More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1189 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_1189  Citrate (Si)-synthase  100 
 
 
395 aa  803    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2557  citrate synthase  56.99 
 
 
391 aa  390  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4146  citrate (Si)-synthase  53.17 
 
 
375 aa  372  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2423  Citrate (Si)-synthase  49.33 
 
 
377 aa  337  1.9999999999999998e-91  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0663  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  45.99 
 
 
373 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.280152  normal  0.110027 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2539  Citrate (Si)-synthase  48.95 
 
 
374 aa  324  2e-87  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.64966  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2221  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  44.15 
 
 
377 aa  321  9.999999999999999e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57744  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2679  citrate synthase  43.65 
 
 
372 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0198833  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0781  citrate synthase  44.44 
 
 
372 aa  318  1e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1467  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.22 
 
 
385 aa  318  1e-85  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0316751  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1252  Citrate (Si)-synthase  44.65 
 
 
373 aa  314  1.9999999999999998e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0837  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.73 
 
 
378 aa  312  4.999999999999999e-84  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.531649  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1621  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.8 
 
 
379 aa  308  8e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285346  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0306  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.8 
 
 
397 aa  308  1.0000000000000001e-82  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.772555 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3278  citrate synthase  43.12 
 
 
386 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.312589  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4948  citrate synthase 2  47.96 
 
 
364 aa  302  6.000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.257238  normal  0.409706 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1258  citrate synthase  40.27 
 
 
373 aa  301  2e-80  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4725  citrate synthase  42.06 
 
 
371 aa  300  2e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4488  citrate synthase  41.8 
 
 
371 aa  300  3e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4839  citrate synthase  41.8 
 
 
371 aa  300  3e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4323  citrate synthase  41.8 
 
 
371 aa  300  4e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4335  citrate synthase  41.8 
 
 
371 aa  300  4e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4720  citrate synthase  41.8 
 
 
382 aa  300  4e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1035  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.88 
 
 
375 aa  300  4e-80  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4709  citrate synthase  41.8 
 
 
382 aa  300  4e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000257504 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4704  citrate synthase  41.53 
 
 
382 aa  298  9e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4424  citrate synthase  41.8 
 
 
371 aa  298  1e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0534  citrate synthase  41.53 
 
 
382 aa  298  1e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0555246 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1572  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.31 
 
 
380 aa  298  1e-79  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1523  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.93 
 
 
379 aa  297  2e-79  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.297697  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2103  citrate synthase 2  45.5 
 
 
364 aa  297  2e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0895  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.6 
 
 
430 aa  294  2e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1522  citrate synthase  40.37 
 
 
370 aa  293  5e-78  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.640515  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1726  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.16 
 
 
380 aa  292  6e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0647  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  39.26 
 
 
367 aa  292  9e-78  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.029125  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0723  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  39.95 
 
 
382 aa  292  9e-78  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.517524  normal  0.584309 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0622  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  39.26 
 
 
367 aa  292  9e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0115525  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3036  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  39.95 
 
 
382 aa  289  7e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0154  citrate synthase  42.93 
 
 
374 aa  288  9e-77  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.649155 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6150  Citrate (Si)-synthase  42.47 
 
 
391 aa  288  1e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.153659 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1786  citrate synthase  40 
 
 
373 aa  288  2e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1752  citrate synthase  40 
 
 
373 aa  288  2e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.206255  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02341  citrate synthase  39.9 
 
 
375 aa  286  4e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3093  Citrate (Si)-synthase  41.3 
 
 
378 aa  286  5e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.832749 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2276  citrate synthase  40.98 
 
 
380 aa  286  5.999999999999999e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1476  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  39.16 
 
 
382 aa  286  7e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.644774  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3748  Citrate (Si)-synthase  42.82 
 
 
388 aa  284  2.0000000000000002e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1528  citrate synthase  39.63 
 
 
375 aa  284  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0349986  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2027  citrate synthase 2  46.45 
 
 
362 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0563  citrate synthase  40.56 
 
 
412 aa  283  5.000000000000001e-75  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1526  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  38.99 
 
