More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1806 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3253  type II citrate synthase  70.33 
 
 		 434 aa  658    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5145  citrate synthase I  68.63 
 
 		 429 aa  637    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.236177  normal  0.0251581 
 
 
-
 
NC_004310  BR1148  type II citrate synthase  73 
 
 		 430 aa  671    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4680  citrate synthase I  68.63 
 
 		 446 aa  637    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0599  type II citrate synthase  68.14 
 
 		 430 aa  645    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.281651  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1806  citrate synthase  100 
 
 		 430 aa  899    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.218068 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1681  citrate synthase I  71.76 
 
 		 429 aa  662    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592991 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1845  type II citrate synthase  69.25 
 
 		 433 aa  644    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.273477  normal  0.198527 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5222  citrate synthase I  68.87 
 
 		 429 aa  639    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.827577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1994  citrate synthase  80.52 
 
 		 428 aa  735    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.189666  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1524  citrate synthase I  69.81 
 
 		 430 aa  649    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.802094  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1106  type II citrate synthase  73 
 
 		 435 aa  671    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0646  citrate synthase I  70.05 
 
 		 430 aa  649    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.615558 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4502  type II citrate synthase  69.46 
 
 		 434 aa  647    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.705578 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2813  type II citrate synthase  70.56 
 
 		 434 aa  656    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2032  citrate synthase  69.81 
 
 		 428 aa  636    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808291  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3091  citrate synthase I  81.22 
 
 		 428 aa  742    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.31999 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1841  citrate synthase  82.56 
 
 		 430 aa  762    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.040491 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2450  type II citrate synthase  70.89 
 
 		 434 aa  659    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.444525 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1409  citrate synthase I  69.58 
 
 		 429 aa  650    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.423182 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1596  type II citrate synthase  73.47 
 
 		 429 aa  676    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.218131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2843  type II citrate synthase  68.93 
 
 		 434 aa  644    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.433784  normal  0.36225 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1132  citrate synthase  86.18 
 
 		 431 aa  784    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0829  citrate synthase I  70.35 
 
 		 427 aa  640    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.292623  hitchhiker  0.00485559 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2563  type II citrate synthase  73.26 
 
 		 429 aa  673    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.102281  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3181  citrate synthase I  71.53 
 
 		 438 aa  659    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.270593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1646  type II citrate synthase  73.54 
 
 		 429 aa  676    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0982845  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1789  type II citrate synthase  73.24 
 
 		 429 aa  677    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.069091  hitchhiker  0.00547545 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0704  citrate synthase I  80.75 
 
 		 428 aa  738    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1395  citrate synthase  71.29 
 
 		 434 aa  662    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.322092  normal  0.0167868 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2042  type II citrate synthase  72.3 
 
 		 430 aa  667    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0529149  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2023  citrate synthase I  70.75 
 
 		 429 aa  651    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1144  type II citrate synthase  73.54 
 
 		 429 aa  679    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.300068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3716  citrate synthase I  80.93 
 
 		 430 aa  733    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.364105  normal  0.0570227 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3212  citrate synthase  71.29 
 
 		 427 aa  653    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215147  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4425  citrate synthase I  73 
 
 		 436 aa  675    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.224643  normal  0.0272577 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1708  type II citrate synthase  68.54 
 
 		 433 aa  632  1e-180  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.693797  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2787  citrate synthase I  70.05 
 
 		 426 aa  630  1e-179  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.420339  normal  0.059507 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1422  type II citrate synthase  69.3 
 
 		 428 aa  621  1e-177  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000689188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1149  citrate synthase I  68.81 
 
 		 424 aa  621  1e-177  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2320  type II citrate synthase  65.81 
 
 		 433 aa  615  1e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1678  type II citrate synthase  67.52 
 
 		 431 aa  616  1e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0407476  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29820  type II citrate synthase  67.67 
 
 		 427 aa  617  1e-175  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01350  type II citrate synthase  67.29 
 
 		 429 aa  613  9.999999999999999e-175  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2481  type II citrate synthase  65.34 
 
 		 433 aa  612  9.999999999999999e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523496  normal  0.0627534 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004117  citrate synthase (si)  67.52 
 
 		 429 aa  612  9.999999999999999e-175  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1660  type II citrate synthase  66.98 
 
 		 429 aa  608  1e-173  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1609  type II citrate synthase  67.21 
 
 		 429 aa  608  1e-173  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.706948  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1600  citrate synthase  67.63 
 
 		 433 aa  609  1e-173  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1134  type II citrate synthase  64.81 
 
