More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1726 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1726  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  100 
 
 
380 aa  781    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1621  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  72.22 
 
 
379 aa  575  1.0000000000000001e-163  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285346  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1526  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  55 
 
 
390 aa  418  1e-116  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.682888  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2221  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  47.77 
 
 
377 aa  357  1.9999999999999998e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57744  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1467  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  46.54 
 
 
385 aa  350  2e-95  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0316751  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0306  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  46.13 
 
 
397 aa  340  2.9999999999999998e-92  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.772555 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0895  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  46.65 
 
 
430 aa  333  3e-90  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1522  citrate synthase  43.09 
 
 
370 aa  330  2e-89  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.640515  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0781  citrate synthase  48.28 
 
 
372 aa  322  5e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0100  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.89 
 
 
377 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2679  citrate synthase  46.42 
 
 
372 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0198833  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4704  citrate synthase  45.77 
 
 
382 aa  316  4e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0534  citrate synthase  45.77 
 
 
382 aa  316  4e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0555246 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4424  citrate synthase  45.62 
 
 
371 aa  315  6e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4488  citrate synthase  45.62 
 
 
371 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4839  citrate synthase  45.62 
 
 
371 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3278  citrate synthase  45.65 
 
 
386 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.312589  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01781  citrate synthase  43.67 
 
 
378 aa  314  1.9999999999999998e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.176216  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0837  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  44.18 
 
 
378 aa  314  1.9999999999999998e-84  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.531649  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0404  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.13 
 
 
378 aa  313  1.9999999999999998e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0723  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  44.91 
 
 
382 aa  313  1.9999999999999998e-84  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.517524  normal  0.584309 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4323  citrate synthase  45.36 
 
 
371 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4335  citrate synthase  45.36 
 
 
371 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4720  citrate synthase  45.24 
 
 
382 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4709  citrate synthase  45.24 
 
 
382 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000257504 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1377  citrate synthase  43.4 
 
 
386 aa  313  4.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1408  citrate synthase  43.4 
 
 
386 aa  313  4.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4725  citrate synthase  45.36 
 
 
371 aa  312  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2713  citrate synthase  43.67 
 
 
378 aa  311  1e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1528  citrate synthase  43.13 
 
 
375 aa  310  2.9999999999999997e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0349986  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02341  citrate synthase  42.86 
 
 
375 aa  308  9e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2413  citrate synthase  42.32 
 
 
397 aa  308  1.0000000000000001e-82  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4089  citrate synthase  42.89 
 
 
389 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1258  citrate synthase  42.93 
 
 
373 aa  307  2.0000000000000002e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0622  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.78 
 
 
367 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0115525  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0279  citrate synthase  43.13 
 
 
396 aa  307  2.0000000000000002e-82  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0647  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.78 
 
 
367 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.029125  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26921  citrate synthase  44.47 
 
 
396 aa  307  3e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1523  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.48 
 
 
379 aa  306  3e-82  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.297697  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1752  citrate synthase  44.53 
 
 
373 aa  306  4.0000000000000004e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.206255  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01811  citrate synthase  43.4 
 
 
381 aa  306  4.0000000000000004e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1786  citrate synthase  44.53 
 
 
373 aa  306  4.0000000000000004e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2276  citrate synthase  44.59 
 
 
380 aa  306  5.0000000000000004e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01901  citrate synthase  43.94 
 
 
381 aa  305  8.000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0350  citrate synthase  42.63 
 
 
391 aa  305  9.000000000000001e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2234  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.97 
 
 
409 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.709963 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0163  citrate synthase  43.13 
 
 
381 aa  303  2.0000000000000002e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.292022  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01791  citrate synthase  43.13 
 
 
381 aa  304  2.0000000000000002e-81  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1572  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  45.41 
 
 
380 aa  303  3.0000000000000004e-81  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3036  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  44.36 
 
 
382 aa  303  4.0000000000000003e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1035  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  44.35 
 
 
375 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2105  citrate (Si)-synthase  40.41 
 
