More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0178 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009707  JJD26997_2055  citrate synthase  74.52 
 
 
422 aa  675    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0576  citrate (Si)-synthase  75.18 
 
 
425 aa  682    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.254667  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1851  citrate synthase  74.52 
 
 
422 aa  675    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1675  citrate synthase  74.52 
 
 
422 aa  674    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2287  citrate (Si)-synthase  76.56 
 
 
425 aa  687    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0178  citrate synthase I  100 
 
 
425 aa  888    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00276864  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1548  citrate (Si)-synthase  74.16 
 
 
435 aa  681    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2100  citrate synthase I  68.27 
 
 
426 aa  619  1e-176  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2232  citrate synthase I  65.47 
 
 
428 aa  599  1e-170  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1600  citrate synthase  50.72 
 
 
433 aa  455  1e-127  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2251  citrate synthase I  51.08 
 
 
434 aa  442  1e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0995  citrate synthase I  51.42 
 
 
434 aa  441  1e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.655069 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2545  citrate synthase I  50.24 
 
 
431 aa  440  9.999999999999999e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3212  citrate synthase  49.16 
 
 
427 aa  440  9.999999999999999e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215147  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0897  citrate synthase  50.24 
 
 
433 aa  438  1e-121  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0898483  normal  0.676877 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1301  Citrate (Si)-synthase  50.24 
 
 
431 aa  434  1e-120  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.115082  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1845  type II citrate synthase  48.93 
 
 
433 aa  432  1e-120  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.273477  normal  0.198527 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2032  citrate synthase  49.16 
 
 
428 aa  434  1e-120  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808291  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5145  citrate synthase I  48.4 
 
 
429 aa  428  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.236177  normal  0.0251581 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2508  type II citrate synthase  51.62 
 
 
436 aa  429  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.636436  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0058  citrate synthase I  49.15 
 
 
432 aa  430  1e-119  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00358332  normal  0.0142462 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4680  citrate synthase I  48.4 
 
 
446 aa  428  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0787  type II citrate synthase  48.93 
 
 
429 aa  428  1e-119  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1731  citrate synthase I  50.48 
 
 
439 aa  429  1e-119  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3181  citrate synthase I  48.89 
 
 
438 aa  431  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.270593  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0665  type II citrate synthase  49.04 
 
 
433 aa  425  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.170997  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5222  citrate synthase I  47.24 
 
 
429 aa  427  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.827577  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3694  type II citrate synthase  50.12 
 
 
428 aa  425  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2111  citrate synthase  49.28 
 
 
454 aa  427  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000226419  normal  0.855626 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0874  type II citrate synthase  48.93 
 
 
429 aa  428  1e-118  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0015368  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2023  citrate synthase I  47.62 
 
 
429 aa  427  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0646  citrate synthase I  48.28 
 
 
430 aa  426  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.615558 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02359  type II citrate synthase  48.2 
 
 
442 aa  427  1e-118  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2752  citrate synthase  49.88 
 
 
432 aa  425  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.816634  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44070  type II citrate synthase  50.37 
 
 
428 aa  427  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0599  type II citrate synthase  47.92 
 
 
430 aa  422  1e-117  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.281651  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0504  type II citrate synthase  48.8 
 
 
433 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.405584  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3589  type II citrate synthase  48.22 
 
 
433 aa  421  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0248785  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1744  type II citrate synthase  48.8 
 
 
433 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.676143  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4643  type II citrate synthase  48.46 
 
 
433 aa  423  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2329  type II citrate synthase  48.8 
 
 
433 aa  424  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0788  type II citrate synthase  48.8 
 
 
433 aa  424  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0858919  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2147  type II citrate synthase  48.22 
 
 
433 aa  421  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.787035  normal  0.703076 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2467  type II citrate synthase  48.8 
 
 
433 aa  424  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00536833  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4425  citrate synthase I  48.89 
 
 
436 aa  423  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.224643  normal  0.0272577 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1834  type II citrate synthase  48.8 
 
 
433 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0219356  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2805  citrate synthase I  50.37 
 
 
427 aa  422  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.359876  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3253  type II citrate synthase  47.96 
 
 
425 aa  422  1e-117  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1626  type II citrate synthase  48.8 
 
