More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0855 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_33600  citrate synthase  74.53 
 
 		 437 aa  665    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.522546 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4838  type II citrate synthase  81.59 
 
 		 434 aa  731    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.782916  normal  0.17167 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1729  type II citrate synthase  80.97 
 
 		 434 aa  725    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.540557 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1140  citrate synthase I  72.66 
 
 		 441 aa  641    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.615799  normal  0.0294382 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4703  citrate synthase I  74.88 
 
 		 463 aa  667    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0855  citrate synthase I  100 
 
 		 432 aa  894    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0328929  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0528  citrate synthase I  76.96 
 
 		 437 aa  677    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0708503  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4456  type II citrate synthase  81.59 
 
 		 434 aa  731    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0999  citrate synthase I  74.01 
 
 		 438 aa  669    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2284  citrate synthase I  69.93 
 
 		 427 aa  638    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193692  normal  0.0343529 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10915  type II citrate synthase  79.02 
 
 		 431 aa  705    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1270  citrate synthase I  86.38 
 
 		 440 aa  771    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2136  citrate synthase I  70.17 
 
 		 427 aa  643    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.873392  normal  0.0485985 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4543  type II citrate synthase  81.59 
 
 		 434 aa  731    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.701189 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5022  type II citrate synthase  81.44 
 
 		 434 aa  736    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.834357 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2531  citrate synthase I  71.03 
 
 		 428 aa  630  1e-179  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000235775 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1964  citrate synthase I  69.95 
 
 		 427 aa  626  1e-178  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0148224  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2811  citrate synthase  70.05 
 
 		 427 aa  622  1e-177  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0195056  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0995  citrate synthase I  67.83 
 
 		 436 aa  613  9.999999999999999e-175  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15490  citrate synthase  68.86 
 
 		 428 aa  592  1e-168  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.167286  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11150  citrate synthase  65.02 
 
 		 450 aa  587  1e-166  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.592524  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25990  citrate synthase  67.32 
 
 		 432 aa  584  1.0000000000000001e-165  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0803  citrate synthase I  66.42 
 
 		 440 aa  571  1.0000000000000001e-162  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.558205 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1130  citrate synthase I  63.92 
 
 		 431 aa  569  1e-161  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.684999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0972  citrate synthase I  62.29 
 
 		 436 aa  564  1.0000000000000001e-159  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19470  citrate synthase  62.65 
 
 		 428 aa  553  1e-156  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.286826  hitchhiker  0.00826117 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3584  citrate synthase I  59.9 
 
 		 425 aa  544  1e-153  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00887444 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2053  citrate synthase I  59.9 
 
 		 428 aa  540  9.999999999999999e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.655097  normal  0.0360596 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2224  citrate synthase I  60.88 
 
 		 425 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1275  citrate synthase  59.86 
 
 		 427 aa  534  1e-150  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.152797  normal  0.229785 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0554  citrate synthase I  59.33 
 
 		 428 aa  517  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.488876  normal  0.835408 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0847  citrate synthase  59.51 
 
 		 429 aa  512  1e-144  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2032  citrate synthase  58.71 
 
 		 428 aa  513  1e-144  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808291  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5036  citrate synthase I  58 
 
 		 428 aa  513  1e-144  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3212  citrate synthase  58.98 
 
 		 427 aa  508  1e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215147  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05880  citrate synthase  57.11 
 
 		 428 aa  508  9.999999999999999e-143  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02359  type II citrate synthase  55.21 
 
 		 442 aa  503  1e-141  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3253  type II citrate synthase  56.44 
 
 		 434 aa  502  1e-141  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0367  citrate synthase I  55.5 
 
 		 425 aa  499  1e-140  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4425  citrate synthase I  55.58 
 
 		 436 aa  499  1e-140  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.224643  normal  0.0272577 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2023  citrate synthase I  57.01 
 
 		 429 aa  500  1e-140  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4680  citrate synthase I  55.06 
 
 		 446 aa  496  1e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1845  type II citrate synthase  55.19 
 
 		 433 aa  495  1e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.273477  normal  0.198527 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2813  type II citrate synthase  55.71 
 
 		 434 aa  497  1e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2450  type II citrate synthase  55.74 
 
 		 434 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.444525 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2843  type II citrate synthase  55.27 
 
 		 434 aa  495  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.433784  normal  0.36225 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1132  citrate synthase  57.04 
 
 		 431 aa  495  1e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0995  citrate synthase I  54.81 
 
 		 434 aa  496  1e-139  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.655069 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5145  citrate synthase I  55.48 
 
 		 429 aa  495  1e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.236177  normal  0.0251581 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3716  citrate synthase I  56.42 
 
