More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2713 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2713  citrate synthase  100 
 
 
378 aa  786    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1580  citrate synthase  79.37 
 
 
383 aa  641    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0404  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  88.89 
 
 
378 aa  711    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1408  citrate synthase  78.84 
 
 
386 aa  632  1e-180  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1377  citrate synthase  78.84 
 
 
386 aa  632  1e-180  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1665  citrate synthase  77.51 
 
 
378 aa  630  1e-179  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4089  citrate synthase  77.13 
 
 
389 aa  629  1e-179  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0612  citrate synthase  76.6 
 
 
386 aa  612  9.999999999999999e-175  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.148892  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2413  citrate synthase  69.25 
 
 
397 aa  568  1e-161  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0279  citrate synthase  68.45 
 
 
396 aa  558  1e-158  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01781  citrate synthase  68.28 
 
 
378 aa  560  1e-158  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.176216  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02341  citrate synthase  68.01 
 
 
375 aa  555  1e-157  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1528  citrate synthase  68.28 
 
 
375 aa  555  1e-157  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0349986  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01791  citrate synthase  68.55 
 
 
381 aa  555  1e-157  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01811  citrate synthase  68.82 
 
 
381 aa  557  1e-157  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26921  citrate synthase  68.18 
 
 
396 aa  554  1e-156  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0163  citrate synthase  68.01 
 
 
381 aa  552  1e-156  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.292022  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01901  citrate synthase  68.01 
 
 
381 aa  549  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2141  Citrate (Si)-synthase  56.02 
 
 
389 aa  445  1.0000000000000001e-124  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.636674  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3065  citrate synthase  53.93 
 
 
386 aa  438  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2672  citrate synthase  53.93 
 
 
386 aa  438  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.530506  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2628  citrate synthase  54.81 
 
 
387 aa  434  1e-120  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0350  citrate synthase  52.74 
 
 
391 aa  431  1e-119  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1202  Citrate (Si)-synthase  49.59 
 
 
375 aa  400  9.999999999999999e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000138488  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1467  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  50.53 
 
 
385 aa  368  1e-100  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0316751  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0895  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  48.11 
 
 
430 aa  343  4e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1526  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  44.05 
 
 
390 aa  340  2.9999999999999998e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.682888  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0306  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  45.55 
 
 
397 aa  335  7.999999999999999e-91  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.772555 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0781  citrate synthase  46.09 
 
 
372 aa  333  2e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2679  citrate synthase  45.55 
 
 
372 aa  329  4e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0198833  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1621  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  44.2 
 
 
379 aa  328  8e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285346  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0534  citrate synthase  45.82 
 
 
382 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0555246 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4725  citrate synthase  45.55 
 
 
371 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4488  citrate synthase  45.55 
 
 
371 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4323  citrate synthase  45.55 
 
 
371 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4335  citrate synthase  45.55 
 
 
371 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4720  citrate synthase  45.55 
 
 
382 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4839  citrate synthase  45.55 
 
 
371 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0723  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  44.01 
 
 
382 aa  321  9.999999999999999e-87  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.517524  normal  0.584309 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4709  citrate synthase  45.55 
 
 
382 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000257504 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4704  citrate synthase  45.55 
 
 
382 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1088  citrate synthase I  42.56 
 
 
443 aa  317  3e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.864155  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4424  citrate synthase  44.47 
 
 
371 aa  315  8e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1676  citrate synthase  44.16 
 
 
445 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308594  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0888  citrate synthase  42.56 
 
 
447 aa  313  3.9999999999999997e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.631219  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3278  citrate synthase  44.47 
 
 
386 aa  312  4.999999999999999e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.312589  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1726  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.67 
 
 
380 aa  311  1e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2221  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.51 
 
 
377 aa  311  1e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57744  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1301  Citrate (Si)-synthase  41.34 
 
 
431 aa  311  1e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.115082  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0083  citrate synthase  42.3 
 
 
455 aa  310  2e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2417  citrate synthase I  43.01 
 
 
447 aa  310  4e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2224  citrate synthase I  41.86 
 
