More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0829 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_5145  citrate synthase I  71.87 
 
 		 429 aa  666    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.236177  normal  0.0251581 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1596  type II citrate synthase  74.36 
 
 		 429 aa  685    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.218131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1144  type II citrate synthase  74.12 
 
 		 429 aa  679    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.300068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2042  type II citrate synthase  72.73 
 
 		 430 aa  665    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0529149  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0599  type II citrate synthase  68.54 
 
 		 430 aa  647    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.281651  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1106  type II citrate synthase  73.66 
 
 		 435 aa  672    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1148  type II citrate synthase  73.66 
 
 		 430 aa  672    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1789  type II citrate synthase  74.36 
 
 		 429 aa  687    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.069091  hitchhiker  0.00547545 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1845  type II citrate synthase  68.85 
 
 		 433 aa  638    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.273477  normal  0.198527 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1681  citrate synthase I  70.82 
 
 		 429 aa  654    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592991 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0704  citrate synthase I  69.63 
 
 		 428 aa  638    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1994  citrate synthase  69.63 
 
 		 428 aa  637    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.189666  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3212  citrate synthase  82.44 
 
 		 427 aa  747    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215147  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2023  citrate synthase I  71.5 
 
 		 429 aa  662    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1409  citrate synthase I  72.68 
 
 		 429 aa  655    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.423182 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1524  citrate synthase I  73.35 
 
 		 430 aa  671    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.802094  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1600  citrate synthase  69.98 
 
 		 433 aa  645    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2813  type II citrate synthase  68.94 
 
 		 434 aa  636    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2032  citrate synthase  86.21 
 
 		 428 aa  781    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808291  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1841  citrate synthase  70.02 
 
 		 430 aa  642    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.040491 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2450  type II citrate synthase  69.32 
 
 		 434 aa  640    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.444525 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4680  citrate synthase I  71.87 
 
 		 446 aa  665    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0646  citrate synthase I  73.11 
 
 		 430 aa  670    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.615558 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1132  citrate synthase  70.07 
 
 		 431 aa  646    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0829  citrate synthase I  100 
 
 		 427 aa  891    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.292623  hitchhiker  0.00485559 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4425  citrate synthase I  72.64 
 
 		 436 aa  669    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.224643  normal  0.0272577 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1646  type II citrate synthase  72.94 
 
 		 429 aa  674    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0982845  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2563  type II citrate synthase  74.12 
 
 		 429 aa  679    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.102281  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3253  type II citrate synthase  69.41 
 
 		 434 aa  637    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1395  citrate synthase  71.53 
 
 		 434 aa  656    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.322092  normal  0.0167868 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3091  citrate synthase I  69.39 
 
 		 428 aa  638    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.31999 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3716  citrate synthase I  70.59 
 
 		 430 aa  635    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.364105  normal  0.0570227 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5222  citrate synthase I  71.63 
 
 		 429 aa  667    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.827577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3181  citrate synthase I  72.94 
 
 		 438 aa  665    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.270593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4502  type II citrate synthase  68.15 
 
 		 434 aa  632  1e-180  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.705578 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2843  type II citrate synthase  68.24 
 
 		 434 aa  632  1e-180  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.433784  normal  0.36225 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2787  citrate synthase I  68.15 
 
 		 426 aa  633  1e-180  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.420339  normal  0.059507 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1806  citrate synthase  70.35 
 
 		 430 aa  629  1e-179  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.218068 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1708  type II citrate synthase  67.68 
 
 		 433 aa  623  1e-177  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.693797  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1626  type II citrate synthase  67.31 
 
 		 433 aa  619  1e-176  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00616613  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1744  type II citrate synthase  67.31 
 
 		 433 aa  619  1e-176  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.676143  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0788  type II citrate synthase  67.31 
 
 		 433 aa  619  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0858919  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0504  type II citrate synthase  67.31 
 
 		 433 aa  619  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.405584  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2467  type II citrate synthase  67.31 
 
 		 433 aa  619  1e-176  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00536833  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1834  type II citrate synthase  67.31 
 
 		 433 aa  619  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0219356  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01870  Citrate synthase  65.95 
 
 		 425 aa  620  1e-176  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2329  type II citrate synthase  67.31 
 
 		 433 aa  619  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1422  type II citrate synthase  67.22 
 
 		 428 aa  617  1e-176  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000689188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4643  type II citrate synthase  67.07 
 
 		 433 aa  616  1e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0841  type II citrate synthase  66.27 
 
 		 429 aa  614  1e-175  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5525  type II citrate synthase  65.41 
 