 		 430 aa  498  1e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.364105  normal  0.0570227 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4502  type II citrate synthase  54.8 
 
 		 434 aa  496  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.705578 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1106  type II citrate synthase  54.89 
 
 		 435 aa  491  9.999999999999999e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2508  type II citrate synthase  58.15 
 
 		 436 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.636436  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_004310  BR1148  type II citrate synthase  54.89 
 
 		 430 aa  491  9.999999999999999e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1609  type II citrate synthase  59.22 
 
 		 429 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.706948  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0874  type II citrate synthase  55.16 
 
 		 429 aa  492  9.999999999999999e-139  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0015368  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1731  citrate synthase I  55.92 
 
 		 439 aa  491  9.999999999999999e-139  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0763  type II citrate synthase  55.06 
 
 		 437 aa  491  9.999999999999999e-139  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1524  citrate synthase I  55.71 
 
 		 430 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.802094  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5222  citrate synthase I  55.5 
 
 		 429 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.827577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1301  Citrate (Si)-synthase  54.24 
 
 		 431 aa  488  1e-137  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.115082  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2194  citrate synthase I  58.5 
 
 		 429 aa  489  1e-137  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2004  type II citrate synthase  58.5 
 
 		 429 aa  489  1e-137  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.719341  normal  0.158891 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0704  citrate synthase I  56.83 
 
 		 428 aa  489  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2320  type II citrate synthase  54.14 
 
 		 433 aa  488  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0787  type II citrate synthase  54.93 
 
 		 429 aa  490  1e-137  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0646  citrate synthase I  55.48 
 
 		 430 aa  489  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.615558 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1708  type II citrate synthase  54.48 
 
 		 433 aa  488  1e-137  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.693797  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1681  citrate synthase I  55.85 
 
 		 429 aa  489  1e-137  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592991 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0829  citrate synthase I  56.22 
 
 		 427 aa  490  1e-137  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.292623  hitchhiker  0.00485559 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2042  type II citrate synthase  54.65 
 
 		 430 aa  490  1e-137  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0529149  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29820  type II citrate synthase  57.95 
 
 		 427 aa  490  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6851  type II citrate synthase  54.63 
 
 		 433 aa  485  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.622921 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4194  type II citrate synthase  58.25 
 
 		 429 aa  488  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0867349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3765  type II citrate synthase  58.25 
 
 		 429 aa  488  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0679988  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1744  type II citrate synthase  56.37 
 
 		 433 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.676143  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0504  type II citrate synthase  56.37 
 
 		 433 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.405584  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0788  type II citrate synthase  56.37 
 
 		 433 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0858919  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1994  citrate synthase  56.59 
 
 		 428 aa  488  1e-136  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.189666  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2329  type II citrate synthase  56.37 
 
 		 433 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1660  type II citrate synthase  58.25 
 
 		 429 aa  487  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2467  type II citrate synthase  56.37 
 
 		 433 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00536833  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1834  type II citrate synthase  56.37 
 
 		 433 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0219356  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3694  type II citrate synthase  56.97 
 
 		 428 aa  487  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0665  type II citrate synthase  56.37 
 
 		 433 aa  486  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.170997  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3091  citrate synthase I  56.34 
 
 		 428 aa  486  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.31999 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1409  citrate synthase I  55.99 
 
 		 429 aa  486  1e-136  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.423182 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1134  type II citrate synthase  55.75 
 
 		 432 aa  486  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.066915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2890  type II citrate synthase  54.63 
 
 		 433 aa  485  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1144  type II citrate synthase  54.89 
 
 		 429 aa  485  1e-136  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.300068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2752  citrate synthase  56.9 
 
 		 432 aa  485  1e-136  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.816634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1395  citrate synthase  55.37 
 
 		 434 aa  486  1e-136  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.322092  normal  0.0167868 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44070  type II citrate synthase  57.04 
 
 		 428 aa  487  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1626  type II citrate synthase  56.37 
 
 		 433 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00616613  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0058  citrate synthase I  54.89 
 
 		 432 aa  488  1e-136  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00358332  normal  0.0142462 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2798  type II citrate synthase  53.74 
 
 		 436 aa  484  1e-135  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.242965 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1841  citrate synthase  55.85 
 
 		 430 aa  483  1e-135  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.040491 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1058  type II citrate synthase  54.12 
 
 		 437 aa  484  1e-135  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.704464  normal  0.0578787 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3517  type II citrate synthase  57.52 
 
 		 429 aa  482  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2288  type II citrate synthase  53.74 
 
 		 436 aa  484  1e-135  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>