More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0306 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0306  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  100 
 
 		 397 aa  811    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.772555 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2234  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  60 
 
 		 409 aa  502  1e-141  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.709963 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1692  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  58.05 
 
 		 409 aa  481  1e-135  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.141022  normal  0.100865 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0563  citrate synthase  58.05 
 
 		 412 aa  479  1e-134  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0713  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  56.72 
 
 		 404 aa  460  9.999999999999999e-129  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.756288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1467  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  48.81 
 
 		 385 aa  365  1e-100  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0316751  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1522  citrate synthase  47.44 
 
 		 370 aa  355  1e-96  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.640515  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1621  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  46.93 
 
 		 379 aa  347  2e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285346  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0781  citrate synthase  46.52 
 
 		 372 aa  343  4e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1726  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  46.13 
 
 		 380 aa  340  2.9999999999999998e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2221  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  45.7 
 
 		 377 aa  338  9.999999999999999e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57744  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1526  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.9 
 
 		 390 aa  338  9.999999999999999e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.682888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2713  citrate synthase  45.55 
 
 		 378 aa  335  7.999999999999999e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2679  citrate synthase  45.19 
 
 		 372 aa  330  3e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0198833  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0837  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  44.56 
 
 		 378 aa  329  5.0000000000000004e-89  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.531649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1377  citrate synthase  44.5 
 
 		 386 aa  328  8e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1408  citrate synthase  44.5 
 
 		 386 aa  328  8e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0398  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  45.99 
 
 		 377 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0419831  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0404  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.59 
 
 		 378 aa  324  2e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0723  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  44.44 
 
 		 382 aa  322  8e-87  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.517524  normal  0.584309 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0895  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  44.2 
 
 		 430 aa  321  9.999999999999999e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1523  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  44.83 
 
 		 379 aa  320  3e-86  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.297697  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1580  citrate synthase  42.97 
 
 		 383 aa  319  6e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0647  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  44.92 
 
 		 367 aa  315  9e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.029125  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0622  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  44.92 
 
 		 367 aa  315  9e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0115525  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4089  citrate synthase  43.77 
 
 		 389 aa  315  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3278  citrate synthase  43.58 
 
 		 386 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.312589  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1476  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.62 
 
 		 382 aa  312  4.999999999999999e-84  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.644774  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0281  citrate synthase  43.77 
 
 		 378 aa  312  4.999999999999999e-84  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.160338  normal  0.143922 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2276  citrate synthase  43.97 
 
 		 380 aa  312  5.999999999999999e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4704  citrate synthase  43.32 
 
 		 382 aa  311  2e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3036  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.54 
 
 		 382 aa  310  2e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0534  citrate synthase  43.32 
 
 		 382 aa  310  2e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0555246 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1258  citrate synthase  42.86 
 
 		 373 aa  309  4e-83  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4725  citrate synthase  43.32 
 
 		 371 aa  308  9e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4488  citrate synthase  43.05 
 
 		 371 aa  308  9e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1099  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  44.16 
 
 		 387 aa  308  9e-83  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4839  citrate synthase  43.05 
 
 		 371 aa  308  9e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4323  citrate synthase  43.05 
 
 		 371 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4335  citrate synthase  43.05 
 
 		 371 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1189  Citrate (Si)-synthase  41.8 
 
 		 395 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4709  citrate synthase  43.05 
 
 		 382 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000257504 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4720  citrate synthase  43.05 
 
 		 382 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4424  citrate synthase  43.32 
 
 		 371 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0612  citrate synthase  42.86 
 
 		 386 aa  306  5.0000000000000004e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.148892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1252  Citrate (Si)-synthase  43.67 
 
 		 373 aa  304  2.0000000000000002e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2413  citrate synthase  39.89 
 
 		 397 aa  303  3.0000000000000004e-81  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0350  citrate synthase  43.19 
 
 		 391 aa  303  5.000000000000001e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0100  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.32 
 
 		 377 aa  300  2e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01781  citrate synthase  39.62 
 
 		 378 aa  298  1e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.176216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0072  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.2 
 
 		 372 aa  296  6e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0663  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.63 
 
 		 373 aa  294  2e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.280152  normal  0.110027 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01811  citrate synthase  39.12 
 
