247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_2022 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_2022  citrate synthase  100 
 
 		 267 aa  518  1e-146  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.275146  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0045  citrate synthase  58.56 
 
 		 286 aa  268  8e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2009  citrate synthase  41.94 
 
 		 261 aa  184  9e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.884105 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1313  citrate synthase  40.73 
 
 		 262 aa  180  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1194  citrate synthase  42.75 
 
 		 267 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3867  citrate synthase  37.4 
 
 		 259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4946  citrate synthase  41.49 
 
 		 252 aa  161  9e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.094047  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4268  citrate synthase  39.13 
 
 		 265 aa  159  6e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.245417  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5653  citrate synthase  39.92 
 
 		 268 aa  159  6e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0675936  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6318  citrate synthase  38.53 
 
 		 249 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4477  citrate synthase  32.16 
 
 		 250 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4677  citrate synthase  38.68 
 
 		 257 aa  148  8e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5380  citrate synthase  34.1 
 
 		 261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4697  citrate synthase  35.57 
 
 		 259 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.405969  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0799  citrate synthase  33.46 
 
 		 261 aa  134  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4823  citrate synthase  33.85 
 
 		 261 aa  134  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0986  citrate synthase  37.4 
 
 		 259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.879919 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6294  citrate synthase  33.62 
 
 		 302 aa  122  7e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1039  citrate synthase  28.94 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1379  citrate synthase  28.31 
 
 		 257 aa  105  1e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3119  citrate synthase  34.86 
 
 		 254 aa  96.7  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.199259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2728  citrate synthase  31.51 
 
 		 255 aa  92.8  5e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4826  citrate synthase  29.22 
 
 		 271 aa  90.5  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.538489  normal  0.968705 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2128  citrate synthase  27.89 
 
 		 286 aa  89.7  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4013  citrate synthase  32.5 
 
 		 274 aa  89  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4159  citrate synthase  31.12 
 
 		 275 aa  82.4  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4041  citrate synthase  31.53 
 
 		 284 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4153  citrate synthase  31.53 
 
 		 284 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.595412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0447  Citrate synthase-like protein  32.17 
 
 		 240 aa  82  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000621018  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6289  citrate synthase  28.3 
 
 		 270 aa  80.5  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0980026  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1832  Citrate synthase  33.93 
 
 		 289 aa  78.2  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0399593  normal  0.514801 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8311  citrate synthase  32.16 
 
 		 277 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.173148  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4144  citrate synthase  28.33 
 
 		 284 aa  72.4  0.000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00479182  normal  0.482128 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4959  citrate synthase  26.88 
 
 		 282 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6702  citrate synthase  34.34 
 
 		 390 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1526  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  28.02 
 
 		 390 aa  67  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.682888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1522  citrate synthase  27.27 
 
 		 370 aa  66.2  0.0000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.640515  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2105  citrate (Si)-synthase  24.53 
 
 		 397 aa  65.5  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.414267  normal  0.0115455 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1467  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  27.14 
 
 		 385 aa  63.5  0.000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0316751  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1063  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  29.63 
 
 		 393 aa  62.4  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2413  citrate synthase  28.44 
 
 		 397 aa  62  0.000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6150  Citrate (Si)-synthase  27.65 
 
 		 391 aa  62  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.153659 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1523  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  25.73 
 
 		 379 aa  60.8  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.297697  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3561  Citrate (Si)-synthase  28.33 
 
 		 387 aa  61.2  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141515  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02341  citrate synthase  26.54 
 
 		 375 aa  60.1  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1665  citrate synthase  26.39 
 
 		 378 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3748  Citrate (Si)-synthase  29.66 
 
 		 388 aa  59.3  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1189  Citrate (Si)-synthase  27.88 
 
 		 395 aa  59.3  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1099  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  22.62 
 
 		 387 aa  59.3  0.00000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1528  citrate synthase  26.07 
 
 		 375 aa  58.9  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0349986  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0350  citrate synthase  24.89 
 
 		 391 aa  58.5  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1252  Citrate (Si)-synthase  28.63 
 
 		 373 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0663  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  30.2 
 
 		 373 aa  58.5  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.280152  normal  0.110027 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1726  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  28.37 
 
 		 380 aa  57.4  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0072  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  26.01 
 
 		 372 aa  57.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0723  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  26.38 
 
 		 382 aa  57.4  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.517524  normal  0.584309 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1533  citrate (Si)-synthase  24.06 
 
 		 396 aa  57.4  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1476  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  23.53 
 
 		 382 aa  57.8  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.644774  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0798  citrate synthase 3  25.12 
 
 		 370 aa  57.4  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.036744  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4146  citrate (Si)-synthase  26.51 
 
 		 375 aa  57  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01901  citrate synthase  25 
 
 		 381 aa  57  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0279  citrate synthase  26.67 
 
 		 396 aa  57  0.0000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2221  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  24.4 
 
 		 377 aa  56.6  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57744  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1580  citrate synthase  27.1 
 
 		 383 aa  56.6  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1724  citrate synthase 3  22.9 
 
 		 372 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.992858  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3036  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  23.53 
 
 		 382 aa  56.2  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1377  citrate synthase  23.81 
 
 		 386 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1408  citrate synthase  23.81 
 
 		 386 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0163  citrate synthase  24.53 
 
 		 381 aa  55.8  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.292022  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1090  ATP-citrate lyase/succinyl-CoA ligase  28.31 
 
 		 610 aa  55.8  0.0000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1245  citrate synthase  22.6 
 
 		 374 aa  55.8  0.0000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01811  citrate synthase  24.53 
 
 		 381 aa  55.8  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1258  citrate synthase  24.09 
 
 		 373 aa  55.5  0.0000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2376  citrate synthase 3  22.32 
 
 		 372 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.151245  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2188  citrate synthase 3  22.32 
 
 		 372 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.685723  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2125  citrate synthase 3  22.32 
 
 		 372 aa  55.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.306637  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2315  citrate synthase 3  22.32 
 
 		 373 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2348  citrate synthase 3  22.32 
 
 		 372 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3010  citrate synthase 3  22.32 
 
 		 373 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2450  citrate synthase 3  22.32 
 
 		 373 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0697754  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2367  citrate synthase 3  22.32 
 
 		 373 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2156  citrate synthase 3  22.42 
 
 		 373 aa  55.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0837  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  23.79 
 
 		 378 aa  55.1  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.531649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01791  citrate synthase  24.53 
 
 		 381 aa  55.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3278  citrate synthase  23.7 
 
 		 386 aa  54.3  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.312589  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1351  ATP-citrate lyase/succinyl-CoA ligase  25.49 
 
 		 610 aa  54.3  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2672  citrate synthase  23.81 
 
 		 386 aa  54.3  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.530506  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2111  citrate synthase 3  22.69 
 
 		 372 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1621  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  26.92 
 
 		 379 aa  54.7  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285346  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2713  citrate synthase  25.37 
 
 		 378 aa  54.7  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0781  citrate synthase  22.9 
 
 		 372 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01781  citrate synthase  24.88 
 
 		 378 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.176216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4089  citrate synthase  25.24 
 
 		 389 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3065  citrate synthase  23.81 
 
 		 386 aa  54.3  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4323  citrate synthase  22.82 
 
 		 371 aa  53.5  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4335  citrate synthase  22.82 
 
 		 371 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4488  citrate synthase  22.82 
 
 		 371 aa  53.5  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0534  citrate synthase  22.82 
 
 		 382 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0555246 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4839  citrate synthase  22.82 
 
 		 371 aa  53.5  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4704  citrate synthase  22.82 
 
 		 382 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>