More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1794 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00680  citrate synthase  69.5 
 
 		 427 aa  641    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2916  citrate synthase I  69.5 
 
 		 427 aa  641    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.349648  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1262  type II citrate synthase  69.41 
 
 		 430 aa  641    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.728692  normal  0.31118 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01350  type II citrate synthase  73.88 
 
 		 429 aa  692    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2886  type II citrate synthase  70.14 
 
 		 426 aa  654    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000035086  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2935  type II citrate synthase  69.5 
 
 		 427 aa  641    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.115815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0732  type II citrate synthase  69.5 
 
 		 427 aa  641    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.482725  normal  0.945982 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2214  citrate synthase I  74.47 
 
 		 428 aa  694    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.525644  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1926  type II citrate synthase  73.07 
 
 		 428 aa  659    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2819  type II citrate synthase  72.04 
 
 		 428 aa  645    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0484944  normal  0.528181 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1832  type II citrate synthase  71.56 
 
 		 430 aa  645    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0111193  normal  0.0527351 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2520  type II citrate synthase  72.83 
 
 		 428 aa  652    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0560239  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2919  type II citrate synthase  69.18 
 
 		 428 aa  639    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0764  type II citrate synthase  68.79 
 
 		 427 aa  639    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0790  type II citrate synthase  68.79 
 
 		 427 aa  639    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.148883  normal  0.115118 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0825  type II citrate synthase  68.79 
 
 		 427 aa  639    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0841  type II citrate synthase  72.24 
 
 		 429 aa  676    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1139  type II citrate synthase  69.88 
 
 		 428 aa  641    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1678  type II citrate synthase  72.94 
 
 		 431 aa  685    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0407476  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1650  type II citrate synthase  72.37 
 
 		 428 aa  657    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000481967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0854  type II citrate synthase  68.79 
 
 		 427 aa  639    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000551297 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0638  type II citrate synthase  69.5 
 
 		 427 aa  641    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2274  type II citrate synthase  72.83 
 
 		 428 aa  657    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000358341  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0747  type II citrate synthase  69.5 
 
 		 427 aa  641    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1379  type II citrate synthase  70.14 
 
 		 426 aa  654    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000415607  normal  0.279105 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2189  type II citrate synthase  70.73 
 
 		 445 aa  648    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00268971  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1831  type II citrate synthase  72.83 
 
 		 428 aa  652    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000179965  normal  0.249033 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0887  type II citrate synthase  68.79 
 
 		 427 aa  639    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.305732  normal  0.304459 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2973  type II citrate synthase  70.14 
 
 		 426 aa  654    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00618343  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004117  citrate synthase (si)  74.59 
 
 		 429 aa  696    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1794  citrate synthase I  100 
 
 		 426 aa  893    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000880013  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2508  type II citrate synthase  70.95 
 
 		 436 aa  635    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.636436  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1630  type II citrate synthase  73.3 
 
 		 428 aa  659    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.01465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1705  type II citrate synthase  73.3 
 
 		 428 aa  659    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00232802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1783  type II citrate synthase  72.37 
 
 		 429 aa  654    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0004224  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2348  type II citrate synthase  71.43 
 
 		 428 aa  653    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.729565  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00669  hypothetical protein  69.5 
 
 		 427 aa  641    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0768  type II citrate synthase  69.5 
 
 		 427 aa  641    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1705  type II citrate synthase  73.3 
 
 		 428 aa  659    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0861056  normal  0.668035 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1221  type II citrate synthase  68.56 
 
 		 427 aa  637    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.233861  normal  0.0870629 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1422  type II citrate synthase  73.77 
 
 		 428 aa  687    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000689188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0810  type II citrate synthase  69.5 
 
 		 427 aa  640    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.659455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2257  citrate synthase I  69.18 
 
 		 431 aa  658    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.19804  normal  0.414999 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01870  Citrate synthase  84.43 
 
 		 425 aa  780    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2513  type II citrate synthase  72.83 
 
 		 428 aa  652    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000256312  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2633  type II citrate synthase  72.83 
 
 		 428 aa  652    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000579193  normal  0.265493 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4194  type II citrate synthase  71.5 
 
 		 429 aa  634  1e-180  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0867349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3105  type II citrate synthase  69.5 
 
 		 428 aa  633  1e-180  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.510334  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1231  type II citrate synthase  69.5 
 
 		 428 aa  634  1e-180  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3765  type II citrate synthase  71.5 
 
 		 429 aa  634  1e-180  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0679988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1660  type II citrate synthase  71.5 
 
 		 429 aa  633  1e-180  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3517  type II citrate synthase  71.02 
 
