More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2413 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009976  P9211_01781  citrate synthase  79.89 
 
 		 378 aa  647    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.176216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01901  citrate synthase  79.36 
 
 		 381 aa  646    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02341  citrate synthase  79.36 
 
 		 375 aa  644    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26921  citrate synthase  83.08 
 
 		 396 aa  685    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1528  citrate synthase  79.09 
 
 		 375 aa  642    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0349986  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0279  citrate synthase  91.39 
 
 		 396 aa  747    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2413  citrate synthase  100 
 
 		 397 aa  815    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0163  citrate synthase  79.89 
 
 		 381 aa  649    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.292022  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01791  citrate synthase  80.43 
 
 		 381 aa  654    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01811  citrate synthase  80.43 
 
 		 381 aa  652    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0612  citrate synthase  74.6 
 
 		 386 aa  579  1e-164  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.148892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1665  citrate synthase  71.62 
 
 		 378 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2713  citrate synthase  69.25 
 
 		 378 aa  568  1e-161  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1580  citrate synthase  68.27 
 
 		 383 aa  561  1.0000000000000001e-159  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0404  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  67.9 
 
 		 378 aa  560  1e-158  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4089  citrate synthase  67.89 
 
 		 389 aa  559  1e-158  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1408  citrate synthase  66.13 
 
 		 386 aa  544  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1377  citrate synthase  66.13 
 
 		 386 aa  544  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2141  Citrate (Si)-synthase  57.63 
 
 		 389 aa  452  1.0000000000000001e-126  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.636674  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2672  citrate synthase  55.26 
 
 		 386 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.530506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3065  citrate synthase  55.26 
 
 		 386 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2628  citrate synthase  53.25 
 
 		 387 aa  422  1e-117  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0350  citrate synthase  49.74 
 
 		 391 aa  410  1e-113  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1202  Citrate (Si)-synthase  45.14 
 
 		 375 aa  384  1e-105  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000138488  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1467  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  47.73 
 
 		 385 aa  346  4e-94  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0316751  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0781  citrate synthase  45.28 
 
 		 372 aa  330  3e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2679  citrate synthase  45.01 
 
 		 372 aa  325  1e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0198833  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1621  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.67 
 
 		 379 aa  323  3e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285346  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1526  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.54 
 
 		 390 aa  323  4e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.682888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2221  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.32 
 
 		 377 aa  320  3e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57744  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0534  citrate synthase  44.2 
 
 		 382 aa  317  2e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0555246 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4725  citrate synthase  43.94 
 
 		 371 aa  316  4e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0895  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  45.58 
 
 		 430 aa  316  4e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4704  citrate synthase  43.94 
 
 		 382 aa  315  6e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4488  citrate synthase  43.67 
 
 		 371 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4323  citrate synthase  43.67 
 
 		 371 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4335  citrate synthase  43.67 
 
 		 371 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4839  citrate synthase  43.67 
 
 		 371 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4709  citrate synthase  43.67 
 
 		 382 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000257504 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4720  citrate synthase  43.67 
 
 		 382 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4424  citrate synthase  43.94 
 
 		 371 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1258  citrate synthase  42.4 
 
 		 373 aa  313  3.9999999999999997e-84  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1726  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.32 
 
 		 380 aa  308  1.0000000000000001e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0723  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  44.36 
 
 		 382 aa  307  2.0000000000000002e-82  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.517524  normal  0.584309 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3278  citrate synthase  43.4 
 
 		 386 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.312589  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0837  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  44.21 
 
 		 378 aa  306  6e-82  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.531649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1752  citrate synthase  41.87 
 
 		 373 aa  304  2.0000000000000002e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.206255  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1786  citrate synthase  41.87 
 
 		 373 aa  304  2.0000000000000002e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0306  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  39.89 
 
 		 397 aa  303  3.0000000000000004e-81  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.772555 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1522  citrate synthase  40.27 
 
 		 370 aa  301  1e-80  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.640515  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1476  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.98 
 
 		 382 aa  300  4e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.644774  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3036  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.57 
 
 		 382 aa  299  6e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2234  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.19 
 
