More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1665 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1665  citrate synthase  100 
 
 
378 aa  776    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2713  citrate synthase  77.51 
 
 
378 aa  630  1e-179  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0404  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  78.04 
 
 
378 aa  630  1e-179  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1580  citrate synthase  77.25 
 
 
383 aa  616  1e-175  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0612  citrate synthase  78.99 
 
 
386 aa  613  9.999999999999999e-175  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.148892  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4089  citrate synthase  75.33 
 
 
389 aa  603  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1377  citrate synthase  74.07 
 
 
386 aa  601  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1408  citrate synthase  74.07 
 
 
386 aa  601  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2413  citrate synthase  71.62 
 
 
397 aa  573  1.0000000000000001e-162  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0279  citrate synthase  71.09 
 
 
396 aa  566  1e-160  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01811  citrate synthase  70.97 
 
 
381 aa  563  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01791  citrate synthase  70.97 
 
 
381 aa  562  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0163  citrate synthase  70.43 
 
 
381 aa  560  1e-158  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.292022  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1528  citrate synthase  70.16 
 
 
375 aa  555  1e-157  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0349986  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01901  citrate synthase  70.43 
 
 
381 aa  555  1e-157  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01781  citrate synthase  69.35 
 
 
378 aa  555  1e-157  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.176216  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26921  citrate synthase  70.51 
 
 
396 aa  551  1e-156  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02341  citrate synthase  69.89 
 
 
375 aa  554  1e-156  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2141  Citrate (Si)-synthase  56.02 
 
 
389 aa  436  1e-121  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.636674  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2628  citrate synthase  54.55 
 
 
387 aa  426  1e-118  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2672  citrate synthase  51.43 
 
 
386 aa  421  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.530506  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3065  citrate synthase  51.43 
 
 
386 aa  421  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0350  citrate synthase  51.7 
 
 
391 aa  414  1e-114  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1202  Citrate (Si)-synthase  49.72 
 
 
375 aa  386  1e-106  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000138488  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1467  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  48.4 
 
 
385 aa  347  1e-94  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0316751  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1526  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  44.59 
 
 
390 aa  333  3e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.682888  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1621  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  44.06 
 
 
379 aa  322  8e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285346  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0781  citrate synthase  44.33 
 
 
372 aa  317  2e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1676  citrate synthase  44.94 
 
 
445 aa  316  4e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308594  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0888  citrate synthase  46.36 
 
 
447 aa  316  4e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.631219  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2679  citrate synthase  43.8 
 
 
372 aa  311  1e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0198833  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1088  citrate synthase I  42.56 
 
 
443 aa  311  2e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.864155  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0723  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.42 
 
 
382 aa  308  9e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.517524  normal  0.584309 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0895  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.77 
 
 
430 aa  306  3e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2221  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.98 
 
 
377 aa  303  3.0000000000000004e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57744  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02359  type II citrate synthase  41.97 
 
 
442 aa  302  5.000000000000001e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0317  citrate synthase I  43.34 
 
 
447 aa  301  1e-80  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0083  citrate synthase  41.78 
 
 
455 aa  301  1e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4488  citrate synthase  43.67 
 
 
371 aa  300  2e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4323  citrate synthase  43.67 
 
 
371 aa  300  2e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4335  citrate synthase  43.67 
 
 
371 aa  300  2e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4709  citrate synthase  43.67 
 
 
382 aa  300  2e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000257504 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0534  citrate synthase  43.94 
 
 
382 aa  301  2e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0555246 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4839  citrate synthase  43.67 
 
 
371 aa  300  2e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4720  citrate synthase  43.67 
 
 
382 aa  300  2e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4725  citrate synthase  43.67 
 
 
371 aa  300  3e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1870  citrate synthase I  42.3 
 
 
448 aa  299  4e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.859731 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4704  citrate synthase  43.67 
 
 
382 aa  299  6e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4424  citrate synthase  43.13 
 
 
371 aa  297  2e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2007  citrate synthase I  41.05 
 
 
427 aa  296  3e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2042  citrate synthase I  41.78 
 
