More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0398 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0398  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  100 
 
 
377 aa  771    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0419831  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0281  citrate synthase  67.72 
 
 
378 aa  545  1e-154  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.160338  normal  0.143922 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0306  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  45.99 
 
 
397 aa  327  2.0000000000000001e-88  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.772555 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1522  citrate synthase  44.8 
 
 
370 aa  326  3e-88  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.640515  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1467  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  45.07 
 
 
385 aa  325  8.000000000000001e-88  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0316751  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0713  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  44.27 
 
 
404 aa  311  1e-83  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.756288  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0563  citrate synthase  42.64 
 
 
412 aa  310  2e-83  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2234  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.59 
 
 
409 aa  308  9e-83  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.709963 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1692  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.85 
 
 
409 aa  299  7e-80  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.141022  normal  0.100865 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1726  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.32 
 
 
380 aa  294  2e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2221  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  40.64 
 
 
377 aa  290  2e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57744  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0622  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.47 
 
 
367 aa  289  5.0000000000000004e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0115525  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0647  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.47 
 
 
367 aa  289  5.0000000000000004e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.029125  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1621  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  40.05 
 
 
379 aa  288  1e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285346  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1526  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  40.69 
 
 
390 aa  282  7.000000000000001e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.682888  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0154  citrate synthase  41.82 
 
 
374 aa  279  6e-74  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.649155 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1523  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  40.74 
 
 
379 aa  277  2e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.297697  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0781  citrate synthase  41.27 
 
 
372 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0723  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  39.53 
 
 
382 aa  272  8.000000000000001e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.517524  normal  0.584309 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3036  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  38.85 
 
 
382 aa  272  8.000000000000001e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1202  Citrate (Si)-synthase  37.95 
 
 
375 aa  271  1e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000138488  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1035  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  38.87 
 
 
375 aa  267  2e-70  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2628  citrate synthase  39.28 
 
 
387 aa  266  5e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1476  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  40 
 
 
382 aa  265  8e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.644774  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2679  citrate synthase  40.05 
 
 
372 aa  262  6.999999999999999e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0198833  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1377  citrate synthase  37.27 
 
 
386 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1408  citrate synthase  37.27 
 
 
386 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1099  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  39.59 
 
 
387 aa  260  3e-68  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4725  citrate synthase  40.62 
 
 
371 aa  258  1e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4089  citrate synthase  37 
 
 
389 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4424  citrate synthase  40.36 
 
 
371 aa  258  1e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4704  citrate synthase  40.62 
 
 
382 aa  258  1e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2713  citrate synthase  37 
 
 
378 aa  257  2e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0534  citrate synthase  40.62 
 
 
382 aa  258  2e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0555246 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0715  citrate synthase  41.03 
 
 
355 aa  257  3e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4488  citrate synthase  40.36 
 
 
371 aa  256  5e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4839  citrate synthase  40.36 
 
 
371 aa  256  5e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4720  citrate synthase  40.36 
 
 
382 aa  256  5e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4709  citrate synthase  40.36 
 
 
382 aa  256  5e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000257504 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4323  citrate synthase  40.36 
 
 
371 aa  255  8e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4335  citrate synthase  40.36 
 
 
371 aa  255  8e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3278  citrate synthase  39.58 
 
 
386 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.312589  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4502  type II citrate synthase  37.6 
 
 
434 aa  253  3e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.705578 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2276  citrate synthase  40.32 
 
 
380 aa  253  3e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5222  citrate synthase I  37.97 
 
 
429 aa  252  9.000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.827577  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0663  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  39.26 
 
 
373 aa  251  1e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.280152  normal  0.110027 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1189  Citrate (Si)-synthase  35.34 
 
 
395 aa  251  2e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1845  type II citrate synthase  36.97 
 
 
433 aa  251  2e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.273477  normal  0.198527 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0350  citrate synthase  35.96 
 
 
391 aa  251  2e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2813  type II citrate synthase  36.67 
 
 
434 aa  249  5e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0646  citrate synthase I  37.69 
 
 
430 aa  249  6e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.615558 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0897  citrate synthase  38.46 
 
