More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1099 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1099  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  100 
 
 
387 aa  805    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1063  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  53.51 
 
 
393 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2105  citrate (Si)-synthase  54.43 
 
 
397 aa  438  9.999999999999999e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.414267  normal  0.0115455 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1533  citrate (Si)-synthase  49.12 
 
 
396 aa  385  1e-106  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1467  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  46.21 
 
 
385 aa  328  8e-89  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0316751  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0781  citrate synthase  47.14 
 
 
372 aa  317  2e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2221  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  45.43 
 
 
377 aa  312  7.999999999999999e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57744  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0895  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.6 
 
 
430 aa  311  1e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2679  citrate synthase  47.01 
 
 
372 aa  311  1e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0198833  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0837  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.86 
 
 
378 aa  308  8e-83  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.531649  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0306  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  44.16 
 
 
397 aa  308  9e-83  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.772555 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1523  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.53 
 
 
379 aa  303  4.0000000000000003e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.297697  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3036  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.23 
 
 
382 aa  300  2e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1476  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.74 
 
 
382 aa  299  5e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.644774  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0723  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.33 
 
 
382 aa  299  5e-80  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.517524  normal  0.584309 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1522  citrate synthase  44.11 
 
 
370 aa  298  7e-80  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.640515  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2713  citrate synthase  42.12 
 
 
378 aa  295  1e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1726  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.67 
 
 
380 aa  294  2e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1621  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.69 
 
 
379 aa  293  3e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285346  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1408  citrate synthase  41.51 
 
 
386 aa  292  6e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0404  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.12 
 
 
378 aa  292  6e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1377  citrate synthase  41.51 
 
 
386 aa  292  6e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0663  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.01 
 
 
373 aa  291  1e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.280152  normal  0.110027 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1252  Citrate (Si)-synthase  41.96 
 
 
373 aa  290  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2276  citrate synthase  44.57 
 
 
380 aa  290  4e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1665  citrate synthase  41.51 
 
 
378 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1580  citrate synthase  41.3 
 
 
383 aa  286  2.9999999999999996e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0154  citrate synthase  41.36 
 
 
374 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.649155 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0612  citrate synthase  40.49 
 
 
386 aa  284  2.0000000000000002e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.148892  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01791  citrate synthase  41.53 
 
 
381 aa  284  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1035  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  40.89 
 
 
375 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0350  citrate synthase  40.8 
 
 
391 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0163  citrate synthase  41.26 
 
 
381 aa  283  4.0000000000000003e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.292022  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4089  citrate synthase  41.3 
 
 
389 aa  283  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01811  citrate synthase  40.98 
 
 
381 aa  282  8.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1202  Citrate (Si)-synthase  40.49 
 
 
375 aa  281  1e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000138488  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2413  citrate synthase  39.51 
 
 
397 aa  281  1e-74  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2234  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.07 
 
 
409 aa  281  1e-74  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.709963 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1258  citrate synthase  42.55 
 
 
373 aa  281  2e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4704  citrate synthase  44.72 
 
 
382 aa  281  2e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01901  citrate synthase  40.71 
 
 
381 aa  280  3e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01781  citrate synthase  39.78 
 
 
378 aa  280  3e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.176216  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0534  citrate synthase  44.72 
 
 
382 aa  280  3e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0555246 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1528  citrate synthase  39.07 
 
 
375 aa  280  4e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0349986  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4488  citrate synthase  44.17 
 
 
371 aa  279  5e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4839  citrate synthase  44.17 
 
 
371 aa  279  5e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4323  citrate synthase  44.17 
 
 
371 aa  279  6e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4335  citrate synthase  44.17 
 
 
371 aa  279  6e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2628  citrate synthase  41.22 
 
 
387 aa  279  6e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4720  citrate synthase  44.17 
 
 
382 aa  279  7e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4709  citrate synthase  44.17 
 
