More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3584 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3584  citrate synthase I  100 
 
 		 425 aa  885    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00887444 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2224  citrate synthase I  64.69 
 
 		 425 aa  589  1e-167  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0847  citrate synthase  62.79 
 
 		 429 aa  566  1e-160  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1275  citrate synthase  60.51 
 
 		 427 aa  565  1e-160  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.152797  normal  0.229785 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33600  citrate synthase  61.18 
 
 		 437 aa  556  1e-157  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.522546 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0554  citrate synthase I  61.54 
 
 		 428 aa  549  1e-155  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.488876  normal  0.835408 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0528  citrate synthase I  59.67 
 
 		 437 aa  547  1e-154  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0708503  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1270  citrate synthase I  58.78 
 
 		 440 aa  545  1e-154  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0855  citrate synthase I  59.9 
 
 		 432 aa  544  1e-153  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0328929  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4456  type II citrate synthase  58.55 
 
 		 434 aa  543  1e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4838  type II citrate synthase  58.55 
 
 		 434 aa  543  1e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.782916  normal  0.17167 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4543  type II citrate synthase  58.55 
 
 		 434 aa  543  1e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.701189 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10915  type II citrate synthase  60.05 
 
 		 431 aa  541  9.999999999999999e-153  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5036  citrate synthase I  58.51 
 
 		 428 aa  538  9.999999999999999e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2053  citrate synthase I  57.81 
 
 		 428 aa  539  9.999999999999999e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.655097  normal  0.0360596 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4703  citrate synthase I  59.09 
 
 		 463 aa  538  9.999999999999999e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5022  type II citrate synthase  59.2 
 
 		 434 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.834357 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1729  type II citrate synthase  59.2 
 
 		 434 aa  538  1e-151  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.540557 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1964  citrate synthase I  59.09 
 
 		 427 aa  531  1e-150  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0148224  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1476  citrate synthase I  58.96 
 
 		 428 aa  533  1e-150  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.112534  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2136  citrate synthase I  57.04 
 
 		 427 aa  529  1e-149  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.873392  normal  0.0485985 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0026  citrate synthase I  56.81 
 
 		 426 aa  527  1e-148  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000469449  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0999  citrate synthase I  57.89 
 
 		 438 aa  523  1e-147  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2284  citrate synthase I  56.78 
 
 		 427 aa  521  1e-146  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193692  normal  0.0343529 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1140  citrate synthase I  56.54 
 
 		 441 aa  513  1e-144  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.615799  normal  0.0294382 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05880  citrate synthase  56.84 
 
 		 428 aa  508  1e-143  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2531  citrate synthase I  57.24 
 
 		 428 aa  506  9.999999999999999e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000235775 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0969  citrate synthase I  55.37 
 
 		 427 aa  501  1e-141  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2811  citrate synthase  56.77 
 
 		 427 aa  498  1e-140  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0195056  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0995  citrate synthase I  54.61 
 
 		 436 aa  499  1e-140  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0367  citrate synthase I  54.5 
 
 		 425 aa  495  1e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0186  citrate synthase I  55.5 
 
 		 438 aa  492  9.999999999999999e-139  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1301  Citrate (Si)-synthase  56.09 
 
 		 431 aa  494  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.115082  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1678  type II citrate synthase  54.08 
 
 		 431 aa  489  1e-137  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0407476  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3212  citrate synthase  54.42 
 
 		 427 aa  488  1e-137  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215147  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0995  citrate synthase I  55.21 
 
 		 434 aa  490  1e-137  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.655069 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1130  citrate synthase I  56.32 
 
 		 431 aa  487  1e-136  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.684999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1731  citrate synthase I  54.19 
 
 		 439 aa  483  1e-135  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2251  citrate synthase I  54.27 
 
 		 434 aa  482  1e-135  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01350  type II citrate synthase  53.16 
 
 		 429 aa  483  1e-135  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2752  citrate synthase  55.56 
 
 		 432 aa  482  1e-135  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.816634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0972  citrate synthase I  52.24 
 
 		 436 aa  479  1e-134  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1600  citrate synthase  54.87 
 
 		 433 aa  481  1e-134  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15490  citrate synthase  55.45 
 
 		 428 aa  481  1e-134  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.167286  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004117  citrate synthase (si)  52.93 
 
 		 429 aa  479  1e-134  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25990  citrate synthase  52.84 
 
 		 432 aa  481  1e-134  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0787  type II citrate synthase  53.88 
 
 		 429 aa  475  1e-133  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0841  type II citrate synthase  52.46 
 
 		 429 aa  477  1e-133  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0803  citrate synthase I  53.43 
 
