More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4838 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_1729  type II citrate synthase  91.47 
 
 		 434 aa  822    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.540557 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0855  citrate synthase I  81.59 
 
 		 432 aa  731    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0328929  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1140  citrate synthase I  72.99 
 
 		 441 aa  643    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.615799  normal  0.0294382 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4838  type II citrate synthase  100 
 
 		 434 aa  895    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.782916  normal  0.17167 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2136  citrate synthase I  72.34 
 
 		 427 aa  658    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.873392  normal  0.0485985 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0528  citrate synthase I  77.96 
 
 		 437 aa  686    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0708503  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0999  citrate synthase I  74.88 
 
 		 438 aa  688    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33600  citrate synthase  74.37 
 
 		 437 aa  677    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.522546 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4456  type II citrate synthase  100 
 
 		 434 aa  895    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4703  citrate synthase I  74.02 
 
 		 463 aa  679    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5022  type II citrate synthase  92.17 
 
 		 434 aa  830    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.834357 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2284  citrate synthase I  72.58 
 
 		 427 aa  654    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193692  normal  0.0343529 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1270  citrate synthase I  83.95 
 
 		 440 aa  753    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10915  type II citrate synthase  83.91 
 
 		 431 aa  750    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4543  type II citrate synthase  100 
 
 		 434 aa  895    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.701189 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1964  citrate synthase I  69.03 
 
 		 427 aa  632  1e-180  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0148224  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2531  citrate synthase I  70.81 
 
 		 428 aa  618  1e-176  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000235775 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2811  citrate synthase  69.5 
 
 		 427 aa  616  1e-175  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0195056  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11150  citrate synthase  65.11 
 
 		 450 aa  591  1e-168  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.592524  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0995  citrate synthase I  64.3 
 
 		 436 aa  580  1e-164  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25990  citrate synthase  64.34 
 
 		 432 aa  572  1.0000000000000001e-162  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15490  citrate synthase  66.27 
 
 		 428 aa  573  1.0000000000000001e-162  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.167286  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0803  citrate synthase I  62.76 
 
 		 440 aa  568  1e-161  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.558205 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1130  citrate synthase I  61.77 
 
 		 431 aa  560  1e-158  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.684999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1275  citrate synthase  59.25 
 
 		 427 aa  550  1e-155  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.152797  normal  0.229785 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3584  citrate synthase I  58.55 
 
 		 425 aa  543  1e-153  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00887444 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0972  citrate synthase I  60 
 
 		 436 aa  544  1e-153  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19470  citrate synthase  63.57 
 
 		 428 aa  538  1e-151  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.286826  hitchhiker  0.00826117 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2224  citrate synthase I  59.2 
 
 		 425 aa  533  1e-150  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2053  citrate synthase I  58.02 
 
 		 428 aa  533  1e-150  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.655097  normal  0.0360596 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0554  citrate synthase I  57.28 
 
 		 428 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.488876  normal  0.835408 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5036  citrate synthase I  57.08 
 
 		 428 aa  517  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3212  citrate synthase  57.45 
 
 		 427 aa  504  9.999999999999999e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215147  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05880  citrate synthase  55.74 
 
 		 428 aa  505  9.999999999999999e-143  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0995  citrate synthase I  55.45 
 
 		 434 aa  507  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.655069 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4425  citrate synthase I  54.36 
 
 		 436 aa  501  1e-141  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.224643  normal  0.0272577 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0969  citrate synthase I  56.26 
 
 		 427 aa  503  1e-141  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4502  type II citrate synthase  54.65 
 
 		 434 aa  500  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.705578 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2023  citrate synthase I  56.56 
 
 		 429 aa  501  1e-140  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1731  citrate synthase I  56.16 
 
 		 439 aa  499  1e-140  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1132  citrate synthase  57.65 
 
 		 431 aa  501  1e-140  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0847  citrate synthase  55.97 
 
 		 429 aa  497  1e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2042  type II citrate synthase  54.59 
 
 		 430 aa  495  1e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0529149  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02359  type II citrate synthase  56.66 
 
 		 442 aa  497  1e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1845  type II citrate synthase  54.29 
 
 		 433 aa  496  1e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.273477  normal  0.198527 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2813  type II citrate synthase  54.27 
 
 		 434 aa  497  1e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2450  type II citrate synthase  53.81 
 
 		 434 aa  497  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.444525 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1681  citrate synthase I  55.77 
 
 		 429 aa  495  1e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592991 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5222  citrate synthase I  55.18 
 
 		 429 aa  495  1e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.827577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3253  type II citrate synthase  54.04 
 
