More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0574 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0574  citrate synthase  100 
 
 		 378 aa  764    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1523  citrate synthase  67.46 
 
 		 379 aa  501  1e-141  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000149405 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1523  citrate synthase  67.64 
 
 		 379 aa  494  1e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.836356  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14160  citrate synthase  66.31 
 
 		 381 aa  489  1e-137  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12020  citrate synthase  62.02 
 
 		 389 aa  468  1.0000000000000001e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.555378  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2480  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  64.96 
 
 		 380 aa  467  9.999999999999999e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.388889  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11154  citrate synthase  60.93 
 
 		 393 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0100  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  56.37 
 
 		 377 aa  431  1e-119  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0109  citrate synthase  62.6 
 
 		 372 aa  425  1e-118  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.373645  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1658  citrate synthase  53.39 
 
 		 373 aa  397  1e-109  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.617148  normal  0.567466 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0781  citrate synthase  42.98 
 
 		 372 aa  311  1e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2679  citrate synthase  42.15 
 
 		 372 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0198833  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1815  Citrate synthase  61.32 
 
 		 419 aa  304  2.0000000000000002e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2221  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  45.36 
 
 		 377 aa  299  7e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57744  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4723  methylcitrate synthase  45.05 
 
 		 375 aa  297  2e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53950  methylcitrate synthase  45.05 
 
 		 375 aa  297  2e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.282102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0072  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.58 
 
 		 372 aa  294  1e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4424  citrate synthase  42.18 
 
 		 371 aa  293  4e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3278  citrate synthase  41.92 
 
 		 386 aa  293  5e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.312589  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4725  citrate synthase  41.83 
 
 		 371 aa  292  6e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4488  citrate synthase  41.9 
 
 		 371 aa  292  7e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4839  citrate synthase  41.9 
 
 		 371 aa  292  7e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4704  citrate synthase  41.9 
 
 		 382 aa  292  7e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1258  citrate synthase  38.95 
 
 		 373 aa  292  8e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4720  citrate synthase  41.9 
 
 		 382 aa  292  8e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4709  citrate synthase  41.9 
 
 		 382 aa  292  8e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000257504 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4323  citrate synthase  41.9 
 
 		 371 aa  291  9e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4335  citrate synthase  41.9 
 
 		 371 aa  291  9e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0534  citrate synthase  41.9 
 
 		 382 aa  291  9e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0555246 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1858  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  45.48 
 
 		 374 aa  291  2e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1786  citrate synthase  40 
 
 		 373 aa  290  4e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1752  citrate synthase  40 
 
 		 373 aa  290  4e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.206255  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2288  2-methylcitrate synthase  43.68 
 
 		 375 aa  289  7e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.037213  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1487  2-methylcitrate synthase  44.17 
 
 		 372 aa  289  7e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1936  methylcitrate synthase  44.38 
 
 		 375 aa  289  7e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.686847  hitchhiker  0.000000858753 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0895  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.44 
 
 		 430 aa  289  7e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1420  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.41 
 
 		 374 aa  289  7e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2335  methylcitrate synthase  44.66 
 
 		 375 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218689  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1496  2-methylcitrate synthase  44.23 
 
 		 372 aa  288  1e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3435  methylcitrate synthase  44.66 
 
 		 375 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.01089  normal  0.171025 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2086  methylcitrate synthase  43.68 
 
 		 375 aa  287  2e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.440425  hitchhiker  0.00454661 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1776  methylcitrate synthase  44.11 
 
 		 375 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.549839  hitchhiker  0.000461346 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1665  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.92 
 
 		 374 aa  286  4e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1245  citrate synthase  40.95 
 
 		 374 aa  286  4e-76  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1726  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.47 
 
 		 380 aa  286  5e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1765  methylcitrate synthase  43.25 
 
 		 375 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.924616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0837  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.53 
 
 		 378 aa  282  6.000000000000001e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.531649  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0344  methylcitrate synthase  43.41 
 
 		 375 aa  282  8.000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3630  methylcitrate synthase  43.09 
 
 		 375 aa  281  1e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0314  methylcitrate synthase  43.09 
 
 		 375 aa  280  2e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3826  methylcitrate synthase  43.09 
 
 		 375 aa  281  2e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1467  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  38.69 
 