 
433 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00616613  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0829  citrate synthase I  46.92 
 
 
427 aa  423  1e-117  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.292623  hitchhiker  0.00485559 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4428  type II citrate synthase  48.22 
 
 
433 aa  421  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1646  type II citrate synthase  47.85 
 
 
429 aa  423  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0982845  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3832  type II citrate synthase  48.46 
 
 
433 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.418606 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3939  type II citrate synthase  48.22 
 
 
433 aa  421  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1524  citrate synthase I  47.67 
 
 
430 aa  421  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.802094  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2042  type II citrate synthase  48.4 
 
 
430 aa  422  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0529149  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1149  citrate synthase I  50.86 
 
 
424 aa  424  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2214  citrate synthase I  49.38 
 
 
428 aa  419  1e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.525644  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1148  type II citrate synthase  47.92 
 
 
430 aa  421  1e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1841  citrate synthase  48.46 
 
 
430 aa  420  1e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.040491 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0061  citrate synthase  48.92 
 
 
430 aa  419  1e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0890712  normal  0.301769 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1708  type II citrate synthase  47.48 
 
 
433 aa  419  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.693797  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1132  citrate synthase  49.88 
 
 
431 aa  421  1e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3316  type II citrate synthase  48.55 
 
 
433 aa  421  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.229262  normal  0.697255 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1422  type II citrate synthase  50.37 
 
 
428 aa  419  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000689188  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1106  type II citrate synthase  47.92 
 
 
435 aa  421  1e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1596  type II citrate synthase  47.72 
 
 
429 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.218131  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4194  type II citrate synthase  51 
 
 
429 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0867349  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1660  type II citrate synthase  51 
 
 
429 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1789  type II citrate synthase  48.2 
 
 
429 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.069091  hitchhiker  0.00547545 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2194  citrate synthase I  51 
 
 
429 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2860  citrate synthase  49.75 
 
 
432 aa  417  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29820  type II citrate synthase  50.62 
 
 
427 aa  417  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6851  type II citrate synthase  48.08 
 
 
433 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.622921 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1609  type II citrate synthase  51 
 
 
429 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.706948  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4366  type II citrate synthase  47.51 
 
 
433 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0858  citrate synthase I  49.76 
 
 
433 aa  418  9.999999999999999e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1144  type II citrate synthase  47.96 
 
 
429 aa  417  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.300068  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2890  type II citrate synthase  48.08 
 
 
433 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3517  type II citrate synthase  50.75 
 
 
429 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1794  citrate synthase I  49.13 
 
 
426 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000880013  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3765  type II citrate synthase  51 
 
 
429 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0679988  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1395  citrate synthase  47.23 
 
 
434 aa  417  9.999999999999999e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.322092  normal  0.0167868 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1678  type II citrate synthase  48.63 
 
 
431 aa  415  9.999999999999999e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0407476  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1681  citrate synthase I  47.42 
 
 
429 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592991 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0841  type II citrate synthase  48.76 
 
 
429 aa  414  1e-114  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1409  citrate synthase I  46.91 
 
 
429 aa  412  1e-114  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.423182 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1370  citrate synthase  49.38 
 
 
423 aa  412  1e-114  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1366  citrate synthase  49.63 
 
 
423 aa  413  1e-114  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2004  type II citrate synthase  51 
 
 
429 aa  414  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.719341  normal  0.158891 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2973  type II citrate synthase  47.82 
 
 
426 aa  412  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00618343  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3091  citrate synthase I  48.8 
 
 
428 aa  412  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.31999 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0704  citrate synthase I  48.81 
 
 
428 aa  412  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2450  type II citrate synthase  47.49 
 
 
434 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.444525 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1134  type II citrate synthase  47.36 
 
 
432 aa  414  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.066915  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1212  citrate synthase  48.8 
 
 
428 aa  414  1e-114  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000171793  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1379  type II citrate synthase  47.82 
 
 
426 aa  412  1e-114  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000415607  normal  0.279105 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3716  citrate synthase I  47.85 
 
 
430 aa  413  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.364105  normal  0.0570227 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4502  type II citrate synthase  48.2 
 
 
434 aa  414  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.705578 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2886  type II citrate synthase  47.82 
 
 
426 aa  412  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000035086  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>