More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_2287 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE1851  citrate synthase  75.48 
 
 
422 aa  686    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1675  citrate synthase  75.71 
 
 
422 aa  687    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2287  citrate (Si)-synthase  100 
 
 
425 aa  886    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2055  citrate synthase  75.24 
 
 
422 aa  684    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2100  citrate synthase I  72.24 
 
 
426 aa  662    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0576  citrate (Si)-synthase  95.01 
 
 
425 aa  840    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.254667  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0178  citrate synthase I  76.56 
 
 
425 aa  687    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00276864  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1548  citrate (Si)-synthase  72.6 
 
 
435 aa  654    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2232  citrate synthase I  75.29 
 
 
428 aa  691    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1600  citrate synthase  54.27 
 
 
433 aa  488  1e-137  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0897  citrate synthase  54.72 
 
 
433 aa  485  1e-136  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0898483  normal  0.676877 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2508  type II citrate synthase  56.54 
 
 
436 aa  482  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.636436  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3694  type II citrate synthase  55.8 
 
 
428 aa  481  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44070  type II citrate synthase  56.05 
 
 
428 aa  483  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02359  type II citrate synthase  53.19 
 
 
442 aa  478  1e-134  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2545  citrate synthase I  54.03 
 
 
431 aa  477  1e-133  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3517  type II citrate synthase  56.16 
 
 
429 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1212  citrate synthase  54.12 
 
 
428 aa  476  1e-133  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000171793  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0995  citrate synthase I  54.12 
 
 
434 aa  476  1e-133  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.655069 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1149  citrate synthase I  54.61 
 
 
424 aa  475  1e-133  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4194  type II citrate synthase  55.67 
 
 
429 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0867349  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29820  type II citrate synthase  55.31 
 
 
427 aa  472  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1845  type II citrate synthase  52.84 
 
 
433 aa  473  1e-132  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.273477  normal  0.198527 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2111  citrate synthase  53.19 
 
 
454 aa  473  1e-132  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000226419  normal  0.855626 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0787  type II citrate synthase  53.79 
 
 
429 aa  474  1e-132  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2805  citrate synthase I  53.9 
 
 
427 aa  474  1e-132  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.359876  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0058  citrate synthase I  52.96 
 
 
432 aa  472  1e-132  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00358332  normal  0.0142462 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0874  type II citrate synthase  53.32 
 
 
429 aa  472  1e-132  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0015368  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1660  type II citrate synthase  55.67 
 
 
429 aa  472  1e-132  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3765  type II citrate synthase  55.67 
 
 
429 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0679988  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2194  citrate synthase I  55.42 
 
 
429 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2004  type II citrate synthase  55.42 
 
 
429 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.719341  normal  0.158891 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5222  citrate synthase I  51.66 
 
 
429 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.827577  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1609  type II citrate synthase  55.67 
 
 
429 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.706948  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5145  citrate synthase I  51.9 
 
 
429 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.236177  normal  0.0251581 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1409  citrate synthase I  53.3 
 
 
429 aa  468  1.0000000000000001e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.423182 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4680  citrate synthase I  51.9 
 
 
446 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1301  Citrate (Si)-synthase  52.96 
 
 
431 aa  466  9.999999999999999e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.115082  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0504  type II citrate synthase  52.94 
 
 
433 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.405584  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1148  type II citrate synthase  51.3 
 
 
430 aa  464  9.999999999999999e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1626  type II citrate synthase  52.94 
 
 
433 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00616613  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1744  type II citrate synthase  52.94 
 
 
433 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.676143  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6851  type II citrate synthase  52.71 
 
 
433 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.622921 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2329  type II citrate synthase  52.94 
 
 
433 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0788  type II citrate synthase  52.94 
 
 
433 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0858919  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2467  type II citrate synthase  52.94 
 
 
433 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00536833  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1834  type II citrate synthase  52.94 
 
 
433 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0219356  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1681  citrate synthase I  51.06 
 
 
429 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592991 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2042  type II citrate synthase  51.54 
 
 
430 aa  467  9.999999999999999e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0529149  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1134  type II citrate synthase  52.46 
 
 
432 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.066915  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2890  type II citrate synthase  52.71 
 
 
433 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2023  citrate synthase I  51.77 
 
