More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0612 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0612  citrate synthase  100 
 
 		 386 aa  798    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.148892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1580  citrate synthase  78.99 
 
 		 383 aa  642    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4089  citrate synthase  77.46 
 
 		 389 aa  635    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1665  citrate synthase  78.99 
 
 		 378 aa  629  1e-179  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1377  citrate synthase  78.46 
 
 		 386 aa  625  1e-178  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1408  citrate synthase  78.46 
 
 		 386 aa  625  1e-178  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2713  citrate synthase  76.6 
 
 		 378 aa  620  1e-176  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0404  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  76.6 
 
 		 378 aa  616  1e-175  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2413  citrate synthase  74.6 
 
 		 397 aa  590  1e-167  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0279  citrate synthase  73.8 
 
 		 396 aa  580  1e-164  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01811  citrate synthase  71.05 
 
 		 381 aa  570  1e-161  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01791  citrate synthase  70.59 
 
 		 381 aa  568  1e-161  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26921  citrate synthase  73.46 
 
 		 396 aa  565  1e-160  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0163  citrate synthase  70.32 
 
 		 381 aa  567  1e-160  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.292022  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01781  citrate synthase  70.78 
 
 		 378 aa  566  1e-160  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.176216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01901  citrate synthase  70.51 
 
 		 381 aa  561  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1528  citrate synthase  70.24 
 
 		 375 aa  560  1e-158  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0349986  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02341  citrate synthase  69.97 
 
 		 375 aa  559  1e-158  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2141  Citrate (Si)-synthase  59.16 
 
 		 389 aa  458  9.999999999999999e-129  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.636674  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3065  citrate synthase  55.64 
 
 		 386 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2672  citrate synthase  55.64 
 
 		 386 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.530506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2628  citrate synthase  55.84 
 
 		 387 aa  435  1e-121  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0350  citrate synthase  51.7 
 
 		 391 aa  422  1e-117  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1202  Citrate (Si)-synthase  48.37 
 
 		 375 aa  393  1e-108  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000138488  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1467  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  50.8 
 
 		 385 aa  365  1e-100  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0316751  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1526  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  44.74 
 
 		 390 aa  338  7e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.682888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0781  citrate synthase  46.9 
 
 		 372 aa  334  2e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1621  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  44.74 
 
 		 379 aa  329  5.0000000000000004e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285346  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2679  citrate synthase  46.36 
 
 		 372 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0198833  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0888  citrate synthase  44.91 
 
 		 447 aa  324  2e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.631219  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1676  citrate synthase  44.42 
 
 		 445 aa  323  5e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308594  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1088  citrate synthase I  43.08 
 
 		 443 aa  322  9.000000000000001e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.864155  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0723  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  44.47 
 
 		 382 aa  316  4e-85  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.517524  normal  0.584309 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0306  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.86 
 
 		 397 aa  316  4e-85  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.772555 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2221  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.63 
 
 		 377 aa  315  9.999999999999999e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57744  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0895  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  45.72 
 
 		 430 aa  315  9.999999999999999e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4725  citrate synthase  44.2 
 
 		 371 aa  312  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0534  citrate synthase  44.2 
 
 		 382 aa  312  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0555246 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4488  citrate synthase  43.94 
 
 		 371 aa  311  1e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4323  citrate synthase  43.94 
 
 		 371 aa  311  1e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4335  citrate synthase  43.94 
 
 		 371 aa  311  1e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4839  citrate synthase  43.94 
 
 		 371 aa  311  1e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4704  citrate synthase  43.94 
 
 		 382 aa  310  2e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4720  citrate synthase  43.94 
 
 		 382 aa  311  2e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4709  citrate synthase  43.94 
 
 		 382 aa  311  2e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000257504 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1258  citrate synthase  42.89 
 
 		 373 aa  310  4e-83  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0837  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.68 
 
 		 378 aa  309  5.9999999999999995e-83  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.531649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4424  citrate synthase  43.4 
 
 		 371 aa  308  6.999999999999999e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3278  citrate synthase  43.67 
 
 		 386 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.312589  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1726  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.42 
 
 		 380 aa  307  2.0000000000000002e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02359  type II citrate synthase  42.71 
 
 		 442 aa  307  2.0000000000000002e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3036  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  44.24 
 
 		 382 aa  305  7e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2068  citrate synthase I  42.04 
 
