More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1528 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009976  P9211_01781  citrate synthase  81.33 
 
 		 378 aa  654    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.176216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02341  citrate synthase  99.47 
 
 		 375 aa  769    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1528  citrate synthase  100 
 
 		 375 aa  773    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0349986  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0279  citrate synthase  78.82 
 
 		 396 aa  642    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2413  citrate synthase  79.09 
 
 		 397 aa  642    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0163  citrate synthase  80.27 
 
 		 381 aa  644    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.292022  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01811  citrate synthase  80.8 
 
 		 381 aa  648    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01901  citrate synthase  81.33 
 
 		 381 aa  649    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26921  citrate synthase  80.97 
 
 		 396 aa  635    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01791  citrate synthase  80.27 
 
 		 381 aa  643    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2713  citrate synthase  68.28 
 
 		 378 aa  555  1e-157  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1665  citrate synthase  70.16 
 
 		 378 aa  555  1e-157  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0612  citrate synthase  70.24 
 
 		 386 aa  551  1e-156  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.148892  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0404  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  68.82 
 
 		 378 aa  549  1e-155  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4089  citrate synthase  68.28 
 
 		 389 aa  546  1e-154  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1408  citrate synthase  67.39 
 
 		 386 aa  545  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1377  citrate synthase  67.39 
 
 		 386 aa  545  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1580  citrate synthase  68.1 
 
 		 383 aa  544  1e-153  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2141  Citrate (Si)-synthase  55 
 
 		 389 aa  439  9.999999999999999e-123  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.636674  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2628  citrate synthase  53.42 
 
 		 387 aa  422  1e-117  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2672  citrate synthase  51.06 
 
 		 386 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.530506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3065  citrate synthase  51.06 
 
 		 386 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0350  citrate synthase  49.47 
 
 		 391 aa  391  1e-108  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1202  Citrate (Si)-synthase  47.54 
 
 		 375 aa  389  1e-107  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000138488  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1467  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  48.11 
 
 		 385 aa  352  5e-96  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0316751  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1526  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.8 
 
 		 390 aa  333  4e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.682888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0781  citrate synthase  45.21 
 
 		 372 aa  328  9e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2679  citrate synthase  45.48 
 
 		 372 aa  326  3e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0198833  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1621  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.67 
 
 		 379 aa  325  5e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285346  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2221  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  44.27 
 
 		 377 aa  324  2e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57744  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0895  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  45.19 
 
 		 430 aa  318  9e-86  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4488  citrate synthase  44.41 
 
 		 371 aa  316  3e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4839  citrate synthase  44.41 
 
 		 371 aa  316  3e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4720  citrate synthase  44.41 
 
 		 382 aa  316  3e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4709  citrate synthase  44.41 
 
 		 382 aa  316  3e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000257504 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4323  citrate synthase  44.41 
 
 		 371 aa  316  4e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4335  citrate synthase  44.41 
 
 		 371 aa  316  4e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4424  citrate synthase  44.15 
 
 		 371 aa  315  6e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0534  citrate synthase  44.41 
 
 		 382 aa  315  6e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0555246 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4725  citrate synthase  44.15 
 
 		 371 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4704  citrate synthase  44.15 
 
 		 382 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0723  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  44.74 
 
 		 382 aa  310  2e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.517524  normal  0.584309 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1726  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.13 
 
 		 380 aa  310  2.9999999999999997e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1258  citrate synthase  41.98 
 
 		 373 aa  308  1.0000000000000001e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3278  citrate synthase  43.09 
 
 		 386 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.312589  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3036  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  44.47 
 
 		 382 aa  303  3.0000000000000004e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0837  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.68 
 
 		 378 aa  301  1e-80  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.531649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1476  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  44.36 
 
 		 382 aa  300  4e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.644774  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02359  type II citrate synthase  43.6 
 
 		 442 aa  300  4e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1522  citrate synthase  40 
 
 		 370 aa  297  2e-79  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.640515  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1786  citrate synthase  40.91 
 
 		 373 aa  297  2e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1752  citrate synthase  40.91 
 
 		 373 aa  297  2e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.206255  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1731  citrate synthase I  40.46 
 