 		 385 aa  280  3e-74  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0316751  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3295  methylcitrate synthase  42.86 
 
 		 378 aa  280  3e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.11596 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0723  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.44 
 
 		 382 aa  279  5e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.517524  normal  0.584309 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1821  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.31 
 
 		 374 aa  279  5e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2498  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.13 
 
 		 374 aa  278  1e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0246552 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2321  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.03 
 
 		 384 aa  277  3e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1523  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.47 
 
 		 379 aa  276  3e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.297697  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0121  methylcitrate synthase  42.66 
 
 		 387 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2420  2-methylcitrate synthase  41.22 
 
 		 375 aa  274  1.0000000000000001e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0822163  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1252  Citrate (Si)-synthase  42.7 
 
 		 373 aa  275  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1868  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.76 
 
 		 376 aa  275  1.0000000000000001e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.650369  normal  0.135048 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03371  methylcitrate synthase  41.64 
 
 		 373 aa  273  3e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1508  methylcitrate synthase  41.47 
 
 		 386 aa  273  3e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.83768  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1572  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  40.33 
 
 		 380 aa  273  4.0000000000000004e-72  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2900  methylcitrate synthase  41.94 
 
 		 395 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2604  2-methylcitrate synthase  43.8 
 
 		 374 aa  272  6e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.121252  hitchhiker  0.000290432 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4141  methylcitrate synthase  41.48 
 
 		 379 aa  272  7e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3946  methylcitrate synthase  41.48 
 
 		 375 aa  272  8.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4022  methylcitrate synthase  41.48 
 
 		 375 aa  272  8.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2112  2-methylcitrate synthase  40.66 
 
 		 374 aa  272  9e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0953  methylcitrate synthase  41.48 
 
 		 377 aa  271  9e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2821  putative 2-methylcitrate synthase  41.48 
 
 		 374 aa  271  1e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.702751  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1111  methylcitrate synthase  41.26 
 
 		 379 aa  271  1e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.468935 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1621  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  40.22 
 
 		 379 aa  271  1e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285346  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1310  methylcitrate synthase  41.62 
 
 		 375 aa  271  1e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2276  citrate synthase  41.23 
 
 		 380 aa  271  1e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1198  methylcitrate synthase  42.03 
 
 		 376 aa  270  2e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6860  methylcitrate synthase  41.39 
 
 		 395 aa  271  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.632501  normal  0.17935 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4048  methylcitrate synthase  41.21 
 
 		 375 aa  270  2e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2302  methylcitrate synthase  41.78 
 
 		 389 aa  271  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.459531  normal  0.256502 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1071  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.36 
 
 		 373 aa  271  2e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.66322  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0663  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.02 
 
 		 373 aa  271  2e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.280152  normal  0.110027 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3511  methylcitrate synthase  41.38 
 
 		 390 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.106101 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3645  methylcitrate synthase  41.21 
 
 		 375 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3974  methylcitrate synthase  42.06 
 
 		 389 aa  270  4e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0651061 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3860  methylcitrate synthase  42.06 
 
 		 389 aa  270  4e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6081  methylcitrate synthase  41.23 
 
 		 389 aa  270  4e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.662054 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4355  methylcitrate synthase  41.94 
 
 		 391 aa  270  4e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1869  methylcitrate synthase  41.55 
 
 		 390 aa  269  5e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0383  methylcitrate synthase  41.55 
 
 		 390 aa  269  5e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.679335  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1737  methylcitrate synthase  41.55 
 
 		 390 aa  269  5e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1165  methylcitrate synthase  41.55 
 
 		 390 aa  269  5e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0289  methylcitrate synthase  41.55 
 
 		 390 aa  269  5e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2142  methylcitrate synthase  41.55 
 
 		 390 aa  269  5e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0878  methylcitrate synthase  41.55 
 
 		 390 aa  269  5e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0820  2-methylcitrate synthase  40.87 
 
 		 372 aa  269  5.9999999999999995e-71  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1176  2-methylcitrate synthase  40.87 
 
 		 372 aa  269  5.9999999999999995e-71  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.831059  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3036  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  40.43 
 
 		 382 aa  269  5.9999999999999995e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1526  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  38.77 
 
 		 390 aa  269  7e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.682888  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>