More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1202 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1202  Citrate (Si)-synthase  100 
 
 		 375 aa  759    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000138488  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1377  citrate synthase  51.35 
 
 		 386 aa  413  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1408  citrate synthase  51.35 
 
 		 386 aa  413  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2713  citrate synthase  49.59 
 
 		 378 aa  400  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4089  citrate synthase  49.73 
 
 		 389 aa  398  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01781  citrate synthase  48.79 
 
 		 378 aa  399  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.176216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0163  citrate synthase  47.97 
 
 		 381 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.292022  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01811  citrate synthase  47.7 
 
 		 381 aa  395  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01791  citrate synthase  47.43 
 
 		 381 aa  393  1e-108  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01901  citrate synthase  48.24 
 
 		 381 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1528  citrate synthase  47.54 
 
 		 375 aa  389  1e-107  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0349986  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0279  citrate synthase  45.82 
 
 		 396 aa  388  1e-107  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1580  citrate synthase  49.19 
 
 		 383 aa  390  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0404  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  48.5 
 
 		 378 aa  389  1e-107  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26921  citrate synthase  46.81 
 
 		 396 aa  386  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1665  citrate synthase  49.72 
 
 		 378 aa  386  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02341  citrate synthase  47.27 
 
 		 375 aa  387  1e-106  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2413  citrate synthase  45.14 
 
 		 397 aa  384  1e-105  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0612  citrate synthase  48.37 
 
 		 386 aa  383  1e-105  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.148892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2628  citrate synthase  45.87 
 
 		 387 aa  372  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0350  citrate synthase  47.09 
 
 		 391 aa  368  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3065  citrate synthase  44.06 
 
 		 386 aa  363  2e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2672  citrate synthase  44.06 
 
 		 386 aa  363  2e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.530506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2141  Citrate (Si)-synthase  45.21 
 
 		 389 aa  363  3e-99  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.636674  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1522  citrate synthase  42.97 
 
 		 370 aa  319  6e-86  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.640515  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1467  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.62 
 
 		 385 aa  313  1.9999999999999998e-84  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0316751  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1526  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  40.38 
 
 		 390 aa  305  6e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.682888  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0723  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.37 
 
 		 382 aa  303  3.0000000000000004e-81  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.517524  normal  0.584309 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0154  citrate synthase  41.29 
 
 		 374 aa  302  5.000000000000001e-81  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.649155 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2221  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.42 
 
 		 377 aa  301  1e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57744  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1621  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  40.92 
 
 		 379 aa  299  5e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285346  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0647  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.56 
 
 		 367 aa  298  1e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.029125  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0622  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.56 
 
 		 367 aa  298  1e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0115525  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1035  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  39.67 
 
 		 375 aa  296  5e-79  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1726  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.01 
 
 		 380 aa  296  5e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2679  citrate synthase  40.97 
 
 		 372 aa  293  3e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0198833  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3036  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  38.67 
 
 		 382 aa  290  4e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0781  citrate synthase  41.78 
 
 		 372 aa  289  6e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11150  citrate synthase  41.45 
 
 		 450 aa  288  1e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.592524  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0306  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.19 
 
 		 397 aa  287  2.9999999999999996e-76  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.772555 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1731  citrate synthase I  41.36 
 
 		 439 aa  286  4e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0663  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  38.8 
 
 		 373 aa  285  7e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.280152  normal  0.110027 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1275  citrate synthase  42.41 
 
 		 427 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.152797  normal  0.229785 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1476  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  39.53 
 
 		 382 aa  284  2.0000000000000002e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.644774  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0895  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  39.3 
 
 		 430 aa  283  3.0000000000000004e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1245  citrate synthase  41.44 
 
 		 374 aa  283  4.0000000000000003e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2105  citrate (Si)-synthase  40.43 
 
 		 397 aa  282  8.000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.414267  normal  0.0115455 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1099  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  40.49 
 
 		 387 aa  281  1e-74  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0888  citrate synthase  39.35 
 
 		 447 aa  280  4e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.631219  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2276  citrate synthase  39.17 
 
 		 380 aa  279  5e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05880  citrate synthase  43.41 
 
 		 428 aa  279  6e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2042  citrate synthase I  40.32 
 
 		 447 aa  278  1e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1212  citrate synthase  37.92 
 
 		 428 aa  276  3e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000171793  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0281  citrate synthase  38.15 
 