 		 432 aa  608  1e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.066915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2545  citrate synthase I  65.35 
 
 		 431 aa  610  1e-173  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5205  type II citrate synthase  66.51 
 
 		 433 aa  608  1e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.237518  normal  0.311757 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5525  type II citrate synthase  64.35 
 
 		 432 aa  608  1e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.615237  normal  0.487627 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4194  type II citrate synthase  66.74 
 
 		 429 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0867349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3694  type II citrate synthase  66.98 
 
 		 428 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1744  type II citrate synthase  65.96 
 
 		 433 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.676143  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3765  type II citrate synthase  66.74 
 
 		 429 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0679988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2004  type II citrate synthase  66.51 
 
 		 429 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.719341  normal  0.158891 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2860  citrate synthase  65.66 
 
 		 432 aa  606  9.999999999999999e-173  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2329  type II citrate synthase  65.96 
 
 		 433 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6352  type II citrate synthase  65.95 
 
 		 433 aa  606  9.999999999999999e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0645718  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0504  type II citrate synthase  65.96 
 
 		 433 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.405584  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0788  type II citrate synthase  65.96 
 
 		 433 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0858919  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1626  type II citrate synthase  65.96 
 
 		 433 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00616613  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2508  type II citrate synthase  67.61 
 
 		 436 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.636436  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2467  type II citrate synthase  65.96 
 
 		 433 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00536833  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0665  type II citrate synthase  65.96 
 
 		 433 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.170997  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0841  type II citrate synthase  66.36 
 
 		 429 aa  605  9.999999999999999e-173  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1262  type II citrate synthase  65.88 
 
 		 430 aa  606  9.999999999999999e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.728692  normal  0.31118 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1794  citrate synthase I  66.43 
 
 		 426 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000880013  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3517  type II citrate synthase  66.51 
 
 		 429 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44070  type II citrate synthase  66.98 
 
 		 428 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1834  type II citrate synthase  65.96 
 
 		 433 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0219356  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1731  citrate synthase I  66.67 
 
 		 439 aa  606  9.999999999999999e-173  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6851  type II citrate synthase  65.26 
 
 		 433 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.622921 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4366  type II citrate synthase  65.02 
 
 		 433 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2194  citrate synthase I  66.05 
 
 		 429 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0058  citrate synthase I  65.02 
 
 		 432 aa  603  1.0000000000000001e-171  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00358332  normal  0.0142462 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2890  type II citrate synthase  65.49 
 
 		 433 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2257  citrate synthase I  66.28 
 
 		 431 aa  603  1.0000000000000001e-171  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.19804  normal  0.414999 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2886  type II citrate synthase  65.12 
 
 		 426 aa  599  1e-170  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000035086  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2214  citrate synthase I  65.66 
 
 		 428 aa  598  1e-170  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.525644  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1926  type II citrate synthase  69.07 
 
 		 428 aa  599  1e-170  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2973  type II citrate synthase  65.12 
 
 		 426 aa  599  1e-170  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00618343  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1379  type II citrate synthase  65.12 
 
 		 426 aa  599  1e-170  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000415607  normal  0.279105 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2111  citrate synthase  66.12 
 
 		 454 aa  600  1e-170  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000226419  normal  0.855626 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01870  Citrate synthase  65.65 
 
 		 425 aa  600  1e-170  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4643  type II citrate synthase  66.11 
 
 		 433 aa  600  1e-170  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0790  type II citrate synthase  65.35 
 
 		 427 aa  596  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.148883  normal  0.115118 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2798  type II citrate synthase  63.72 
 
 		 436 aa  596  1e-169  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.242965 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0887  type II citrate synthase  65.35 
 
 		 427 aa  596  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.305732  normal  0.304459 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2520  type II citrate synthase  69.07 
 
 		 428 aa  597  1e-169  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0560239  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0764  type II citrate synthase  65.35 
 
 		 427 aa  596  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1796  type II citrate synthase  62.88 
 
 		 436 aa  596  1e-169  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.216782  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0854  type II citrate synthase  65.35 
 
 		 427 aa  596  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000551297 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2513  type II citrate synthase  69.07 
 
 		 428 aa  597  1e-169  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000256312  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0825  type II citrate synthase  65.35 
 
 		 427 aa  596  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3316  type II citrate synthase  64.55 
 
 		 433 aa  594  1e-169  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.229262  normal  0.697255 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3939  type II citrate synthase  65.02 
 
 		 433 aa  596  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3832  type II citrate synthase  64.79 
 
 		 433 aa  597  1e-169  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.418606 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>