 
390 aa  282  6.000000000000001e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.682888  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1408  citrate synthase  40.8 
 
 
386 aa  282  8.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1377  citrate synthase  40.8 
 
 
386 aa  282  8.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01901  citrate synthase  40 
 
 
381 aa  281  1e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1245  citrate synthase  39.26 
 
 
374 aa  281  2e-74  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7568  citrate synthase 2  45.8 
 
 
362 aa  280  3e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.708852 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0404  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  40.37 
 
 
378 aa  280  3e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4089  citrate synthase  40.94 
 
 
389 aa  279  6e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01781  citrate synthase  39.9 
 
 
378 aa  277  2e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.176216  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01811  citrate synthase  39.29 
 
 
381 aa  277  2e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3561  Citrate (Si)-synthase  41.94 
 
 
387 aa  276  5e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141515  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2234  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  39.8 
 
 
409 aa  275  7e-73  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.709963 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2672  citrate synthase  39.95 
 
 
386 aa  275  7e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.530506  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3065  citrate synthase  39.95 
 
 
386 aa  275  7e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0163  citrate synthase  38.72 
 
 
381 aa  275  9e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.292022  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01791  citrate synthase  39.03 
 
 
381 aa  275  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26921  citrate synthase  38.64 
 
 
396 aa  275  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1830  citrate synthase 2  45.08 
 
 
362 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.011311 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1099  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  39.16 
 
 
387 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0279  citrate synthase  38.48 
 
 
396 aa  274  2.0000000000000002e-72  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2420  Citrate synthase  41.13 
 
 
481 aa  273  3e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2413  citrate synthase  38.32 
 
 
397 aa  272  7e-72  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4723  methylcitrate synthase  40.43 
 
 
375 aa  272  8.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53950  methylcitrate synthase  40.43 
 
 
375 aa  272  8.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.282102  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1523  citrate synthase  40.05 
 
 
379 aa  271  1e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000149405 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0713  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  40.97 
 
 
404 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.756288  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2713  citrate synthase  39.27 
 
 
378 aa  268  1e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0100  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  38.99 
 
 
377 aa  267  2e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1692  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  39.8 
 
 
409 aa  268  2e-70  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.141022  normal  0.100865 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1580  citrate synthase  38.93 
 
 
383 aa  267  2.9999999999999995e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0924  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  38.1 
 
 
379 aa  265  7e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1523  citrate synthase  40.64 
 
 
379 aa  265  8e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.836356  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1729  Citrate (Si)-synthase  41.08 
 
 
373 aa  264  2e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.120294  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2105  citrate (Si)-synthase  37.47 
 
 
397 aa  263  3e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.414267  normal  0.0115455 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1665  citrate synthase  39.53 
 
 
378 aa  263  4e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2031  citrate (Si)-synthase  39.52 
 
 
473 aa  263  4.999999999999999e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602388  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0109  citrate synthase  42.71 
 
 
372 aa  263  6e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.373645  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1776  methylcitrate synthase  38.56 
 
 
375 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.549839  hitchhiker  0.000461346 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1765  methylcitrate synthase  39.1 
 
 
375 aa  261  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.924616  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0612  citrate synthase  39.57 
 
 
386 aa  261  1e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.148892  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2401  2-methylcitrate synthase  40.69 
 
 
371 aa  261  1e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.612256  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1063  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  37.82 
 
 
393 aa  260  3e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1533  citrate (Si)-synthase  37.89 
 
 
396 aa  260  3e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2480  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  40.64 
 
 
380 aa  259  8e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.388889  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2335  methylcitrate synthase  37.77 
 
 
375 aa  258  9e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218689  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3435  methylcitrate synthase  37.77 
 
 
375 aa  258  9e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.01089  normal  0.171025 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23220  methylcitrate synthase  39.3 
 
 
387 aa  258  2e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1936  methylcitrate synthase  37.77 
 
 
375 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.686847  hitchhiker  0.000000858753 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2081  methylcitrate synthase  39.3 
 
 
404 aa  256  4e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.847456  normal  0.17968 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1111  methylcitrate synthase  39.41 
 
 
379 aa  256  5e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.468935 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>