More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2007 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_2007  citrate synthase I  100 
 
 		 427 aa  889    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1088  citrate synthase I  66.43 
 
 		 443 aa  615  1e-175  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.864155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0083  citrate synthase  66.9 
 
 		 455 aa  614  1e-175  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7227  citrate synthase I  67.37 
 
 		 455 aa  613  9.999999999999999e-175  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2068  citrate synthase I  65.88 
 
 		 450 aa  608  1e-173  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.355535  normal  0.380729 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1870  citrate synthase I  65.65 
 
 		 448 aa  606  9.999999999999999e-173  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.859731 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2083  citrate synthase  64.79 
 
 		 447 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.48822  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0317  citrate synthase I  64.32 
 
 		 447 aa  598  1e-170  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2042  citrate synthase I  64 
 
 		 447 aa  595  1e-169  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0336  citrate synthase I  63.15 
 
 		 447 aa  594  1e-168  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000388875  normal  0.187011 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2417  citrate synthase I  64 
 
 		 447 aa  592  1e-168  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2617  citrate synthase I  63.82 
 
 		 436 aa  592  1e-168  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.819839 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0888  citrate synthase  62.76 
 
 		 447 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.631219  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3488  citrate synthase I  64 
 
 		 428 aa  576  1.0000000000000001e-163  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1676  citrate synthase  61.74 
 
 		 445 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308594  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3738  citrate synthase I  62.59 
 
 		 428 aa  570  1e-161  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.680995  normal  0.033422 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0581  citrate synthase I  63.53 
 
 		 428 aa  563  1.0000000000000001e-159  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.178688 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1835  citrate synthase I  60.98 
 
 		 422 aa  543  1e-153  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2450  type II citrate synthase  51.39 
 
 		 434 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.444525 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0995  citrate synthase I  50.11 
 
 		 434 aa  476  1e-133  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.655069 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4703  citrate synthase I  54.89 
 
 		 463 aa  472  1e-132  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2752  citrate synthase  52.8 
 
 		 432 aa  472  1e-132  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.816634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2843  type II citrate synthase  50.58 
 
 		 434 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.433784  normal  0.36225 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3253  type II citrate synthase  49.65 
 
 		 434 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2813  type II citrate synthase  50.81 
 
 		 434 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2136  citrate synthase I  57.03 
 
 		 427 aa  466  9.999999999999999e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.873392  normal  0.0485985 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0897  citrate synthase  51.5 
 
 		 433 aa  465  9.999999999999999e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0898483  normal  0.676877 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0528  citrate synthase I  54.67 
 
 		 437 aa  464  1e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0708503  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02359  type II citrate synthase  51.65 
 
 		 442 aa  464  1e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1301  Citrate (Si)-synthase  49.77 
 
 		 431 aa  462  1e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.115082  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2284  citrate synthase I  56.35 
 
 		 427 aa  464  1e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193692  normal  0.0343529 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2251  citrate synthase I  50.93 
 
 		 434 aa  459  9.999999999999999e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4502  type II citrate synthase  49.88 
 
 		 434 aa  461  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.705578 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0058  citrate synthase I  51.42 
 
 		 432 aa  461  9.999999999999999e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00358332  normal  0.0142462 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1187  citrate synthase  51.27 
 
 		 431 aa  456  1e-127  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0855  citrate synthase I  54.46 
 
 		 432 aa  456  1e-127  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0328929  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3212  citrate synthase  50.71 
 
 		 427 aa  455  1e-127  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215147  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1731  citrate synthase I  50.58 
 
 		 439 aa  456  1e-127  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2787  citrate synthase I  50 
 
 		 426 aa  457  1e-127  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.420339  normal  0.059507 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2032  citrate synthase  51.43 
 
 		 428 aa  451  1.0000000000000001e-126  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808291  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2481  type II citrate synthase  50.47 
 
 		 433 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523496  normal  0.0627534 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1409  citrate synthase I  51.19 
 
 		 429 aa  451  1.0000000000000001e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.423182 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1270  citrate synthase I  52.56 
 
 		 440 aa  452  1.0000000000000001e-126  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2320  type II citrate synthase  49.77 
 
 		 433 aa  449  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0995  citrate synthase I  53.68 
 
 		 436 aa  451  1e-125  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1964  citrate synthase I  55.24 
 
 		 427 aa  451  1e-125  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0148224  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1600  citrate synthase  48.95 
 
 		 433 aa  450  1e-125  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1708  type II citrate synthase  50 
 
 		 433 aa  451  1e-125  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.693797  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4425  citrate synthase I  50.72 
 
 		 436 aa  447  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.224643  normal  0.0272577 
 
