More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1130 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1130  citrate synthase I  100 
 
 		 431 aa  888    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.684999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25990  citrate synthase  69.68 
 
 		 432 aa  639    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1140  citrate synthase I  72.53 
 
 		 441 aa  627  1e-178  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.615799  normal  0.0294382 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0995  citrate synthase I  71.71 
 
 		 436 aa  622  1e-177  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0803  citrate synthase I  67.82 
 
 		 440 aa  605  9.999999999999999e-173  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.558205 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4703  citrate synthase I  65.67 
 
 		 463 aa  594  1e-169  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0999  citrate synthase I  64.38 
 
 		 438 aa  580  1e-164  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1964  citrate synthase I  65.93 
 
 		 427 aa  578  1e-164  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0148224  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0528  citrate synthase I  65.94 
 
 		 437 aa  576  1.0000000000000001e-163  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0708503  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2531  citrate synthase I  65.02 
 
 		 428 aa  570  1e-161  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000235775 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0855  citrate synthase I  63.92 
 
 		 432 aa  569  1e-161  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0328929  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2811  citrate synthase  65.26 
 
 		 427 aa  570  1e-161  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0195056  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2136  citrate synthase I  64.46 
 
 		 427 aa  569  1e-161  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.873392  normal  0.0485985 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1729  type II citrate synthase  62.79 
 
 		 434 aa  566  1e-160  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.540557 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0972  citrate synthase I  64.15 
 
 		 436 aa  566  1e-160  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2284  citrate synthase I  64.22 
 
 		 427 aa  565  1e-160  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193692  normal  0.0343529 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1270  citrate synthase I  63.68 
 
 		 440 aa  566  1e-160  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4838  type II citrate synthase  61.77 
 
 		 434 aa  560  1e-158  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.782916  normal  0.17167 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4456  type II citrate synthase  61.77 
 
 		 434 aa  560  1e-158  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4543  type II citrate synthase  61.77 
 
 		 434 aa  560  1e-158  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.701189 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33600  citrate synthase  64.49 
 
 		 437 aa  560  1e-158  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.522546 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10915  type II citrate synthase  61.27 
 
 		 431 aa  554  1e-157  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5022  type II citrate synthase  62.21 
 
 		 434 aa  557  1e-157  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.834357 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11150  citrate synthase  61.08 
 
 		 450 aa  540  9.999999999999999e-153  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.592524  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15490  citrate synthase  61.79 
 
 		 428 aa  526  1e-148  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.167286  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19470  citrate synthase  60.62 
 
 		 428 aa  526  1e-148  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.286826  hitchhiker  0.00826117 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1275  citrate synthase  56.63 
 
 		 427 aa  496  1e-139  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.152797  normal  0.229785 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3584  citrate synthase I  56.32 
 
 		 425 aa  487  1e-136  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00887444 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2450  type II citrate synthase  55.12 
 
 		 434 aa  481  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.444525 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4502  type II citrate synthase  53.36 
 
 		 434 aa  475  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.705578 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2224  citrate synthase I  53.54 
 
 		 425 aa  477  1e-133  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1845  type II citrate synthase  53.81 
 
 		 433 aa  473  1e-132  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.273477  normal  0.198527 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3253  type II citrate synthase  54.1 
 
 		 434 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2843  type II citrate synthase  54.57 
 
 		 434 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.433784  normal  0.36225 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2053  citrate synthase I  53.25 
 
 		 428 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.655097  normal  0.0360596 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2813  type II citrate synthase  54.12 
 
 		 434 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1409  citrate synthase I  53.77 
 
 		 429 aa  469  1.0000000000000001e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.423182 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2023  citrate synthase I  53.29 
 
 		 429 aa  464  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1646  type II citrate synthase  55.19 
 
 		 429 aa  467  9.999999999999999e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0982845  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4425  citrate synthase I  53.47 
 
 		 436 aa  465  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.224643  normal  0.0272577 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0874  type II citrate synthase  53.85 
 
 		 429 aa  463  1e-129  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0015368  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1708  type II citrate synthase  53.12 
 
 		 433 aa  462  1e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.693797  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02359  type II citrate synthase  52.2 
 
 		 442 aa  461  1e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3212  citrate synthase  53.55 
 
 		 427 aa  460  9.999999999999999e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215147  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1731  citrate synthase I  57 
 
 		 439 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1681  citrate synthase I  53.54 
 
 		 429 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592991 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0787  type II citrate synthase  53.85 
 
