More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6318 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C6318  citrate synthase  100 
 
 		 249 aa  507  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4477  citrate synthase  40.17 
 
 		 250 aa  201  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0799  citrate synthase  42.68 
 
 		 261 aa  177  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5380  citrate synthase  40.65 
 
 		 261 aa  176  4e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4823  citrate synthase  40.65 
 
 		 261 aa  170  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4697  citrate synthase  38.64 
 
 		 259 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.405969  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2009  citrate synthase  35.71 
 
 		 261 aa  163  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.884105 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2022  citrate synthase  38.53 
 
 		 267 aa  157  1e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.275146  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0986  citrate synthase  38.75 
 
 		 259 aa  155  7e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.879919 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1313  citrate synthase  34.9 
 
 		 262 aa  154  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1194  citrate synthase  39.2 
 
 		 267 aa  142  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0045  citrate synthase  36.48 
 
 		 286 aa  139  3e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5653  citrate synthase  33.2 
 
 		 268 aa  139  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0675936  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3867  citrate synthase  33.47 
 
 		 259 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4268  citrate synthase  34.45 
 
 		 265 aa  134  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.245417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1379  citrate synthase  29.96 
 
 		 257 aa  132  3.9999999999999996e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4946  citrate synthase  34.39 
 
 		 252 aa  130  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.094047  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4677  citrate synthase  33.2 
 
 		 257 aa  130  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1039  citrate synthase  30.84 
 
 		 255 aa  122  6e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6294  citrate synthase  30.6 
 
 		 302 aa  122  7e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4826  citrate synthase  32.88 
 
 		 271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.538489  normal  0.968705 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6289  citrate synthase  32.56 
 
 		 270 aa  106  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0980026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2728  citrate synthase  28.25 
 
 		 255 aa  97.4  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3119  citrate synthase  29.6 
 
 		 254 aa  96.7  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.199259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4959  citrate synthase  28.57 
 
 		 282 aa  90.9  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4144  citrate synthase  27.67 
 
 		 284 aa  88.6  8e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00479182  normal  0.482128 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1832  Citrate synthase  32.24 
 
 		 289 aa  88.2  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0399593  normal  0.514801 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3036  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  31.31 
 
 		 382 aa  85.5  8e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0447  Citrate synthase-like protein  32.54 
 
 		 240 aa  83.6  0.000000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000621018  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2128  citrate synthase  26.58 
 
 		 286 aa  81.6  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4013  citrate synthase  26.16 
 
 		 274 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4041  citrate synthase  28.95 
 
 		 284 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4153  citrate synthase  28.95 
 
 		 284 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.595412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1476  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  28.14 
 
 		 382 aa  79.7  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.644774  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1189  Citrate (Si)-synthase  26.34 
 
 		 395 aa  79.3  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1522  citrate synthase  29.52 
 
 		 370 aa  78.6  0.00000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.640515  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1523  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  31.34 
 
 		 379 aa  77.4  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.297697  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0723  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  28.29 
 
 		 382 aa  77.4  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.517524  normal  0.584309 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2276  citrate synthase  26.73 
 
 		 380 aa  76.6  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4159  citrate synthase  27.91 
 
 		 275 aa  76.3  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0663  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  29.52 
 
 		 373 aa  75.9  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.280152  normal  0.110027 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1035  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  28.64 
 
 		 375 aa  73.6  0.000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2423  Citrate (Si)-synthase  28.11 
 
 		 377 aa  73.6  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6150  Citrate (Si)-synthase  28.85 
 
 		 391 aa  72.8  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.153659 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2420  Citrate synthase  25.71 
 
 		 481 aa  72  0.000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0279  citrate synthase  29.56 
 
 		 396 aa  71.2  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3748  Citrate (Si)-synthase  29.67 
 
 		 388 aa  70.5  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1665  citrate synthase  28.08 
 
 		 378 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2027  citrate synthase 2  29.35 
 
 		 362 aa  70.5  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1621  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  30.05 
 
 		 379 aa  69.7  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285346  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02341  citrate synthase  29.95 
 