 
397 aa  302  6.000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.414267  normal  0.0115455 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0612  citrate synthase  43.42 
 
 
386 aa  302  7.000000000000001e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.148892  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0281  citrate synthase  41.76 
 
 
378 aa  301  1e-80  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.160338  normal  0.143922 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2672  citrate synthase  44.09 
 
 
386 aa  300  3e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.530506  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3065  citrate synthase  44.09 
 
 
386 aa  300  3e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0713  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  44.39 
 
 
404 aa  300  3e-80  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.756288  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0563  citrate synthase  42.6 
 
 
412 aa  300  4e-80  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1580  citrate synthase  43.13 
 
 
383 aa  300  4e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1252  Citrate (Si)-synthase  43.82 
 
 
373 aa  299  5e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2031  citrate (Si)-synthase  45.19 
 
 
473 aa  297  2e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602388  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1476  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.23 
 
 
382 aa  296  3e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.644774  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1202  Citrate (Si)-synthase  42.01 
 
 
375 aa  296  5e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000138488  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1692  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  44.13 
 
 
409 aa  296  5e-79  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.141022  normal  0.100865 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0398  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.32 
 
 
377 aa  294  2e-78  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0419831  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1099  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.67 
 
 
387 aa  294  2e-78  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1189  Citrate (Si)-synthase  41.16 
 
 
395 aa  292  5e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0154  citrate synthase  42.74 
 
 
374 aa  290  3e-77  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.649155 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0663  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.18 
 
 
373 aa  286  5e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.280152  normal  0.110027 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0574  citrate synthase  42.47 
 
 
378 aa  286  5e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1063  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  39.79 
 
 
393 aa  285  7e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2141  Citrate (Si)-synthase  41.58 
 
 
389 aa  284  1.0000000000000001e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.636674  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1665  citrate synthase  42.86 
 
 
378 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2628  citrate synthase  43.68 
 
 
387 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0072  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  40.21 
 
 
372 aa  280  2e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1245  citrate synthase  43.42 
 
 
374 aa  280  2e-74  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1658  citrate synthase  40.6 
 
 
373 aa  278  1e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.617148  normal  0.567466 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2498  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  38.46 
 
 
374 aa  276  4e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0246552 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1665  methylcitrate synthase  40.48 
 
 
377 aa  276  4e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11154  citrate synthase  41.64 
 
 
393 aa  276  4e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1420  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  38.19 
 
 
374 aa  273  3e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1533  citrate (Si)-synthase  38.86 
 
 
396 aa  273  3e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1821  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  38.46 
 
 
374 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53950  methylcitrate synthase  37.73 
 
 
375 aa  271  1e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.282102  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2604  2-methylcitrate synthase  38.46 
 
 
374 aa  270  2e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.121252  hitchhiker  0.000290432 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4723  methylcitrate synthase  37.47 
 
 
375 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1665  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  38.19 
 
 
374 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1936  methylcitrate synthase  37.47 
 
 
375 aa  270  4e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.686847  hitchhiker  0.000000858753 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1071  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  38.74 
 
 
373 aa  269  5e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.66322  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1776  methylcitrate synthase  37.47 
 
 
375 aa  270  5e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.549839  hitchhiker  0.000461346 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14160  citrate synthase  41.05 
 
 
381 aa  269  5e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1858  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  38.46 
 
 
374 aa  268  8e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2821  putative 2-methylcitrate synthase  37.91 
 
 
374 aa  268  8.999999999999999e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.702751  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2112  2-methylcitrate synthase  37.64 
 
 
374 aa  268  1e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2335  methylcitrate synthase  37.2 
 
 
375 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218689  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4756  methylcitrate synthase  38.27 
 
 
390 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.394349  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5345  methylcitrate synthase  38.27 
 
 
390 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.417928  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3435  methylcitrate synthase  37.2 
 
 
375 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.01089  normal  0.171025 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5516  methylcitrate synthase  38.27 
 
 
390 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0272926  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1523  citrate synthase  40.86 
 
 
379 aa  268  2e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000149405 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>