More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0528 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0528  citrate synthase I  100 
 
 
437 aa  897    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0708503  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1270  citrate synthase I  75.99 
 
 
440 aa  686    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0999  citrate synthase I  79.73 
 
 
438 aa  731    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33600  citrate synthase  80.32 
 
 
437 aa  743    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.522546 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4703  citrate synthase I  76.35 
 
 
463 aa  699    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4838  type II citrate synthase  77.96 
 
 
434 aa  686    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.782916  normal  0.17167 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2284  citrate synthase I  74.06 
 
 
427 aa  675    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193692  normal  0.0343529 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2136  citrate synthase I  73.82 
 
 
427 aa  677    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.873392  normal  0.0485985 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2531  citrate synthase I  74.76 
 
 
428 aa  652    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000235775 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10915  type II citrate synthase  76.71 
 
 
431 aa  682    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1729  type II citrate synthase  76.66 
 
 
434 aa  686    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.540557 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4456  type II citrate synthase  77.96 
 
 
434 aa  686    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1140  citrate synthase I  76.71 
 
 
441 aa  683    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.615799  normal  0.0294382 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0855  citrate synthase I  76.96 
 
 
432 aa  677    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0328929  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2811  citrate synthase  73.51 
 
 
427 aa  653    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0195056  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1964  citrate synthase I  70.99 
 
 
427 aa  652    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0148224  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4543  type II citrate synthase  77.96 
 
 
434 aa  686    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.701189 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5022  type II citrate synthase  77.57 
 
 
434 aa  697    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.834357 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0995  citrate synthase I  65.45 
 
 
436 aa  603  1.0000000000000001e-171  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15490  citrate synthase  70 
 
 
428 aa  601  1e-170  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.167286  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25990  citrate synthase  64.99 
 
 
432 aa  596  1e-169  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11150  citrate synthase  65.12 
 
 
450 aa  589  1e-167  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.592524  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0803  citrate synthase I  64.19 
 
 
440 aa  579  1e-164  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.558205 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1130  citrate synthase I  65.94 
 
 
431 aa  576  1.0000000000000001e-163  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.684999  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19470  citrate synthase  63.38 
 
 
428 aa  557  1e-157  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.286826  hitchhiker  0.00826117 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0972  citrate synthase I  62.23 
 
 
436 aa  551  1e-156  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3584  citrate synthase I  59.67 
 
 
425 aa  547  1e-154  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00887444 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2224  citrate synthase I  60 
 
 
425 aa  543  1e-153  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2053  citrate synthase I  60.05 
 
 
428 aa  540  9.999999999999999e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.655097  normal  0.0360596 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1275  citrate synthase  60.48 
 
 
427 aa  533  1e-150  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.152797  normal  0.229785 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1409  citrate synthase I  60.05 
 
 
429 aa  522  1e-147  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.423182 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0646  citrate synthase I  58.19 
 
 
430 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.615558 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5036  citrate synthase I  58.57 
 
 
428 aa  516  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3212  citrate synthase  58.59 
 
 
427 aa  517  1.0000000000000001e-145  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215147  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1524  citrate synthase I  59.41 
 
 
430 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.802094  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0847  citrate synthase  59.28 
 
 
429 aa  513  1e-144  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0554  citrate synthase I  58.95 
 
 
428 aa  511  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.488876  normal  0.835408 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2023  citrate synthase I  57.48 
 
 
429 aa  513  1e-144  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05880  citrate synthase  57.81 
 
 
428 aa  512  1e-144  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0367  citrate synthase I  57.62 
 
 
425 aa  512  1e-144  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1301  Citrate (Si)-synthase  56.05 
 
 
431 aa  510  1e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.115082  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5222  citrate synthase I  57.25 
 
 
429 aa  510  1e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.827577  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1681  citrate synthase I  57.38 
 
 
429 aa  509  1e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592991 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4425  citrate synthase I  59.07 
 
 
436 aa  510  1e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.224643  normal  0.0272577 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1845  type II citrate synthase  55.73 
 
 
433 aa  508  1e-143  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.273477  normal  0.198527 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2042  type II citrate synthase  55.5 
 
 
430 aa  509  1e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0529149  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0995  citrate synthase I  55.79 
 
 
434 aa  508  1e-143  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.655069 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5145  citrate synthase I  57.49 
 
 
429 aa  508  1e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.236177  normal  0.0251581 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1708  type II citrate synthase  56.21 
 
 
433 aa  509  1e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.693797  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3253  type II citrate synthase  56.19 
 
