More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0847 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0847  citrate synthase  100 
 
 		 429 aa  892    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2224  citrate synthase I  66.12 
 
 		 425 aa  593  1e-168  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3584  citrate synthase I  62.79 
 
 		 425 aa  566  1e-160  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00887444 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2053  citrate synthase I  61.77 
 
 		 428 aa  555  1e-157  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.655097  normal  0.0360596 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1275  citrate synthase  59.67 
 
 		 427 aa  531  1e-150  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.152797  normal  0.229785 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5036  citrate synthase I  59.49 
 
 		 428 aa  530  1e-149  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0026  citrate synthase I  57.11 
 
 		 426 aa  526  1e-148  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000469449  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0554  citrate synthase I  59.44 
 
 		 428 aa  518  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.488876  normal  0.835408 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33600  citrate synthase  58.73 
 
 		 437 aa  520  1e-146  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.522546 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1270  citrate synthase I  58.65 
 
 		 440 aa  514  1.0000000000000001e-145  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0367  citrate synthase I  57.68 
 
 		 425 aa  513  1e-144  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0855  citrate synthase I  59.51 
 
 		 432 aa  512  1e-144  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0328929  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0528  citrate synthase I  59.28 
 
 		 437 aa  513  1e-144  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0708503  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1964  citrate synthase I  58.5 
 
 		 427 aa  514  1e-144  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0148224  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05880  citrate synthase  58.33 
 
 		 428 aa  511  1e-143  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0999  citrate synthase I  57.04 
 
 		 438 aa  503  1e-141  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2284  citrate synthase I  55.19 
 
 		 427 aa  498  1e-140  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193692  normal  0.0343529 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2136  citrate synthase I  55.06 
 
 		 427 aa  496  1e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.873392  normal  0.0485985 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4838  type II citrate synthase  55.97 
 
 		 434 aa  497  1e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.782916  normal  0.17167 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4456  type II citrate synthase  55.97 
 
 		 434 aa  497  1e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4543  type II citrate synthase  55.97 
 
 		 434 aa  497  1e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.701189 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4703  citrate synthase I  55.06 
 
 		 463 aa  491  1e-137  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0969  citrate synthase I  55.09 
 
 		 427 aa  488  1e-137  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1729  type II citrate synthase  56.49 
 
 		 434 aa  487  1e-136  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.540557 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10915  type II citrate synthase  56.01 
 
 		 431 aa  486  1e-136  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5022  type II citrate synthase  55.74 
 
 		 434 aa  487  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.834357 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1140  citrate synthase I  52.9 
 
 		 441 aa  478  1e-134  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.615799  normal  0.0294382 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1476  citrate synthase I  54.35 
 
 		 428 aa  479  1e-134  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.112534  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0186  citrate synthase I  54.21 
 
 		 438 aa  477  1e-133  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2531  citrate synthase I  53.32 
 
 		 428 aa  469  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000235775 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0972  citrate synthase I  51.29 
 
 		 436 aa  467  9.999999999999999e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5222  citrate synthase I  52.01 
 
 		 429 aa  464  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.827577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4425  citrate synthase I  53.86 
 
 		 436 aa  468  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.224643  normal  0.0272577 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1301  Citrate (Si)-synthase  53 
 
 		 431 aa  464  1e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.115082  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02359  type II citrate synthase  51.28 
 
 		 442 aa  462  1e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5145  citrate synthase I  52.48 
 
 		 429 aa  464  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.236177  normal  0.0251581 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0646  citrate synthase I  53.27 
 
 		 430 aa  462  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.615558 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4680  citrate synthase I  52.48 
 
 		 446 aa  463  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2251  citrate synthase I  54.89 
 
 		 434 aa  463  1e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1132  citrate synthase  52.45 
 
 		 431 aa  464  1e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2811  citrate synthase  53.66 
 
 		 427 aa  464  1e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0195056  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1422  type II citrate synthase  53.15 
 
 		 428 aa  462  1e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000689188  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1148  type II citrate synthase  51.98 
 
 		 430 aa  458  9.999999999999999e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1789  type II citrate synthase  52.21 
 
 		 429 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.069091  hitchhiker  0.00547545 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3212  citrate synthase  51.51 
 
 		 427 aa  461  9.999999999999999e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215147  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1524  citrate synthase I  52.8 
 
 		 430 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.802094  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1409  citrate synthase I  51.62 
 
 		 429 aa  461  9.999999999999999e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.423182 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2023  citrate synthase I  51.39 
 
 		 429 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2032  citrate synthase  52.8 
 
