More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1245 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_1245  citrate synthase  100 
 
 
374 aa  782    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0781  citrate synthase  55.04 
 
 
372 aa  420  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2679  citrate synthase  54.22 
 
 
372 aa  419  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0198833  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1258  citrate synthase  52.59 
 
 
373 aa  407  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1752  citrate synthase  52.59 
 
 
373 aa  402  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.206255  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1786  citrate synthase  52.59 
 
 
373 aa  402  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3278  citrate synthase  52.03 
 
 
386 aa  394  1e-108  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.312589  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4424  citrate synthase  51.76 
 
 
371 aa  392  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4725  citrate synthase  50.95 
 
 
371 aa  388  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4488  citrate synthase  51.22 
 
 
371 aa  390  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4323  citrate synthase  50.95 
 
 
371 aa  389  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4335  citrate synthase  50.95 
 
 
371 aa  389  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4704  citrate synthase  51.22 
 
 
382 aa  390  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4709  citrate synthase  50.95 
 
 
382 aa  389  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000257504 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4839  citrate synthase  51.22 
 
 
371 aa  390  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0534  citrate synthase  50.95 
 
 
382 aa  389  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0555246 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4720  citrate synthase  50.95 
 
 
382 aa  389  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2221  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  48.92 
 
 
377 aa  365  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57744  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0837  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  45.84 
 
 
378 aa  340  2e-92  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.531649  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1523  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  44.92 
 
 
379 aa  335  5e-91  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.297697  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0663  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  44.3 
 
 
373 aa  324  2e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.280152  normal  0.110027 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2276  citrate synthase  45.62 
 
 
380 aa  322  9.000000000000001e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1476  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.24 
 
 
382 aa  321  9.999999999999999e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.644774  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0723  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.82 
 
 
382 aa  320  3e-86  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.517524  normal  0.584309 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1526  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  45.16 
 
 
390 aa  318  1e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.682888  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1252  Citrate (Si)-synthase  43.35 
 
 
373 aa  318  1e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1467  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  45.04 
 
 
385 aa  316  4e-85  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0316751  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3036  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.04 
 
 
382 aa  315  9e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0895  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  44.24 
 
 
430 aa  315  9.999999999999999e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1580  citrate synthase  43.5 
 
 
383 aa  305  6e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1377  citrate synthase  42.13 
 
 
386 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1408  citrate synthase  42.13 
 
 
386 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01781  citrate synthase  43.16 
 
 
378 aa  300  3e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.176216  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2713  citrate synthase  41.49 
 
 
378 aa  299  6e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1572  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.65 
 
 
380 aa  297  2e-79  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0404  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.67 
 
 
378 aa  297  3e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26921  citrate synthase  41.6 
 
 
396 aa  296  4e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01811  citrate synthase  43.97 
 
 
381 aa  296  5e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0163  citrate synthase  43.97 
 
 
381 aa  296  6e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.292022  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01791  citrate synthase  43.7 
 
 
381 aa  294  1e-78  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1665  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  40.97 
 
 
374 aa  294  2e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4089  citrate synthase  41.82 
 
 
389 aa  293  3e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01901  citrate synthase  42.9 
 
 
381 aa  292  7e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0279  citrate synthase  41.36 
 
 
396 aa  291  9e-78  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1528  citrate synthase  41.29 
 
 
375 aa  291  1e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0349986  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0306  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.44 
 
 
397 aa  291  1e-77  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.772555 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1776  methylcitrate synthase  39.46 
 
 
375 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.549839  hitchhiker  0.000461346 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1665  citrate synthase  41.34 
 
 
378 aa  290  4e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2335  methylcitrate synthase  39.46 
 
 
375 aa  290  4e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218689  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3435  methylcitrate synthase  39.46 
 
 
375 aa  290  4e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.01089  normal  0.171025 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1522  citrate synthase  40.8 
 
 
370 aa  289  6e-77  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.640515  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1936  methylcitrate synthase  39.62 
 
