More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2679 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0781  citrate synthase  91.4 
 
 		 372 aa  716    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2679  citrate synthase  100 
 
 		 372 aa  770    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0198833  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3278  citrate synthase  74.39 
 
 		 386 aa  589  1e-167  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.312589  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4725  citrate synthase  73.85 
 
 		 371 aa  589  1e-167  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0534  citrate synthase  73.58 
 
 		 382 aa  588  1e-167  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0555246 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4704  citrate synthase  73.58 
 
 		 382 aa  588  1e-167  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4488  citrate synthase  73.05 
 
 		 371 aa  585  1e-166  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4323  citrate synthase  73.32 
 
 		 371 aa  587  1e-166  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4335  citrate synthase  73.32 
 
 		 371 aa  587  1e-166  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4709  citrate synthase  73.32 
 
 		 382 aa  587  1e-166  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000257504 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4839  citrate synthase  73.05 
 
 		 371 aa  585  1e-166  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4720  citrate synthase  73.32 
 
 		 382 aa  587  1e-166  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4424  citrate synthase  72.78 
 
 		 371 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1258  citrate synthase  61.79 
 
 		 373 aa  489  1e-137  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1786  citrate synthase  59.35 
 
 		 373 aa  478  1e-134  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1752  citrate synthase  59.35 
 
 		 373 aa  478  1e-134  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.206255  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1245  citrate synthase  54.22 
 
 		 374 aa  419  1e-116  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2221  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  55.5 
 
 		 377 aa  414  1e-114  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57744  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0837  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  51.73 
 
 		 378 aa  391  1e-108  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.531649  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0895  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  51.22 
 
 		 430 aa  383  1e-105  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2276  citrate synthase  53.99 
 
 		 380 aa  381  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1572  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  51.23 
 
 		 380 aa  374  1e-102  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3036  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  48.68 
 
 		 382 aa  368  1e-101  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1523  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  51.47 
 
 		 379 aa  371  1e-101  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.297697  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0723  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  48.67 
 
 		 382 aa  363  2e-99  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.517524  normal  0.584309 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1476  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  49.08 
 
 		 382 aa  359  5e-98  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.644774  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1526  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  48.4 
 
 		 390 aa  349  4e-95  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.682888  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1621  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  47.87 
 
 		 379 aa  343  2e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285346  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1252  Citrate (Si)-synthase  48.26 
 
 		 373 aa  341  1e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0663  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  46.76 
 
 		 373 aa  341  1e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.280152  normal  0.110027 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1467  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  47.99 
 
 		 385 aa  338  8e-92  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0316751  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0306  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  45.19 
 
 		 397 aa  330  3e-89  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.772555 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2713  citrate synthase  45.55 
 
 		 378 aa  329  4e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0100  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  45.16 
 
 		 377 aa  328  6e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4089  citrate synthase  46.77 
 
 		 389 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1528  citrate synthase  45.48 
 
 		 375 aa  326  3e-88  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0349986  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1580  citrate synthase  45.43 
 
 		 383 aa  326  3e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2413  citrate synthase  45.01 
 
 		 397 aa  325  1e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02341  citrate synthase  45.21 
 
 		 375 aa  324  1e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01811  citrate synthase  45.82 
 
 		 381 aa  323  2e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0404  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  45.38 
 
 		 378 aa  323  3e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1189  Citrate (Si)-synthase  43.65 
 
 		 395 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01791  citrate synthase  45.55 
 
 		 381 aa  321  9.999999999999999e-87  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0163  citrate synthase  45.55 
 
 		 381 aa  321  9.999999999999999e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.292022  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01781  citrate synthase  44.15 
 
 		 378 aa  320  1.9999999999999998e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.176216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1726  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  46.42 
 
 		 380 aa  320  1.9999999999999998e-86  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0612  citrate synthase  46.36 
 
 		 386 aa  319  5e-86  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.148892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0279  citrate synthase  44.2 
 
 		 396 aa  319  6e-86  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1522  citrate synthase  44.3 
 
 		 370 aa  317  2e-85  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.640515  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0072  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  44.12 
 
 		 372 aa  316  3e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53950  methylcitrate synthase  44.53 
 
