More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl1366 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_4194  type II citrate synthase  71.56 
 
 
429 aa  650    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0867349  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3765  type II citrate synthase  71.56 
 
 
429 aa  650    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0679988  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2194  citrate synthase I  70.38 
 
 
429 aa  639    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1370  citrate synthase  99.76 
 
 
423 aa  884    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1366  citrate synthase  100 
 
 
423 aa  885    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2004  type II citrate synthase  69.91 
 
 
429 aa  635    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.719341  normal  0.158891 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1609  type II citrate synthase  70.85 
 
 
429 aa  639    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.706948  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0586  citrate synthase  71.63 
 
 
430 aa  660    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1570  citrate (Si)-synthase  71.16 
 
 
430 aa  657    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00021591  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3517  type II citrate synthase  71.8 
 
 
429 aa  649    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1660  type II citrate synthase  71.56 
 
 
429 aa  650    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2508  type II citrate synthase  70.14 
 
 
436 aa  633  1e-180  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.636436  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29820  type II citrate synthase  70.55 
 
 
427 aa  631  1e-180  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2860  citrate synthase  69.03 
 
 
432 aa  625  1e-178  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2545  citrate synthase I  68.32 
 
 
431 aa  622  1e-177  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0841  type II citrate synthase  66.27 
 
 
429 aa  621  1e-177  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44070  type II citrate synthase  68.17 
 
 
428 aa  623  1e-177  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3694  type II citrate synthase  67.93 
 
 
428 aa  622  1e-177  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1149  citrate synthase I  67.93 
 
 
424 aa  623  1e-177  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4425  citrate synthase I  68.57 
 
 
436 aa  614  1e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.224643  normal  0.0272577 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1678  type II citrate synthase  66.82 
 
 
431 aa  617  1e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0407476  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2111  citrate synthase  66.04 
 
 
454 aa  612  9.999999999999999e-175  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000226419  normal  0.855626 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2257  citrate synthase I  68.15 
 
 
431 aa  614  9.999999999999999e-175  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.19804  normal  0.414999 
 
 
-
 
NC_004310  BR1148  type II citrate synthase  67.45 
 
 
430 aa  608  1e-173  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004117  citrate synthase (si)  66.59 
 
 
429 aa  610  1e-173  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1106  type II citrate synthase  67.45 
 
 
435 aa  608  1e-173  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2563  type II citrate synthase  68.09 
 
 
429 aa  610  1e-173  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.102281  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2042  type II citrate synthase  67.14 
 
 
430 aa  608  1e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0529149  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1422  type II citrate synthase  68.01 
 
 
428 aa  609  1e-173  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000689188  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2805  citrate synthase I  66.11 
 
 
427 aa  605  9.999999999999999e-173  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.359876  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1646  type II citrate synthase  66.19 
 
 
429 aa  604  9.999999999999999e-173  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0982845  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01350  type II citrate synthase  65.88 
 
 
429 aa  606  9.999999999999999e-173  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1144  type II citrate synthase  65.96 
 
 
429 aa  600  1e-170  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.300068  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2919  type II citrate synthase  65.25 
 
 
428 aa  598  1e-170  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0858  citrate synthase I  67.15 
 
 
433 aa  600  1e-170  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1596  type II citrate synthase  67.14 
 
 
429 aa  600  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.218131  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1789  type II citrate synthase  67.14 
 
 
429 aa  601  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.069091  hitchhiker  0.00547545 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0061  citrate synthase  64.45 
 
 
430 aa  600  1e-170  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0890712  normal  0.301769 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3181  citrate synthase I  66.99 
 
 
438 aa  600  1e-170  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.270593  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1139  type II citrate synthase  65.48 
 
 
428 aa  595  1e-169  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2890  type II citrate synthase  66.27 
 
 
433 aa  594  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6851  type II citrate synthase  66.27 
 
 
433 aa  594  1e-169  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.622921 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3091  citrate synthase I  65.95 
 
 
428 aa  595  1e-169  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.31999 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1832  type II citrate synthase  67.7 
 
 
430 aa  593  1e-168  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0111193  normal  0.0527351 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1212  citrate synthase  64.39 
 
 
428 aa  593  1e-168  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000171793  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1262  type II citrate synthase  64.62 
 
 
430 aa  593  1e-168  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.728692  normal  0.31118 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1132  citrate synthase  65.4 
 
 
431 aa  594  1e-168  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1231  type II citrate synthase  65.01 
 
 
428 aa  593  1e-168  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0960  citrate synthase  65.88 
 
 
427 aa  591  1e-168  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1630  type II citrate synthase  67.77 
 
 
428 aa  593  1e-168  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.01465  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1705  type II citrate synthase  67.77 
 