 		 381 aa  294  2e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0163  citrate synthase  39.22 
 
 		 381 aa  293  3e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.292022  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1786  citrate synthase  40.05 
 
 		 373 aa  293  4e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1752  citrate synthase  40.05 
 
 		 373 aa  293  4e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.206255  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0279  citrate synthase  39.08 
 
 		 396 aa  293  5e-78  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01791  citrate synthase  38.86 
 
 		 381 aa  292  7e-78  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0154  citrate synthase  42.63 
 
 		 374 aa  291  1e-77  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.649155 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1245  citrate synthase  41.44 
 
 		 374 aa  291  1e-77  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26921  citrate synthase  39.08 
 
 		 396 aa  291  2e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01901  citrate synthase  39.25 
 
 		 381 aa  290  4e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1665  citrate synthase  40.43 
 
 		 378 aa  289  5.0000000000000004e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02341  citrate synthase  38.27 
 
 		 375 aa  289  6e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1528  citrate synthase  38.01 
 
 		 375 aa  287  2e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0349986  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2031  citrate (Si)-synthase  40.51 
 
 		 473 aa  287  2e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602388  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3065  citrate synthase  41.32 
 
 		 386 aa  287  2.9999999999999996e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2672  citrate synthase  41.32 
 
 		 386 aa  287  2.9999999999999996e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.530506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1202  Citrate (Si)-synthase  41.19 
 
 		 375 aa  287  2.9999999999999996e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000138488  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1063  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  40.1 
 
 		 393 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1035  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  39.52 
 
 		 375 aa  281  2e-74  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0715  citrate synthase  41.67 
 
 		 355 aa  279  8e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2628  citrate synthase  39.74 
 
 		 387 aa  277  2e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2105  citrate (Si)-synthase  39.18 
 
 		 397 aa  277  2e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.414267  normal  0.0115455 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1936  methylcitrate synthase  37.63 
 
 		 375 aa  276  3e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.686847  hitchhiker  0.000000858753 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1676  citrate synthase  43.43 
 
 		 445 aa  276  4e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308594  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1572  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  38.98 
 
 		 380 aa  276  5e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2335  methylcitrate synthase  37.37 
 
 		 375 aa  275  7e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218689  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3435  methylcitrate synthase  37.37 
 
 		 375 aa  275  7e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.01089  normal  0.171025 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2208  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.67 
 
 		 374 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.539974  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0586  citrate synthase  40.05 
 
 		 430 aa  273  4.0000000000000004e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1570  citrate (Si)-synthase  40.05 
 
 		 430 aa  273  5.000000000000001e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00021591  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1776  methylcitrate synthase  36.83 
 
 		 375 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.549839  hitchhiker  0.000461346 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2539  Citrate (Si)-synthase  38.36 
 
 		 374 aa  271  2e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.64966  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3832  type II citrate synthase  40.47 
 
 		 433 aa  270  4e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.418606 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3316  type II citrate synthase  40.47 
 
 		 433 aa  270  4e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.229262  normal  0.697255 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1088  citrate synthase I  40.05 
 
 		 443 aa  269  5.9999999999999995e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.864155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6851  type II citrate synthase  40.96 
 
 		 433 aa  268  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.622921 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2890  type II citrate synthase  40.96 
 
 		 433 aa  268  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2557  citrate synthase  38.69 
 
 		 391 aa  268  2e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4680  citrate synthase I  40 
 
 		 446 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5145  citrate synthase I  40 
 
 		 429 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.236177  normal  0.0251581 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2288  2-methylcitrate synthase  37.9 
 
 		 375 aa  266  4e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.037213  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2023  citrate synthase I  39.36 
 
 		 429 aa  266  4e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0665  type II citrate synthase  39.95 
 
 		 433 aa  266  5e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.170997  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4643  type II citrate synthase  39.69 
 
 		 433 aa  266  5e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5222  citrate synthase I  39.73 
 
 		 429 aa  266  5e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.827577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5205  type II citrate synthase  40.58 
 
 		 433 aa  266  7e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.237518  normal  0.311757 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11154  citrate synthase  38.36 
 
 		 393 aa  265  8e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5525  type II citrate synthase  40.43 
 
 		 432 aa  265  8e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.615237  normal  0.487627 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>