 		 440 aa  476  1e-133  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.558205 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0061  citrate synthase  53.96 
 
 		 430 aa  474  1e-133  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0890712  normal  0.301769 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5222  citrate synthase I  53.61 
 
 		 429 aa  476  1e-133  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.827577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0058  citrate synthase I  53.18 
 
 		 432 aa  476  1e-133  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00358332  normal  0.0142462 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5145  citrate synthase I  53.15 
 
 		 429 aa  475  1e-133  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.236177  normal  0.0251581 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3716  citrate synthase I  53.65 
 
 		 430 aa  478  1e-133  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.364105  normal  0.0570227 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2214  citrate synthase I  52.46 
 
 		 428 aa  472  1e-132  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.525644  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02359  type II citrate synthase  54 
 
 		 442 aa  473  1e-132  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2023  citrate synthase I  52.45 
 
 		 429 aa  473  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0874  type II citrate synthase  53.41 
 
 		 429 aa  472  1e-132  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0015368  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4680  citrate synthase I  53.15 
 
 		 446 aa  474  1e-132  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1422  type II citrate synthase  53.52 
 
 		 428 aa  474  1e-132  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000689188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2787  citrate synthase I  51.17 
 
 		 426 aa  469  1.0000000000000001e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.420339  normal  0.059507 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1783  type II citrate synthase  54.57 
 
 		 429 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0004224  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4425  citrate synthase I  53.6 
 
 		 436 aa  470  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.224643  normal  0.0272577 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1132  citrate synthase  54.35 
 
 		 431 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2545  citrate synthase I  52.93 
 
 		 431 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3181  citrate synthase I  52.8 
 
 		 438 aa  471  1.0000000000000001e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.270593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1524  citrate synthase I  52.47 
 
 		 430 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.802094  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1926  type II citrate synthase  54.46 
 
 		 428 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1681  citrate synthase I  53.21 
 
 		 429 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592991 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2274  type II citrate synthase  54.23 
 
 		 428 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000358341  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1409  citrate synthase I  52.49 
 
 		 429 aa  465  9.999999999999999e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.423182 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11150  citrate synthase  52.22 
 
 		 450 aa  466  9.999999999999999e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.592524  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1646  type II citrate synthase  53.26 
 
 		 429 aa  466  9.999999999999999e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0982845  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1630  type II citrate synthase  54.46 
 
 		 428 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.01465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1705  type II citrate synthase  54.46 
 
 		 428 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00232802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0646  citrate synthase I  52.71 
 
 		 430 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.615558 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1705  type II citrate synthase  54.46 
 
 		 428 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0861056  normal  0.668035 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2042  type II citrate synthase  52.2 
 
 		 430 aa  466  9.999999999999999e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0529149  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3765  type II citrate synthase  53.27 
 
 		 429 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0679988  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4194  type II citrate synthase  53.27 
 
 		 429 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0867349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1660  type II citrate synthase  53.27 
 
 		 429 aa  461  1e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1626  type II citrate synthase  53.97 
 
 		 433 aa  463  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00616613  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1744  type II citrate synthase  53.97 
 
 		 433 aa  463  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.676143  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2467  type II citrate synthase  53.97 
 
 		 433 aa  463  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00536833  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1425  type II citrate synthase  52.97 
 
 		 436 aa  464  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0788  type II citrate synthase  53.97 
 
 		 433 aa  463  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0858919  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1834  type II citrate synthase  53.97 
 
 		 433 aa  463  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0219356  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1106  type II citrate synthase  51.5 
 
 		 435 aa  461  1e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0504  type II citrate synthase  53.97 
 
 		 433 aa  463  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.405584  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0704  citrate synthase I  53.36 
 
 		 428 aa  463  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2329  type II citrate synthase  53.97 
 
 		 433 aa  463  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0665  type II citrate synthase  54.21 
 
 		 433 aa  464  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.170997  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0763  type II citrate synthase  53.83 
 
 		 437 aa  463  1e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3091  citrate synthase I  53.83 
 
 		 428 aa  464  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.31999 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1789  type II citrate synthase  53.01 
 
 		 429 aa  464  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.069091  hitchhiker  0.00547545 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2450  type II citrate synthase  51.05 
 
 		 434 aa  462  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.444525 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19470  citrate synthase  53.68 
 
 		 428 aa  461  1e-129  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.286826  hitchhiker  0.00826117 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29820  type II citrate synthase  52.11 
 
 		 427 aa  463  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0260  citrate synthase I  52.21 
 
 		 426 aa  463  1e-129  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.419168  normal  0.11552 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1596  type II citrate synthase  52.56 
 
 		 429 aa  463  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.218131  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>