More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_1675 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008787  CJJ81176_1675  citrate synthase  100 
 
 
422 aa  881    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0576  citrate (Si)-synthase  74.82 
 
 
425 aa  688    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.254667  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1851  citrate synthase  99.76 
 
 
422 aa  880    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2055  citrate synthase  99.29 
 
 
422 aa  877    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1548  citrate (Si)-synthase  69.76 
 
 
435 aa  648    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0178  citrate synthase I  74.52 
 
 
425 aa  674    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00276864  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2287  citrate (Si)-synthase  75.71 
 
 
425 aa  687    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2100  citrate synthase I  68.92 
 
 
426 aa  627  1e-178  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2232  citrate synthase I  67.54 
 
 
428 aa  611  9.999999999999999e-175  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1600  citrate synthase  54.76 
 
 
433 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1646  type II citrate synthase  54.27 
 
 
429 aa  485  1e-136  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0982845  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1148  type II citrate synthase  53.53 
 
 
430 aa  481  1e-134  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4425  citrate synthase I  54.57 
 
 
436 aa  478  1e-134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.224643  normal  0.0272577 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1132  citrate synthase  54.5 
 
 
431 aa  479  1e-134  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1106  type II citrate synthase  53.53 
 
 
435 aa  481  1e-134  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2042  type II citrate synthase  54.15 
 
 
430 aa  480  1e-134  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0529149  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0646  citrate synthase I  54.05 
 
 
430 aa  478  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.615558 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1524  citrate synthase I  53.53 
 
 
430 aa  477  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.802094  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4680  citrate synthase I  52.4 
 
 
446 aa  474  1e-132  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1789  type II citrate synthase  52.97 
 
 
429 aa  474  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.069091  hitchhiker  0.00547545 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02359  type II citrate synthase  53.04 
 
 
442 aa  472  1e-132  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1596  type II citrate synthase  53.21 
 
 
429 aa  474  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.218131  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1144  type II citrate synthase  54.09 
 
 
429 aa  474  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.300068  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5222  citrate synthase I  51.92 
 
 
429 aa  472  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.827577  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3181  citrate synthase I  53.56 
 
 
438 aa  471  1e-132  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.270593  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5145  citrate synthase I  52.4 
 
 
429 aa  474  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.236177  normal  0.0251581 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2023  citrate synthase I  51.66 
 
 
429 aa  472  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1681  citrate synthase I  52.58 
 
 
429 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592991 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1845  type II citrate synthase  53.53 
 
 
433 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.273477  normal  0.198527 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2111  citrate synthase  53.14 
 
 
454 aa  468  1.0000000000000001e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000226419  normal  0.855626 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2251  citrate synthase I  53.21 
 
 
434 aa  468  1.0000000000000001e-131  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4502  type II citrate synthase  52.49 
 
 
434 aa  467  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.705578 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3212  citrate synthase  52.68 
 
 
427 aa  466  9.999999999999999e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215147  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44070  type II citrate synthase  54.32 
 
 
428 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0897  citrate synthase  52.14 
 
 
433 aa  465  9.999999999999999e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0898483  normal  0.676877 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3694  type II citrate synthase  54.07 
 
 
428 aa  464  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2508  type II citrate synthase  54.86 
 
 
436 aa  463  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.636436  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1409  citrate synthase I  52.31 
 
 
429 aa  464  1e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.423182 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2563  type II citrate synthase  52.57 
 
 
429 aa  462  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.102281  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0787  type II citrate synthase  52.01 
 
 
429 aa  462  1e-129  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0995  citrate synthase I  51.64 
 
 
434 aa  464  1e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.655069 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2450  type II citrate synthase  52.02 
 
 
434 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.444525 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1708  type II citrate synthase  52.02 
 
 
433 aa  464  1e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.693797  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0874  type II citrate synthase  51.77 
 
 
429 aa  461  1e-129  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0015368  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1301  Citrate (Si)-synthase  51.55 
 
 
431 aa  464  1e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.115082  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2545  citrate synthase I  51.42 
 
 
431 aa  458  9.999999999999999e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4194  type II citrate synthase  54.19 
 
 
429 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0867349  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2194  citrate synthase I  54.43 
 
 
429 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0599  type II citrate synthase  50.85 
 
 
430 aa  459  9.999999999999999e-129  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.281651  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2004  type II citrate synthase  54.43 
 
