More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_19470 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_19470  citrate synthase  100 
 
 		 428 aa  888    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.286826  hitchhiker  0.00826117 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0528  citrate synthase I  63.38 
 
 		 437 aa  557  1e-157  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0708503  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4703  citrate synthase I  63.36 
 
 		 463 aa  555  1e-157  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1270  citrate synthase I  63.36 
 
 		 440 aa  556  1e-157  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1140  citrate synthase I  63.79 
 
 		 441 aa  556  1e-157  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.615799  normal  0.0294382 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2811  citrate synthase  62.95 
 
 		 427 aa  555  1e-157  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0195056  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2284  citrate synthase I  63.77 
 
 		 427 aa  551  1e-156  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193692  normal  0.0343529 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0855  citrate synthase I  62.65 
 
 		 432 aa  553  1e-156  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0328929  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2531  citrate synthase I  61.59 
 
 		 428 aa  553  1e-156  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000235775 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2136  citrate synthase I  63.29 
 
 		 427 aa  550  1e-155  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.873392  normal  0.0485985 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0999  citrate synthase I  62.38 
 
 		 438 aa  551  1e-155  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33600  citrate synthase  63.48 
 
 		 437 aa  543  1e-153  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.522546 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5022  type II citrate synthase  61.94 
 
 		 434 aa  541  1e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.834357 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1729  type II citrate synthase  61.47 
 
 		 434 aa  538  9.999999999999999e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.540557 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1964  citrate synthase I  62.94 
 
 		 427 aa  539  9.999999999999999e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0148224  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4838  type II citrate synthase  63.57 
 
 		 434 aa  538  1e-151  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.782916  normal  0.17167 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4456  type II citrate synthase  63.57 
 
 		 434 aa  538  1e-151  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4543  type II citrate synthase  63.57 
 
 		 434 aa  538  1e-151  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.701189 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11150  citrate synthase  59.95 
 
 		 450 aa  527  1e-148  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.592524  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1130  citrate synthase I  60.62 
 
 		 431 aa  526  1e-148  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.684999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10915  type II citrate synthase  60.14 
 
 		 431 aa  522  1e-147  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25990  citrate synthase  61.18 
 
 		 432 aa  517  1.0000000000000001e-145  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0995  citrate synthase I  57.72 
 
 		 436 aa  515  1.0000000000000001e-145  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0803  citrate synthase I  58.98 
 
 		 440 aa  508  9.999999999999999e-143  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.558205 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15490  citrate synthase  61.39 
 
 		 428 aa  500  1e-140  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.167286  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0972  citrate synthase I  55.12 
 
 		 436 aa  482  1e-135  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1275  citrate synthase  56.2 
 
 		 427 aa  483  1e-135  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.152797  normal  0.229785 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05880  citrate synthase  54.89 
 
 		 428 aa  473  1e-132  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2053  citrate synthase I  53.3 
 
 		 428 aa  465  9.999999999999999e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.655097  normal  0.0360596 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3584  citrate synthase I  53.68 
 
 		 425 aa  461  1e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00887444 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3253  type II citrate synthase  53.48 
 
 		 425 aa  464  1e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0847  citrate synthase  53.77 
 
 		 429 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0367  citrate synthase I  53.33 
 
 		 425 aa  458  1e-127  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5036  citrate synthase I  52.74 
 
 		 428 aa  448  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2224  citrate synthase I  51.2 
 
 		 425 aa  448  1e-125  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02359  type II citrate synthase  52.62 
 
 		 442 aa  450  1e-125  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0554  citrate synthase I  53.33 
 
 		 428 aa  448  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.488876  normal  0.835408 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2450  type II citrate synthase  51.29 
 
 		 434 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.444525 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0995  citrate synthase I  50.48 
 
 		 434 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.655069 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0969  citrate synthase I  52.39 
 
 		 427 aa  441  1e-123  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1845  type II citrate synthase  52.03 
 
 		 433 aa  443  1e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.273477  normal  0.198527 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3212  citrate synthase  51.46 
 
 		 427 aa  442  1e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215147  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2752  citrate synthase  52.55 
 
 		 432 aa  439  9.999999999999999e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.816634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2251  citrate synthase I  50.7 
 
 		 434 aa  436  1e-121  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3253  type II citrate synthase  50.35 
 
 		 434 aa  435  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1301  Citrate (Si)-synthase  49.51 
 
 		 431 aa  435  1e-121  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.115082  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1708  type II citrate synthase  50.6 
 
 		 433 aa  435  1e-121  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.693797  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1646  type II citrate synthase  51.59 
 
 		 429 aa  438  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0982845  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1395  citrate synthase  50.12 
 