 		 450 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.355535  normal  0.380729 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37633  predicted protein  40.85 
 
 		 544 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.506551  normal  0.0169313 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1063  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.98 
 
 		 393 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2007  citrate synthase I  41.84 
 
 		 427 aa  302  6.000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0317  citrate synthase I  43.08 
 
 		 447 aa  302  7.000000000000001e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1522  citrate synthase  41.98 
 
 		 370 aa  301  9e-81  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.640515  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0554  citrate synthase I  42.34 
 
 		 428 aa  299  4e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.488876  normal  0.835408 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2224  citrate synthase I  41.33 
 
 		 425 aa  299  4e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1476  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.56 
 
 		 382 aa  299  5e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.644774  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2417  citrate synthase I  41.6 
 
 		 447 aa  299  5e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0083  citrate synthase  40.47 
 
 		 455 aa  298  8e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1870  citrate synthase I  41.25 
 
 		 448 aa  297  2e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.859731 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1786  citrate synthase  42.11 
 
 		 373 aa  297  2e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0787  type II citrate synthase  42.89 
 
 		 429 aa  297  2e-79  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1752  citrate synthase  42.11 
 
 		 373 aa  297  2e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.206255  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2083  citrate synthase  41.78 
 
 		 447 aa  296  3e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.48822  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1187  citrate synthase  40.93 
 
 		 431 aa  295  6e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2042  citrate synthase I  41.15 
 
 		 447 aa  295  7e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0874  type II citrate synthase  42.64 
 
 		 429 aa  295  8e-79  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0015368  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1523  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.74 
 
 		 379 aa  295  9e-79  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.297697  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2787  citrate synthase I  40.26 
 
 		 426 aa  294  2e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.420339  normal  0.059507 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3253  type II citrate synthase  38.78 
 
 		 434 aa  294  2e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2843  type II citrate synthase  39.53 
 
 		 434 aa  293  3e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.433784  normal  0.36225 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7227  citrate synthase I  39.49 
 
 		 455 aa  293  4e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2136  citrate synthase I  41.21 
 
 		 427 aa  293  4e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.873392  normal  0.0485985 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5036  citrate synthase I  41.97 
 
 		 428 aa  293  4e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1275  citrate synthase  40.66 
 
 		 427 aa  292  7e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.152797  normal  0.229785 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2053  citrate synthase I  41.04 
 
 		 428 aa  291  9e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.655097  normal  0.0360596 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0097  citrate synthase  38.8 
 
 		 426 aa  291  1e-77  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0802276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2284  citrate synthase I  40.7 
 
 		 427 aa  291  1e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193692  normal  0.0343529 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1845  type II citrate synthase  38.01 
 
 		 433 aa  291  1e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.273477  normal  0.198527 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3694  type II citrate synthase  39.22 
 
 		 428 aa  291  1e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3584  citrate synthase I  41.88 
 
 		 425 aa  291  1e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00887444 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29820  type II citrate synthase  38.44 
 
 		 427 aa  290  2e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3716  citrate synthase I  38.87 
 
 		 430 aa  290  2e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.364105  normal  0.0570227 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2450  type II citrate synthase  39.28 
 
 		 434 aa  290  3e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.444525 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0058  citrate synthase I  41.43 
 
 		 432 aa  290  3e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00358332  normal  0.0142462 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004117  citrate synthase (si)  39.28 
 
 		 429 aa  290  4e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0106  citrate synthase I  38.54 
 
 		 426 aa  290  4e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0154  citrate synthase  41.94 
 
 		 374 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.649155 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01350  type II citrate synthase  39.02 
 
 		 429 aa  289  5.0000000000000004e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0563  citrate synthase  41.69 
 
 		 412 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2251  citrate synthase I  41.93 
 
 		 434 aa  289  5.0000000000000004e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2563  type II citrate synthase  39.28 
 
 		 429 aa  289  5.0000000000000004e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.102281  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1099  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.03 
 
 		 387 aa  289  6e-77  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0336  citrate synthase I  40.73 
 
 		 447 aa  289  7e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000388875  normal  0.187011 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1245  citrate synthase  40.91 
 
 		 374 aa  289  7e-77  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0061  citrate synthase  39.33 
 
 		 430 aa  288  8e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0890712  normal  0.301769 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>