 		 429 aa  632  1e-180  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29820  type II citrate synthase  69.09 
 
 		 427 aa  630  1e-179  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3694  type II citrate synthase  68.47 
 
 		 428 aa  630  1e-179  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1609  type II citrate synthase  70.02 
 
 		 429 aa  626  1e-178  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.706948  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3181  citrate synthase I  67.45 
 
 		 438 aa  625  1e-178  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.270593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44070  type II citrate synthase  68.24 
 
 		 428 aa  627  1e-178  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2194  citrate synthase I  70.31 
 
 		 429 aa  623  1e-177  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2004  type II citrate synthase  70.07 
 
 		 429 aa  622  1e-177  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.719341  normal  0.158891 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4425  citrate synthase I  66.67 
 
 		 436 aa  621  1e-177  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.224643  normal  0.0272577 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1789  type II citrate synthase  66.59 
 
 		 429 aa  622  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.069091  hitchhiker  0.00547545 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2032  citrate synthase  66.82 
 
 		 428 aa  621  1e-177  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808291  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2111  citrate synthase  67.06 
 
 		 454 aa  622  1e-177  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000226419  normal  0.855626 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1596  type II citrate synthase  67.06 
 
 		 429 aa  623  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.218131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1132  citrate synthase  68.53 
 
 		 431 aa  621  1e-177  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1646  type II citrate synthase  66.12 
 
 		 429 aa  621  1e-177  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0982845  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1149  citrate synthase I  66.75 
 
 		 424 aa  622  1e-177  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0960  citrate synthase  68.01 
 
 		 427 aa  620  1e-176  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2805  citrate synthase I  66.75 
 
 		 427 aa  616  1e-175  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.359876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0599  type II citrate synthase  66.04 
 
 		 430 aa  615  1e-175  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.281651  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1148  type II citrate synthase  65.89 
 
 		 430 aa  612  9.999999999999999e-175  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1841  citrate synthase  68.15 
 
 		 430 aa  613  9.999999999999999e-175  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.040491 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0829  citrate synthase I  64.86 
 
 		 427 aa  611  9.999999999999999e-175  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.292623  hitchhiker  0.00485559 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2563  type II citrate synthase  65.65 
 
 		 429 aa  611  9.999999999999999e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.102281  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1106  type II citrate synthase  65.89 
 
 		 435 aa  612  9.999999999999999e-175  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2042  type II citrate synthase  66.12 
 
 		 430 aa  610  1e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0529149  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1600  citrate synthase  65.51 
 
 		 433 aa  610  1e-173  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1212  citrate synthase  66.43 
 
 		 428 aa  610  1e-173  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000171793  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1144  type II citrate synthase  64.95 
 
 		 429 aa  607  9.999999999999999e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.300068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5205  type II citrate synthase  65.8 
 
 		 433 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.237518  normal  0.311757 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3212  citrate synthase  64.64 
 
 		 427 aa  606  9.999999999999999e-173  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215147  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1681  citrate synthase I  64.72 
 
 		 429 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592991 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6851  type II citrate synthase  65.34 
 
 		 433 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.622921 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5525  type II citrate synthase  65.47 
 
 		 432 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.615237  normal  0.487627 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0665  type II citrate synthase  65.03 
 
 		 433 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.170997  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1134  type II citrate synthase  65.71 
 
 		 432 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.066915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2890  type II citrate synthase  65.11 
 
 		 433 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1626  type II citrate synthase  64.34 
 
 		 433 aa  598  1e-170  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00616613  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3832  type II citrate synthase  64.25 
 
 		 433 aa  598  1e-170  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.418606 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0788  type II citrate synthase  64.34 
 
 		 433 aa  598  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0858919  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1834  type II citrate synthase  64.34 
 
 		 433 aa  598  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0219356  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2329  type II citrate synthase  64.34 
 
 		 433 aa  598  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2467  type II citrate synthase  64.34 
 
 		 433 aa  598  1e-170  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00536833  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2813  type II citrate synthase  64.55 
 
 		 434 aa  598  1e-170  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4643  type II citrate synthase  64.25 
 
 		 433 aa  598  1e-170  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0646  citrate synthase I  64.95 
 
 		 430 aa  598  1e-170  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.615558 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4366  type II citrate synthase  64.87 
 
 		 433 aa  598  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0504  type II citrate synthase  64.34 
 
 		 433 aa  598  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.405584  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3316  type II citrate synthase  64.49 
 
 		 433 aa  600  1e-170  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.229262  normal  0.697255 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3939  type II citrate synthase  64.49 
 
 		 433 aa  598  1e-170  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>