More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1522 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1522  citrate synthase  100 
 
 		 370 aa  759    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.640515  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1467  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  47.34 
 
 		 385 aa  359  4e-98  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0316751  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0306  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  47.44 
 
 		 397 aa  355  8.999999999999999e-97  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.772555 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1035  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  44.59 
 
 		 375 aa  338  7e-92  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0723  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  44.06 
 
 		 382 aa  335  9e-91  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.517524  normal  0.584309 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2221  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.05 
 
 		 377 aa  334  2e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57744  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1621  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.78 
 
 		 379 aa  331  1e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285346  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1523  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  46.17 
 
 		 379 aa  331  1e-89  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.297697  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1726  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.09 
 
 		 380 aa  330  2e-89  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0281  citrate synthase  44.71 
 
 		 378 aa  328  1.0000000000000001e-88  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.160338  normal  0.143922 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0398  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  44.8 
 
 		 377 aa  326  3e-88  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0419831  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1476  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  44.74 
 
 		 382 aa  326  5e-88  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.644774  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3036  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  44.21 
 
 		 382 aa  325  8.000000000000001e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0647  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  45.68 
 
 		 367 aa  325  9e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.029125  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0622  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  45.68 
 
 		 367 aa  325  9e-88  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0115525  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2234  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  44.56 
 
 		 409 aa  322  9.000000000000001e-87  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.709963 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2276  citrate synthase  46.54 
 
 		 380 aa  320  1.9999999999999998e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0837  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.74 
 
 		 378 aa  319  3.9999999999999996e-86  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.531649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1202  Citrate (Si)-synthase  42.97 
 
 		 375 aa  319  6e-86  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000138488  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1526  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.05 
 
 		 390 aa  318  1e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.682888  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2679  citrate synthase  44.3 
 
 		 372 aa  317  2e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0198833  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0781  citrate synthase  44.83 
 
 		 372 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0154  citrate synthase  43.78 
 
 		 374 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.649155 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0713  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  44.87 
 
 		 404 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.756288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1408  citrate synthase  42.43 
 
 		 386 aa  313  3.9999999999999997e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1377  citrate synthase  42.43 
 
 		 386 aa  313  3.9999999999999997e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0663  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.2 
 
 		 373 aa  311  1e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.280152  normal  0.110027 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3065  citrate synthase  41.64 
 
 		 386 aa  310  4e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2672  citrate synthase  41.64 
 
 		 386 aa  310  4e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.530506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0563  citrate synthase  43.01 
 
 		 412 aa  308  9e-83  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01781  citrate synthase  40.8 
 
 		 378 aa  307  2.0000000000000002e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.176216  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0404  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.87 
 
 		 378 aa  306  3e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1692  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.52 
 
 		 409 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.141022  normal  0.100865 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2713  citrate synthase  42.78 
 
 		 378 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0895  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.78 
 
 		 430 aa  303  2.0000000000000002e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4089  citrate synthase  41.98 
 
 		 389 aa  302  7.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2413  citrate synthase  40.27 
 
 		 397 aa  301  1e-80  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1252  Citrate (Si)-synthase  39.89 
 
 		 373 aa  300  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3278  citrate synthase  41.76 
 
 		 386 aa  299  5e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.312589  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1099  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  44.11 
 
 		 387 aa  298  7e-80  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1752  citrate synthase  39.47 
 
 		 373 aa  298  1e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.206255  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1786  citrate synthase  39.47 
 
 		 373 aa  298  1e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4725  citrate synthase  41.49 
 
 		 371 aa  297  2e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4704  citrate synthase  41.49 
 
 		 382 aa  297  2e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1528  citrate synthase  40 
 
 		 375 aa  297  2e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0349986  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4424  citrate synthase  41.22 
 
 		 371 aa  297  2e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01811  citrate synthase  40.75 
 
 		 381 aa  297  2e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0163  citrate synthase  40.75 
 
 		 381 aa  296  4e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.292022  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0534  citrate synthase  41.49 
 
 		 382 aa  296  4e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0555246 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02341  citrate synthase  39.73 
 
 		 375 aa  295  6e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0279  citrate synthase  39.47 
 