 		 434 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1301  Citrate (Si)-synthase  54.18 
 
 		 431 aa  495  1e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.115082  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4680  citrate synthase I  55.42 
 
 		 446 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1148  type II citrate synthase  54.35 
 
 		 430 aa  493  9.999999999999999e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1524  citrate synthase I  54.23 
 
 		 430 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.802094  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1139  type II citrate synthase  55.21 
 
 		 428 aa  492  9.999999999999999e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2032  citrate synthase  55.4 
 
 		 428 aa  494  9.999999999999999e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808291  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0646  citrate synthase I  54.46 
 
 		 430 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.615558 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2843  type II citrate synthase  53.6 
 
 		 434 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.433784  normal  0.36225 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0058  citrate synthase I  54.59 
 
 		 432 aa  491  9.999999999999999e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00358332  normal  0.0142462 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5145  citrate synthase I  55.42 
 
 		 429 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.236177  normal  0.0251581 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0367  citrate synthase I  54.92 
 
 		 425 aa  493  9.999999999999999e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29820  type II citrate synthase  57 
 
 		 427 aa  494  9.999999999999999e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1646  type II citrate synthase  54.31 
 
 		 429 aa  491  9.999999999999999e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0982845  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0704  citrate synthase I  56.07 
 
 		 428 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1422  type II citrate synthase  55.53 
 
 		 428 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000689188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1106  type II citrate synthase  54.35 
 
 		 435 aa  494  9.999999999999999e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2973  type II citrate synthase  53.92 
 
 		 426 aa  488  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00618343  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2919  type II citrate synthase  54.27 
 
 		 428 aa  490  1e-137  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1994  citrate synthase  55.84 
 
 		 428 aa  490  1e-137  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.189666  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1409  citrate synthase I  55.88 
 
 		 429 aa  491  1e-137  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.423182 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1708  type II citrate synthase  53.83 
 
 		 433 aa  491  1e-137  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.693797  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2886  type II citrate synthase  53.92 
 
 		 426 aa  488  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000035086  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1379  type II citrate synthase  53.92 
 
 		 426 aa  488  1e-137  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000415607  normal  0.279105 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44070  type II citrate synthase  56.59 
 
 		 428 aa  489  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3716  citrate synthase I  55.76 
 
 		 430 aa  491  1e-137  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.364105  normal  0.0570227 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00680  citrate synthase  53.97 
 
 		 427 aa  486  1e-136  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2916  citrate synthase I  53.97 
 
 		 427 aa  486  1e-136  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.349648  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2508  type II citrate synthase  55.66 
 
 		 436 aa  487  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.636436  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0747  type II citrate synthase  53.97 
 
 		 427 aa  486  1e-136  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1789  type II citrate synthase  55.29 
 
 		 429 aa  487  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.069091  hitchhiker  0.00547545 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3694  type II citrate synthase  56.28 
 
 		 428 aa  487  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0854  type II citrate synthase  53.5 
 
 		 427 aa  485  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000551297 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0732  type II citrate synthase  53.97 
 
 		 427 aa  486  1e-136  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.482725  normal  0.945982 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0768  type II citrate synthase  53.97 
 
 		 427 aa  486  1e-136  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1609  type II citrate synthase  56.25 
 
 		 429 aa  486  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.706948  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0638  type II citrate synthase  53.97 
 
 		 427 aa  486  1e-136  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0790  type II citrate synthase  53.5 
 
 		 427 aa  485  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.148883  normal  0.115118 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1231  type II citrate synthase  53.79 
 
 		 428 aa  485  1e-136  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0810  type II citrate synthase  54.27 
 
 		 427 aa  485  1e-136  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.659455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1600  citrate synthase  56.09 
 
 		 433 aa  487  1e-136  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1596  type II citrate synthase  54.81 
 
 		 429 aa  486  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.218131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0764  type II citrate synthase  53.5 
 
 		 427 aa  485  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3091  citrate synthase I  55.61 
 
 		 428 aa  487  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.31999 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0887  type II citrate synthase  53.5 
 
 		 427 aa  485  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.305732  normal  0.304459 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0829  citrate synthase I  54.8 
 
 		 427 aa  486  1e-136  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.292623  hitchhiker  0.00485559 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00669  hypothetical protein  53.97 
 
 		 427 aa  486  1e-136  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0825  type II citrate synthase  53.5 
 
 		 427 aa  485  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1144  type II citrate synthase  54.12 
 
 		 429 aa  485  1e-136  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.300068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2935  type II citrate synthase  53.97 
 
 		 427 aa  486  1e-136  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.115815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3517  type II citrate synthase  55.09 
 
 		 429 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>