More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1548 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008787  CJJ81176_1675  citrate synthase  69.76 
 
 		 422 aa  648    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1548  citrate (Si)-synthase  100 
 
 		 435 aa  906    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1851  citrate synthase  69.52 
 
 		 422 aa  646    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0576  citrate (Si)-synthase  70.59 
 
 		 425 aa  648    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.254667  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2287  citrate (Si)-synthase  72.6 
 
 		 425 aa  654    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0178  citrate synthase I  74.16 
 
 		 425 aa  681    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00276864  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2055  citrate synthase  69.52 
 
 		 422 aa  646    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2232  citrate synthase I  65.62 
 
 		 428 aa  609  1e-173  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2100  citrate synthase I  64.9 
 
 		 426 aa  603  1.0000000000000001e-171  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1600  citrate synthase  53.12 
 
 		 433 aa  473  1e-132  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2251  citrate synthase I  54.2 
 
 		 434 aa  471  1.0000000000000001e-131  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5145  citrate synthase I  51.6 
 
 		 429 aa  463  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.236177  normal  0.0251581 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1301  Citrate (Si)-synthase  52.77 
 
 		 431 aa  461  1e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.115082  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4680  citrate synthase I  51.6 
 
 		 446 aa  462  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2752  citrate synthase  53.73 
 
 		 432 aa  462  1e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.816634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5222  citrate synthase I  51.36 
 
 		 429 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.827577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0995  citrate synthase I  52.22 
 
 		 434 aa  459  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.655069 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1845  type II citrate synthase  51.08 
 
 		 433 aa  457  1e-127  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.273477  normal  0.198527 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1409  citrate synthase I  51.6 
 
 		 429 aa  457  1e-127  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.423182 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4425  citrate synthase I  51.6 
 
 		 436 aa  456  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.224643  normal  0.0272577 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2023  citrate synthase I  50.6 
 
 		 429 aa  457  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0646  citrate synthase I  51.44 
 
 		 430 aa  457  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.615558 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02359  type II citrate synthase  51.08 
 
 		 442 aa  455  1e-127  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0599  type II citrate synthase  49.51 
 
 		 430 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.281651  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1596  type II citrate synthase  51.19 
 
 		 429 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.218131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1144  type II citrate synthase  50.84 
 
 		 429 aa  451  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.300068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1646  type II citrate synthase  50.96 
 
 		 429 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0982845  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1681  citrate synthase I  50.75 
 
 		 429 aa  451  1e-125  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592991 
 
 
-
 
NC_004310  BR1148  type II citrate synthase  50.49 
 
 		 430 aa  449  1e-125  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0787  type II citrate synthase  50.35 
 
 		 429 aa  449  1e-125  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2508  type II citrate synthase  51.87 
 
 		 436 aa  449  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.636436  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1106  type II citrate synthase  50.49 
 
 		 435 aa  450  1e-125  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1789  type II citrate synthase  50.95 
 
 		 429 aa  451  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.069091  hitchhiker  0.00547545 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1524  citrate synthase I  50.96 
 
 		 430 aa  451  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.802094  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2042  type II citrate synthase  50.74 
 
 		 430 aa  449  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0529149  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1609  type II citrate synthase  52.59 
 
 		 429 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.706948  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3212  citrate synthase  49.04 
 
 		 427 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215147  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2111  citrate synthase  49.3 
 
 		 454 aa  445  1.0000000000000001e-124  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000226419  normal  0.855626 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1708  type II citrate synthase  50.12 
 
 		 433 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.693797  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0874  type II citrate synthase  51.07 
 
 		 429 aa  447  1.0000000000000001e-124  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0015368  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0897  citrate synthase  51.2 
 
 		 433 aa  446  1.0000000000000001e-124  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0898483  normal  0.676877 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3181  citrate synthase I  50.25 
 
 		 438 aa  448  1.0000000000000001e-124  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.270593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4502  type II citrate synthase  50.36 
 
 		 434 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.705578 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4194  type II citrate synthase  51.99 
 
 		 429 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0867349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3694  type II citrate synthase  51.37 
 
 		 428 aa  441  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3517  type II citrate synthase  52.24 
 
 		 429 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2194  citrate synthase I  52.24 
 
 		 429 aa  442  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2004  type II citrate synthase  52.24 
 
 		 429 aa  441  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.719341  normal  0.158891 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2813  type II citrate synthase  49.64 
 
 		 434 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2032  citrate synthase  49.76 
 