 		 375 aa  316  4e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.282102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01901  citrate synthase  44.74 
 
 		 381 aa  316  5e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02396  methylcitrate synthase  44.2 
 
 		 380 aa  315  6e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4723  methylcitrate synthase  44.27 
 
 		 375 aa  315  7e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1665  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  44.44 
 
 		 374 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1420  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  44.44 
 
 		 374 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26921  citrate synthase  43.67 
 
 		 396 aa  314  9.999999999999999e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2335  methylcitrate synthase  45.26 
 
 		 375 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218689  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1063  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.08 
 
 		 393 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1936  methylcitrate synthase  44.99 
 
 		 375 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.686847  hitchhiker  0.000000858753 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3435  methylcitrate synthase  45.26 
 
 		 375 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.01089  normal  0.171025 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1665  methylcitrate synthase  45.41 
 
 		 377 aa  313  3.9999999999999997e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2420  2-methylcitrate synthase  44.09 
 
 		 375 aa  312  6.999999999999999e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0822163  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1665  citrate synthase  43.8 
 
 		 378 aa  311  1e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1821  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.63 
 
 		 374 aa  311  1e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1776  methylcitrate synthase  44.17 
 
 		 375 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.549839  hitchhiker  0.000461346 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1099  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  47.01 
 
 		 387 aa  311  1e-83  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2604  2-methylcitrate synthase  43.9 
 
 		 374 aa  311  1e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.121252  hitchhiker  0.000290432 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2112  2-methylcitrate synthase  43.36 
 
 		 374 aa  310  2e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1523  citrate synthase  43.55 
 
 		 379 aa  310  2e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000149405 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1408  citrate synthase  43.94 
 
 		 386 aa  311  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1765  methylcitrate synthase  44.74 
 
 		 375 aa  311  2e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.924616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1377  citrate synthase  43.94 
 
 		 386 aa  311  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11154  citrate synthase  44.08 
 
 		 393 aa  311  2e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2498  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  44.17 
 
 		 374 aa  309  4e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0246552 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003389  2-methylcitrate synthase  43.24 
 
 		 380 aa  308  8e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3630  methylcitrate synthase  44.17 
 
 		 375 aa  308  8e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0314  methylcitrate synthase  44.17 
 
 		 375 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3826  methylcitrate synthase  44.17 
 
 		 375 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0713  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  44.25 
 
 		 404 aa  306  3e-82  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.756288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1198  methylcitrate synthase  42.7 
 
 		 376 aa  306  5.0000000000000004e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0344  methylcitrate synthase  43.63 
 
 		 375 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0574  citrate synthase  42.15 
 
 		 378 aa  306  5.0000000000000004e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0953  methylcitrate synthase  42.47 
 
 		 377 aa  305  6e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2288  2-methylcitrate synthase  43.63 
 
 		 375 aa  305  8.000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.037213  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2321  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.28 
 
 		 384 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1523  citrate synthase  43.82 
 
 		 379 aa  304  2.0000000000000002e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.836356  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3295  methylcitrate synthase  42.7 
 
 		 378 aa  301  1e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.11596 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3645  methylcitrate synthase  43.09 
 
 		 375 aa  300  2e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2086  methylcitrate synthase  43.13 
 
 		 375 aa  300  2e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.440425  hitchhiker  0.00454661 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1858  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.09 
 
 		 374 aa  301  2e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2821  putative 2-methylcitrate synthase  43.63 
 
 		 374 aa  300  3e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.702751  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0820  2-methylcitrate synthase  44.27 
 
 		 372 aa  300  3e-80  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1176  2-methylcitrate synthase  44.27 
 
 		 372 aa  300  3e-80  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.831059  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2480  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.66 
 
 		 380 aa  300  3e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.388889  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2234  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.08 
 
 		 409 aa  300  4e-80  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.709963 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1868  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.36 
 
 		 376 aa  299  4e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.650369  normal  0.135048 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4141  methylcitrate synthase  42.82 
 
 		 379 aa  299  5e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2401  2-methylcitrate synthase  43.67 
 
 		 371 aa  299  5e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.612256  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0798  citrate synthase 3  44.01 
 
 		 370 aa  299  6e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.036744  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>