More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6294 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C6294  citrate synthase  100 
 
 		 302 aa  629  1e-179  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1379  citrate synthase  38.89 
 
 		 257 aa  182  6e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1039  citrate synthase  39.76 
 
 		 255 aa  176  5e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2128  citrate synthase  37.85 
 
 		 286 aa  149  8e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4144  citrate synthase  32.79 
 
 		 284 aa  138  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00479182  normal  0.482128 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4013  citrate synthase  33.88 
 
 		 274 aa  134  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4959  citrate synthase  31.64 
 
 		 282 aa  133  5e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4477  citrate synthase  32.27 
 
 		 250 aa  132  6e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1313  citrate synthase  34.44 
 
 		 262 aa  132  6.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4041  citrate synthase  34.31 
 
 		 284 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3867  citrate synthase  33.73 
 
 		 259 aa  130  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4153  citrate synthase  34.31 
 
 		 284 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.595412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2009  citrate synthase  32.77 
 
 		 261 aa  130  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.884105 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4159  citrate synthase  35.48 
 
 		 275 aa  130  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2728  citrate synthase  32.08 
 
 		 255 aa  127  3e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1832  Citrate synthase  33.46 
 
 		 289 aa  125  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0399593  normal  0.514801 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3119  citrate synthase  32.65 
 
 		 254 aa  122  7e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.199259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2022  citrate synthase  33.62 
 
 		 267 aa  122  8e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.275146  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6318  citrate synthase  30.6 
 
 		 249 aa  122  9e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8311  citrate synthase  33.47 
 
 		 277 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.173148  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4677  citrate synthase  34.07 
 
 		 257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1194  citrate synthase  35.92 
 
 		 267 aa  113  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4268  citrate synthase  32.69 
 
 		 265 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.245417  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5653  citrate synthase  32.38 
 
 		 268 aa  108  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0675936  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4946  citrate synthase  33.04 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.094047  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4697  citrate synthase  29.82 
 
 		 259 aa  98.2  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.405969  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5380  citrate synthase  29.39 
 
 		 261 aa  96.3  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4823  citrate synthase  30.6 
 
 		 261 aa  95.1  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0799  citrate synthase  28.75 
 
 		 261 aa  94.7  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4826  citrate synthase  29.91 
 
 		 271 aa  94  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.538489  normal  0.968705 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0986  citrate synthase  30.73 
 
 		 259 aa  92.8  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.879919 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0045  citrate synthase  29.02 
 
 		 286 aa  92  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6289  citrate synthase  28.75 
 
 		 270 aa  89.7  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0980026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0447  Citrate synthase-like protein  30.1 
 
 		 240 aa  88.6  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000621018  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3212  citrate synthase  31.02 
 
 		 427 aa  77.4  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215147  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0715  citrate synthase  23.97 
 
 		 355 aa  77  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1189  Citrate (Si)-synthase  30.17 
 
 		 395 aa  75.9  0.0000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0730  citrate synthase  28.93 
 
 		 398 aa  74.3  0.000000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.554862  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0856  citrate synthase  30.37 
 
 		 406 aa  74.7  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2276  citrate synthase  27.23 
 
 		 380 aa  73.9  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3560  DNA binding domain protein, excisionase family  29.15 
 
 		 412 aa  73.2  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0836216  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2617  citrate synthase I  30.77 
 
 		 436 aa  72.8  0.000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.819839 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1187  citrate synthase  28.24 
 
 		 431 aa  72.4  0.000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02359  type II citrate synthase  28.57 
 
 		 442 aa  70.9  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1258  citrate synthase  27.8 
 
 		 373 aa  71.6  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4680  citrate synthase I  26.51 
 
 		 446 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1708  type II citrate synthase  29.11 
 
 		 433 aa  70.1  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.693797  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5145  citrate synthase I  26.51 
 
 		 429 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.236177  normal  0.0251581 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0787  type II citrate synthase  28.12 
 
 		 429 aa  69.7  0.00000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2679  citrate synthase  25.33 
 
 		 372 aa  69.7  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0198833  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0781  citrate synthase  25.78 
 
 		 372 aa  69.3  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1275  citrate synthase  28.04 
 
 		 427 aa  69.7  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.152797  normal  0.229785 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5222  citrate synthase I  26.05 
 