 		 432 aa  615  1e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.615237  normal  0.487627 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0665  type II citrate synthase  67.07 
 
 		 433 aa  616  1e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.170997  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1134  type II citrate synthase  65.65 
 
 		 432 aa  616  1e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.066915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2257  citrate synthase I  67.98 
 
 		 431 aa  617  1e-175  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.19804  normal  0.414999 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5205  type II citrate synthase  66.27 
 
 		 433 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.237518  normal  0.311757 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004117  citrate synthase (si)  66.51 
 
 		 429 aa  614  9.999999999999999e-175  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1794  citrate synthase I  64.86 
 
 		 426 aa  611  9.999999999999999e-175  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000880013  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3832  type II citrate synthase  65.87 
 
 		 433 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.418606 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01350  type II citrate synthase  66.03 
 
 		 429 aa  613  9.999999999999999e-175  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1149  citrate synthase I  67.85 
 
 		 424 aa  613  9.999999999999999e-175  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3589  type II citrate synthase  66.35 
 
 		 433 aa  610  1e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0248785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1832  type II citrate synthase  68.16 
 
 		 430 aa  608  1e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0111193  normal  0.0527351 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2147  type II citrate synthase  66.35 
 
 		 433 aa  610  1e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.787035  normal  0.703076 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1678  type II citrate synthase  65.55 
 
 		 431 aa  610  1e-173  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0407476  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4428  type II citrate synthase  66.35 
 
 		 433 aa  610  1e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3316  type II citrate synthase  65.62 
 
 		 433 aa  608  1e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.229262  normal  0.697255 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3939  type II citrate synthase  66.35 
 
 		 433 aa  610  1e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29820  type II citrate synthase  66.75 
 
 		 427 aa  605  9.999999999999999e-173  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6851  type II citrate synthase  65.87 
 
 		 433 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.622921 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4366  type II citrate synthase  65.62 
 
 		 433 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2890  type II citrate synthase  66.11 
 
 		 433 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2819  type II citrate synthase  67.61 
 
 		 428 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0484944  normal  0.528181 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44070  type II citrate synthase  67.22 
 
 		 428 aa  604  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3694  type II citrate synthase  67.22 
 
 		 428 aa  604  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00680  citrate synthase  66.43 
 
 		 427 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2916  citrate synthase I  66.43 
 
 		 427 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.349648  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0732  type II citrate synthase  66.43 
 
 		 427 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.482725  normal  0.945982 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2214  citrate synthase I  65.79 
 
 		 428 aa  602  1.0000000000000001e-171  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.525644  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0810  type II citrate synthase  66.43 
 
 		 427 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.659455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1379  type II citrate synthase  65.95 
 
 		 426 aa  603  1.0000000000000001e-171  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000415607  normal  0.279105 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0854  type II citrate synthase  65.73 
 
 		 427 aa  602  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000551297 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00669  hypothetical protein  66.43 
 
 		 427 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2973  type II citrate synthase  65.95 
 
 		 426 aa  603  1.0000000000000001e-171  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00618343  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2935  type II citrate synthase  66.43 
 
 		 427 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.115815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0825  type II citrate synthase  65.73 
 
 		 427 aa  602  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0768  type II citrate synthase  66.43 
 
 		 427 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2508  type II citrate synthase  67.8 
 
 		 436 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.636436  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0764  type II citrate synthase  65.73 
 
 		 427 aa  602  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0638  type II citrate synthase  66.43 
 
 		 427 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0790  type II citrate synthase  65.73 
 
 		 427 aa  602  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.148883  normal  0.115118 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0887  type II citrate synthase  65.73 
 
 		 427 aa  602  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.305732  normal  0.304459 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1630  type II citrate synthase  67.92 
 
 		 428 aa  601  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.01465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1705  type II citrate synthase  67.92 
 
 		 428 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00232802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0747  type II citrate synthase  66.43 
 
 		 427 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0897  citrate synthase  67.7 
 
 		 433 aa  601  1.0000000000000001e-171  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0898483  normal  0.676877 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1705  type II citrate synthase  67.92 
 
 		 428 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0861056  normal  0.668035 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1221  type II citrate synthase  66.19 
 
 		 427 aa  602  1.0000000000000001e-171  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.233861  normal  0.0870629 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2886  type II citrate synthase  65.95 
 
 		 426 aa  603  1.0000000000000001e-171  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000035086  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2199  type II citrate synthase  65.42 
 
 		 436 aa  601  1.0000000000000001e-171  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.308068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3605  type II citrate synthase  66.59 
 
 		 436 aa  600  1e-170  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.113528 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>