 		 378 aa  275  6e-73  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.160338  normal  0.143922 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3694  type II citrate synthase  38.24 
 
 		 428 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1409  citrate synthase I  39.01 
 
 		 429 aa  275  1.0000000000000001e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.423182 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1140  citrate synthase I  41.04 
 
 		 441 aa  274  2.0000000000000002e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.615799  normal  0.0294382 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1252  Citrate (Si)-synthase  38.25 
 
 		 373 aa  274  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2111  citrate synthase  37.7 
 
 		 454 aa  274  2.0000000000000002e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000226419  normal  0.855626 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1523  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  37.03 
 
 		 379 aa  274  2.0000000000000002e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.297697  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4680  citrate synthase I  38.8 
 
 		 446 aa  272  6e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5145  citrate synthase I  38.8 
 
 		 429 aa  272  6e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.236177  normal  0.0251581 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2531  citrate synthase I  39.9 
 
 		 428 aa  272  6e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000235775 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1676  citrate synthase  40.85 
 
 		 445 aa  272  7e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308594  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2136  citrate synthase I  37.73 
 
 		 427 aa  272  8.000000000000001e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.873392  normal  0.0485985 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44070  type II citrate synthase  38.66 
 
 		 428 aa  272  8.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0398  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  37.95 
 
 		 377 aa  271  1e-71  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0419831  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1964  citrate synthase I  38.9 
 
 		 427 aa  271  1e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0148224  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2545  citrate synthase I  39.68 
 
 		 431 aa  271  1e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4703  citrate synthase I  41.71 
 
 		 463 aa  271  1e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2417  citrate synthase I  41.16 
 
 		 447 aa  271  1e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0058  citrate synthase I  38.54 
 
 		 432 aa  270  2e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00358332  normal  0.0142462 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0106  citrate synthase I  38.3 
 
 		 426 aa  271  2e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0803  citrate synthase I  40.46 
 
 		 440 aa  271  2e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.558205 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0097  citrate synthase  38.56 
 
 		 426 aa  270  2.9999999999999997e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0802276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0336  citrate synthase I  41.07 
 
 		 447 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000388875  normal  0.187011 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3278  citrate synthase  39.89 
 
 		 386 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.312589  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1786  citrate synthase  38.52 
 
 		 373 aa  270  4e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1752  citrate synthase  38.52 
 
 		 373 aa  270  4e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.206255  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2083  citrate synthase  40.05 
 
 		 447 aa  270  4e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.48822  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2284  citrate synthase I  38.06 
 
 		 427 aa  269  5e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193692  normal  0.0343529 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5222  citrate synthase I  38.12 
 
 		 429 aa  269  5e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.827577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2042  type II citrate synthase  36.91 
 
 		 430 aa  269  7e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0529149  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4725  citrate synthase  39.62 
 
 		 371 aa  269  7e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19470  citrate synthase  39.16 
 
 		 428 aa  269  7e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.286826  hitchhiker  0.00826117 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1301  Citrate (Si)-synthase  38.68 
 
 		 431 aa  269  7e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.115082  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0317  citrate synthase I  40.05 
 
 		 447 aa  268  8e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3181  citrate synthase I  36.2 
 
 		 438 aa  268  8e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.270593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2053  citrate synthase I  40.43 
 
 		 428 aa  268  8e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.655097  normal  0.0360596 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1870  citrate synthase I  39.26 
 
 		 448 aa  268  8e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.859731 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4488  citrate synthase  39.35 
 
 		 371 aa  268  1e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4839  citrate synthase  39.35 
 
 		 371 aa  268  1e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0554  citrate synthase I  41.09 
 
 		 428 aa  268  1e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.488876  normal  0.835408 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0586  citrate synthase  37.4 
 
 		 430 aa  268  1e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0995  citrate synthase I  37.34 
 
 		 434 aa  267  2e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.655069 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4323  citrate synthase  39.35 
 
 		 371 aa  268  2e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4709  citrate synthase  39.35 
 
 		 382 aa  267  2e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000257504 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0534  citrate synthase  39.35 
 
 		 382 aa  267  2e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0555246 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4720  citrate synthase  39.35 
 
 		 382 aa  267  2e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1570  citrate (Si)-synthase  37.4 
 
 		 430 aa  268  2e-70  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00021591  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>