 
375 aa  288  7e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.686847  hitchhiker  0.000000858753 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1858  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  40.27 
 
 
374 aa  288  1e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02341  citrate synthase  40.75 
 
 
375 aa  288  1e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2321  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.39 
 
 
384 aa  287  2e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0100  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.87 
 
 
377 aa  287  2e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2112  2-methylcitrate synthase  40.27 
 
 
374 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2604  2-methylcitrate synthase  40.65 
 
 
374 aa  286  2.9999999999999996e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.121252  hitchhiker  0.000290432 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2413  citrate synthase  39.27 
 
 
397 aa  286  4e-76  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0574  citrate synthase  40.95 
 
 
378 aa  286  4e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1420  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  39.19 
 
 
374 aa  286  5e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2086  methylcitrate synthase  40 
 
 
375 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.440425  hitchhiker  0.00454661 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1765  methylcitrate synthase  40 
 
 
375 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.924616  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53950  methylcitrate synthase  39.46 
 
 
375 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.282102  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4723  methylcitrate synthase  39.46 
 
 
375 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2498  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  40.56 
 
 
374 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0246552 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2288  2-methylcitrate synthase  39.73 
 
 
375 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.037213  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0612  citrate synthase  40.91 
 
 
386 aa  283  3.0000000000000004e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.148892  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1202  Citrate (Si)-synthase  41.44 
 
 
375 aa  283  4.0000000000000003e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000138488  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2821  putative 2-methylcitrate synthase  40.54 
 
 
374 aa  283  4.0000000000000003e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.702751  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0953  methylcitrate synthase  39.84 
 
 
377 aa  283  4.0000000000000003e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2420  2-methylcitrate synthase  40 
 
 
375 aa  281  1e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0822163  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2480  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.08 
 
 
380 aa  280  2e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.388889  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3065  citrate synthase  39.58 
 
 
386 aa  281  2e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2672  citrate synthase  39.58 
 
 
386 aa  281  2e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.530506  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1189  Citrate (Si)-synthase  39.26 
 
 
395 aa  281  2e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1726  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.42 
 
 
380 aa  280  2e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3295  methylcitrate synthase  39.19 
 
 
378 aa  279  4e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.11596 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003389  2-methylcitrate synthase  38.98 
 
 
380 aa  278  8e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1665  methylcitrate synthase  40.05 
 
 
377 aa  278  9e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0344  methylcitrate synthase  38.92 
 
 
375 aa  278  1e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1523  citrate synthase  40.38 
 
 
379 aa  277  2e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000149405 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1621  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.62 
 
 
379 aa  277  3e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285346  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3630  methylcitrate synthase  39.39 
 
 
375 aa  276  4e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0820  2-methylcitrate synthase  41.6 
 
 
372 aa  276  6e-73  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1176  2-methylcitrate synthase  41.6 
 
 
372 aa  276  6e-73  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.831059  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0314  methylcitrate synthase  39.39 
 
 
375 aa  276  6e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3826  methylcitrate synthase  39.39 
 
 
375 aa  276  6e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1821  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  38.65 
 
 
374 aa  275  9e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02396  methylcitrate synthase  38.44 
 
 
380 aa  275  1.0000000000000001e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2628  citrate synthase  39.58 
 
 
387 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1111  methylcitrate synthase  40.28 
 
 
379 aa  274  2.0000000000000002e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.468935 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1496  2-methylcitrate synthase  41.22 
 
 
372 aa  273  3e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3645  methylcitrate synthase  38.44 
 
 
375 aa  273  3e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4048  methylcitrate synthase  38.44 
 
 
375 aa  273  3e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4141  methylcitrate synthase  38.11 
 
 
379 aa  273  3e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03371  methylcitrate synthase  39.78 
 
 
373 aa  273  3e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3946  methylcitrate synthase  38.11 
 
 
375 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4022  methylcitrate synthase  38.11 
 
 
375 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0924  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  38.93 
 
 
379 aa  273  4.0000000000000004e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>