 
433 aa  249  7e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0898483  normal  0.676877 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1572  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  38.24 
 
 
380 aa  248  9e-65  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1580  citrate synthase  36.03 
 
 
383 aa  248  9e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1708  type II citrate synthase  37.33 
 
 
433 aa  248  1e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.693797  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0404  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  36.19 
 
 
378 aa  248  1e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0837  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  37.7 
 
 
378 aa  248  1e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.531649  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1252  Citrate (Si)-synthase  37.02 
 
 
373 aa  247  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0586  citrate synthase  39.79 
 
 
430 aa  247  2e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1570  citrate (Si)-synthase  39.79 
 
 
430 aa  247  2e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00021591  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5145  citrate synthase I  37.17 
 
 
429 aa  246  3e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.236177  normal  0.0251581 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2617  citrate synthase I  38.22 
 
 
436 aa  247  3e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.819839 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1752  citrate synthase  37.92 
 
 
373 aa  246  3e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.206255  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0612  citrate synthase  36.91 
 
 
386 aa  247  3e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.148892  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1786  citrate synthase  37.92 
 
 
373 aa  246  3e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4680  citrate synthase I  37.43 
 
 
446 aa  246  3e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1245  citrate synthase  37.63 
 
 
374 aa  246  3e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1258  citrate synthase  37.98 
 
 
373 aa  245  6.999999999999999e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2023  citrate synthase I  37.07 
 
 
429 aa  246  6.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2224  citrate synthase I  37.27 
 
 
425 aa  245  6.999999999999999e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3212  citrate synthase  37.27 
 
 
427 aa  245  9.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215147  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1524  citrate synthase I  36.92 
 
 
430 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.802094  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2843  type II citrate synthase  36.27 
 
 
434 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.433784  normal  0.36225 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0367  citrate synthase I  36.69 
 
 
425 aa  243  3e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1144  type II citrate synthase  36.57 
 
 
429 aa  242  7e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.300068  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1476  citrate synthase I  34.03 
 
 
428 aa  242  9e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.112534  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0995  citrate synthase I  36.48 
 
 
436 aa  242  9e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1870  citrate synthase I  38.22 
 
 
448 aa  241  1e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.859731 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0803  citrate synthase I  35.35 
 
 
440 aa  241  1e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.558205 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1275  citrate synthase  36.18 
 
 
427 aa  241  1e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.152797  normal  0.229785 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0163  citrate synthase  36.39 
 
 
381 aa  241  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.292022  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2450  type II citrate synthase  36.87 
 
 
434 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.444525 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1528  citrate synthase  35.53 
 
 
375 aa  240  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0349986  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01811  citrate synthase  36.13 
 
 
381 aa  240  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1301  Citrate (Si)-synthase  37.23 
 
 
431 aa  239  4e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.115082  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1665  citrate synthase  35.39 
 
 
378 aa  239  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02341  citrate synthase  35.26 
 
 
375 aa  239  6.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0599  type II citrate synthase  36.27 
 
 
430 aa  239  6.999999999999999e-62  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.281651  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01791  citrate synthase  35.86 
 
 
381 aa  238  9e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3584  citrate synthase I  34.38 
 
 
425 aa  238  9e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00887444 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1789  type II citrate synthase  36.8 
 
 
429 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.069091  hitchhiker  0.00547545 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0124  citrate synthase I  38.27 
 
 
416 aa  238  1e-61  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.559249  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1676  citrate synthase  36.39 
 
 
445 aa  238  1e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308594  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2141  Citrate (Si)-synthase  35.68 
 
 
389 aa  238  1e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.636674  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0075  citrate synthase  37.71 
 
 
416 aa  238  2e-61  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3253  type II citrate synthase  36.6 
 
 
434 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1646  type II citrate synthase  36.15 
 
 
429 aa  237  2e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0982845  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0895  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  35.28 
 
 
430 aa  238  2e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1835  citrate synthase I  39.63 
 
 
422 aa  237  3e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1088  citrate synthase I  37.27 
 
 
443 aa  237  3e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.864155  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>