 		 439 aa  296  5e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1523  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.12 
 
 		 379 aa  292  6e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.297697  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1187  citrate synthase  40.41 
 
 		 431 aa  291  1e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1245  citrate synthase  41.29 
 
 		 374 aa  291  1e-77  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0154  citrate synthase  41.49 
 
 		 374 aa  290  2e-77  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.649155 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2068  citrate synthase I  41.45 
 
 		 450 aa  290  3e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.355535  normal  0.380729 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1132  citrate synthase  39.22 
 
 		 431 aa  290  3e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2251  citrate synthase I  41.67 
 
 		 434 aa  290  4e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1134  type II citrate synthase  40.26 
 
 		 432 aa  290  4e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.066915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1088  citrate synthase I  39.48 
 
 		 443 aa  289  6e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.864155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1149  citrate synthase I  40.21 
 
 		 424 aa  288  8e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29820  type II citrate synthase  38.96 
 
 		 427 aa  288  1e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2320  type II citrate synthase  41.56 
 
 		 433 aa  288  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2234  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  39.64 
 
 		 409 aa  288  1e-76  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.709963 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2147  type II citrate synthase  39.48 
 
 		 433 aa  288  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.787035  normal  0.703076 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3589  type II citrate synthase  39.48 
 
 		 433 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0248785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3832  type II citrate synthase  39.22 
 
 		 433 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.418606 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1252  Citrate (Si)-synthase  41.11 
 
 		 373 aa  288  1e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3694  type II citrate synthase  39.43 
 
 		 428 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1301  Citrate (Si)-synthase  39.48 
 
 		 431 aa  288  1e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.115082  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4428  type II citrate synthase  39.48 
 
 		 433 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3316  type II citrate synthase  39.22 
 
 		 433 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.229262  normal  0.697255 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3939  type II citrate synthase  39.48 
 
 		 433 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2787  citrate synthase I  38.6 
 
 		 426 aa  288  1e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.420339  normal  0.059507 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0100  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  40.48 
 
 		 377 aa  287  2e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0306  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  38.01 
 
 		 397 aa  287  2e-76  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.772555 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6851  type II citrate synthase  39.74 
 
 		 433 aa  287  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.622921 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2752  citrate synthase  42.71 
 
 		 432 aa  287  2e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.816634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4366  type II citrate synthase  39.48 
 
 		 433 aa  288  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5205  type II citrate synthase  40 
 
 		 433 aa  287  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.237518  normal  0.311757 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0061  citrate synthase  39.38 
 
 		 430 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0890712  normal  0.301769 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44070  type II citrate synthase  39.43 
 
 		 428 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0504  type II citrate synthase  39.22 
 
 		 433 aa  286  4e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.405584  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1744  type II citrate synthase  39.22 
 
 		 433 aa  286  4e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.676143  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0788  type II citrate synthase  39.22 
 
 		 433 aa  286  4e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0858919  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1626  type II citrate synthase  39.22 
 
 		 433 aa  286  4e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00616613  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1676  citrate synthase  40.93 
 
 		 445 aa  286  4e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308594  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1834  type II citrate synthase  39.22 
 
 		 433 aa  286  4e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0219356  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2467  type II citrate synthase  39.22 
 
 		 433 aa  286  4e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00536833  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2329  type II citrate synthase  39.22 
 
 		 433 aa  286  4e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4643  type II citrate synthase  39.48 
 
 		 433 aa  286  5e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2890  type II citrate synthase  39.48 
 
 		 433 aa  286  5e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1609  type II citrate synthase  38.8 
 
 		 429 aa  285  7e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.706948  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0665  type II citrate synthase  39.22 
 
 		 433 aa  285  7e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.170997  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2481  type II citrate synthase  41.04 
 
 		 433 aa  285  9e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523496  normal  0.0627534 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1130  citrate synthase I  39.85 
 
 		 431 aa  285  1.0000000000000001e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.684999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5525  type II citrate synthase  40 
 
 		 432 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.615237  normal  0.487627 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37633  predicted protein  38.29 
 
 		 544 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.506551  normal  0.0169313 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>