 
-
 
NC_004310  BR1148  type II citrate synthase  49.64 
 
 		 430 aa  445  1.0000000000000001e-124  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33600  citrate synthase  55.75 
 
 		 437 aa  446  1.0000000000000001e-124  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.522546 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1106  type II citrate synthase  49.64 
 
 		 435 aa  445  1.0000000000000001e-124  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6352  type II citrate synthase  50.12 
 
 		 433 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0645718  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1845  type II citrate synthase  48.26 
 
 		 433 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.273477  normal  0.198527 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0874  type II citrate synthase  50 
 
 		 429 aa  447  1.0000000000000001e-124  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0015368  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1140  citrate synthase I  52.44 
 
 		 441 aa  447  1.0000000000000001e-124  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.615799  normal  0.0294382 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0787  type II citrate synthase  50.23 
 
 		 429 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2563  type II citrate synthase  50.72 
 
 		 429 aa  447  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.102281  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3181  citrate synthase I  51.07 
 
 		 438 aa  444  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.270593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0999  citrate synthase I  55.75 
 
 		 438 aa  444  1e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2023  citrate synthase I  48.62 
 
 		 429 aa  444  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2042  type II citrate synthase  49.4 
 
 		 430 aa  442  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0529149  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1144  type II citrate synthase  48.93 
 
 		 429 aa  442  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.300068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10915  type II citrate synthase  54.22 
 
 		 431 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2224  citrate synthase I  50 
 
 		 425 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0646  citrate synthase I  48.95 
 
 		 430 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.615558 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1130  citrate synthase I  54.45 
 
 		 431 aa  440  9.999999999999999e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.684999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1729  type II citrate synthase  54.99 
 
 		 434 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.540557 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1681  citrate synthase I  49.4 
 
 		 429 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592991 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0061  citrate synthase  48.03 
 
 		 430 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0890712  normal  0.301769 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1132  citrate synthase  50.36 
 
 		 431 aa  438  9.999999999999999e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1395  citrate synthase  47.66 
 
 		 434 aa  439  9.999999999999999e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.322092  normal  0.0167868 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00680  citrate synthase  48.56 
 
 		 427 aa  435  1e-121  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2916  citrate synthase I  48.56 
 
 		 427 aa  435  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.349648  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25990  citrate synthase  52.07 
 
 		 432 aa  437  1e-121  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00669  hypothetical protein  48.56 
 
 		 427 aa  435  1e-121  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0747  type II citrate synthase  48.56 
 
 		 427 aa  435  1e-121  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004117  citrate synthase (si)  48.8 
 
 		 429 aa  436  1e-121  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0810  type II citrate synthase  48.78 
 
 		 427 aa  435  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.659455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5145  citrate synthase I  49.16 
 
 		 429 aa  437  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.236177  normal  0.0251581 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2935  type II citrate synthase  48.56 
 
 		 427 aa  435  1e-121  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.115815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0704  citrate synthase I  50.12 
 
 		 428 aa  435  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0732  type II citrate synthase  48.56 
 
 		 427 aa  435  1e-121  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.482725  normal  0.945982 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0829  citrate synthase I  49.07 
 
 		 427 aa  436  1e-121  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.292623  hitchhiker  0.00485559 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1646  type II citrate synthase  48.26 
 
 		 429 aa  437  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0982845  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1524  citrate synthase I  48.25 
 
 		 430 aa  436  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.802094  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0638  type II citrate synthase  48.56 
 
 		 427 aa  435  1e-121  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1596  type II citrate synthase  48.33 
 
 		 429 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.218131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3716  citrate synthase I  49.42 
 
 		 430 aa  436  1e-121  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.364105  normal  0.0570227 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1422  type II citrate synthase  49.52 
 
 		 428 aa  435  1e-121  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000689188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4680  citrate synthase I  49.16 
 
 		 446 aa  437  1e-121  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5022  type II citrate synthase  54.48 
 
 		 434 aa  437  1e-121  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.834357 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0768  type II citrate synthase  48.56 
 
 		 427 aa  435  1e-121  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01350  type II citrate synthase  48.32 
 
 		 429 aa  434  1e-120  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3091  citrate synthase I  49.65 
 
 		 428 aa  432  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.31999 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2146  type II citrate synthase  49.3 
 
 		 433 aa  434  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0788  type II citrate synthase  47.91 
 
 		 433 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0858919  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1841  citrate synthase  48.5 
 
 		 430 aa  434  1e-120  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.040491 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5222  citrate synthase I  48.93 
 
 		 429 aa  434  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.827577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4543  type II citrate synthase  54.22 
 
 		 434 aa  433  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.701189 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>