 
429 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.719341  normal  0.158891 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1609  type II citrate synthase  54.68 
 
 
429 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.706948  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3765  type II citrate synthase  54.19 
 
 
429 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0679988  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3517  type II citrate synthase  53.94 
 
 
429 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2813  type II citrate synthase  51.78 
 
 
434 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2843  type II citrate synthase  51.78 
 
 
434 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.433784  normal  0.36225 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1212  citrate synthase  52.8 
 
 
428 aa  459  9.999999999999999e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000171793  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1660  type II citrate synthase  54.19 
 
 
429 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1731  citrate synthase I  53.38 
 
 
439 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6851  type II citrate synthase  51.67 
 
 
433 aa  455  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.622921 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3253  type II citrate synthase  50.59 
 
 
434 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1994  citrate synthase  52.37 
 
 
428 aa  455  1e-127  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.189666  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0704  citrate synthase I  52.37 
 
 
428 aa  457  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3091  citrate synthase I  51.9 
 
 
428 aa  456  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.31999 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2890  type II citrate synthase  51.91 
 
 
433 aa  456  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2752  citrate synthase  52.98 
 
 
432 aa  457  1e-127  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.816634  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1395  citrate synthase  50.6 
 
 
434 aa  456  1e-127  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.322092  normal  0.0167868 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1422  type II citrate synthase  52.83 
 
 
428 aa  455  1e-127  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000689188  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1678  type II citrate synthase  52.61 
 
 
431 aa  454  1.0000000000000001e-126  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0407476  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3832  type II citrate synthase  51.44 
 
 
433 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.418606 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29820  type II citrate synthase  53.62 
 
 
427 aa  452  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2147  type II citrate synthase  51.44 
 
 
433 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.787035  normal  0.703076 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0665  type II citrate synthase  51.44 
 
 
433 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.170997  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4428  type II citrate synthase  51.44 
 
 
433 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4643  type II citrate synthase  51.2 
 
 
433 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2805  citrate synthase I  51.95 
 
 
427 aa  452  1.0000000000000001e-126  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.359876  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3939  type II citrate synthase  51.44 
 
 
433 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004117  citrate synthase (si)  52.96 
 
 
429 aa  451  1.0000000000000001e-126  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3589  type II citrate synthase  51.44 
 
 
433 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0248785  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1744  type II citrate synthase  51.2 
 
 
433 aa  451  1e-125  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.676143  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0788  type II citrate synthase  51.2 
 
 
433 aa  451  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0858919  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2329  type II citrate synthase  51.2 
 
 
433 aa  451  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0504  type II citrate synthase  51.2 
 
 
433 aa  451  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.405584  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2467  type II citrate synthase  51.2 
 
 
433 aa  451  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00536833  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1626  type II citrate synthase  51.2 
 
 
433 aa  451  1e-125  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00616613  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2032  citrate synthase  50.48 
 
 
428 aa  450  1e-125  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808291  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1841  citrate synthase  50.24 
 
 
430 aa  449  1e-125  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.040491 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0829  citrate synthase I  50.83 
 
 
427 aa  450  1e-125  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.292623  hitchhiker  0.00485559 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0960  citrate synthase  51.31 
 
 
427 aa  449  1e-125  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5205  type II citrate synthase  52.22 
 
 
433 aa  449  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.237518  normal  0.311757 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3316  type II citrate synthase  51.2 
 
 
433 aa  450  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.229262  normal  0.697255 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1834  type II citrate synthase  51.2 
 
 
433 aa  451  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0219356  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01350  type II citrate synthase  52.96 
 
 
429 aa  451  1e-125  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3716  citrate synthase I  51.44 
 
 
430 aa  451  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.364105  normal  0.0570227 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1149  citrate synthase I  52.08 
 
 
424 aa  449  1e-125  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0058  citrate synthase I  50.6 
 
 
432 aa  446  1.0000000000000001e-124  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00358332  normal  0.0142462 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1366  citrate synthase  51.72 
 
 
423 aa  446  1.0000000000000001e-124  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1134  type II citrate synthase  50.72 
 
 
432 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.066915  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1806  citrate synthase  52.38 
 
 
430 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.218068 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4366  type II citrate synthase  50.6 
 
 
433 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2787  citrate synthase I  50.12 
 
 
426 aa  444  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.420339  normal  0.059507 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>