More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1523 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_1523  citrate synthase  92.06 
 
 
379 aa  723    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.836356  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1523  citrate synthase  100 
 
 
379 aa  784    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000149405 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14160  citrate synthase  79.42 
 
 
381 aa  622  1e-177  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12020  citrate synthase  73.02 
 
 
389 aa  572  1.0000000000000001e-162  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.555378  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0574  citrate synthase  67.46 
 
 
378 aa  501  1e-141  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2480  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  61.98 
 
 
380 aa  477  1e-133  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.388889  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0109  citrate synthase  65.24 
 
 
372 aa  472  1e-132  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.373645  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11154  citrate synthase  60.27 
 
 
393 aa  443  1e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0100  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  54.93 
 
 
377 aa  424  1e-117  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1658  citrate synthase  51.87 
 
 
373 aa  385  1e-106  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.617148  normal  0.567466 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2679  citrate synthase  43.55 
 
 
372 aa  310  2e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0198833  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0781  citrate synthase  42.74 
 
 
372 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1815  Citrate synthase  57.04 
 
 
419 aa  305  1.0000000000000001e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3278  citrate synthase  43.27 
 
 
386 aa  299  5e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.312589  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0837  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.22 
 
 
378 aa  296  4e-79  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.531649  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4725  citrate synthase  43.01 
 
 
371 aa  293  2e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4424  citrate synthase  43.16 
 
 
371 aa  294  2e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0534  citrate synthase  42.74 
 
 
382 aa  292  7e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0555246 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4704  citrate synthase  42.74 
 
 
382 aa  292  7e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2221  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.53 
 
 
377 aa  290  3e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57744  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4488  citrate synthase  42.47 
 
 
371 aa  290  4e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4839  citrate synthase  42.47 
 
 
371 aa  290  4e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4323  citrate synthase  42.47 
 
 
371 aa  289  6e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4335  citrate synthase  42.47 
 
 
371 aa  289  6e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4720  citrate synthase  42.47 
 
 
382 aa  289  6e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4709  citrate synthase  42.47 
 
 
382 aa  289  6e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000257504 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0895  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.24 
 
 
430 aa  288  8e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2276  citrate synthase  40.6 
 
 
380 aa  284  1.0000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4723  methylcitrate synthase  43.51 
 
 
375 aa  282  6.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53950  methylcitrate synthase  43.51 
 
 
375 aa  282  6.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.282102  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1936  methylcitrate synthase  43.13 
 
 
375 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.686847  hitchhiker  0.000000858753 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2335  methylcitrate synthase  43.43 
 
 
375 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218689  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1776  methylcitrate synthase  43.43 
 
 
375 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.549839  hitchhiker  0.000461346 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3435  methylcitrate synthase  43.43 
 
 
375 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.01089  normal  0.171025 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1467  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  38.65 
 
 
385 aa  280  4e-74  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0316751  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2288  2-methylcitrate synthase  43.24 
 
 
375 aa  277  2e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.037213  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1665  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.05 
 
 
374 aa  277  2e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1245  citrate synthase  40.38 
 
 
374 aa  277  2e-73  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1258  citrate synthase  39.68 
 
 
373 aa  276  3e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1176  2-methylcitrate synthase  40.54 
 
 
372 aa  277  3e-73  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.831059  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0820  2-methylcitrate synthase  40.54 
 
 
372 aa  277  3e-73  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0344  methylcitrate synthase  42.59 
 
 
375 aa  276  4e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2821  putative 2-methylcitrate synthase  42.59 
 
 
374 aa  276  5e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.702751  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1765  methylcitrate synthase  42.86 
 
 
375 aa  276  5e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.924616  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0072  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.96 
 
 
372 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1252  Citrate (Si)-synthase  42.74 
 
 
373 aa  274  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1526  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  40.16 
 
 
390 aa  274  2.0000000000000002e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.682888  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1420  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.1 
 
 
374 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1111  methylcitrate synthase  42.47 
 
 
379 aa  272  6e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.468935 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1752  citrate synthase  39.95 
 
 
373 aa  272  6e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.206255  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3295  methylcitrate synthase  40.78 
 