 
447 aa  296  3e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1835  citrate synthase I  43.04 
 
 
422 aa  296  3e-79  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7227  citrate synthase I  40.99 
 
 
455 aa  296  4e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2068  citrate synthase I  42.04 
 
 
450 aa  296  5e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.355535  normal  0.380729 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1409  citrate synthase I  42.38 
 
 
429 aa  295  9e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.423182 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0837  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.69 
 
 
378 aa  295  1e-78  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.531649  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2417  citrate synthase I  41.97 
 
 
447 aa  294  2e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29820  type II citrate synthase  38.7 
 
 
427 aa  293  3e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2224  citrate synthase I  40.83 
 
 
425 aa  293  4e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2251  citrate synthase I  41.86 
 
 
434 aa  293  4e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2787  citrate synthase I  40 
 
 
426 aa  292  8e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.420339  normal  0.059507 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3278  citrate synthase  42.86 
 
 
386 aa  291  1e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.312589  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1731  citrate synthase I  39.49 
 
 
439 aa  290  2e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1063  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  44.24 
 
 
393 aa  291  2e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2136  citrate synthase I  40.2 
 
 
427 aa  290  3e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.873392  normal  0.0485985 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1187  citrate synthase  40.41 
 
 
431 aa  290  3e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3036  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.22 
 
 
382 aa  289  4e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1245  citrate synthase  41.34 
 
 
374 aa  290  4e-77  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2083  citrate synthase  40.99 
 
 
447 aa  290  4e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.48822  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0306  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  40.43 
 
 
397 aa  289  5.0000000000000004e-77  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.772555 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37633  predicted protein  41.25 
 
 
544 aa  289  6e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.506551  normal  0.0169313 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0336  citrate synthase I  40.99 
 
 
447 aa  289  7e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000388875  normal  0.187011 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4502  type II citrate synthase  39.53 
 
 
434 aa  288  8e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.705578 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2843  type II citrate synthase  39.53 
 
 
434 aa  288  8e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.433784  normal  0.36225 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3584  citrate synthase I  41.88 
 
 
425 aa  288  1e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00887444 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2617  citrate synthase I  41.15 
 
 
436 aa  288  1e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.819839 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1258  citrate synthase  38.99 
 
 
373 aa  287  2e-76  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3253  type II citrate synthase  39.53 
 
 
434 aa  287  2e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1099  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.51 
 
 
387 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2752  citrate synthase  41.86 
 
 
432 aa  286  2.9999999999999996e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.816634  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1252  Citrate (Si)-synthase  43.58 
 
 
373 aa  286  2.9999999999999996e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2284  citrate synthase I  39.95 
 
 
427 aa  287  2.9999999999999996e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193692  normal  0.0343529 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1275  citrate synthase  40.89 
 
 
427 aa  286  5e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.152797  normal  0.229785 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1964  citrate synthase I  39.64 
 
 
427 aa  285  7e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0148224  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0072  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.51 
 
 
372 aa  285  9e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2813  type II citrate synthase  39.53 
 
 
434 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2450  type II citrate synthase  39.53 
 
 
434 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.444525 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1132  citrate synthase  38.46 
 
 
431 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1752  citrate synthase  40.05 
 
 
373 aa  283  2.0000000000000002e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.206255  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3517  type II citrate synthase  38.6 
 
 
429 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5036  citrate synthase I  41.34 
 
 
428 aa  284  2.0000000000000002e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0787  type II citrate synthase  41.88 
 
 
429 aa  284  2.0000000000000002e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1301  Citrate (Si)-synthase  37.98 
 
 
431 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.115082  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1786  citrate synthase  40.05 
 
 
373 aa  283  2.0000000000000002e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0554  citrate synthase I  41.24 
 
 
428 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.488876  normal  0.835408 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1726  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.86 
 
 
380 aa  284  2.0000000000000002e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4194  type II citrate synthase  38.08 
 
 
429 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0867349  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2194  citrate synthase I  38.6 
 
 
429 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1609  type II citrate synthase  38.34 
 
 
429 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.706948  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3765  type II citrate synthase  38.08 
 
 
429 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0679988  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>