More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0713 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_0713  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  100 
 
 		 404 aa  822    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.756288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2234  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  75.81 
 
 		 409 aa  654    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.709963 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1692  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  75.06 
 
 		 409 aa  644    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.141022  normal  0.100865 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0563  citrate synthase  72.75 
 
 		 412 aa  632  1e-180  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0306  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  56.72 
 
 		 397 aa  460  9.999999999999999e-129  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.772555 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1523  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  45.27 
 
 		 379 aa  319  6e-86  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.297697  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1467  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  45.13 
 
 		 385 aa  318  1e-85  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0316751  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2221  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  45.22 
 
 		 377 aa  317  3e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57744  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1522  citrate synthase  44.87 
 
 		 370 aa  313  2.9999999999999996e-84  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.640515  normal  0.251629 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0398  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  44.27 
 
 		 377 aa  311  1e-83  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0419831  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2679  citrate synthase  44.25 
 
 		 372 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0198833  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0781  citrate synthase  43.73 
 
 		 372 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0895  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.01 
 
 		 430 aa  303  5.000000000000001e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1476  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.18 
 
 		 382 aa  302  8.000000000000001e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.644774  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1726  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  44.39 
 
 		 380 aa  300  3e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0837  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.16 
 
 		 378 aa  299  5e-80  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.531649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3036  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.07 
 
 		 382 aa  298  9e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0723  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.03 
 
 		 382 aa  297  2e-79  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.517524  normal  0.584309 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0281  citrate synthase  43.62 
 
 		 378 aa  297  2e-79  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.160338  normal  0.143922 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1526  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.09 
 
 		 390 aa  293  3e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.682888  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1621  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.85 
 
 		 379 aa  292  7e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285346  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0622  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.42 
 
 		 367 aa  291  1e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0115525  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0647  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.42 
 
 		 367 aa  291  1e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.029125  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3278  citrate synthase  42.05 
 
 		 386 aa  289  6e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.312589  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2713  citrate synthase  42.64 
 
 		 378 aa  288  8e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1580  citrate synthase  42.14 
 
 		 383 aa  289  8e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0279  citrate synthase  40.15 
 
 		 396 aa  288  9e-77  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2413  citrate synthase  40.77 
 
 		 397 aa  288  9e-77  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01781  citrate synthase  40.05 
 
 		 378 aa  286  5e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.176216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0534  citrate synthase  41.54 
 
 		 382 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0555246 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4424  citrate synthase  41.54 
 
 		 371 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4704  citrate synthase  41.28 
 
 		 382 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0163  citrate synthase  39.9 
 
 		 381 aa  284  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.292022  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01811  citrate synthase  39.9 
 
 		 381 aa  283  3.0000000000000004e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02341  citrate synthase  40.16 
 
 		 375 aa  283  3.0000000000000004e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01791  citrate synthase  39.64 
 
 		 381 aa  283  5.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4725  citrate synthase  41.28 
 
 		 371 aa  282  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2276  citrate synthase  41.54 
 
 		 380 aa  283  6.000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4488  citrate synthase  41.03 
 
 		 371 aa  282  7.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4839  citrate synthase  41.03 
 
 		 371 aa  282  7.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1528  citrate synthase  39.9 
 
 		 375 aa  282  8.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0349986  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4089  citrate synthase  41.16 
 
 		 389 aa  282  8.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01901  citrate synthase  39.64 
 
 		 381 aa  282  8.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4323  citrate synthase  41.03 
 
 		 371 aa  282  9e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4335  citrate synthase  41.03 
 
 		 371 aa  282  9e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4709  citrate synthase  41.03 
 
 		 382 aa  281  1e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000257504 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4720  citrate synthase  41.03 
 
 		 382 aa  281  1e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1408  citrate synthase  41.45 
 
 		 386 aa  280  4e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1377  citrate synthase  41.45 
 
 		 386 aa  280  4e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0404  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.97 
 
 		 378 aa  278  1e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2628  citrate synthase  42.82 
 
 		 387 aa  278  1e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0663  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.31 
 
 		 373 aa  278  1e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.280152  normal  0.110027 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1786  citrate synthase  40.05 
 