 		 429 aa  459  9.999999999999999e-129  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1911  citrate synthase  53.02 
 
 		 430 aa  459  9.999999999999999e-129  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4680  citrate synthase I  51.89 
 
 		 446 aa  456  1e-127  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5222  citrate synthase I  52.12 
 
 		 429 aa  457  1e-127  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.827577  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1148  type II citrate synthase  54.68 
 
 		 430 aa  455  1e-127  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5145  citrate synthase I  51.89 
 
 		 429 aa  456  1e-127  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.236177  normal  0.0251581 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1106  type II citrate synthase  54.68 
 
 		 435 aa  456  1e-127  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0704  citrate synthase I  52.94 
 
 		 428 aa  456  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05880  citrate synthase  52.46 
 
 		 428 aa  457  1e-127  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5036  citrate synthase I  52.38 
 
 		 428 aa  452  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3091  citrate synthase I  52.47 
 
 		 428 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.31999 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1994  citrate synthase  52.94 
 
 		 428 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.189666  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2032  citrate synthase  53.58 
 
 		 428 aa  452  1.0000000000000001e-126  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808291  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1524  citrate synthase I  53.38 
 
 		 430 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.802094  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2042  type II citrate synthase  54.43 
 
 		 430 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0529149  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1132  citrate synthase  52.42 
 
 		 431 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1395  citrate synthase  53.41 
 
 		 434 aa  454  1.0000000000000001e-126  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.322092  normal  0.0167868 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1596  type II citrate synthase  51.99 
 
 		 429 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.218131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3253  type II citrate synthase  52.49 
 
 		 425 aa  454  1.0000000000000001e-126  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4410  citrate synthase I  55.04 
 
 		 429 aa  451  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0367  citrate synthase I  50.96 
 
 		 425 aa  449  1e-125  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1301  Citrate (Si)-synthase  52.42 
 
 		 431 aa  450  1e-125  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.115082  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1600  citrate synthase  54.22 
 
 		 433 aa  451  1e-125  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1789  type II citrate synthase  51.29 
 
 		 429 aa  448  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.069091  hitchhiker  0.00547545 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0995  citrate synthase I  51.56 
 
 		 434 aa  449  1e-125  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.655069 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29820  type II citrate synthase  51.79 
 
 		 427 aa  449  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0646  citrate synthase I  52 
 
 		 430 aa  451  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.615558 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1144  type II citrate synthase  53.92 
 
 		 429 aa  450  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.300068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0186  citrate synthase I  52.45 
 
 		 438 aa  449  1e-125  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2194  citrate synthase I  54.55 
 
 		 429 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0599  type II citrate synthase  50.83 
 
 		 430 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.281651  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2147  type II citrate synthase  51.65 
 
 		 433 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.787035  normal  0.703076 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0665  type II citrate synthase  51.65 
 
 		 433 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.170997  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0026  citrate synthase I  51.16 
 
 		 426 aa  448  1.0000000000000001e-124  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000469449  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4428  type II citrate synthase  51.65 
 
 		 433 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1660  type II citrate synthase  54.8 
 
 		 429 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3589  type II citrate synthase  51.65 
 
 		 433 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0248785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3939  type II citrate synthase  51.65 
 
 		 433 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3716  citrate synthase I  53.68 
 
 		 430 aa  446  1.0000000000000001e-124  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.364105  normal  0.0570227 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4643  type II citrate synthase  51.42 
 
 		 433 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3517  type II citrate synthase  55.05 
 
 		 429 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2563  type II citrate synthase  50.81 
 
 		 429 aa  442  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.102281  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1744  type II citrate synthase  51.18 
 
 		 433 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.676143  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2004  type II citrate synthase  54.55 
 
 		 429 aa  443  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.719341  normal  0.158891 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3832  type II citrate synthase  52.71 
 
 		 433 aa  442  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.418606 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1187  citrate synthase  52.35 
 
 		 431 aa  444  1e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0788  type II citrate synthase  51.18 
 
 		 433 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0858919  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2467  type II citrate synthase  51.18 
 
 		 433 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00536833  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0504  type II citrate synthase  51.18 
 
 		 433 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.405584  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1834  type II citrate synthase  51.18 
 
 		 433 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0219356  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0061  citrate synthase  50.71 
 
 		 430 aa  443  1e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0890712  normal  0.301769 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3765  type II citrate synthase  54.8 
 
 		 429 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0679988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2329  type II citrate synthase  51.18 
 
 		 433 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3181  citrate synthase I  52.21 
 
 		 438 aa  444  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.270593  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>