More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2811 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0999  citrate synthase I  72.48 
 
 
438 aa  652    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15490  citrate synthase  72.07 
 
 
428 aa  635    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.167286  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2531  citrate synthase I  92.74 
 
 
428 aa  822    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000235775 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0528  citrate synthase I  73.51 
 
 
437 aa  653    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0708503  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4703  citrate synthase I  73.51 
 
 
463 aa  650    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2136  citrate synthase I  72.14 
 
 
427 aa  652    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.873392  normal  0.0485985 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2284  citrate synthase I  71.43 
 
 
427 aa  648    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193692  normal  0.0343529 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2811  citrate synthase  100 
 
 
427 aa  881    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0195056  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1140  citrate synthase I  74.46 
 
 
441 aa  651    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.615799  normal  0.0294382 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33600  citrate synthase  74.76 
 
 
437 aa  662    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.522546 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1270  citrate synthase I  70.92 
 
 
440 aa  630  1e-179  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0855  citrate synthase I  70.05 
 
 
432 aa  622  1e-177  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0328929  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5022  type II citrate synthase  70.57 
 
 
434 aa  620  1e-176  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.834357 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4838  type II citrate synthase  69.5 
 
 
434 aa  616  1e-175  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.782916  normal  0.17167 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4456  type II citrate synthase  69.5 
 
 
434 aa  616  1e-175  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4543  type II citrate synthase  69.5 
 
 
434 aa  616  1e-175  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.701189 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1729  type II citrate synthase  70.1 
 
 
434 aa  613  9.999999999999999e-175  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.540557 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1964  citrate synthase I  68.27 
 
 
427 aa  610  1e-173  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0148224  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0995  citrate synthase I  69.9 
 
 
436 aa  607  9.999999999999999e-173  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10915  type II citrate synthase  68.5 
 
 
431 aa  606  9.999999999999999e-173  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11150  citrate synthase  68.01 
 
 
450 aa  602  1.0000000000000001e-171  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.592524  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25990  citrate synthase  65.57 
 
 
432 aa  586  1e-166  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0803  citrate synthase I  67.23 
 
 
440 aa  577  1.0000000000000001e-163  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.558205 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1130  citrate synthase I  65.26 
 
 
431 aa  570  1e-161  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.684999  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19470  citrate synthase  62.95 
 
 
428 aa  555  1e-157  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.286826  hitchhiker  0.00826117 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0972  citrate synthase I  64.13 
 
 
436 aa  553  1e-156  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1275  citrate synthase  59.08 
 
 
427 aa  515  1.0000000000000001e-145  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.152797  normal  0.229785 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2224  citrate synthase I  58.68 
 
 
425 aa  513  1e-144  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1524  citrate synthase I  58 
 
 
430 aa  510  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.802094  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0646  citrate synthase I  58.23 
 
 
430 aa  510  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.615558 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3212  citrate synthase  58.87 
 
 
427 aa  510  1e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215147  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2053  citrate synthase I  56.32 
 
 
428 aa  506  9.999999999999999e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.655097  normal  0.0360596 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2032  citrate synthase  57.42 
 
 
428 aa  505  9.999999999999999e-143  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808291  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1646  type II citrate synthase  56.77 
 
 
429 aa  505  9.999999999999999e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0982845  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1845  type II citrate synthase  55.9 
 
 
433 aa  503  1e-141  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.273477  normal  0.198527 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1708  type II citrate synthase  56.13 
 
 
433 aa  503  1e-141  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.693797  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02359  type II citrate synthase  56.84 
 
 
442 aa  502  1e-141  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1395  citrate synthase  57.62 
 
 
434 aa  504  1e-141  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.322092  normal  0.0167868 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2023  citrate synthase I  56.87 
 
 
429 aa  503  1e-141  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1148  type II citrate synthase  56.26 
 
 
430 aa  500  1e-140  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2042  type II citrate synthase  55.71 
 
 
430 aa  501  1e-140  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0529149  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3584  citrate synthase I  56.77 
 
 
425 aa  498  1e-140  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00887444 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3253  type II citrate synthase  55.9 
 
 
434 aa  500  1e-140  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1301  Citrate (Si)-synthase  54.98 
 
 
431 aa  501  1e-140  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.115082  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1106  type II citrate synthase  56.26 
 
 
435 aa  500  1e-140  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2813  type II citrate synthase  55.9 
 
 
434 aa  498  1e-140  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2843  type II citrate synthase  55.66 
 
 
434 aa  500  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.433784  normal  0.36225 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1596  type II citrate synthase  56.13 
 