 
378 aa  272  6e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.11596 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1786  citrate synthase  39.95 
 
 
373 aa  272  6e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3630  methylcitrate synthase  42.47 
 
 
375 aa  272  8.000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1189  Citrate (Si)-synthase  40.05 
 
 
395 aa  271  1e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2086  methylcitrate synthase  42.32 
 
 
375 aa  271  1e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.440425  hitchhiker  0.00454661 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0314  methylcitrate synthase  42.47 
 
 
375 aa  271  1e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3826  methylcitrate synthase  42.47 
 
 
375 aa  271  1e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2604  2-methylcitrate synthase  43.51 
 
 
374 aa  270  2.9999999999999997e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.121252  hitchhiker  0.000290432 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5388  methylcitrate synthase  42.51 
 
 
390 aa  270  4e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4841  methylcitrate synthase  42.51 
 
 
390 aa  270  4e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.994856  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2420  2-methylcitrate synthase  41.27 
 
 
375 aa  269  5e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0822163  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2208  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.02 
 
 
374 aa  269  5.9999999999999995e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.539974  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2112  2-methylcitrate synthase  41.27 
 
 
374 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1821  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.55 
 
 
374 aa  268  8.999999999999999e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3273  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.58 
 
 
389 aa  268  1e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3292  methylcitrate synthase  41.58 
 
 
389 aa  268  1e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01901  citrate synthase  37.7 
 
 
381 aa  268  1e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1476  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  39.64 
 
 
382 aa  268  1e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.644774  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1621  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  39.63 
 
 
379 aa  268  1e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285346  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1310  methylcitrate synthase  41.4 
 
 
375 aa  268  1e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00287  2-methylcitrate synthase  41.58 
 
 
389 aa  267  2e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0357  methylcitrate synthase  41.35 
 
 
389 aa  268  2e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00291  hypothetical protein  41.58 
 
 
389 aa  267  2e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0364  methylcitrate synthase  41.35 
 
 
389 aa  267  2e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2321  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.55 
 
 
384 aa  267  2e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0142  methylcitrate synthase  42.23 
 
 
390 aa  267  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.482229  normal  0.590891 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4756  methylcitrate synthase  41.96 
 
 
390 aa  267  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.394349  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6860  methylcitrate synthase  41.4 
 
 
395 aa  268  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.632501  normal  0.17935 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5345  methylcitrate synthase  41.96 
 
 
390 aa  267  2e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.417928  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1726  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  40.86 
 
 
380 aa  268  2e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5516  methylcitrate synthase  41.96 
 
 
390 aa  267  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0272926  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0398  methylcitrate synthase  41.58 
 
 
389 aa  267  2e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03371  methylcitrate synthase  40.79 
 
 
373 aa  266  2.9999999999999995e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3036  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  39.38 
 
 
382 aa  266  4e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0663  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  40.16 
 
 
373 aa  266  4e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.280152  normal  0.110027 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1858  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  40.05 
 
 
374 aa  266  4e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1523  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  39.64 
 
 
379 aa  266  4e-70  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.297697  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1572  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  38.61 
 
 
380 aa  266  5e-70  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2413  citrate synthase  38.13 
 
 
397 aa  266  5e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0121  methylcitrate synthase  42.23 
 
 
387 aa  266  5.999999999999999e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0404  methylcitrate synthase  41.08 
 
 
389 aa  265  7e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2401  2-methylcitrate synthase  40.11 
 
 
371 aa  265  7e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.612256  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1198  methylcitrate synthase  41.55 
 
 
376 aa  265  8.999999999999999e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4355  methylcitrate synthase  41.96 
 
 
391 aa  265  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3288  methylcitrate synthase  41.96 
 
 
390 aa  264  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.281405  normal  0.014196 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2498  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.05 
 
 
374 aa  264  2e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0246552 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6707  methylcitrate synthase  41.69 
 
 
389 aa  264  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1487  2-methylcitrate synthase  41.98 
 
 
372 aa  263  3e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02341  citrate synthase  38.36 
 
 
375 aa  263  3e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0403  methylcitrate synthase  41.3 
 
 
389 aa  263  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>