 		 434 aa  436  1e-121  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.322092  normal  0.0167868 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2798  type II citrate synthase  50.23 
 
 		 436 aa  431  1e-120  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.242965 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5145  citrate synthase I  51.2 
 
 		 429 aa  432  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.236177  normal  0.0251581 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2813  type II citrate synthase  49.41 
 
 		 434 aa  431  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1134  type II citrate synthase  49.76 
 
 		 432 aa  434  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.066915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2843  type II citrate synthase  50.12 
 
 		 434 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.433784  normal  0.36225 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0787  type II citrate synthase  50.47 
 
 		 429 aa  433  1e-120  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2288  type II citrate synthase  50.23 
 
 		 436 aa  431  1e-120  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0874  type II citrate synthase  50.7 
 
 		 429 aa  434  1e-120  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0015368  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2787  citrate synthase I  49.04 
 
 		 426 aa  431  1e-119  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.420339  normal  0.059507 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2023  citrate synthase I  50.36 
 
 		 429 aa  429  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2320  type II citrate synthase  48.94 
 
 		 433 aa  429  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4680  citrate synthase I  51.2 
 
 		 446 aa  431  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5222  citrate synthase I  50.72 
 
 		 429 aa  431  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.827577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2032  citrate synthase  48.8 
 
 		 428 aa  430  1e-119  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808291  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0763  type II citrate synthase  50.7 
 
 		 437 aa  431  1e-119  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2481  type II citrate synthase  48.94 
 
 		 433 aa  429  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523496  normal  0.0627534 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1731  citrate synthase I  51.18 
 
 		 439 aa  429  1e-119  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2042  type II citrate synthase  50.36 
 
 		 430 aa  428  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0529149  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0897  citrate synthase  48.91 
 
 		 433 aa  429  1e-119  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0898483  normal  0.676877 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1409  citrate synthase I  49.05 
 
 		 429 aa  429  1e-119  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.423182 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4410  citrate synthase I  51.81 
 
 		 429 aa  431  1e-119  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1149  citrate synthase I  49.76 
 
 		 424 aa  430  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4643  type II citrate synthase  49.17 
 
 		 433 aa  427  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4366  type II citrate synthase  48.69 
 
 		 433 aa  427  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1088  citrate synthase I  54.81 
 
 		 443 aa  426  1e-118  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.864155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0058  citrate synthase I  48.36 
 
 		 432 aa  425  1e-118  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00358332  normal  0.0142462 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1626  type II citrate synthase  49.52 
 
 		 433 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00616613  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1744  type II citrate synthase  49.52 
 
 		 433 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.676143  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5525  type II citrate synthase  48.81 
 
 		 432 aa  426  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.615237  normal  0.487627 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2329  type II citrate synthase  49.52 
 
 		 433 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1187  citrate synthase  48.8 
 
 		 431 aa  425  1e-118  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0788  type II citrate synthase  49.52 
 
 		 433 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0858919  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0504  type II citrate synthase  49.52 
 
 		 433 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.405584  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2563  type II citrate synthase  49.88 
 
 		 429 aa  426  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.102281  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1870  citrate synthase I  54.29 
 
 		 448 aa  425  1e-118  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.859731 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1834  type II citrate synthase  49.52 
 
 		 433 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0219356  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5205  type II citrate synthase  48.82 
 
 		 433 aa  427  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.237518  normal  0.311757 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2068  citrate synthase I  50.7 
 
 		 450 aa  426  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.355535  normal  0.380729 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2545  citrate synthase I  49.05 
 
 		 431 aa  425  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1600  citrate synthase  50.61 
 
 		 433 aa  426  1e-118  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0665  type II citrate synthase  49.29 
 
 		 433 aa  425  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.170997  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2111  citrate synthase  50.23 
 
 		 454 aa  427  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000226419  normal  0.855626 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2890  type II citrate synthase  48.93 
 
 		 433 aa  426  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0829  citrate synthase I  49.28 
 
 		 427 aa  426  1e-118  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.292623  hitchhiker  0.00485559 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2467  type II citrate synthase  49.52 
 
 		 433 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00536833  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3694  type II citrate synthase  48.7 
 
 		 428 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44070  type II citrate synthase  48.46 
 
 		 428 aa  425  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3181  citrate synthase I  48.45 
 
 		 438 aa  427  1e-118  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.270593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1058  type II citrate synthase  50 
 
 		 437 aa  426  1e-118  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.704464  normal  0.0578787 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4502  type II citrate synthase  49.64 
 
 		 434 aa  426  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.705578 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1476  citrate synthase I  50.12 
 
 		 428 aa  427  1e-118  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.112534  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>