 
382 aa  279  7e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000257504 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4725  citrate synthase  44.17 
 
 
371 aa  278  1e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3278  citrate synthase  44.72 
 
 
386 aa  277  2e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.312589  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0100  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.08 
 
 
377 aa  278  2e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02341  citrate synthase  38.8 
 
 
375 aa  277  3e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4424  citrate synthase  44.44 
 
 
371 aa  275  7e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0279  citrate synthase  38.8 
 
 
396 aa  275  1.0000000000000001e-72  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1189  Citrate (Si)-synthase  39.16 
 
 
395 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2672  citrate synthase  40.64 
 
 
386 aa  273  3e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.530506  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26921  citrate synthase  39.07 
 
 
396 aa  273  3e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3065  citrate synthase  40.64 
 
 
386 aa  273  3e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1692  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.07 
 
 
409 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.141022  normal  0.100865 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1572  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  40.27 
 
 
380 aa  271  1e-71  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1526  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  40.64 
 
 
390 aa  267  2e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.682888  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0563  citrate synthase  39.7 
 
 
412 aa  266  4e-70  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1752  citrate synthase  41.46 
 
 
373 aa  266  5e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.206255  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1786  citrate synthase  41.46 
 
 
373 aa  266  5e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2450  citrate synthase 3  39.3 
 
 
373 aa  264  2e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0697754  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2188  citrate synthase 3  39.57 
 
 
372 aa  264  2e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.685723  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2125  citrate synthase 3  39.57 
 
 
372 aa  264  2e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.306637  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2111  citrate synthase 3  39.57 
 
 
372 aa  264  2e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3010  citrate synthase 3  39.3 
 
 
373 aa  264  2e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2348  citrate synthase 3  39.57 
 
 
372 aa  264  2e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2156  citrate synthase 3  39.3 
 
 
373 aa  264  2e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2367  citrate synthase 3  39.3 
 
 
373 aa  263  3e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2315  citrate synthase 3  39.3 
 
 
373 aa  263  3e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1724  citrate synthase 3  39.67 
 
 
372 aa  263  6e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.992858  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2031  citrate (Si)-synthase  39.73 
 
 
473 aa  262  6.999999999999999e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602388  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0713  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  39.27 
 
 
404 aa  261  1e-68  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.756288  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4146  citrate (Si)-synthase  38.17 
 
 
375 aa  261  2e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0398  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  39.59 
 
 
377 aa  260  3e-68  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0419831  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1088  citrate synthase I  38.25 
 
 
443 aa  258  1e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.864155  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1245  citrate synthase  40.92 
 
 
374 aa  258  1e-67  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1676  citrate synthase  40.33 
 
 
445 aa  257  2e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308594  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2376  citrate synthase 3  39.3 
 
 
372 aa  256  4e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.151245  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0715  citrate synthase  41.6 
 
 
355 aa  256  5e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2141  Citrate (Si)-synthase  37.87 
 
 
389 aa  256  5e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.636674  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0281  citrate synthase  38.96 
 
 
378 aa  255  8e-67  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.160338  normal  0.143922 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0622  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  39.47 
 
 
367 aa  255  9e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0115525  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0647  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  39.47 
 
 
367 aa  255  9e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.029125  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3645  methylcitrate synthase  39.73 
 
 
375 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0072  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  36.43 
 
 
372 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3630  methylcitrate synthase  39.73 
 
 
375 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0314  methylcitrate synthase  39.73 
 
 
375 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0344  methylcitrate synthase  39.73 
 
 
375 aa  253  3e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3826  methylcitrate synthase  39.73 
 
 
375 aa  253  3e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4048  methylcitrate synthase  39.45 
 
 
375 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3946  methylcitrate synthase  39.18 
 
 
375 aa  252  9.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11154  citrate synthase  38.36 
 
 
393 aa  252  9.000000000000001e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4022  methylcitrate synthase  39.18 
 
 
375 aa  252  9.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>