More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0554 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5036  citrate synthase I  79.67 
 
 		 428 aa  723    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2053  citrate synthase I  69.39 
 
 		 428 aa  638    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.655097  normal  0.0360596 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0554  citrate synthase I  100 
 
 		 428 aa  890    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.488876  normal  0.835408 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1275  citrate synthase  68.07 
 
 		 427 aa  627  1e-178  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.152797  normal  0.229785 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0367  citrate synthase I  68.41 
 
 		 425 aa  616  1e-175  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05880  citrate synthase  67.06 
 
 		 428 aa  604  9.999999999999999e-173  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2224  citrate synthase I  64.15 
 
 		 425 aa  580  1e-164  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0969  citrate synthase I  64.17 
 
 		 427 aa  580  1e-164  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3584  citrate synthase I  61.54 
 
 		 425 aa  565  1e-160  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00887444 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1270  citrate synthase I  58.96 
 
 		 440 aa  545  1e-154  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2136  citrate synthase I  58.61 
 
 		 427 aa  543  1e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.873392  normal  0.0485985 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2284  citrate synthase I  58.85 
 
 		 427 aa  541  1e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193692  normal  0.0343529 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0847  citrate synthase  59.44 
 
 		 429 aa  535  1e-151  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33600  citrate synthase  59.1 
 
 		 437 aa  536  1e-151  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.522546 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0855  citrate synthase I  59.33 
 
 		 432 aa  534  1e-150  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0328929  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4838  type II citrate synthase  57.28 
 
 		 434 aa  534  1e-150  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.782916  normal  0.17167 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4456  type II citrate synthase  57.28 
 
 		 434 aa  534  1e-150  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4543  type II citrate synthase  57.28 
 
 		 434 aa  534  1e-150  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.701189 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5022  type II citrate synthase  57.68 
 
 		 434 aa  531  1e-150  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.834357 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0528  citrate synthase I  58.95 
 
 		 437 aa  528  1e-149  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0708503  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1964  citrate synthase I  57.24 
 
 		 427 aa  530  1e-149  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0148224  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1729  type II citrate synthase  57.21 
 
 		 434 aa  526  1e-148  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.540557 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0999  citrate synthase I  57.58 
 
 		 438 aa  523  1e-147  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10915  type II citrate synthase  57.55 
 
 		 431 aa  521  1e-147  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4703  citrate synthase I  56.7 
 
 		 463 aa  522  1e-147  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11150  citrate synthase  57.08 
 
 		 450 aa  508  1e-143  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.592524  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2531  citrate synthase I  56.94 
 
 		 428 aa  504  1e-141  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000235775 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1140  citrate synthase I  53.74 
 
 		 441 aa  500  1e-140  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.615799  normal  0.0294382 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0026  citrate synthase I  53.5 
 
 		 426 aa  498  1e-140  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000469449  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2811  citrate synthase  55.66 
 
 		 427 aa  496  1e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0195056  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1600  citrate synthase  55.37 
 
 		 433 aa  489  1e-137  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2251  citrate synthase I  56.19 
 
 		 434 aa  491  1e-137  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0995  citrate synthase I  52.48 
 
 		 436 aa  487  1e-136  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0058  citrate synthase I  53.16 
 
 		 432 aa  482  1e-135  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00358332  normal  0.0142462 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4425  citrate synthase I  53.83 
 
 		 436 aa  482  1e-135  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.224643  normal  0.0272577 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0803  citrate synthase I  53.25 
 
 		 440 aa  481  1e-134  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.558205 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3212  citrate synthase  51.87 
 
 		 427 aa  478  1e-134  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215147  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4680  citrate synthase I  52.91 
 
 		 446 aa  479  1e-134  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5145  citrate synthase I  52.91 
 
 		 429 aa  480  1e-134  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.236177  normal  0.0251581 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1476  citrate synthase I  54.01 
 
 		 428 aa  479  1e-134  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.112534  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2752  citrate synthase  56.09 
 
 		 432 aa  478  1e-134  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.816634  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15490  citrate synthase  56.09 
 
 		 428 aa  480  1e-134  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.167286  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3181  citrate synthase I  52.11 
 
 		 438 aa  476  1e-133  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.270593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1409  citrate synthase I  51.64 
 
 		 429 aa  476  1e-133  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.423182 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1301  Citrate (Si)-synthase  52.98 
 
 		 431 aa  476  1e-133  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.115082  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1524  citrate synthase I  52.48 
 
 		 430 aa  477  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.802094  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2023  citrate synthase I  52.21 
 
 		 429 aa  476  1e-133  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5222  citrate synthase I  52.21 
 
