More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_2141 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_2141  Citrate (Si)-synthase  100 
 
 		 389 aa  809    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.636674  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2628  citrate synthase  60.73 
 
 		 387 aa  489  1e-137  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2672  citrate synthase  58.9 
 
 		 386 aa  486  1e-136  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.530506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3065  citrate synthase  58.9 
 
 		 386 aa  486  1e-136  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0350  citrate synthase  58.33 
 
 		 391 aa  479  1e-134  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2413  citrate synthase  57.63 
 
 		 397 aa  452  1.0000000000000001e-126  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1408  citrate synthase  57.33 
 
 		 386 aa  449  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1377  citrate synthase  57.33 
 
 		 386 aa  449  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2713  citrate synthase  56.02 
 
 		 378 aa  445  1.0000000000000001e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0279  citrate synthase  57.11 
 
 		 396 aa  446  1.0000000000000001e-124  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0612  citrate synthase  59.16 
 
 		 386 aa  444  1e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.148892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1580  citrate synthase  56.3 
 
 		 383 aa  443  1e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26921  citrate synthase  56.7 
 
 		 396 aa  440  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1528  citrate synthase  55 
 
 		 375 aa  439  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0349986  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02341  citrate synthase  54.74 
 
 		 375 aa  437  1e-121  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1665  citrate synthase  56.02 
 
 		 378 aa  436  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01781  citrate synthase  54.74 
 
 		 378 aa  428  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.176216  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0404  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  54.71 
 
 		 378 aa  431  1e-119  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4089  citrate synthase  54.45 
 
 		 389 aa  428  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01901  citrate synthase  54.74 
 
 		 381 aa  425  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01791  citrate synthase  53.98 
 
 		 381 aa  426  1e-118  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0163  citrate synthase  53.47 
 
 		 381 aa  424  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.292022  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01811  citrate synthase  53.73 
 
 		 381 aa  424  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1202  Citrate (Si)-synthase  45.21 
 
 		 375 aa  363  4e-99  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000138488  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1467  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  44.5 
 
 		 385 aa  331  1e-89  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0316751  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1526  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.74 
 
 		 390 aa  320  1.9999999999999998e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.682888  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1621  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.37 
 
 		 379 aa  301  2e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285346  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0723  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  44.27 
 
 		 382 aa  300  3e-80  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.517524  normal  0.584309 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1258  citrate synthase  42.45 
 
 		 373 aa  292  8e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2221  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.27 
 
 		 377 aa  290  2e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57744  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0895  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.27 
 
 		 430 aa  290  3e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0781  citrate synthase  42.11 
 
 		 372 aa  289  7e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1726  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.58 
 
 		 380 aa  284  1.0000000000000001e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0837  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.57 
 
 		 378 aa  284  1.0000000000000001e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.531649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3036  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.01 
 
 		 382 aa  283  3.0000000000000004e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1523  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.41 
 
 		 379 aa  280  4e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.297697  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1676  citrate synthase  40.15 
 
 		 445 aa  280  4e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308594  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4488  citrate synthase  41.62 
 
 		 371 aa  279  6e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4709  citrate synthase  41.62 
 
 		 382 aa  279  6e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000257504 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4839  citrate synthase  41.62 
 
 		 371 aa  279  6e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4720  citrate synthase  41.62 
 
 		 382 aa  279  6e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1476  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.56 
 
 		 382 aa  279  6e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.644774  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4323  citrate synthase  41.62 
 
 		 371 aa  278  8e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4335  citrate synthase  41.62 
 
 		 371 aa  278  8e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4424  citrate synthase  41.75 
 
 		 371 aa  278  8e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37633  predicted protein  39.54 
 
 		 544 aa  279  8e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.506551  normal  0.0169313 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1752  citrate synthase  41.15 
 
 		 373 aa  278  1e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.206255  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1786  citrate synthase  41.15 
 
 		 373 aa  278  1e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4704  citrate synthase  41.62 
 
 		 382 aa  278  1e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0534  citrate synthase  41.75 
 
 		 382 aa  277  2e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0555246 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4725  citrate synthase  41.62 
 
 		 371 aa  277  3e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2679  citrate synthase  40.79 
 
