More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2508 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00680  citrate synthase  70.99 
 
 		 427 aa  664    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2916  citrate synthase I  70.99 
 
 		 427 aa  664    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.349648  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1262  type II citrate synthase  69.88 
 
 		 430 aa  647    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.728692  normal  0.31118 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4194  type II citrate synthase  91.04 
 
 		 429 aa  817    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0867349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004117  citrate synthase (si)  72.99 
 
 		 429 aa  671    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2214  citrate synthase I  69.91 
 
 		 428 aa  637    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.525644  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3694  type II citrate synthase  90.42 
 
 		 428 aa  820    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1926  type II citrate synthase  73.46 
 
 		 428 aa  644    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2194  citrate synthase I  91.51 
 
 		 429 aa  819    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2513  type II citrate synthase  73.11 
 
 		 428 aa  638    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000256312  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2819  type II citrate synthase  72.75 
 
 		 428 aa  637    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0484944  normal  0.528181 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00669  hypothetical protein  70.99 
 
 		 427 aa  664    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2004  type II citrate synthase  91.27 
 
 		 429 aa  818    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.719341  normal  0.158891 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1231  type II citrate synthase  70.75 
 
 		 428 aa  655    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0810  type II citrate synthase  70.99 
 
 		 427 aa  664    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.659455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0764  type II citrate synthase  70.45 
 
 		 427 aa  658    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1609  type II citrate synthase  92.18 
 
 		 429 aa  824    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.706948  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3765  type II citrate synthase  91.04 
 
 		 429 aa  817    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0679988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2805  citrate synthase I  74.71 
 
 		 427 aa  689    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.359876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2973  type II citrate synthase  70.21 
 
 		 426 aa  649    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00618343  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1678  type II citrate synthase  72.51 
 
 		 431 aa  668    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0407476  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0747  type II citrate synthase  70.99 
 
 		 427 aa  664    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0887  type II citrate synthase  70.45 
 
 		 427 aa  658    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.305732  normal  0.304459 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01350  type II citrate synthase  72.99 
 
 		 429 aa  673    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1831  type II citrate synthase  73.11 
 
 		 428 aa  638    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000179965  normal  0.249033 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1379  type II citrate synthase  70.21 
 
 		 426 aa  649    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000415607  normal  0.279105 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0854  type II citrate synthase  70.45 
 
 		 427 aa  658    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000551297 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1221  type II citrate synthase  70.05 
 
 		 427 aa  658    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.233861  normal  0.0870629 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2935  type II citrate synthase  70.99 
 
 		 427 aa  664    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.115815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0732  type II citrate synthase  70.99 
 
 		 427 aa  664    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.482725  normal  0.945982 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2111  citrate synthase  73.77 
 
 		 454 aa  673    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000226419  normal  0.855626 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0825  type II citrate synthase  70.45 
 
 		 427 aa  658    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2189  type II citrate synthase  71.89 
 
 		 445 aa  650    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00268971  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0841  type II citrate synthase  73.93 
 
 		 429 aa  681    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1212  citrate synthase  72.83 
 
 		 428 aa  676    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000171793  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3517  type II citrate synthase  91 
 
 		 429 aa  815    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1660  type II citrate synthase  91.23 
 
 		 429 aa  816    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1794  citrate synthase I  70.95 
 
 		 426 aa  635    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000880013  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1646  type II citrate synthase  70.69 
 
 		 429 aa  639    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0982845  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29820  type II citrate synthase  92.86 
 
 		 427 aa  835    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1630  type II citrate synthase  73.93 
 
 		 428 aa  647    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.01465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1705  type II citrate synthase  73.7 
 
 		 428 aa  645    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00232802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2348  type II citrate synthase  72.27 
 
 		 428 aa  634    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.729565  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0790  type II citrate synthase  70.45 
 
 		 427 aa  658    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.148883  normal  0.115118 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44070  type II citrate synthase  90.65 
 
 		 428 aa  823    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2886  type II citrate synthase  70.21 
 
 		 426 aa  649    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000035086  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1139  type II citrate synthase  71.73 
 
 		 428 aa  662    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2633  type II citrate synthase  73.11 
 
 		 428 aa  638    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000579193  normal  0.265493 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1705  type II citrate synthase  73.93 
 
 		 428 aa  647    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0861056  normal  0.668035 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2274  type II citrate synthase  73.22 
 
 		 428 aa  640    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000358341  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2919  type II citrate synthase  71.5 
 
 		 428 aa  657    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2508  type II citrate synthase  100 
 