 
425 aa  309  5.9999999999999995e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0837  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.93 
 
 
378 aa  308  1.0000000000000001e-82  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.531649  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1258  citrate synthase  42.06 
 
 
373 aa  306  5.0000000000000004e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02359  type II citrate synthase  42.23 
 
 
442 aa  305  6e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2068  citrate synthase I  41.78 
 
 
450 aa  305  9.000000000000001e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.355535  normal  0.380729 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1522  citrate synthase  42.78 
 
 
370 aa  305  1.0000000000000001e-81  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.640515  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2042  citrate synthase I  42.82 
 
 
447 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1572  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.78 
 
 
380 aa  304  2.0000000000000002e-81  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3738  citrate synthase I  42.38 
 
 
428 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.680995  normal  0.033422 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1252  Citrate (Si)-synthase  42.97 
 
 
373 aa  304  2.0000000000000002e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2234  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.59 
 
 
409 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.709963 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1063  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.15 
 
 
393 aa  303  5.000000000000001e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0563  citrate synthase  43.26 
 
 
412 aa  302  5.000000000000001e-81  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1523  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.08 
 
 
379 aa  302  8.000000000000001e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.297697  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7227  citrate synthase I  41.25 
 
 
455 aa  301  1e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2843  type II citrate synthase  39.95 
 
 
434 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.433784  normal  0.36225 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1409  citrate synthase I  41.09 
 
 
429 aa  301  1e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.423182 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1187  citrate synthase  40.83 
 
 
431 aa  300  2e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0336  citrate synthase I  42.04 
 
 
447 aa  300  2e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000388875  normal  0.187011 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0995  citrate synthase I  40.41 
 
 
434 aa  300  2e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.655069 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1476  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.6 
 
 
382 aa  301  2e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.644774  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3036  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.45 
 
 
382 aa  300  2e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1870  citrate synthase I  41.78 
 
 
448 aa  300  2e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.859731 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3488  citrate synthase I  41.86 
 
 
428 aa  300  3e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0058  citrate synthase I  40.31 
 
 
432 aa  300  4e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00358332  normal  0.0142462 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01350  type II citrate synthase  39.38 
 
 
429 aa  299  5e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1835  citrate synthase I  43.31 
 
 
422 aa  299  6e-80  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0317  citrate synthase I  42.12 
 
 
447 aa  299  6e-80  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0072  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.33 
 
 
372 aa  299  6e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1245  citrate synthase  41.49 
 
 
374 aa  299  6e-80  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2105  citrate (Si)-synthase  42.05 
 
 
397 aa  299  6e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.414267  normal  0.0115455 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0581  citrate synthase I  41.86 
 
 
428 aa  298  7e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.178688 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5205  type II citrate synthase  40.31 
 
 
433 aa  299  7e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.237518  normal  0.311757 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37633  predicted protein  40.26 
 
 
544 aa  298  8e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.506551  normal  0.0169313 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2083  citrate synthase  41.78 
 
 
447 aa  298  9e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.48822  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1752  citrate synthase  41.38 
 
 
373 aa  298  1e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.206255  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1731  citrate synthase I  40 
 
 
439 aa  298  1e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1786  citrate synthase  41.38 
 
 
373 aa  298  1e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2617  citrate synthase I  41.15 
 
 
436 aa  298  1e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.819839 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004117  citrate synthase (si)  39.12 
 
 
429 aa  297  2e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2450  type II citrate synthase  40.46 
 
 
434 aa  297  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.444525 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2023  citrate synthase I  40.56 
 
 
429 aa  298  2e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2007  citrate synthase I  40.26 
 
 
427 aa  296  3e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0100  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.02 
 
 
377 aa  296  3e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3253  type II citrate synthase  39.02 
 
 
434 aa  296  4e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0663  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.62 
 
 
373 aa  296  5e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.280152  normal  0.110027 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3584  citrate synthase I  40.87 
 
 
425 aa  296  6e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00887444 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1099  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.12 
 
 
387 aa  295  9e-79  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2508  type II citrate synthase  40.48 
 
 
436 aa  293  2e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.636436  normal  0.21976 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>