 		 372 aa  276  3e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0198833  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0072  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  40.67 
 
 		 372 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2068  citrate synthase I  39.29 
 
 		 450 aa  273  5.000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.355535  normal  0.380729 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1522  citrate synthase  37.47 
 
 		 370 aa  272  9e-72  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.640515  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3278  citrate synthase  41.1 
 
 		 386 aa  272  9e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.312589  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004117  citrate synthase (si)  39.35 
 
 		 429 aa  270  2e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0841  type II citrate synthase  39.1 
 
 		 429 aa  270  2.9999999999999997e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1366  citrate synthase  39.27 
 
 		 423 aa  270  4e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1088  citrate synthase I  38.62 
 
 		 443 aa  270  4e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.864155  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1370  citrate synthase  39.27 
 
 		 423 aa  269  5e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0336  citrate synthase I  39.03 
 
 		 447 aa  269  5e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000388875  normal  0.187011 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1275  citrate synthase  40.4 
 
 		 427 aa  269  5e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.152797  normal  0.229785 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0554  citrate synthase I  40.15 
 
 		 428 aa  268  1e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.488876  normal  0.835408 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1063  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  39.85 
 
 		 393 aa  268  2e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1870  citrate synthase I  38.27 
 
 		 448 aa  268  2e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.859731 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1301  Citrate (Si)-synthase  37.47 
 
 		 431 aa  268  2e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.115082  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01350  type II citrate synthase  38.85 
 
 		 429 aa  268  2e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1245  citrate synthase  38.92 
 
 		 374 aa  267  2e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29820  type II citrate synthase  38.52 
 
 		 427 aa  268  2e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1609  type II citrate synthase  37.5 
 
 		 429 aa  266  5e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.706948  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1252  Citrate (Si)-synthase  40.63 
 
 		 373 aa  266  5e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0306  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  37.96 
 
 		 397 aa  265  8e-70  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.772555 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1678  type II citrate synthase  38.75 
 
 		 431 aa  265  1e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0407476  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2083  citrate synthase  39.03 
 
 		 447 aa  265  1e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.48822  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1149  citrate synthase I  38.93 
 
 		 424 aa  264  2e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0083  citrate synthase  38.36 
 
 		 455 aa  265  2e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7227  citrate synthase I  38.52 
 
 		 455 aa  264  2e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2417  citrate synthase I  38.27 
 
 		 447 aa  264  2e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5036  citrate synthase I  39.4 
 
 		 428 aa  263  3e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0058  citrate synthase I  38.32 
 
 		 432 aa  263  3e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00358332  normal  0.0142462 
 
 
-
 
NC_004310  BR1148  type II citrate synthase  37.31 
 
 		 430 aa  263  4e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0317  citrate synthase I  38.87 
 
 		 447 aa  263  4e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02359  type II citrate synthase  38.93 
 
 		 442 aa  263  4e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2805  citrate synthase I  37.56 
 
 		 427 aa  263  4.999999999999999e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.359876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1106  type II citrate synthase  37.31 
 
 		 435 aa  263  4.999999999999999e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2031  citrate (Si)-synthase  39.31 
 
 		 473 aa  261  1e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602388  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0787  type II citrate synthase  39.64 
 
 		 429 aa  261  1e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0097  citrate synthase  38.62 
 
 		 426 aa  261  1e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0802276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1600  citrate synthase  37.88 
 
 		 433 aa  261  1e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2224  citrate synthase I  37.5 
 
 		 425 aa  261  2e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2508  type II citrate synthase  38.28 
 
 		 436 aa  261  2e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.636436  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0106  citrate synthase I  38.62 
 
 		 426 aa  261  2e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0586  citrate synthase  37.85 
 
 		 430 aa  260  2e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0874  type II citrate synthase  39.64 
 
 		 429 aa  261  2e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0015368  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6851  type II citrate synthase  37.91 
 
 		 433 aa  261  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.622921 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4194  type II citrate synthase  36.99 
 
 		 429 aa  260  3e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0867349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1596  type II citrate synthase  38.83 
 
 		 429 aa  260  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.218131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1660  type II citrate synthase  36.99 
 
 		 429 aa  260  3e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1731  citrate synthase I  38.83 
 
 		 439 aa  260  3e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>