 
434 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1144  type II citrate synthase  58.13 
 
 
429 aa  505  9.999999999999999e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.300068  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2813  type II citrate synthase  55.73 
 
 
434 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2032  citrate synthase  57.68 
 
 
428 aa  507  9.999999999999999e-143  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808291  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2450  type II citrate synthase  55.5 
 
 
434 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.444525 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2843  type II citrate synthase  55.5 
 
 
434 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.433784  normal  0.36225 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1646  type II citrate synthase  56.34 
 
 
429 aa  508  9.999999999999999e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0982845  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4680  citrate synthase I  57.49 
 
 
446 aa  508  9.999999999999999e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1148  type II citrate synthase  55.04 
 
 
430 aa  502  1e-141  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1106  type II citrate synthase  55.04 
 
 
435 aa  502  1e-141  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1596  type II citrate synthase  56.87 
 
 
429 aa  503  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.218131  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0969  citrate synthase I  57.88 
 
 
427 aa  502  1e-141  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4502  type II citrate synthase  55.32 
 
 
434 aa  503  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.705578 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1789  type II citrate synthase  56.63 
 
 
429 aa  499  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.069091  hitchhiker  0.00547545 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0058  citrate synthase I  55.2 
 
 
432 aa  498  1e-140  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00358332  normal  0.0142462 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1731  citrate synthase I  57.59 
 
 
439 aa  500  1e-140  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3716  citrate synthase I  55.97 
 
 
430 aa  500  1e-140  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.364105  normal  0.0570227 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02359  type II citrate synthase  57.63 
 
 
442 aa  498  1e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1132  citrate synthase  55.97 
 
 
431 aa  497  1e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2860  citrate synthase  55.68 
 
 
432 aa  493  9.999999999999999e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0787  type II citrate synthase  57.21 
 
 
429 aa  493  9.999999999999999e-139  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0874  type II citrate synthase  56.97 
 
 
429 aa  491  9.999999999999999e-139  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0015368  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3181  citrate synthase I  55.48 
 
 
438 aa  489  1e-137  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.270593  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0763  type II citrate synthase  56.35 
 
 
437 aa  489  1e-137  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4366  type II citrate synthase  54.4 
 
 
433 aa  489  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0829  citrate synthase I  57.28 
 
 
427 aa  490  1e-137  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.292623  hitchhiker  0.00485559 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2563  type II citrate synthase  56.14 
 
 
429 aa  490  1e-137  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.102281  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2752  citrate synthase  56.01 
 
 
432 aa  488  1e-137  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.816634  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0897  citrate synthase  55.13 
 
 
433 aa  491  1e-137  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0898483  normal  0.676877 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2251  citrate synthase I  54.93 
 
 
434 aa  484  1e-136  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1744  type II citrate synthase  54.4 
 
 
433 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.676143  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2467  type II citrate synthase  54.4 
 
 
433 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00536833  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2320  type II citrate synthase  54.4 
 
 
433 aa  487  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2329  type II citrate synthase  54.4 
 
 
433 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0788  type II citrate synthase  54.4 
 
 
433 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0858919  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0704  citrate synthase I  57.6 
 
 
428 aa  487  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1994  citrate synthase  57.6 
 
 
428 aa  486  1e-136  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.189666  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3091  citrate synthase I  57.35 
 
 
428 aa  484  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.31999 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0504  type II citrate synthase  54.4 
 
 
433 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.405584  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1834  type II citrate synthase  54.4 
 
 
433 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0219356  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1600  citrate synthase  55.87 
 
 
433 aa  486  1e-136  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1626  type II citrate synthase  54.4 
 
 
433 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00616613  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4643  type II citrate synthase  54.4 
 
 
433 aa  485  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1058  type II citrate synthase  55.88 
 
 
437 aa  485  1e-136  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.704464  normal  0.0578787 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1609  type II citrate synthase  57.42 
 
 
429 aa  481  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.706948  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0665  type II citrate synthase  54.4 
 
 
433 aa  484  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.170997  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1841  citrate synthase  54.08 
 
 
430 aa  483  1e-135  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.040491 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2890  type II citrate synthase  54.4 
 
 
433 aa  483  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2481  type II citrate synthase  53.94 
 
 
433 aa  482  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523496  normal  0.0627534 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3694  type II citrate synthase  57.31 
 
 
428 aa  482  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2545  citrate synthase I  54.42 
 
 
431 aa  484  1e-135  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>