 
428 aa  593  1e-168  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00232802  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1705  type II citrate synthase  67.77 
 
 
428 aa  592  1e-168  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0861056  normal  0.668035 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00680  citrate synthase  64.07 
 
 
427 aa  588  1e-167  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2916  citrate synthase I  64.07 
 
 
427 aa  588  1e-167  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.349648  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2165  type II citrate synthase  66.19 
 
 
437 aa  590  1e-167  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.962895  normal  0.161655 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1926  type II citrate synthase  67.54 
 
 
428 aa  591  1e-167  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3105  type II citrate synthase  65.08 
 
 
428 aa  589  1e-167  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.510334  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00669  hypothetical protein  64.07 
 
 
427 aa  588  1e-167  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2633  type II citrate synthase  67.77 
 
 
428 aa  590  1e-167  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000579193  normal  0.265493 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0638  type II citrate synthase  64.07 
 
 
427 aa  588  1e-167  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0763  type II citrate synthase  65.72 
 
 
437 aa  588  1e-167  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2513  type II citrate synthase  67.77 
 
 
428 aa  590  1e-167  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000256312  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0704  citrate synthase I  65 
 
 
428 aa  588  1e-167  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2520  type II citrate synthase  67.77 
 
 
428 aa  590  1e-167  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0560239  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2274  type II citrate synthase  67.54 
 
 
428 aa  590  1e-167  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000358341  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5525  type II citrate synthase  65.41 
 
 
432 aa  588  1e-167  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.615237  normal  0.487627 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1134  type II citrate synthase  65.34 
 
 
432 aa  590  1e-167  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.066915  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2189  type II citrate synthase  67.06 
 
 
445 aa  589  1e-167  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00268971  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1831  type II citrate synthase  67.77 
 
 
428 aa  590  1e-167  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000179965  normal  0.249033 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4366  type II citrate synthase  65.54 
 
 
433 aa  589  1e-167  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3212  citrate synthase  66.11 
 
 
427 aa  591  1e-167  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215147  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0810  type II citrate synthase  64.07 
 
 
427 aa  588  1e-167  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.659455  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1409  citrate synthase I  64.07 
 
 
429 aa  588  1e-167  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.423182 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2935  type II citrate synthase  64.07 
 
 
427 aa  588  1e-167  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.115815  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0747  type II citrate synthase  64.07 
 
 
427 aa  588  1e-167  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3716  citrate synthase I  64.93 
 
 
430 aa  588  1e-167  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.364105  normal  0.0570227 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0768  type II citrate synthase  64.07 
 
 
427 aa  588  1e-167  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0732  type II citrate synthase  64.07 
 
 
427 aa  588  1e-167  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.482725  normal  0.945982 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4502  type II citrate synthase  64.76 
 
 
434 aa  587  1e-166  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.705578 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0599  type II citrate synthase  64.3 
 
 
430 aa  587  1e-166  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.281651  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2214  citrate synthase I  62.56 
 
 
428 aa  585  1e-166  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.525644  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0887  type II citrate synthase  64.3 
 
 
427 aa  585  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.305732  normal  0.304459 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0825  type II citrate synthase  64.3 
 
 
427 aa  585  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2320  type II citrate synthase  65.94 
 
 
433 aa  585  1e-166  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3589  type II citrate synthase  65.3 
 
 
433 aa  587  1e-166  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0248785  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0788  type II citrate synthase  65.54 
 
 
433 aa  586  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0858919  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4643  type II citrate synthase  65.54 
 
 
433 aa  587  1e-166  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2467  type II citrate synthase  65.54 
 
 
433 aa  586  1e-166  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00536833  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2819  type II citrate synthase  67.06 
 
 
428 aa  586  1e-166  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0484944  normal  0.528181 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2329  type II citrate synthase  65.54 
 
 
433 aa  586  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0665  type II citrate synthase  65.54 
 
 
433 aa  585  1e-166  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.170997  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5205  type II citrate synthase  65.78 
 
 
433 aa  585  1e-166  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.237518  normal  0.311757 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2450  type II citrate synthase  64.76 
 
 
434 aa  585  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.444525 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0646  citrate synthase I  65.25 
 
 
430 aa  585  1e-166  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.615558 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2348  type II citrate synthase  66.59 
 
 
428 aa  585  1e-166  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.729565  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3316  type II citrate synthase  63.55 
 
 
433 aa  587  1e-166  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.229262  normal  0.697255 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0764  type II citrate synthase  64.3 
 
 
427 aa  585  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3939  type II citrate synthase  65.3 
 
 
433 aa  587  1e-166  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1834  type II citrate synthase  65.54 
 
 
433 aa  586  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0219356  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1221  type II citrate synthase  63.83 
 
 
427 aa  584  1e-166  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.233861  normal  0.0870629 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>