More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1476 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1476  citrate synthase I  100 
 
 		 428 aa  895    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.112534  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3584  citrate synthase I  58.96 
 
 		 425 aa  533  1e-150  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00887444 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0186  citrate synthase I  59.12 
 
 		 438 aa  512  1e-144  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2224  citrate synthase I  55.53 
 
 		 425 aa  485  1e-136  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1275  citrate synthase  53.19 
 
 		 427 aa  482  1e-135  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.152797  normal  0.229785 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0847  citrate synthase  54.35 
 
 		 429 aa  479  1e-134  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1729  type II citrate synthase  53.86 
 
 		 434 aa  478  1e-133  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.540557 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05880  citrate synthase  53.76 
 
 		 428 aa  476  1e-133  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1270  citrate synthase I  53.13 
 
 		 440 aa  478  1e-133  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0026  citrate synthase I  53.05 
 
 		 426 aa  476  1e-133  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000469449  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0855  citrate synthase I  54.07 
 
 		 432 aa  472  1e-132  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0328929  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0367  citrate synthase I  54.55 
 
 		 425 aa  473  1e-132  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10915  type II citrate synthase  53.52 
 
 		 431 aa  473  1e-132  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5036  citrate synthase I  52.46 
 
 		 428 aa  473  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4703  citrate synthase I  53.26 
 
 		 463 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0528  citrate synthase I  53.65 
 
 		 437 aa  470  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0708503  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0969  citrate synthase I  52.93 
 
 		 427 aa  470  1.0000000000000001e-131  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1140  citrate synthase I  52.82 
 
 		 441 aa  464  9.999999999999999e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.615799  normal  0.0294382 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4456  type II citrate synthase  52.83 
 
 		 434 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4838  type II citrate synthase  52.83 
 
 		 434 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.782916  normal  0.17167 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4543  type II citrate synthase  52.83 
 
 		 434 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.701189 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5022  type II citrate synthase  52.69 
 
 		 434 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.834357 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2053  citrate synthase I  53.16 
 
 		 428 aa  462  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.655097  normal  0.0360596 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0554  citrate synthase I  54.01 
 
 		 428 aa  462  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.488876  normal  0.835408 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1964  citrate synthase I  52.63 
 
 		 427 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0148224  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33600  citrate synthase  53.01 
 
 		 437 aa  456  1e-127  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.522546 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0995  citrate synthase I  52.04 
 
 		 436 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25990  citrate synthase  51.29 
 
 		 432 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2136  citrate synthase I  50.24 
 
 		 427 aa  449  1e-125  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.873392  normal  0.0485985 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2284  citrate synthase I  50.48 
 
 		 427 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193692  normal  0.0343529 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0803  citrate synthase I  51.3 
 
 		 440 aa  442  1e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.558205 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11150  citrate synthase  50.12 
 
 		 450 aa  441  9.999999999999999e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.592524  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2531  citrate synthase I  52.01 
 
 		 428 aa  441  9.999999999999999e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000235775 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0874  type II citrate synthase  51.06 
 
 		 429 aa  438  9.999999999999999e-123  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0015368  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0999  citrate synthase I  51.2 
 
 		 438 aa  440  9.999999999999999e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0787  type II citrate synthase  51.06 
 
 		 429 aa  436  1e-121  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0995  citrate synthase I  49.31 
 
 		 434 aa  437  1e-121  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.655069 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02359  type II citrate synthase  50.95 
 
 		 442 aa  434  1e-120  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2811  citrate synthase  51.42 
 
 		 427 aa  434  1e-120  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0195056  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1301  Citrate (Si)-synthase  49.77 
 
 		 431 aa  432  1e-120  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.115082  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15490  citrate synthase  50.35 
 
 		 428 aa  431  1e-119  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.167286  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0972  citrate synthase I  49.76 
 
 		 436 aa  427  1e-118  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19470  citrate synthase  50.12 
 
 		 428 aa  427  1e-118  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.286826  hitchhiker  0.00826117 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004117  citrate synthase (si)  49.41 
 
 		 429 aa  422  1e-117  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0576  citrate (Si)-synthase  50.24 
 
 		 425 aa  419  1e-116  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.254667  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3212  citrate synthase  48.83 
 
 		 427 aa  421  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215147  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01350  type II citrate synthase  49.18 
 
 		 429 aa  420  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1409  citrate synthase I  46.59 
 
 		 429 aa  416  9.999999999999999e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.423182 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2214  citrate synthase I  46.95 
 
 		 428 aa  416  9.999999999999999e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.525644  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0058  citrate synthase I  48.71 
 
