More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1523 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1523  citrate synthase  92.06 
 
 
379 aa  723    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000149405 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1523  citrate synthase  100 
 
 
379 aa  786    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.836356  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14160  citrate synthase  79.1 
 
 
381 aa  613  9.999999999999999e-175  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12020  citrate synthase  72.15 
 
 
389 aa  563  1.0000000000000001e-159  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.555378  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0574  citrate synthase  67.64 
 
 
378 aa  494  1e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2480  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  62.66 
 
 
380 aa  482  1e-135  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.388889  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0109  citrate synthase  63.54 
 
 
372 aa  458  9.999999999999999e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.373645  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11154  citrate synthase  60.37 
 
 
393 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0100  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  55.44 
 
 
377 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1658  citrate synthase  49.6 
 
 
373 aa  370  1e-101  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.617148  normal  0.567466 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1815  Citrate synthase  58.25 
 
 
419 aa  317  2e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2679  citrate synthase  43.82 
 
 
372 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0198833  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0781  citrate synthase  43.28 
 
 
372 aa  303  5.000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4725  citrate synthase  42.86 
 
 
371 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0895  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.51 
 
 
430 aa  289  6e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3278  citrate synthase  43.43 
 
 
386 aa  289  6e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.312589  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4424  citrate synthase  41.58 
 
 
371 aa  286  4e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0534  citrate synthase  42.59 
 
 
382 aa  285  7e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0555246 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4488  citrate synthase  42.32 
 
 
371 aa  285  8e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4839  citrate synthase  42.32 
 
 
371 aa  285  8e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4704  citrate synthase  42.59 
 
 
382 aa  285  8e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4323  citrate synthase  42.32 
 
 
371 aa  285  9e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4335  citrate synthase  42.32 
 
 
371 aa  285  9e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4720  citrate synthase  42.32 
 
 
382 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4709  citrate synthase  42.32 
 
 
382 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000257504 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4723  methylcitrate synthase  43.68 
 
 
375 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53950  methylcitrate synthase  43.68 
 
 
375 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.282102  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0344  methylcitrate synthase  43.32 
 
 
375 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0837  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  40.32 
 
 
378 aa  280  2e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.531649  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2335  methylcitrate synthase  43.04 
 
 
375 aa  280  4e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218689  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3435  methylcitrate synthase  43.04 
 
 
375 aa  280  4e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.01089  normal  0.171025 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1936  methylcitrate synthase  42.82 
 
 
375 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.686847  hitchhiker  0.000000858753 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2221  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.01 
 
 
377 aa  278  1e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57744  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1665  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.74 
 
 
374 aa  278  1e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3630  methylcitrate synthase  42.47 
 
 
375 aa  277  2e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0314  methylcitrate synthase  42.74 
 
 
375 aa  277  2e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3826  methylcitrate synthase  42.74 
 
 
375 aa  277  2e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3295  methylcitrate synthase  41.67 
 
 
378 aa  277  3e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.11596 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1765  methylcitrate synthase  43.31 
 
 
375 aa  276  4e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.924616  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2288  2-methylcitrate synthase  43.42 
 
 
375 aa  276  5e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.037213  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1776  methylcitrate synthase  41.99 
 
 
375 aa  275  9e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.549839  hitchhiker  0.000461346 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1467  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  38.81 
 
 
385 aa  270  2e-71  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0316751  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1111  methylcitrate synthase  42.82 
 
 
379 aa  270  4e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.468935 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1310  methylcitrate synthase  42.82 
 
 
375 aa  268  8.999999999999999e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2413  citrate synthase  38.67 
 
 
397 aa  268  1e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1420  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.13 
 
 
374 aa  268  1e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2604  2-methylcitrate synthase  42.01 
 
 
374 aa  268  1e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.121252  hitchhiker  0.000290432 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2821  putative 2-methylcitrate synthase  41.01 
 
 
374 aa  267  2e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.702751  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1252  Citrate (Si)-synthase  41.64 
 
 
373 aa  267  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0279  citrate synthase  38.13 
 