 
429 aa  498  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.218131  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1789  type II citrate synthase  56.37 
 
 
429 aa  499  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.069091  hitchhiker  0.00547545 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5222  citrate synthase I  55.58 
 
 
429 aa  498  1e-140  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.827577  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1409  citrate synthase I  57.97 
 
 
429 aa  496  1e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.423182 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4680  citrate synthase I  55.34 
 
 
446 aa  495  1e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0874  type II citrate synthase  56.71 
 
 
429 aa  497  1e-139  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0015368  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0995  citrate synthase I  53.5 
 
 
434 aa  494  1e-139  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.655069 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1144  type II citrate synthase  56.43 
 
 
429 aa  497  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.300068  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5145  citrate synthase I  55.34 
 
 
429 aa  496  1e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.236177  normal  0.0251581 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2450  type II citrate synthase  55.19 
 
 
434 aa  498  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.444525 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0787  type II citrate synthase  56.71 
 
 
429 aa  497  1e-139  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0829  citrate synthase I  55.84 
 
 
427 aa  494  1e-139  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.292623  hitchhiker  0.00485559 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4425  citrate synthase I  55.9 
 
 
436 aa  495  1e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.224643  normal  0.0272577 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1681  citrate synthase I  56.83 
 
 
429 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592991 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1422  type II citrate synthase  55.5 
 
 
428 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000689188  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4502  type II citrate synthase  54.95 
 
 
434 aa  493  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.705578 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01350  type II citrate synthase  56.32 
 
 
429 aa  488  1e-137  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1134  type II citrate synthase  55.06 
 
 
432 aa  488  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.066915  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5036  citrate synthase I  56.19 
 
 
428 aa  488  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1731  citrate synthase I  56.97 
 
 
439 aa  491  1e-137  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3181  citrate synthase I  55.11 
 
 
438 aa  490  1e-137  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.270593  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2563  type II citrate synthase  55.01 
 
 
429 aa  486  1e-136  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.102281  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4366  type II citrate synthase  56.37 
 
 
433 aa  486  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1600  citrate synthase  54.61 
 
 
433 aa  485  1e-136  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1841  citrate synthase  54.35 
 
 
430 aa  485  1e-136  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.040491 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5205  type II citrate synthase  55.19 
 
 
433 aa  486  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.237518  normal  0.311757 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0058  citrate synthase I  55.16 
 
 
432 aa  487  1e-136  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00358332  normal  0.0142462 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0367  citrate synthase I  55.5 
 
 
425 aa  482  1e-135  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1626  type II citrate synthase  56.62 
 
 
433 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00616613  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1744  type II citrate synthase  56.62 
 
 
433 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.676143  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0788  type II citrate synthase  56.62 
 
 
433 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0858919  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2467  type II citrate synthase  56.62 
 
 
433 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00536833  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4643  type II citrate synthase  56.37 
 
 
433 aa  482  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0504  type II citrate synthase  56.62 
 
 
433 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.405584  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0665  type II citrate synthase  56.62 
 
 
433 aa  483  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.170997  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0763  type II citrate synthase  54.83 
 
 
437 aa  483  1e-135  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004117  citrate synthase (si)  55.71 
 
 
429 aa  484  1e-135  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2329  type II citrate synthase  56.62 
 
 
433 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1834  type II citrate synthase  56.62 
 
 
433 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0219356  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3589  type II citrate synthase  56.37 
 
 
433 aa  481  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0248785  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0704  citrate synthase I  55.69 
 
 
428 aa  478  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0554  citrate synthase I  55.66 
 
 
428 aa  479  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.488876  normal  0.835408 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2973  type II citrate synthase  55.02 
 
 
426 aa  478  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00618343  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3832  type II citrate synthase  56.13 
 
 
433 aa  478  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.418606 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4428  type II citrate synthase  56.37 
 
 
433 aa  481  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1379  type II citrate synthase  55.02 
 
 
426 aa  478  1e-134  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000415607  normal  0.279105 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5525  type II citrate synthase  54.12 
 
 
432 aa  481  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.615237  normal  0.487627 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6851  type II citrate synthase  56.13 
 
 
433 aa  478  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.622921 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3316  type II citrate synthase  56.13 
 
 
433 aa  478  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.229262  normal  0.697255 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3939  type II citrate synthase  56.37 
 
 
433 aa  481  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0897  citrate synthase  55.76 
 
 
433 aa  481  1e-134  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0898483  normal  0.676877 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3091  citrate synthase I  55.45 
 
 
428 aa  478  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.31999 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1149  citrate synthase I  55 
 
 
424 aa  479  1e-134  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>