 		 373 aa  276  5e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1752  citrate synthase  40.05 
 
 		 373 aa  276  5e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.206255  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1258  citrate synthase  39.95 
 
 		 373 aa  275  1.0000000000000001e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2224  citrate synthase I  40.24 
 
 		 425 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1088  citrate synthase I  42.45 
 
 		 443 aa  272  7e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.864155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1063  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  39.9 
 
 		 393 aa  271  1e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26921  citrate synthase  39.15 
 
 		 396 aa  271  2e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1676  citrate synthase  41.82 
 
 		 445 aa  271  2e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308594  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1189  Citrate (Si)-synthase  40.97 
 
 		 395 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0350  citrate synthase  38.72 
 
 		 391 aa  270  4e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0612  citrate synthase  41.67 
 
 		 386 aa  270  4e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.148892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3584  citrate synthase I  39.07 
 
 		 425 aa  270  5e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00887444 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1252  Citrate (Si)-synthase  40.16 
 
 		 373 aa  269  8e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1202  Citrate (Si)-synthase  38.8 
 
 		 375 aa  267  2.9999999999999995e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000138488  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5222  citrate synthase I  38.34 
 
 		 429 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.827577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1275  citrate synthase  40.05 
 
 		 427 aa  266  5.999999999999999e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.152797  normal  0.229785 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3065  citrate synthase  39.7 
 
 		 386 aa  265  7e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2672  citrate synthase  39.7 
 
 		 386 aa  265  7e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.530506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5145  citrate synthase I  38.08 
 
 		 429 aa  265  1e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.236177  normal  0.0251581 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0995  citrate synthase I  40.26 
 
 		 434 aa  264  2e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.655069 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4680  citrate synthase I  38.08 
 
 		 446 aa  264  2e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0888  citrate synthase  40.62 
 
 		 447 aa  262  8.999999999999999e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.631219  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1099  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  39.27 
 
 		 387 aa  261  1e-68  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0787  type II citrate synthase  40.84 
 
 		 429 aa  261  2e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2053  citrate synthase I  39.43 
 
 		 428 aa  261  2e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.655097  normal  0.0360596 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1245  citrate synthase  38.01 
 
 		 374 aa  261  2e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1176  2-methylcitrate synthase  40.31 
 
 		 372 aa  260  3e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.831059  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33600  citrate synthase  39.02 
 
 		 437 aa  260  3e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.522546 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004117  citrate synthase (si)  38.18 
 
 		 429 aa  260  3e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1301  Citrate (Si)-synthase  38.76 
 
 		 431 aa  260  3e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.115082  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0820  2-methylcitrate synthase  40.31 
 
 		 372 aa  260  3e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2251  citrate synthase I  40.16 
 
 		 434 aa  260  3e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2539  Citrate (Si)-synthase  40.41 
 
 		 374 aa  260  3e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.64966  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1570  citrate (Si)-synthase  37.82 
 
 		 430 aa  259  4e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00021591  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01870  Citrate synthase  38.22 
 
 		 425 aa  259  5.0000000000000005e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0072  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  39.34 
 
 		 372 aa  259  6e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0100  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  39.9 
 
 		 377 aa  259  6e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1665  citrate synthase  39.9 
 
 		 378 aa  259  7e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01350  type II citrate synthase  38.18 
 
 		 429 aa  259  7e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3630  methylcitrate synthase  37.73 
 
 		 375 aa  259  7e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2031  citrate (Si)-synthase  38.72 
 
 		 473 aa  259  9e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602388  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0586  citrate synthase  37.82 
 
 		 430 aa  258  1e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0874  type II citrate synthase  40.84 
 
 		 429 aa  258  1e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0015368  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1572  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  39.95 
 
 		 380 aa  258  1e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0314  methylcitrate synthase  37.73 
 
 		 375 aa  258  1e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2068  citrate synthase I  40.73 
 
 		 450 aa  258  1e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.355535  normal  0.380729 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3826  methylcitrate synthase  37.47 
 
 		 375 aa  258  1e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3295  methylcitrate synthase  36.21 
 
 		 378 aa  258  1e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.11596 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>