 		 409 aa  298  8e-80  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.709963 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2068  citrate synthase I  41.03 
 
 		 450 aa  298  2e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.355535  normal  0.380729 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1744  type II citrate synthase  42.08 
 
 		 433 aa  296  3e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.676143  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0788  type II citrate synthase  42.08 
 
 		 433 aa  296  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0858919  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2467  type II citrate synthase  42.08 
 
 		 433 aa  296  3e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00536833  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2329  type II citrate synthase  42.08 
 
 		 433 aa  296  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1834  type II citrate synthase  42.08 
 
 		 433 aa  296  3e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0219356  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1626  type II citrate synthase  42.08 
 
 		 433 aa  296  3e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00616613  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0504  type II citrate synthase  42.08 
 
 		 433 aa  296  3e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.405584  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29820  type II citrate synthase  39.58 
 
 		 427 aa  295  1e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3584  citrate synthase I  40.7 
 
 		 425 aa  294  2e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00887444 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1523  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.27 
 
 		 379 aa  294  2e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.297697  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1731  citrate synthase I  40.2 
 
 		 439 aa  294  2e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3832  type II citrate synthase  41.82 
 
 		 433 aa  294  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.418606 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0563  citrate synthase  41.71 
 
 		 412 aa  293  3e-78  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3316  type II citrate synthase  41.82 
 
 		 433 aa  293  3e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.229262  normal  0.697255 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0665  type II citrate synthase  41.56 
 
 		 433 aa  293  4e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.170997  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1676  citrate synthase  41.62 
 
 		 445 aa  293  4e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308594  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2147  type II citrate synthase  41.56 
 
 		 433 aa  292  8e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.787035  normal  0.703076 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4428  type II citrate synthase  41.56 
 
 		 433 aa  292  8e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3589  type II citrate synthase  41.56 
 
 		 433 aa  292  8e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0248785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3939  type II citrate synthase  41.56 
 
 		 433 aa  292  8e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4643  type II citrate synthase  41.56 
 
 		 433 aa  292  9e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1088  citrate synthase I  40.42 
 
 		 443 aa  290  2e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.864155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2224  citrate synthase I  41.06 
 
 		 425 aa  290  3e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4194  type II citrate synthase  38.8 
 
 		 429 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0867349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3765  type II citrate synthase  38.8 
 
 		 429 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0679988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6851  type II citrate synthase  41.56 
 
 		 433 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.622921 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1660  type II citrate synthase  38.8 
 
 		 429 aa  289  6e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5205  type II citrate synthase  41.3 
 
 		 433 aa  289  7e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.237518  normal  0.311757 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02359  type II citrate synthase  41.75 
 
 		 442 aa  289  7e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2890  type II citrate synthase  41.56 
 
 		 433 aa  288  8e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0888  citrate synthase  41.47 
 
 		 447 aa  289  8e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.631219  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0713  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  40.77 
 
 		 404 aa  288  9e-77  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.756288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0100  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.71 
 
 		 377 aa  288  1e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1301  Citrate (Si)-synthase  38.44 
 
 		 431 aa  288  1e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.115082  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1870  citrate synthase I  41.36 
 
 		 448 aa  288  1e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.859731 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1692  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  40.93 
 
 		 409 aa  288  1e-76  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.141022  normal  0.100865 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2199  type II citrate synthase  40.69 
 
 		 436 aa  288  1e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.308068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2805  citrate synthase I  39.53 
 
 		 427 aa  287  2e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.359876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0083  citrate synthase  41.21 
 
 		 455 aa  287  2e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4366  type II citrate synthase  40.78 
 
 		 433 aa  287  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3037  type II citrate synthase  41.69 
 
 		 436 aa  287  2e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.797011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0154  citrate synthase  40.86 
 
 		 374 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.649155 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0336  citrate synthase I  41.21 
 
 		 447 aa  286  4e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000388875  normal  0.187011 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37633  predicted protein  41.16 
 
 		 544 aa  286  4e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.506551  normal  0.0169313 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1245  citrate synthase  39.27 
 
 		 374 aa  286  4e-76  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0072  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.93 
 
 		 372 aa  286  4e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>