 		 428 aa  442  1e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808291  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2450  type II citrate synthase  49.64 
 
 		 434 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.444525 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1660  type II citrate synthase  51.99 
 
 		 429 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2805  citrate synthase I  51.21 
 
 		 427 aa  442  1e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.359876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3765  type II citrate synthase  51.99 
 
 		 429 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0679988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44070  type II citrate synthase  51.62 
 
 		 428 aa  444  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1149  citrate synthase I  52.21 
 
 		 424 aa  444  1e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29820  type II citrate synthase  51.62 
 
 		 427 aa  441  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3253  type II citrate synthase  49.4 
 
 		 434 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2843  type II citrate synthase  49.05 
 
 		 434 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.433784  normal  0.36225 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1212  citrate synthase  50.72 
 
 		 428 aa  440  9.999999999999999e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000171793  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0829  citrate synthase I  49.03 
 
 		 427 aa  439  9.999999999999999e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.292623  hitchhiker  0.00485559 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3253  type II citrate synthase  49.88 
 
 		 425 aa  438  9.999999999999999e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1731  citrate synthase I  50 
 
 		 439 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6851  type II citrate synthase  50.12 
 
 		 433 aa  435  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.622921 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0058  citrate synthase I  50 
 
 		 432 aa  436  1e-121  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00358332  normal  0.0142462 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2890  type II citrate synthase  50.6 
 
 		 433 aa  437  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2563  type II citrate synthase  49.75 
 
 		 429 aa  437  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.102281  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1678  type II citrate synthase  50.12 
 
 		 431 aa  437  1e-121  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0407476  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2545  citrate synthase I  50.24 
 
 		 431 aa  432  1e-120  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4366  type II citrate synthase  49.64 
 
 		 433 aa  432  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0665  type II citrate synthase  48.48 
 
 		 433 aa  431  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.170997  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01350  type II citrate synthase  50 
 
 		 429 aa  435  1e-120  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1132  citrate synthase  50 
 
 		 431 aa  433  1e-120  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004117  citrate synthase (si)  50 
 
 		 429 aa  434  1e-120  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2053  citrate synthase I  51.35 
 
 		 428 aa  434  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.655097  normal  0.0360596 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5525  type II citrate synthase  49.64 
 
 		 432 aa  432  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.615237  normal  0.487627 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1834  type II citrate synthase  49.16 
 
 		 433 aa  428  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0219356  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2214  citrate synthase I  49.38 
 
 		 428 aa  430  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.525644  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1626  type II citrate synthase  49.16 
 
 		 433 aa  428  1e-119  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00616613  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1744  type II citrate synthase  49.16 
 
 		 433 aa  428  1e-119  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.676143  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1370  citrate synthase  50.61 
 
 		 423 aa  429  1e-119  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1366  citrate synthase  50.86 
 
 		 423 aa  431  1e-119  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3589  type II citrate synthase  49.4 
 
 		 433 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0248785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2329  type II citrate synthase  49.16 
 
 		 433 aa  428  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4643  type II citrate synthase  49.4 
 
 		 433 aa  429  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3832  type II citrate synthase  49.64 
 
 		 433 aa  430  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.418606 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0788  type II citrate synthase  49.16 
 
 		 433 aa  428  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0858919  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0504  type II citrate synthase  49.16 
 
 		 433 aa  428  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.405584  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2147  type II citrate synthase  49.4 
 
 		 433 aa  429  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.787035  normal  0.703076 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0841  type II citrate synthase  48.88 
 
 		 429 aa  431  1e-119  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2467  type II citrate synthase  49.16 
 
 		 433 aa  428  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00536833  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0367  citrate synthase I  49.76 
 
 		 425 aa  431  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0061  citrate synthase  47.61 
 
 		 430 aa  429  1e-119  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0890712  normal  0.301769 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1134  type II citrate synthase  48.93 
 
 		 432 aa  429  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.066915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4428  type II citrate synthase  49.4 
 
 		 433 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0960  citrate synthase  48.92 
 
 		 427 aa  430  1e-119  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3316  type II citrate synthase  49.64 
 
 		 433 aa  430  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.229262  normal  0.697255 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3939  type II citrate synthase  49.4 
 
 		 433 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2257  citrate synthase I  49.28 
 
 		 431 aa  431  1e-119  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.19804  normal  0.414999 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0764  type II citrate synthase  48.91 
 
 		 427 aa  427  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>