More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0281 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0281  citrate synthase  100 
 
 		 378 aa  778    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.160338  normal  0.143922 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0398  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  67.72 
 
 		 377 aa  545  1e-154  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0419831  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1522  citrate synthase  44.71 
 
 		 370 aa  328  1.0000000000000001e-88  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.640515  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0306  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.77 
 
 		 397 aa  312  4.999999999999999e-84  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.772555 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1467  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.12 
 
 		 385 aa  311  1e-83  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0316751  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1726  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.76 
 
 		 380 aa  301  1e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1526  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.27 
 
 		 390 aa  298  1e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.682888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0713  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.62 
 
 		 404 aa  297  2e-79  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.756288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0647  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.58 
 
 		 367 aa  294  2e-78  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.029125  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1621  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  40.31 
 
 		 379 aa  294  2e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285346  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0622  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.58 
 
 		 367 aa  294  2e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0115525  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2221  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.44 
 
 		 377 aa  289  5.0000000000000004e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57744  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0563  citrate synthase  42.16 
 
 		 412 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2234  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.03 
 
 		 409 aa  283  5.000000000000001e-75  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.709963 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1692  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.31 
 
 		 409 aa  280  2e-74  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.141022  normal  0.100865 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0781  citrate synthase  42.74 
 
 		 372 aa  279  6e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2679  citrate synthase  42.22 
 
 		 372 aa  276  5e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0198833  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1202  Citrate (Si)-synthase  38.15 
 
 		 375 aa  275  6e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000138488  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1523  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  38.58 
 
 		 379 aa  270  4e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.297697  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0154  citrate synthase  40.21 
 
 		 374 aa  266  5.999999999999999e-70  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.649155 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2628  citrate synthase  39.33 
 
 		 387 aa  265  1e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3036  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  38.6 
 
 		 382 aa  263  4e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0723  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  39.69 
 
 		 382 aa  261  1e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.517524  normal  0.584309 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1035  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  39.21 
 
 		 375 aa  258  1e-67  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1476  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  38.82 
 
 		 382 aa  256  4e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.644774  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1099  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  38.96 
 
 		 387 aa  255  7e-67  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0995  citrate synthase I  37.69 
 
 		 436 aa  253  3e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1964  citrate synthase I  38.02 
 
 		 427 aa  253  5.000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0148224  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1789  type II citrate synthase  39.36 
 
 		 429 aa  252  6e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.069091  hitchhiker  0.00547545 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4488  citrate synthase  39.42 
 
 		 371 aa  252  7e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4839  citrate synthase  39.42 
 
 		 371 aa  252  7e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0124  citrate synthase I  39.34 
 
 		 416 aa  252  7e-66  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.559249  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4725  citrate synthase  39.68 
 
 		 371 aa  251  1e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3278  citrate synthase  39.68 
 
 		 386 aa  251  1e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.312589  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1301  Citrate (Si)-synthase  37.67 
 
 		 431 aa  251  2e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.115082  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4720  citrate synthase  39.42 
 
 		 382 aa  251  2e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4323  citrate synthase  39.42 
 
 		 371 aa  251  2e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4335  citrate synthase  39.42 
 
 		 371 aa  251  2e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1596  type II citrate synthase  39.1 
 
 		 429 aa  250  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.218131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4089  citrate synthase  37.53 
 
 		 389 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4709  citrate synthase  39.42 
 
 		 382 aa  251  2e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000257504 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2713  citrate synthase  37 
 
 		 378 aa  250  3e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1144  type II citrate synthase  39.36 
 
 		 429 aa  250  3e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.300068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4704  citrate synthase  39.42 
 
 		 382 aa  249  4e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5222  citrate synthase I  38.13 
 
 		 429 aa  249  5e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.827577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1600  citrate synthase  38.73 
 
 		 433 aa  249  5e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2032  citrate synthase  38.24 
 
 		 428 aa  249  5e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808291  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0534  citrate synthase  39.42 
 
 		 382 aa  249  6e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0555246 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0837  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  37.86 
 
 		 378 aa  249  8e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.531649  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1370  citrate synthase  39.36 
 
 		 423 aa  248  9e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3212  citrate synthase  38.13 
 
 		 427 aa  248  9e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215147  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1366  citrate synthase  39.36 
 