 		 429 aa  478  1e-133  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.827577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2545  citrate synthase I  53.4 
 
 		 431 aa  475  1e-133  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1148  type II citrate synthase  51.4 
 
 		 430 aa  474  1e-132  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1106  type II citrate synthase  51.4 
 
 		 435 aa  474  1e-132  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25990  citrate synthase  51.05 
 
 		 432 aa  474  1e-132  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0972  citrate synthase I  51.42 
 
 		 436 aa  472  1e-132  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02359  type II citrate synthase  54.48 
 
 		 442 aa  474  1e-132  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2042  type II citrate synthase  51.4 
 
 		 430 aa  473  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0529149  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0995  citrate synthase I  51.38 
 
 		 434 aa  472  1e-132  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.655069 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3694  type II citrate synthase  52.36 
 
 		 428 aa  473  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0646  citrate synthase I  52.01 
 
 		 430 aa  473  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.615558 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1731  citrate synthase I  52.46 
 
 		 439 aa  471  1.0000000000000001e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1845  type II citrate synthase  51.06 
 
 		 433 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.273477  normal  0.198527 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0186  citrate synthase I  54.44 
 
 		 438 aa  469  1.0000000000000001e-131  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1132  citrate synthase  52.46 
 
 		 431 aa  468  1.0000000000000001e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44070  type II citrate synthase  52.36 
 
 		 428 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1149  citrate synthase I  53.83 
 
 		 424 aa  469  1.0000000000000001e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2563  type II citrate synthase  52.46 
 
 		 429 aa  465  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.102281  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1144  type II citrate synthase  52.47 
 
 		 429 aa  467  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.300068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3091  citrate synthase I  52.91 
 
 		 428 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.31999 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1708  type II citrate synthase  50 
 
 		 433 aa  465  9.999999999999999e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.693797  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0787  type II citrate synthase  53.99 
 
 		 429 aa  467  9.999999999999999e-131  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1646  type II citrate synthase  52.01 
 
 		 429 aa  467  9.999999999999999e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0982845  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29820  type II citrate synthase  51.89 
 
 		 427 aa  467  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0874  type II citrate synthase  53.76 
 
 		 429 aa  468  9.999999999999999e-131  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0015368  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3517  type II citrate synthase  52.58 
 
 		 429 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3716  citrate synthase I  52.09 
 
 		 430 aa  467  9.999999999999999e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.364105  normal  0.0570227 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4194  type II citrate synthase  52.11 
 
 		 429 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0867349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2004  type II citrate synthase  51.88 
 
 		 429 aa  461  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.719341  normal  0.158891 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0704  citrate synthase I  52.45 
 
 		 428 aa  464  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2320  type II citrate synthase  53.49 
 
 		 433 aa  461  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1187  citrate synthase  53.61 
 
 		 431 aa  463  1e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1994  citrate synthase  52.21 
 
 		 428 aa  462  1e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.189666  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2813  type II citrate synthase  50.47 
 
 		 434 aa  461  1e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1681  citrate synthase I  51.3 
 
 		 429 aa  463  1e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592991 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2450  type II citrate synthase  51.87 
 
 		 434 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.444525 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1660  type II citrate synthase  51.88 
 
 		 429 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3765  type II citrate synthase  52.11 
 
 		 429 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0679988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1422  type II citrate synthase  51.06 
 
 		 428 aa  464  1e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000689188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19470  citrate synthase  53.33 
 
 		 428 aa  463  1e-129  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.286826  hitchhiker  0.00826117 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1596  type II citrate synthase  51.29 
 
 		 429 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.218131  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1789  type II citrate synthase  51.29 
 
 		 429 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.069091  hitchhiker  0.00547545 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2194  citrate synthase I  51.64 
 
 		 429 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3253  type II citrate synthase  50.23 
 
 		 434 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1783  type II citrate synthase  53.63 
 
 		 429 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0004224  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1609  type II citrate synthase  52.11 
 
 		 429 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.706948  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2111  citrate synthase  52.38 
 
 		 454 aa  460  9.999999999999999e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000226419  normal  0.855626 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1212  citrate synthase  51.3 
 
 		 428 aa  459  9.999999999999999e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000171793  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2481  type II citrate synthase  53.01 
 
 		 433 aa  461  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523496  normal  0.0627534 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2805  citrate synthase I  52.62 
 
 		 427 aa  458  9.999999999999999e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.359876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2798  type II citrate synthase  51.56 
 
 		 436 aa  457  1e-127  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.242965 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2288  type II citrate synthase  51.56 
 
 		 436 aa  457  1e-127  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0061  citrate synthase  52.77 
 
 		 430 aa  455  1e-127  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0890712  normal  0.301769 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>