 		 432 aa  416  9.999999999999999e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00358332  normal  0.0142462 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2100  citrate synthase I  48.56 
 
 		 426 aa  416  9.999999999999999e-116  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2287  citrate (Si)-synthase  50.47 
 
 		 425 aa  417  9.999999999999999e-116  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2450  type II citrate synthase  47.29 
 
 		 434 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.444525 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1678  type II citrate synthase  48 
 
 		 431 aa  418  9.999999999999999e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0407476  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0841  type II citrate synthase  48 
 
 		 429 aa  417  9.999999999999999e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1366  citrate synthase  47.99 
 
 		 423 aa  412  1e-114  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1845  type II citrate synthase  46.82 
 
 		 433 aa  412  1e-114  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.273477  normal  0.198527 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3253  type II citrate synthase  47.88 
 
 		 425 aa  413  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3694  type II citrate synthase  49.3 
 
 		 428 aa  412  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3181  citrate synthase I  47.65 
 
 		 438 aa  412  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.270593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1708  type II citrate synthase  47.18 
 
 		 433 aa  414  1e-114  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.693797  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1130  citrate synthase I  48.83 
 
 		 431 aa  413  1e-114  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.684999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1548  citrate (Si)-synthase  49.88 
 
 		 435 aa  415  1e-114  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44070  type II citrate synthase  49.53 
 
 		 428 aa  412  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1422  type II citrate synthase  48 
 
 		 428 aa  411  1e-114  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000689188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2508  type II citrate synthase  50.24 
 
 		 436 aa  411  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.636436  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1851  citrate synthase  48.33 
 
 		 422 aa  409  1e-113  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2194  citrate synthase I  50.82 
 
 		 429 aa  410  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2055  citrate synthase  48.33 
 
 		 422 aa  409  1e-113  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1370  citrate synthase  47.75 
 
 		 423 aa  410  1e-113  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0260  citrate synthase I  48.94 
 
 		 426 aa  410  1e-113  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.419168  normal  0.11552 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0646  citrate synthase I  47.29 
 
 		 430 aa  409  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.615558 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2032  citrate synthase  46.48 
 
 		 428 aa  409  1e-113  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808291  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1841  citrate synthase  47.56 
 
 		 430 aa  411  1e-113  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.040491 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2111  citrate synthase  48.69 
 
 		 454 aa  411  1e-113  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000226419  normal  0.855626 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0061  citrate synthase  46.53 
 
 		 430 aa  409  1e-113  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0890712  normal  0.301769 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1212  citrate synthase  49.76 
 
 		 428 aa  410  1e-113  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000171793  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1231  type II citrate synthase  48.93 
 
 		 428 aa  409  1e-113  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2805  citrate synthase I  49.18 
 
 		 427 aa  410  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.359876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1675  citrate synthase  48.56 
 
 		 422 aa  410  1e-113  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1783  type II citrate synthase  49.41 
 
 		 429 aa  409  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0004224  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4502  type II citrate synthase  46.48 
 
 		 434 aa  410  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.705578 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1731  citrate synthase I  47.54 
 
 		 439 aa  409  1e-113  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3253  type II citrate synthase  46.01 
 
 		 434 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2042  citrate synthase I  47.48 
 
 		 447 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2004  type II citrate synthase  50.12 
 
 		 429 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.719341  normal  0.158891 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1262  type II citrate synthase  49.06 
 
 		 430 aa  406  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.728692  normal  0.31118 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2232  citrate synthase I  48.57 
 
 		 428 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2813  type II citrate synthase  46.24 
 
 		 434 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1831  type II citrate synthase  48.71 
 
 		 428 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000179965  normal  0.249033 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2513  type II citrate synthase  48.71 
 
 		 428 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000256312  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4425  citrate synthase I  46.59 
 
 		 436 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.224643  normal  0.0272577 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2919  type II citrate synthase  48.93 
 
 		 428 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2189  type II citrate synthase  48.45 
 
 		 445 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00268971  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2843  type II citrate synthase  46.01 
 
 		 434 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.433784  normal  0.36225 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2633  type II citrate synthase  48.71 
 
 		 428 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000579193  normal  0.265493 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1630  type II citrate synthase  48.71 
 
 		 428 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.01465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1705  type II citrate synthase  48.71 
 
 		 428 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0861056  normal  0.668035 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5222  citrate synthase I  45.52 
 
 		 429 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.827577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1149  citrate synthase I  48.21 
 
 		 424 aa  407  1.0000000000000001e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>