More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1467 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_1467  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  100 
 
 
385 aa  786    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0316751  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1526  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  50.67 
 
 
390 aa  389  1e-107  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.682888  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0404  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  50.8 
 
 
378 aa  371  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1377  citrate synthase  50.53 
 
 
386 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2713  citrate synthase  50.53 
 
 
378 aa  368  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0306  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  48.81 
 
 
397 aa  365  1e-100  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.772555 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1580  citrate synthase  49.87 
 
 
383 aa  365  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1408  citrate synthase  50.53 
 
 
386 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4089  citrate synthase  49.73 
 
 
389 aa  362  7.0000000000000005e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0612  citrate synthase  50.8 
 
 
386 aa  361  9e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.148892  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0723  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  48.02 
 
 
382 aa  361  1e-98  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.517524  normal  0.584309 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1522  citrate synthase  47.34 
 
 
370 aa  359  4e-98  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.640515  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1523  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  49.34 
 
 
379 aa  358  7e-98  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.297697  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0622  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  49.33 
 
 
367 aa  357  9.999999999999999e-98  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0115525  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0647  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  49.33 
 
 
367 aa  357  9.999999999999999e-98  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.029125  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1621  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  46.65 
 
 
379 aa  357  2.9999999999999997e-97  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285346  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0279  citrate synthase  48.8 
 
 
396 aa  355  1e-96  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01901  citrate synthase  49.6 
 
 
381 aa  354  1e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02341  citrate synthase  48.38 
 
 
375 aa  354  1e-96  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01791  citrate synthase  49.73 
 
 
381 aa  353  2.9999999999999997e-96  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01811  citrate synthase  49.33 
 
 
381 aa  353  4e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1528  citrate synthase  48.11 
 
 
375 aa  352  5e-96  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0349986  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0163  citrate synthase  49.73 
 
 
381 aa  352  5.9999999999999994e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.292022  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1726  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  46.54 
 
 
380 aa  350  2e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0837  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  47.73 
 
 
378 aa  350  3e-95  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.531649  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1665  citrate synthase  48.4 
 
 
378 aa  347  1e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2221  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  46.79 
 
 
377 aa  347  2e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57744  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2413  citrate synthase  47.73 
 
 
397 aa  346  4e-94  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26921  citrate synthase  46.7 
 
 
396 aa  345  6e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3036  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  49.07 
 
 
382 aa  344  1e-93  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0895  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  48.12 
 
 
430 aa  344  1e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01781  citrate synthase  47.3 
 
 
378 aa  343  2.9999999999999997e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.176216  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1476  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  48.54 
 
 
382 aa  340  2.9999999999999998e-92  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.644774  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0072  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  44.92 
 
 
372 aa  339  5.9999999999999996e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2679  citrate synthase  47.99 
 
 
372 aa  338  9e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0198833  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0781  citrate synthase  48.53 
 
 
372 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0350  citrate synthase  45.83 
 
 
391 aa  335  1e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1252  Citrate (Si)-synthase  45.16 
 
 
373 aa  333  4e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2672  citrate synthase  46.72 
 
 
386 aa  332  5e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.530506  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3065  citrate synthase  46.72 
 
 
386 aa  332  5e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2628  citrate synthase  46.21 
 
 
387 aa  332  5e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2234  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  45.8 
 
 
409 aa  332  9e-90  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.709963 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2141  Citrate (Si)-synthase  44.5 
 
 
389 aa  331  1e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.636674  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1099  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  46.21 
 
 
387 aa  328  8e-89  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4424  citrate synthase  47.04 
 
 
371 aa  328  9e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0663  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.28 
 
 
373 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.280152  normal  0.110027 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2276  citrate synthase  45.77 
 
 
380 aa  327  2.0000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4488  citrate synthase  46.24 
 
 
371 aa  327  3e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4839  citrate synthase  46.24 
 
 
371 aa  327  3e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4709  citrate synthase  45.48 
 
 
382 aa  327  3e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000257504 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4720  citrate synthase  45.48 
 
 
382 aa  327  3e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4323  citrate synthase  46.24 
 
 
371 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4335  citrate synthase  46.24 
 
 
371 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1692  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  46.31 
 
