More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0663 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0663  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  100 
 
 		 373 aa  764    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.280152  normal  0.110027 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1252  Citrate (Si)-synthase  82.84 
 
 		 373 aa  641    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2221  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  52.45 
 
 		 377 aa  387  1e-106  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57744  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2276  citrate synthase  50.28 
 
 		 380 aa  357  1.9999999999999998e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0837  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  47.09 
 
 		 378 aa  343  2e-93  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.531649  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2679  citrate synthase  46.76 
 
 		 372 aa  341  1e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0198833  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0781  citrate synthase  48.66 
 
 		 372 aa  341  1e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1189  Citrate (Si)-synthase  45.99 
 
 		 395 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1467  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.28 
 
 		 385 aa  327  2.0000000000000001e-88  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0316751  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0895  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  45.41 
 
 		 430 aa  327  2.0000000000000001e-88  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1523  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  44.85 
 
 		 379 aa  324  1e-87  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.297697  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1245  citrate synthase  44.3 
 
 		 374 aa  324  2e-87  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0534  citrate synthase  46.11 
 
 		 382 aa  323  4e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0555246 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0723  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.86 
 
 		 382 aa  322  5e-87  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.517524  normal  0.584309 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4704  citrate synthase  45.84 
 
 		 382 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4488  citrate synthase  45.84 
 
 		 371 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4323  citrate synthase  45.84 
 
 		 371 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4335  citrate synthase  45.84 
 
 		 371 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4720  citrate synthase  45.84 
 
 		 382 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4709  citrate synthase  45.84 
 
 		 382 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000257504 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4839  citrate synthase  45.84 
 
 		 371 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4424  citrate synthase  45.58 
 
 		 371 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3278  citrate synthase  45.26 
 
 		 386 aa  320  3e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.312589  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4725  citrate synthase  45.84 
 
 		 371 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1786  citrate synthase  44.17 
 
 		 373 aa  319  5e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1752  citrate synthase  44.17 
 
 		 373 aa  319  5e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.206255  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1476  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.6 
 
 		 382 aa  319  6e-86  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.644774  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1572  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  47.43 
 
 		 380 aa  318  7.999999999999999e-86  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3036  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.6 
 
 		 382 aa  318  1e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1258  citrate synthase  43.63 
 
 		 373 aa  316  5e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1522  citrate synthase  42.2 
 
 		 370 aa  311  1e-83  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.640515  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0072  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  45.24 
 
 		 372 aa  310  2e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0820  2-methylcitrate synthase  43.09 
 
 		 372 aa  310  4e-83  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1176  2-methylcitrate synthase  43.09 
 
 		 372 aa  310  4e-83  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.831059  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1071  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  45.65 
 
 		 373 aa  308  6.999999999999999e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.66322  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1665  methylcitrate synthase  43.09 
 
 		 377 aa  308  8e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1496  2-methylcitrate synthase  43.9 
 
 		 372 aa  308  1.0000000000000001e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1765  methylcitrate synthase  41.85 
 
 		 375 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.924616  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1487  2-methylcitrate synthase  43.82 
 
 		 372 aa  306  3e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1408  citrate synthase  42.97 
 
 		 386 aa  304  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1377  citrate synthase  42.97 
 
 		 386 aa  304  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4723  methylcitrate synthase  42.12 
 
 		 375 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1063  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.41 
 
 		 393 aa  303  4.0000000000000003e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1776  methylcitrate synthase  41.85 
 
 		 375 aa  302  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.549839  hitchhiker  0.000461346 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53950  methylcitrate synthase  41.85 
 
 		 375 aa  302  5.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.282102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2086  methylcitrate synthase  41.85 
 
 		 375 aa  301  1e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.440425  hitchhiker  0.00454661 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2498  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.66 
 
 		 374 aa  301  1e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0246552 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1936  methylcitrate synthase  41.85 
 
 		 375 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.686847  hitchhiker  0.000000858753 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4089  citrate synthase  43.24 
 
 		 389 aa  300  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2335  methylcitrate synthase  41.58 
 
 		 375 aa  299  5e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218689  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2112  2-methylcitrate synthase  42.39 
 