 
396 aa  267  2e-70  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2276  citrate synthase  39.73 
 
 
380 aa  267  2e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3645  methylcitrate synthase  41.71 
 
 
375 aa  267  2e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1245  citrate synthase  40.38 
 
 
374 aa  268  2e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4048  methylcitrate synthase  41.71 
 
 
375 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3946  methylcitrate synthase  41.44 
 
 
375 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4022  methylcitrate synthase  41.44 
 
 
375 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1189  Citrate (Si)-synthase  40.64 
 
 
395 aa  265  7e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4141  methylcitrate synthase  41.44 
 
 
379 aa  265  7e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0820  2-methylcitrate synthase  40 
 
 
372 aa  265  8e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03371  methylcitrate synthase  41.11 
 
 
373 aa  265  8e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2086  methylcitrate synthase  41.88 
 
 
375 aa  265  8e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.440425  hitchhiker  0.00454661 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1176  2-methylcitrate synthase  40 
 
 
372 aa  265  8e-70  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.831059  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1572  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  38.81 
 
 
380 aa  265  8e-70  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1821  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.82 
 
 
374 aa  265  1e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2498  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.46 
 
 
374 aa  263  3e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0246552 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02341  citrate synthase  38.13 
 
 
375 aa  263  4e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0072  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  40.87 
 
 
372 aa  263  4e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2713  citrate synthase  38.46 
 
 
378 aa  263  4.999999999999999e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1258  citrate synthase  39.41 
 
 
373 aa  262  6e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1752  citrate synthase  39.41 
 
 
373 aa  262  6.999999999999999e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.206255  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1786  citrate synthase  39.41 
 
 
373 aa  262  6.999999999999999e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1523  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  39.43 
 
 
379 aa  262  8e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.297697  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1858  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  40.59 
 
 
374 aa  262  8.999999999999999e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1528  citrate synthase  37.87 
 
 
375 aa  261  1e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0349986  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2112  2-methylcitrate synthase  41.18 
 
 
374 aa  261  1e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2321  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  40.86 
 
 
384 aa  261  1e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01811  citrate synthase  38.24 
 
 
381 aa  261  1e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1198  methylcitrate synthase  41.67 
 
 
376 aa  260  2e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5388  methylcitrate synthase  42.23 
 
 
390 aa  260  3e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2208  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.74 
 
 
374 aa  260  3e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.539974  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1071  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  40.75 
 
 
373 aa  260  3e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.66322  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2420  2-methylcitrate synthase  40.65 
 
 
375 aa  260  3e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0822163  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1526  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  39.2 
 
 
390 aa  260  3e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.682888  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4841  methylcitrate synthase  42.23 
 
 
390 aa  260  3e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.994856  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01901  citrate synthase  37.43 
 
 
381 aa  260  3e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1868  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.24 
 
 
376 aa  259  5.0000000000000005e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.650369  normal  0.135048 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0163  citrate synthase  37.43 
 
 
381 aa  259  7e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.292022  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01791  citrate synthase  37.7 
 
 
381 aa  258  8e-68  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26921  citrate synthase  38.5 
 
 
396 aa  259  8e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1726  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  39.35 
 
 
380 aa  257  2e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2401  2-methylcitrate synthase  39.78 
 
 
371 aa  257  2e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.612256  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4756  methylcitrate synthase  41.69 
 
 
390 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.394349  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5345  methylcitrate synthase  41.69 
 
 
390 aa  257  3e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.417928  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0404  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  37.83 
 
 
378 aa  256  3e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5516  methylcitrate synthase  41.69 
 
 
390 aa  257  3e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0272926  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0142  methylcitrate synthase  41.96 
 
 
390 aa  256  4e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.482229  normal  0.590891 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01781  citrate synthase  36.36 
 
 
378 aa  256  4e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.176216  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3036  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  39.16 
 
 
382 aa  256  4e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0647  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  39.84 
 
 
367 aa  256  5e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.029125  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0622  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  39.84 
 
 
367 aa  256  5e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0115525  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>