 		 436 aa  913    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.636436  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1422  type II citrate synthase  73.46 
 
 		 428 aa  664    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000689188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2520  type II citrate synthase  73.11 
 
 		 428 aa  638    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0560239  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0768  type II citrate synthase  70.99 
 
 		 427 aa  664    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2257  citrate synthase I  71.39 
 
 		 431 aa  645    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.19804  normal  0.414999 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3105  type II citrate synthase  70.52 
 
 		 428 aa  652    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.510334  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1149  citrate synthase I  75.18 
 
 		 424 aa  681    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1832  type II citrate synthase  72.86 
 
 		 430 aa  638    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0111193  normal  0.0527351 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0638  type II citrate synthase  70.99 
 
 		 427 aa  664    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1370  citrate synthase  69.91 
 
 		 423 aa  631  1e-180  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1366  citrate synthase  70.14 
 
 		 423 aa  633  1e-180  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0106  citrate synthase I  70.38 
 
 		 426 aa  633  1e-180  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0058  citrate synthase I  71.5 
 
 		 432 aa  632  1e-180  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00358332  normal  0.0142462 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0097  citrate synthase  70.14 
 
 		 426 aa  629  1e-179  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0802276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2032  citrate synthase  70.14 
 
 		 428 aa  630  1e-179  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808291  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6851  type II citrate synthase  69.27 
 
 		 433 aa  630  1e-179  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.622921 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2890  type II citrate synthase  69.27 
 
 		 433 aa  630  1e-179  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1650  type II citrate synthase  71.56 
 
 		 428 aa  627  1e-179  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000481967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0260  citrate synthase I  69.91 
 
 		 426 aa  629  1e-179  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.419168  normal  0.11552 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0960  citrate synthase  70.05 
 
 		 427 aa  630  1e-179  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1783  type II citrate synthase  71.56 
 
 		 429 aa  629  1e-179  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0004224  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2042  type II citrate synthase  68.79 
 
 		 430 aa  626  1e-178  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0529149  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1600  citrate synthase  70.14 
 
 		 433 aa  627  1e-178  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01870  Citrate synthase  68.1 
 
 		 425 aa  627  1e-178  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2481  type II citrate synthase  68.24 
 
 		 433 aa  624  1e-178  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523496  normal  0.0627534 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3212  citrate synthase  71.05 
 
 		 427 aa  623  1e-177  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215147  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1106  type II citrate synthase  68.32 
 
 		 435 aa  624  1e-177  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1148  type II citrate synthase  68.32 
 
 		 430 aa  624  1e-177  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4366  type II citrate synthase  68.32 
 
 		 433 aa  622  1e-177  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1596  type II citrate synthase  69.03 
 
 		 429 aa  621  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.218131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1409  citrate synthase I  70.94 
 
 		 429 aa  622  1e-177  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.423182 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2545  citrate synthase I  68.16 
 
 		 431 aa  621  1e-177  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5222  citrate synthase I  69.54 
 
 		 429 aa  622  1e-177  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.827577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1144  type II citrate synthase  69.03 
 
 		 429 aa  623  1e-177  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.300068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2320  type II citrate synthase  68 
 
 		 433 aa  620  1e-176  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1789  type II citrate synthase  68.79 
 
 		 429 aa  620  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.069091  hitchhiker  0.00547545 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4425  citrate synthase I  68.48 
 
 		 436 aa  619  1e-176  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.224643  normal  0.0272577 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2798  type II citrate synthase  67.91 
 
 		 436 aa  615  1e-175  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.242965 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0599  type II citrate synthase  68.09 
 
 		 430 aa  616  1e-175  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.281651  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5145  citrate synthase I  68.82 
 
 		 429 aa  617  1e-175  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.236177  normal  0.0251581 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2860  citrate synthase  68.76 
 
 		 432 aa  615  1e-175  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2288  type II citrate synthase  67.91 
 
 		 436 aa  615  1e-175  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4680  citrate synthase I  68.82 
 
 		 446 aa  616  1e-175  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3181  citrate synthase I  67.77 
 
 		 438 aa  615  1e-175  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.270593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0858  citrate synthase I  67.84 
 
 		 433 aa  615  1e-175  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0665  type II citrate synthase  68.01 
 
 		 433 aa  615  1e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.170997  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2813  type II citrate synthase  68.65 
 
 		 434 aa  616  1e-175  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0788  type II citrate synthase  67.77 
 
 		 433 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0858919  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2329  type II citrate synthase  67.77 
 
 		 433 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>