 
429 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4643  type II citrate synthase  52.71 
 
 
433 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5205  type II citrate synthase  52.11 
 
 
433 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.237518  normal  0.311757 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1106  type II citrate synthase  51.3 
 
 
435 aa  464  9.999999999999999e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3589  type II citrate synthase  52.71 
 
 
433 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0248785  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1370  citrate synthase  53.29 
 
 
423 aa  464  1e-129  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1366  citrate synthase  53.29 
 
 
423 aa  464  1e-129  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3832  type II citrate synthase  52.24 
 
 
433 aa  464  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.418606 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2147  type II citrate synthase  52.71 
 
 
433 aa  464  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.787035  normal  0.703076 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0665  type II citrate synthase  52.71 
 
 
433 aa  464  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.170997  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2032  citrate synthase  52.13 
 
 
428 aa  464  1e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808291  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4428  type II citrate synthase  52.71 
 
 
433 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3212  citrate synthase  51.83 
 
 
427 aa  464  1e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215147  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4366  type II citrate synthase  52.49 
 
 
433 aa  461  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3316  type II citrate synthase  52 
 
 
433 aa  462  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.229262  normal  0.697255 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3939  type II citrate synthase  52.71 
 
 
433 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4425  citrate synthase I  53.06 
 
 
436 aa  462  1e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.224643  normal  0.0272577 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4502  type II citrate synthase  52.61 
 
 
434 aa  461  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.705578 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2214  citrate synthase I  52.48 
 
 
428 aa  461  9.999999999999999e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.525644  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0599  type II citrate synthase  50.59 
 
 
430 aa  459  9.999999999999999e-129  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.281651  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0646  citrate synthase I  52.01 
 
 
430 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.615558 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2813  type II citrate synthase  51.66 
 
 
434 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1708  type II citrate synthase  52.13 
 
 
433 aa  459  9.999999999999999e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.693797  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1132  citrate synthase  51.9 
 
 
431 aa  458  9.999999999999999e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0829  citrate synthase I  51.96 
 
 
427 aa  459  9.999999999999999e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.292623  hitchhiker  0.00485559 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1646  type II citrate synthase  51.77 
 
 
429 aa  460  9.999999999999999e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0982845  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1524  citrate synthase I  51.54 
 
 
430 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.802094  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1731  citrate synthase I  52.79 
 
 
439 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004117  citrate synthase (si)  53.09 
 
 
429 aa  457  1e-127  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2251  citrate synthase I  51.54 
 
 
434 aa  457  1e-127  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0841  type II citrate synthase  51.85 
 
 
429 aa  457  1e-127  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3181  citrate synthase I  50.48 
 
 
438 aa  457  1e-127  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.270593  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3253  type II citrate synthase  50.95 
 
 
434 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2450  type II citrate synthase  50.95 
 
 
434 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.444525 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2843  type II citrate synthase  50.71 
 
 
434 aa  455  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.433784  normal  0.36225 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01350  type II citrate synthase  53.09 
 
 
429 aa  457  1e-127  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5525  type II citrate synthase  51.42 
 
 
432 aa  456  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.615237  normal  0.487627 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2886  type II citrate synthase  51.42 
 
 
426 aa  453  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000035086  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0763  type II citrate synthase  52.57 
 
 
437 aa  452  1.0000000000000001e-126  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2973  type II citrate synthase  51.42 
 
 
426 aa  453  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00618343  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1379  type II citrate synthase  51.42 
 
 
426 aa  453  1.0000000000000001e-126  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000415607  normal  0.279105 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0747  type II citrate synthase  51.66 
 
 
427 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0732  type II citrate synthase  51.66 
 
 
427 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.482725  normal  0.945982 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0638  type II citrate synthase  51.66 
 
 
427 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0768  type II citrate synthase  51.66 
 
 
427 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1422  type II citrate synthase  53.56 
 
 
428 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000689188  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0260  citrate synthase I  52.48 
 
 
426 aa  452  1.0000000000000001e-126  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.419168  normal  0.11552 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2257  citrate synthase I  53.45 
 
 
431 aa  453  1.0000000000000001e-126  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.19804  normal  0.414999 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2935  type II citrate synthase  51.66 
 
 
427 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.115815  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>