 		 423 aa  248  1e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1377  citrate synthase  36.73 
 
 		 386 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1149  citrate synthase I  37.77 
 
 		 424 aa  248  1e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1408  citrate synthase  36.73 
 
 		 386 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4424  citrate synthase  39.15 
 
 		 371 aa  248  2e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0829  citrate synthase I  37.17 
 
 		 427 aa  248  2e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.292623  hitchhiker  0.00485559 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33600  citrate synthase  36.79 
 
 		 437 aa  247  2e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.522546 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0599  type II citrate synthase  37.77 
 
 		 430 aa  247  2e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.281651  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1731  citrate synthase I  37.57 
 
 		 439 aa  247  3e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2224  citrate synthase I  37.43 
 
 		 425 aa  247  3e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5145  citrate synthase I  37.33 
 
 		 429 aa  246  4e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.236177  normal  0.0251581 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2276  citrate synthase  38.52 
 
 		 380 aa  246  4e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1646  type II citrate synthase  38.56 
 
 		 429 aa  246  4e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0982845  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4680  citrate synthase I  37.33 
 
 		 446 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0646  citrate synthase I  37.93 
 
 		 430 aa  246  6e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.615558 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0586  citrate synthase  37.77 
 
 		 430 aa  246  6e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1570  citrate (Si)-synthase  37.77 
 
 		 430 aa  246  6.999999999999999e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00021591  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0350  citrate synthase  34.91 
 
 		 391 aa  245  8e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1106  type II citrate synthase  37.89 
 
 		 435 aa  245  9e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1148  type II citrate synthase  38.03 
 
 		 430 aa  245  9.999999999999999e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1252  Citrate (Si)-synthase  38.36 
 
 		 373 aa  245  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2023  citrate synthase I  36.97 
 
 		 429 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11150  citrate synthase  37.4 
 
 		 450 aa  244  1.9999999999999999e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.592524  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1580  citrate synthase  37.4 
 
 		 383 aa  244  1.9999999999999999e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2531  citrate synthase I  37.4 
 
 		 428 aa  243  3e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000235775 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2450  type II citrate synthase  37.5 
 
 		 434 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.444525 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0895  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  36.7 
 
 		 430 aa  243  5e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4838  type II citrate synthase  35.94 
 
 		 434 aa  242  6e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.782916  normal  0.17167 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0075  citrate synthase  37.98 
 
 		 416 aa  242  6e-63  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4456  type II citrate synthase  35.94 
 
 		 434 aa  242  6e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4543  type II citrate synthase  35.94 
 
 		 434 aa  242  6e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.701189 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1911  citrate synthase  35.88 
 
 		 430 aa  242  7.999999999999999e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1187  citrate synthase  37.67 
 
 		 431 aa  242  7.999999999999999e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0858  citrate synthase I  37.7 
 
 		 433 aa  242  7.999999999999999e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2042  type II citrate synthase  37.63 
 
 		 430 aa  242  7.999999999999999e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0529149  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2563  type II citrate synthase  38.56 
 
 		 429 aa  241  1e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.102281  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1845  type II citrate synthase  37.93 
 
 		 433 aa  241  1e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.273477  normal  0.198527 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2136  citrate synthase I  34.87 
 
 		 427 aa  241  1e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.873392  normal  0.0485985 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25990  citrate synthase  36.06 
 
 		 432 aa  241  1e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1258  citrate synthase  37.27 
 
 		 373 aa  240  2e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2004  type II citrate synthase  37.08 
 
 		 429 aa  240  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.719341  normal  0.158891 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0663  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  37.47 
 
 		 373 aa  241  2e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.280152  normal  0.110027 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1088  citrate synthase I  37.93 
 
 		 443 aa  241  2e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.864155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0803  citrate synthase I  36.22 
 
 		 440 aa  240  2e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.558205 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2860  citrate synthase  36.2 
 
 		 432 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3253  type II citrate synthase  37.14 
 
 		 434 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2811  citrate synthase  36.87 
 
 		 427 aa  240  2.9999999999999997e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0195056  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1524  citrate synthase I  37.4 
 
 		 430 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.802094  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0026  citrate synthase I  37.34 
 
 		 426 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000469449  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>