More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_25990 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0803  citrate synthase I  82.87 
 
 		 440 aa  744    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.558205 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25990  citrate synthase  100 
 
 		 432 aa  892    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0972  citrate synthase I  76.3 
 
 		 436 aa  676    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1130  citrate synthase I  69.68 
 
 		 431 aa  639    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.684999  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0995  citrate synthase I  83.18 
 
 		 436 aa  744    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1140  citrate synthase I  68.98 
 
 		 441 aa  629  1e-179  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.615799  normal  0.0294382 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2284  citrate synthase I  65.57 
 
 		 427 aa  598  1e-170  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193692  normal  0.0343529 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2136  citrate synthase I  65.33 
 
 		 427 aa  597  1e-169  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.873392  normal  0.0485985 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0528  citrate synthase I  64.99 
 
 		 437 aa  596  1e-169  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0708503  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4703  citrate synthase I  65.65 
 
 		 463 aa  597  1e-169  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0999  citrate synthase I  66.04 
 
 		 438 aa  595  1e-169  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2531  citrate synthase I  64.55 
 
 		 428 aa  588  1e-167  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000235775 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33600  citrate synthase  66.34 
 
 		 437 aa  589  1e-167  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.522546 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1964  citrate synthase I  63.44 
 
 		 427 aa  585  1e-166  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0148224  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2811  citrate synthase  65.57 
 
 		 427 aa  586  1e-166  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0195056  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0855  citrate synthase I  67.32 
 
 		 432 aa  584  1.0000000000000001e-165  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0328929  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1270  citrate synthase I  63.64 
 
 		 440 aa  580  1e-164  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4838  type II citrate synthase  64.34 
 
 		 434 aa  572  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.782916  normal  0.17167 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4456  type II citrate synthase  64.34 
 
 		 434 aa  572  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4543  type II citrate synthase  64.34 
 
 		 434 aa  572  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.701189 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11150  citrate synthase  61.86 
 
 		 450 aa  565  1e-160  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.592524  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1729  type II citrate synthase  63.68 
 
 		 434 aa  564  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.540557 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1911  citrate synthase  62.41 
 
 		 430 aa  559  1e-158  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5022  type II citrate synthase  62.18 
 
 		 434 aa  559  1e-158  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.834357 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10915  type II citrate synthase  63.06 
 
 		 431 aa  554  1e-157  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15490  citrate synthase  63.68 
 
 		 428 aa  545  1e-154  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.167286  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19470  citrate synthase  61.18 
 
 		 428 aa  517  1.0000000000000001e-145  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.286826  hitchhiker  0.00826117 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1275  citrate synthase  55.11 
 
 		 427 aa  500  1e-140  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.152797  normal  0.229785 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05880  citrate synthase  55.58 
 
 		 428 aa  494  1e-139  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1845  type II citrate synthase  54.97 
 
 		 433 aa  492  9.999999999999999e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.273477  normal  0.198527 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2224  citrate synthase I  53.52 
 
 		 425 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2053  citrate synthase I  54.14 
 
 		 428 aa  493  9.999999999999999e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.655097  normal  0.0360596 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3212  citrate synthase  55.29 
 
 		 427 aa  489  1e-137  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215147  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1646  type II citrate synthase  55.16 
 
 		 429 aa  488  1e-137  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0982845  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1708  type II citrate synthase  54.73 
 
 		 433 aa  488  1e-136  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.693797  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2023  citrate synthase I  54.25 
 
 		 429 aa  478  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0367  citrate synthase I  52.39 
 
 		 425 aa  480  1e-134  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1409  citrate synthase I  53.54 
 
 		 429 aa  478  1e-134  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.423182 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3253  type II citrate synthase  53.47 
 
 		 434 aa  478  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4502  type II citrate synthase  53.24 
 
 		 434 aa  479  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.705578 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3584  citrate synthase I  52.84 
 
 		 425 aa  481  1e-134  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00887444 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5036  citrate synthase I  53.05 
 
 		 428 aa  476  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1731  citrate synthase I  54.23 
 
 		 439 aa  478  1e-133  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5222  citrate synthase I  53.66 
 
 		 429 aa  476  1e-133  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.827577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2450  type II citrate synthase  53.24 
 
 		 434 aa  474  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.444525 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02359  type II citrate synthase  54.48 
 
 		 442 aa  477  1e-133  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0874  type II citrate synthase  54.52 
 
 		 429 aa  473  1e-132  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0015368  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1524  citrate synthase I  53.63 
 
 		 430 aa  473  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.802094  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0646  citrate synthase I  53.63 
 