 		 375 aa  69.7  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1528  citrate synthase  29.38 
 
 		 375 aa  68.6  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0349986  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2105  citrate (Si)-synthase  27.35 
 
 		 397 aa  68.6  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.414267  normal  0.0115455 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0837  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  22.93 
 
 		 378 aa  67.4  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.531649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26921  citrate synthase  29.06 
 
 		 396 aa  67  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1245  citrate synthase  28.28 
 
 		 374 aa  67.4  0.0000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0848  Citrate (Si)-synthase  29.69 
 
 		 368 aa  67.8  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1351  ATP-citrate lyase/succinyl-CoA ligase  23.56 
 
 		 610 aa  66.6  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2188  citrate synthase 3  24.06 
 
 		 372 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.685723  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2125  citrate synthase 3  24.06 
 
 		 372 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.306637  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1202  Citrate (Si)-synthase  22.12 
 
 		 375 aa  66.6  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000138488  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2367  citrate synthase 3  24.06 
 
 		 373 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2348  citrate synthase 3  24.06 
 
 		 372 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0154  citrate synthase  29.61 
 
 		 374 aa  66.6  0.0000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.649155 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2376  citrate synthase 3  24.06 
 
 		 372 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.151245  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3010  citrate synthase 3  24.06 
 
 		 373 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2156  citrate synthase 3  24.06 
 
 		 373 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2315  citrate synthase 3  24.06 
 
 		 373 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1252  Citrate (Si)-synthase  27.49 
 
 		 373 aa  66.2  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2450  citrate synthase 3  24.06 
 
 		 373 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0697754  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2111  citrate synthase 3  24.06 
 
 		 372 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1099  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  22.97 
 
 		 387 aa  65.5  0.0000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1008  citrate synthase  27.59 
 
 		 429 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.115669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0163  citrate synthase  28.16 
 
 		 381 aa  65.1  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.292022  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0398  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  28.26 
 
 		 377 aa  64.7  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0419831  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3584  citrate synthase I  26.02 
 
 		 425 aa  65.1  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00887444 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2413  citrate synthase  27.32 
 
 		 397 aa  64.7  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1063  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  26.13 
 
 		 393 aa  64.7  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0404  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  27.05 
 
 		 378 aa  65.1  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1726  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  27.54 
 
 		 380 aa  64.7  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1467  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  29.81 
 
 		 385 aa  64.7  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0316751  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33820  citrate synthase 2  29.7 
 
 		 389 aa  63.9  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.655288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1760  citrate synthase  29.35 
 
 		 374 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0647  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  24.62 
 
 		 367 aa  63.9  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.029125  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01901  citrate synthase  27.05 
 
 		 381 aa  63.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3561  Citrate (Si)-synthase  29.05 
 
 		 387 aa  63.9  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141515  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0622  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  24.62 
 
 		 367 aa  63.9  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0115525  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3093  Citrate (Si)-synthase  27.57 
 
 		 378 aa  63.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.832749 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4146  citrate (Si)-synthase  27.46 
 
 		 375 aa  63.9  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01781  citrate synthase  27.4 
 
 		 378 aa  63.5  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.176216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2557  citrate synthase  26.89 
 
 		 391 aa  63.5  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01811  citrate synthase  27.67 
 
 		 381 aa  63.5  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1533  citrate (Si)-synthase  26.34 
 
 		 396 aa  63.2  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1090  ATP-citrate lyase/succinyl-CoA ligase  25 
 
 		 610 aa  63.2  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3560  DNA binding domain protein, excisionase family  30.94 
 
 		 412 aa  63.2  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0836216  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1724  citrate synthase 3  23.33 
 
 		 372 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.992858  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2141  Citrate (Si)-synthase  27.27 
 
 		 389 aa  63.2  0.000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.636674  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8311  citrate synthase  26.61 
 
 		 277 aa  62.8  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.173148  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0281  citrate synthase  28.08 
 
 		 378 aa  62.8  0.000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.160338  normal  0.143922 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01791  citrate synthase  27.67 
 
 		 381 aa  62.8  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>