 		 428 aa  460  9.999999999999999e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808291  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0995  citrate synthase I  50.35 
 
 		 436 aa  459  9.999999999999999e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1106  type II citrate synthase  51.98 
 
 		 435 aa  458  9.999999999999999e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1681  citrate synthase I  51.4 
 
 		 429 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592991 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1646  type II citrate synthase  53.4 
 
 		 429 aa  458  9.999999999999999e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0982845  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1596  type II citrate synthase  52.68 
 
 		 429 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.218131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19470  citrate synthase  53.77 
 
 		 428 aa  458  9.999999999999999e-129  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.286826  hitchhiker  0.00826117 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4194  type II citrate synthase  53.72 
 
 		 429 aa  454  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0867349  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2214  citrate synthase I  52.14 
 
 		 428 aa  457  1e-127  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.525644  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1187  citrate synthase  53.33 
 
 		 431 aa  457  1e-127  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15490  citrate synthase  53.46 
 
 		 428 aa  457  1e-127  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.167286  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3765  type II citrate synthase  53.72 
 
 		 429 aa  454  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0679988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0058  citrate synthase I  51.64 
 
 		 432 aa  457  1e-127  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00358332  normal  0.0142462 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01350  type II citrate synthase  52.28 
 
 		 429 aa  457  1e-127  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004117  citrate synthase (si)  51.9 
 
 		 429 aa  457  1e-127  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2752  citrate synthase  55.02 
 
 		 432 aa  456  1e-127  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.816634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25990  citrate synthase  51.68 
 
 		 432 aa  456  1e-127  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3517  type II citrate synthase  54.2 
 
 		 429 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3694  type II citrate synthase  51.68 
 
 		 428 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0787  type II citrate synthase  51.99 
 
 		 429 aa  452  1.0000000000000001e-126  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2545  citrate synthase I  50.82 
 
 		 431 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1660  type II citrate synthase  53.72 
 
 		 429 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2194  citrate synthase I  53.48 
 
 		 429 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11150  citrate synthase  51.29 
 
 		 450 aa  454  1.0000000000000001e-126  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.592524  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2004  type II citrate synthase  53.72 
 
 		 429 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.719341  normal  0.158891 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2042  type II citrate synthase  51.52 
 
 		 430 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0529149  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3181  citrate synthase I  51.29 
 
 		 438 aa  454  1.0000000000000001e-126  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.270593  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29820  type II citrate synthase  52.16 
 
 		 427 aa  454  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1144  type II citrate synthase  51.98 
 
 		 429 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.300068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0829  citrate synthase I  50.12 
 
 		 427 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.292623  hitchhiker  0.00485559 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1794  citrate synthase I  50.82 
 
 		 426 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000880013  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44070  type II citrate synthase  51.92 
 
 		 428 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01870  Citrate synthase  50.97 
 
 		 425 aa  454  1.0000000000000001e-126  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2257  citrate synthase I  53.55 
 
 		 431 aa  454  1.0000000000000001e-126  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.19804  normal  0.414999 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0803  citrate synthase I  50 
 
 		 440 aa  451  1e-125  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.558205 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1609  type II citrate synthase  53.48 
 
 		 429 aa  449  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.706948  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0995  citrate synthase I  51.43 
 
 		 434 aa  449  1e-125  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.655069 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0841  type II citrate synthase  50.95 
 
 		 429 aa  448  1e-125  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2563  type II citrate synthase  51.75 
 
 		 429 aa  451  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.102281  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0874  type II citrate synthase  51.76 
 
 		 429 aa  451  1e-125  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0015368  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2508  type II citrate synthase  53.43 
 
 		 436 aa  450  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.636436  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1832  type II citrate synthase  53.15 
 
 		 430 aa  451  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0111193  normal  0.0527351 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1731  citrate synthase I  50.83 
 
 		 439 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5205  type II citrate synthase  51.32 
 
 		 433 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.237518  normal  0.311757 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1783  type II citrate synthase  52.44 
 
 		 429 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0004224  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1600  citrate synthase  51.44 
 
 		 433 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2890  type II citrate synthase  50.83 
 
 		 433 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2919  type II citrate synthase  51.54 
 
 		 428 aa  445  1.0000000000000001e-124  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6851  type II citrate synthase  50.83 
 
 		 433 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.622921 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1678  type II citrate synthase  50.96 
 
 		 431 aa  447  1.0000000000000001e-124  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0407476  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0061  citrate synthase  50.48 
 
 		 430 aa  443  1e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0890712  normal  0.301769 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2189  type II citrate synthase  51.41 
 
 		 445 aa  442  1e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00268971  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>