 		 374 aa  299  5e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3435  methylcitrate synthase  41.58 
 
 		 375 aa  299  5e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.01089  normal  0.171025 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0100  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.75 
 
 		 377 aa  299  6e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1821  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.85 
 
 		 374 aa  298  1e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2288  2-methylcitrate synthase  42.28 
 
 		 375 aa  298  1e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.037213  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0404  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.16 
 
 		 378 aa  298  1e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1198  methylcitrate synthase  42.66 
 
 		 376 aa  298  1e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02396  methylcitrate synthase  42.55 
 
 		 380 aa  296  4e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2420  2-methylcitrate synthase  40.58 
 
 		 375 aa  296  4e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0822163  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2713  citrate synthase  41.62 
 
 		 378 aa  296  5e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1420  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.3 
 
 		 374 aa  296  5e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0344  methylcitrate synthase  42.93 
 
 		 375 aa  296  6e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1665  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.85 
 
 		 374 aa  296  6e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3630  methylcitrate synthase  42.93 
 
 		 375 aa  296  6e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0314  methylcitrate synthase  42.93 
 
 		 375 aa  295  6e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2604  2-methylcitrate synthase  41.3 
 
 		 374 aa  295  7e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.121252  hitchhiker  0.000290432 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3946  methylcitrate synthase  42.39 
 
 		 375 aa  294  1e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4048  methylcitrate synthase  42.39 
 
 		 375 aa  295  1e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4022  methylcitrate synthase  42.39 
 
 		 375 aa  294  1e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4141  methylcitrate synthase  42.39 
 
 		 379 aa  295  1e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3826  methylcitrate synthase  42.66 
 
 		 375 aa  295  1e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0306  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.63 
 
 		 397 aa  294  2e-78  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.772555 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3645  methylcitrate synthase  42.39 
 
 		 375 aa  294  2e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003389  2-methylcitrate synthase  42.55 
 
 		 380 aa  293  3e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2321  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.03 
 
 		 384 aa  292  5e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0953  methylcitrate synthase  42.82 
 
 		 377 aa  292  8e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1099  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.01 
 
 		 387 aa  291  1e-77  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3295  methylcitrate synthase  42.39 
 
 		 378 aa  291  2e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.11596 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0924  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.89 
 
 		 379 aa  290  3e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1858  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.03 
 
 		 374 aa  289  4e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03371  methylcitrate synthase  41.62 
 
 		 373 aa  287  2e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1580  citrate synthase  41.82 
 
 		 383 aa  287  2e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2821  putative 2-methylcitrate synthase  41.58 
 
 		 374 aa  286  4e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.702751  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2031  citrate (Si)-synthase  43.16 
 
 		 473 aa  286  4e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602388  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1726  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.18 
 
 		 380 aa  286  4e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1202  Citrate (Si)-synthase  38.8 
 
 		 375 aa  285  5.999999999999999e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000138488  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2413  citrate synthase  41.62 
 
 		 397 aa  286  5.999999999999999e-76  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0279  citrate synthase  42.16 
 
 		 396 aa  285  9e-76  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0154  citrate synthase  43.28 
 
 		 374 aa  285  9e-76  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.649155 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1868  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.03 
 
 		 376 aa  285  1.0000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.650369  normal  0.135048 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1528  citrate synthase  40 
 
 		 375 aa  283  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0349986  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1035  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.47 
 
 		 375 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2105  citrate (Si)-synthase  43.01 
 
 		 397 aa  281  9e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.414267  normal  0.0115455 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1111  methylcitrate synthase  41.57 
 
 		 379 aa  281  1e-74  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.468935 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02341  citrate synthase  39.73 
 
 		 375 aa  281  1e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1526  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.49 
 
 		 390 aa  280  2e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.682888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0621  methylcitrate synthase  40.69 
 
 		 383 aa  280  2e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01781  citrate synthase  40.59 
 
 		 378 aa  279  6e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.176216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1665  citrate synthase  41.35 
 
 		 378 aa  279  6e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1310  methylcitrate synthase  40.45 
 
 		 375 aa  278  1e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>