 		 396 aa  295  7e-79  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4488  citrate synthase  41.22 
 
 		 371 aa  295  8e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4839  citrate synthase  41.22 
 
 		 371 aa  295  8e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01791  citrate synthase  40.48 
 
 		 381 aa  295  8e-79  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4323  citrate synthase  41.22 
 
 		 371 aa  295  1e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4335  citrate synthase  41.22 
 
 		 371 aa  295  1e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4720  citrate synthase  41.22 
 
 		 382 aa  294  1e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0350  citrate synthase  38.6 
 
 		 391 aa  295  1e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0612  citrate synthase  41.98 
 
 		 386 aa  294  1e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.148892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4709  citrate synthase  41.22 
 
 		 382 aa  294  1e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000257504 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1580  citrate synthase  40.27 
 
 		 383 aa  295  1e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1258  citrate synthase  39.73 
 
 		 373 aa  294  2e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0100  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  39.3 
 
 		 377 aa  293  2e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1189  Citrate (Si)-synthase  40.37 
 
 		 395 aa  293  4e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26921  citrate synthase  39.47 
 
 		 396 aa  291  1e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01901  citrate synthase  39.95 
 
 		 381 aa  289  5.0000000000000004e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1245  citrate synthase  40.8 
 
 		 374 aa  289  6e-77  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2628  citrate synthase  38.38 
 
 		 387 aa  287  2e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1665  citrate synthase  40 
 
 		 378 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1572  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  39.73 
 
 		 380 aa  277  2e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2557  citrate synthase  39.46 
 
 		 391 aa  275  8e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4146  citrate (Si)-synthase  37.67 
 
 		 375 aa  274  2.0000000000000002e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2141  Citrate (Si)-synthase  37.47 
 
 		 389 aa  272  8.000000000000001e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.636674  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0715  citrate synthase  42.07 
 
 		 355 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2105  citrate (Si)-synthase  38.5 
 
 		 397 aa  269  5.9999999999999995e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.414267  normal  0.0115455 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1063  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  37.4 
 
 		 393 aa  267  2e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1658  citrate synthase  38.21 
 
 		 373 aa  268  2e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.617148  normal  0.567466 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2031  citrate (Si)-synthase  38.54 
 
 		 473 aa  265  8e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602388  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11154  citrate synthase  37.5 
 
 		 393 aa  265  8.999999999999999e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2423  Citrate (Si)-synthase  38.83 
 
 		 377 aa  265  1e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33600  citrate synthase  40.62 
 
 		 437 aa  265  1e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.522546 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0574  citrate synthase  37.3 
 
 		 378 aa  261  8.999999999999999e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2480  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  37.87 
 
 		 380 aa  260  3e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.388889  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0072  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  37.23 
 
 		 372 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2224  citrate synthase I  38.32 
 
 		 425 aa  258  1e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1088  citrate synthase I  38.73 
 
 		 443 aa  258  1e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.864155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0528  citrate synthase I  39.74 
 
 		 437 aa  256  3e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0708503  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1665  methylcitrate synthase  38.34 
 
 		 377 aa  256  3e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1523  citrate synthase  35.36 
 
 		 379 aa  256  6e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000149405 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0888  citrate synthase  39.47 
 
 		 447 aa  256  6e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.631219  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1275  citrate synthase  38.08 
 
 		 427 aa  256  7e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.152797  normal  0.229785 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1964  citrate synthase I  38.5 
 
 		 427 aa  255  7e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0148224  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2023  citrate synthase I  36.98 
 
 		 429 aa  255  9e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1198  methylcitrate synthase  37.74 
 
 		 376 aa  254  1.0000000000000001e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4456  type II citrate synthase  38.38 
 
 		 434 aa  255  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4838  type II citrate synthase  38.38 
 
 		 434 aa  255  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.782916  normal  0.17167 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4543  type II citrate synthase  38.38 
 
 		 434 aa  255  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.701189 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1835  citrate synthase I  39.95 
 
 		 422 aa  253  3e-66  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0075  citrate synthase  39.2 
 
 		 416 aa  253  3e-66  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1176  2-methylcitrate synthase  37.74 
 
 		 372 aa  253  4.0000000000000004e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.831059  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>