 		 429 aa  69.3  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.827577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3584  citrate synthase I  26.17 
 
 		 425 aa  69.7  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00887444 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1786  citrate synthase  28.92 
 
 		 373 aa  69.3  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0350  citrate synthase  26.59 
 
 		 391 aa  69.3  0.00000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2787  citrate synthase I  27.06 
 
 		 426 aa  69.3  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.420339  normal  0.059507 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1752  citrate synthase  28.92 
 
 		 373 aa  69.3  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.206255  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4502  type II citrate synthase  28.64 
 
 		 434 aa  69.3  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.705578 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2023  citrate synthase I  29.36 
 
 		 429 aa  68.9  0.00000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1845  type II citrate synthase  28.85 
 
 		 433 aa  68.9  0.00000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.273477  normal  0.198527 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1681  citrate synthase I  27.44 
 
 		 429 aa  68.9  0.00000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592991 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1202  Citrate (Si)-synthase  25.13 
 
 		 375 aa  68.6  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000138488  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0646  citrate synthase I  27.83 
 
 		 430 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.615558 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0058  citrate synthase I  28.37 
 
 		 432 aa  68.6  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00358332  normal  0.0142462 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2563  type II citrate synthase  26.98 
 
 		 429 aa  68.9  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.102281  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2214  citrate synthase I  29.03 
 
 		 428 aa  67.8  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.525644  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2042  citrate synthase I  29.03 
 
 		 447 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1870  citrate synthase I  27.98 
 
 		 448 aa  67.8  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.859731 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3181  citrate synthase I  28.91 
 
 		 438 aa  67.8  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.270593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2068  citrate synthase I  29.73 
 
 		 450 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.355535  normal  0.380729 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0874  type II citrate synthase  27.46 
 
 		 429 aa  67.8  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0015368  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1409  citrate synthase I  29.17 
 
 		 429 aa  67.8  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.423182 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1212  citrate synthase  27.36 
 
 		 428 aa  67.4  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000171793  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1132  citrate synthase  27.49 
 
 		 431 aa  67  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2531  citrate synthase I  29.17 
 
 		 428 aa  67  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000235775 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2813  type II citrate synthase  27.19 
 
 		 434 aa  67  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2481  type II citrate synthase  27.14 
 
 		 433 aa  66.6  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523496  normal  0.0627534 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1676  citrate synthase  27.31 
 
 		 445 aa  67  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308594  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2557  citrate synthase  29.78 
 
 		 391 aa  66.6  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2287  citrate (Si)-synthase  28.12 
 
 		 425 aa  66.6  0.0000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1408  citrate synthase  28.43 
 
 		 386 aa  66.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2819  type II citrate synthase  27.1 
 
 		 428 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0484944  normal  0.528181 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0061  citrate synthase  27.49 
 
 		 430 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0890712  normal  0.301769 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1400  citrate synthase I  28.76 
 
 		 444 aa  66.6  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.562441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3716  citrate synthase I  27.96 
 
 		 430 aa  66.6  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.364105  normal  0.0570227 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37633  predicted protein  27.27 
 
 		 544 aa  66.6  0.0000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.506551  normal  0.0169313 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1377  citrate synthase  28.43 
 
 		 386 aa  66.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1926  type II citrate synthase  27.32 
 
 		 428 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1088  citrate synthase I  27.44 
 
 		 443 aa  66.2  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.864155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1646  type II citrate synthase  27.31 
 
 		 429 aa  66.2  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0982845  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1705  type II citrate synthase  27.32 
 
 		 428 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00232802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1705  type II citrate synthase  27.27 
 
 		 428 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0861056  normal  0.668035 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2221  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  27.8 
 
 		 377 aa  66.2  0.0000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57744  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0663  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  28.95 
 
 		 373 aa  66.2  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.280152  normal  0.110027 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4425  citrate synthase I  28.77 
 
 		 436 aa  66.2  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.224643  normal  0.0272577 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1630  type II citrate synthase  27.32 
 
 		 428 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.01465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1783  type II citrate synthase  26.64 
 
 		 429 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0004224  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1524  citrate synthase I  27.36 
 
 		 430 aa  65.9  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.802094  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2083  citrate synthase  28.64 
 
 		 447 aa  65.9  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.48822  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>