 		 430 aa  471  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.615558 
 
 
-
 
NC_004310  BR1148  type II citrate synthase  52.66 
 
 		 430 aa  471  1e-132  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4680  citrate synthase I  53.66 
 
 		 446 aa  473  1e-132  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5145  citrate synthase I  53.66 
 
 		 429 aa  474  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.236177  normal  0.0251581 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0058  citrate synthase I  52.83 
 
 		 432 aa  474  1e-132  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00358332  normal  0.0142462 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0969  citrate synthase I  53.18 
 
 		 427 aa  474  1e-132  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1106  type II citrate synthase  52.66 
 
 		 435 aa  472  1e-132  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0787  type II citrate synthase  54.52 
 
 		 429 aa  469  1.0000000000000001e-131  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1144  type II citrate synthase  52.58 
 
 		 429 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.300068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2813  type II citrate synthase  52.55 
 
 		 434 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2032  citrate synthase  52.55 
 
 		 428 aa  471  1.0000000000000001e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808291  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2042  type II citrate synthase  52.66 
 
 		 430 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0529149  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1681  citrate synthase I  53.52 
 
 		 429 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592991 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0841  type II citrate synthase  51.27 
 
 		 429 aa  465  9.999999999999999e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3181  citrate synthase I  52.35 
 
 		 438 aa  464  1e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.270593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1301  Citrate (Si)-synthase  51.28 
 
 		 431 aa  461  1e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.115082  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2843  type II citrate synthase  51.16 
 
 		 434 aa  464  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.433784  normal  0.36225 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3253  type II citrate synthase  54.42 
 
 		 425 aa  462  1e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1132  citrate synthase  51.96 
 
 		 431 aa  463  1e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4425  citrate synthase I  52.08 
 
 		 436 aa  464  1e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.224643  normal  0.0272577 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1395  citrate synthase  53.99 
 
 		 434 aa  464  1e-129  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.322092  normal  0.0167868 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2563  type II citrate synthase  52.35 
 
 		 429 aa  462  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.102281  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0995  citrate synthase I  51.04 
 
 		 434 aa  461  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.655069 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1596  type II citrate synthase  52.35 
 
 		 429 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.218131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1600  citrate synthase  52.53 
 
 		 433 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0554  citrate synthase I  51.05 
 
 		 428 aa  460  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.488876  normal  0.835408 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0829  citrate synthase I  53.16 
 
 		 427 aa  458  9.999999999999999e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.292623  hitchhiker  0.00485559 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0847  citrate synthase  51.68 
 
 		 429 aa  456  1e-127  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1678  type II citrate synthase  50.81 
 
 		 431 aa  455  1e-127  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0407476  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1789  type II citrate synthase  52.11 
 
 		 429 aa  456  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.069091  hitchhiker  0.00547545 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01350  type II citrate synthase  50.81 
 
 		 429 aa  455  1e-127  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1841  citrate synthase  50.58 
 
 		 430 aa  456  1e-127  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.040491 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1134  type II citrate synthase  49.88 
 
 		 432 aa  455  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.066915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0026  citrate synthase I  49.88 
 
 		 426 aa  455  1e-127  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000469449  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0599  type II citrate synthase  51.78 
 
 		 430 aa  457  1e-127  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.281651  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2508  type II citrate synthase  54.33 
 
 		 436 aa  455  1e-127  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.636436  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1476  citrate synthase I  51.29 
 
 		 428 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.112534  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5525  type II citrate synthase  49.65 
 
 		 432 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.615237  normal  0.487627 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0665  type II citrate synthase  50.47 
 
 		 433 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.170997  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004117  citrate synthase (si)  50.58 
 
 		 429 aa  454  1.0000000000000001e-126  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3694  type II citrate synthase  52.48 
 
 		 428 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44070  type II citrate synthase  52.72 
 
 		 428 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3716  citrate synthase I  51.16 
 
 		 430 aa  454  1.0000000000000001e-126  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.364105  normal  0.0570227 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2919  type II citrate synthase  51.16 
 
 		 428 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0186  citrate synthase I  51.49 
 
 		 438 aa  452  1.0000000000000001e-126  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3589  type II citrate synthase  50.23 
 
 		 433 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0248785  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2194  citrate synthase I  53.07 
 
 		 429 aa  450  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6352  type II citrate synthase  50.59 
 
 		 433 aa  451  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0645718  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0788  type II citrate synthase  50.23 
 
 		 433 aa  451  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0858919  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3832  type II citrate synthase  50 
 
 		 433 aa  449  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.418606 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29820  type II citrate synthase  52.25 
 
 		 427 aa  449  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0888  citrate synthase  52.17 
 
 		 447 aa  449  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.631219  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>