 
409 aa  325  6e-88  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.141022  normal  0.100865 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0398  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  45.07 
 
 
377 aa  325  9e-88  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0419831  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3278  citrate synthase  46.51 
 
 
386 aa  325  9e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.312589  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4725  citrate synthase  45.97 
 
 
371 aa  324  2e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0534  citrate synthase  44.96 
 
 
382 aa  323  2e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0555246 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0563  citrate synthase  45.04 
 
 
412 aa  324  2e-87  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4704  citrate synthase  44.96 
 
 
382 aa  324  2e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1189  Citrate (Si)-synthase  41.22 
 
 
395 aa  318  9e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0713  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  45.13 
 
 
404 aa  318  1e-85  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.756288  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1245  citrate synthase  45.04 
 
 
374 aa  316  5e-85  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0715  citrate synthase  46.57 
 
 
355 aa  314  9.999999999999999e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0154  citrate synthase  43.62 
 
 
374 aa  315  9.999999999999999e-85  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.649155 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1202  Citrate (Si)-synthase  42.62 
 
 
375 aa  313  1.9999999999999998e-84  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000138488  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1035  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.71 
 
 
375 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2031  citrate (Si)-synthase  44.88 
 
 
473 aa  313  3.9999999999999997e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602388  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2105  citrate (Si)-synthase  44.59 
 
 
397 aa  312  6.999999999999999e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.414267  normal  0.0115455 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1258  citrate synthase  43.73 
 
 
373 aa  311  1e-83  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1063  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.04 
 
 
393 aa  311  1e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0100  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.8 
 
 
377 aa  310  2e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0281  citrate synthase  43.12 
 
 
378 aa  311  2e-83  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.160338  normal  0.143922 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1752  citrate synthase  42.82 
 
 
373 aa  308  1.0000000000000001e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.206255  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1786  citrate synthase  42.82 
 
 
373 aa  308  1.0000000000000001e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1572  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  44.11 
 
 
380 aa  307  2.0000000000000002e-82  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2208  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.43 
 
 
374 aa  305  8.000000000000001e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.539974  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1765  methylcitrate synthase  40.16 
 
 
375 aa  305  8.000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.924616  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2288  2-methylcitrate synthase  40 
 
 
375 aa  301  1e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.037213  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2335  methylcitrate synthase  39.89 
 
 
375 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218689  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1936  methylcitrate synthase  39.89 
 
 
375 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.686847  hitchhiker  0.000000858753 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3435  methylcitrate synthase  39.89 
 
 
375 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.01089  normal  0.171025 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53950  methylcitrate synthase  39.47 
 
 
375 aa  300  2e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.282102  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1776  methylcitrate synthase  39.89 
 
 
375 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.549839  hitchhiker  0.000461346 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4723  methylcitrate synthase  39.2 
 
 
375 aa  299  5e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1496  2-methylcitrate synthase  41.82 
 
 
372 aa  299  6e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1487  2-methylcitrate synthase  41.82 
 
 
372 aa  299  7e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2420  2-methylcitrate synthase  40.64 
 
 
375 aa  298  1e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0822163  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2401  2-methylcitrate synthase  41.33 
 
 
371 aa  298  1e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.612256  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2086  methylcitrate synthase  39.62 
 
 
375 aa  295  9e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.440425  hitchhiker  0.00454661 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02396  methylcitrate synthase  39.78 
 
 
380 aa  294  1e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2604  2-methylcitrate synthase  40.16 
 
 
374 aa  295  1e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.121252  hitchhiker  0.000290432 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1533  citrate (Si)-synthase  42.97 
 
 
396 aa  294  1e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0924  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  39.63 
 
 
379 aa  294  2e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0109  citrate synthase  42.86 
 
 
372 aa  293  3e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.373645  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1665  methylcitrate synthase  39.25 
 
 
377 aa  293  4e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1658  citrate synthase  41.73 
 
 
373 aa  290  3e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.617148  normal  0.567466 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003389  2-methylcitrate synthase  40.05 
 
 
380 aa  290  4e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0953  methylcitrate synthase  39.12 
 
 
377 aa  290  4e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1198  methylcitrate synthase  40.11 
 
 
376 aa  287  2.9999999999999996e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>