More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2539 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2539  Citrate (Si)-synthase  100 
 
 
374 aa  747    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.64966  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2423  Citrate (Si)-synthase  59.42 
 
 
377 aa  441  9.999999999999999e-123  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2557  citrate synthase  54.89 
 
 
391 aa  375  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4146  citrate (Si)-synthase  51.73 
 
 
375 aa  366  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1189  Citrate (Si)-synthase  48.95 
 
 
395 aa  336  2.9999999999999997e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2420  Citrate synthase  46.07 
 
 
481 aa  310  2.9999999999999997e-83  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0837  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.67 
 
 
378 aa  292  6e-78  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.531649  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1523  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.08 
 
 
379 aa  289  4e-77  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.297697  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0723  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.67 
 
 
382 aa  281  9e-75  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.517524  normal  0.584309 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1476  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.93 
 
 
382 aa  277  2e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.644774  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2679  citrate synthase  40.42 
 
 
372 aa  277  3e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0198833  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3036  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.93 
 
 
382 aa  276  3e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1621  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  40.89 
 
 
379 aa  275  9e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285346  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1258  citrate synthase  39.01 
 
 
373 aa  275  1.0000000000000001e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0306  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  38.36 
 
 
397 aa  273  4.0000000000000004e-72  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.772555 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1245  citrate synthase  39.74 
 
 
374 aa  273  4.0000000000000004e-72  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0781  citrate synthase  41.47 
 
 
372 aa  272  8.000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2221  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  40.43 
 
 
377 aa  271  1e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57744  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1786  citrate synthase  40.11 
 
 
373 aa  271  1e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1752  citrate synthase  40.11 
 
 
373 aa  271  1e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.206255  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3278  citrate synthase  40.96 
 
 
386 aa  268  8e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.312589  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1526  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  39.31 
 
 
390 aa  268  1e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.682888  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1726  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.58 
 
 
380 aa  265  8e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2234  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  40.71 
 
 
409 aa  265  8e-70  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.709963 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0713  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  40.41 
 
 
404 aa  265  8.999999999999999e-70  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.756288  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1252  Citrate (Si)-synthase  42.29 
 
 
373 aa  265  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0534  citrate synthase  39.89 
 
 
382 aa  264  2e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0555246 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4488  citrate synthase  39.89 
 
 
371 aa  263  3e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4839  citrate synthase  39.89 
 
 
371 aa  263  3e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3093  Citrate (Si)-synthase  40.33 
 
 
378 aa  263  3e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.832749 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0563  citrate synthase  39.95 
 
 
412 aa  263  4.999999999999999e-69  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4323  citrate synthase  39.63 
 
 
371 aa  262  6e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4335  citrate synthase  39.63 
 
 
371 aa  262  6e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4424  citrate synthase  40.16 
 
 
371 aa  262  6e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4725  citrate synthase  39.63 
 
 
371 aa  262  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4704  citrate synthase  39.63 
 
 
382 aa  262  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4720  citrate synthase  39.63 
 
 
382 aa  262  8e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4709  citrate synthase  39.63 
 
 
382 aa  262  8e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000257504 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01781  citrate synthase  39.47 
 
 
378 aa  260  3e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.176216  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1692  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  39.44 
 
 
409 aa  259  7e-68  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.141022  normal  0.100865 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2413  citrate synthase  40.42 
 
 
397 aa  258  1e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0663  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.22 
 
 
373 aa  257  2e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.280152  normal  0.110027 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0404  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  37.08 
 
 
378 aa  256  4e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1522  citrate synthase  35.56 
 
 
370 aa  256  5e-67  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.640515  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6150  Citrate (Si)-synthase  41.03 
 
 
391 aa  254  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.153659 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0895  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  37.5 
 
 
430 aa  254  2.0000000000000002e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2713  citrate synthase  37.73 
 
 
378 aa  253  3e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3065  citrate synthase  38.46 
 
 
386 aa  253  3e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2672  citrate synthase  38.46 
 
 
386 aa  253  3e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.530506  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1572  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  39.73 
 
 
380 aa  253  5.000000000000001e-66  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0279  citrate synthase  38.26 
 
 
396 aa  251  1e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0622  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  35.58 
 
 
367 aa  248  2e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0115525  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0647  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  35.58 
 
 
367 aa  248  2e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.029125  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4948  citrate synthase 2  42.59 
 
 
364 aa  246  4e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.257238  normal  0.409706 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1580  citrate synthase  36.94 
 
 
383 aa  246  4e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01811  citrate synthase  37.33 
 
 
381 aa  246  6.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3561  Citrate (Si)-synthase  39.95 
 
 
387 aa  245  6.999999999999999e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141515  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26921  citrate synthase  38.93 
 
 
396 aa  245  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1377  citrate synthase  35.47 
 
 
386 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01791  citrate synthase  37.07 
 
 
381 aa  244  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01901  citrate synthase  37.6 
 
 
381 aa  244  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1408  citrate synthase  35.47 
 
 
386 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4089  citrate synthase  36 
 
 
389 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2103  citrate synthase 2  41.8 
 
 
364 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0163  citrate synthase  37.07 
 
 
381 aa  243  3e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.292022  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2027  citrate synthase 2  42.66 
 
 
362 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1528  citrate synthase  37.33 
 
 
375 aa  243  3.9999999999999997e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0349986  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1467  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  36.15 
 
 
385 aa  243  3.9999999999999997e-63  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0316751  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02341  citrate synthase  37.07 
 
 
375 aa  242  9e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2276  citrate synthase  36.91 
 
 
380 aa  241  1e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1063  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  36.6 
 
 
393 aa  241  1e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1665  citrate synthase  37.08 
 
 
378 aa  239  5e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1099  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  36.96 
 
 
387 aa  238  9e-62  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0100  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  39.01 
 
 
377 aa  236  7e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0612  citrate synthase  36.68 
 
 
386 aa  234  2.0000000000000002e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.148892  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2105  citrate (Si)-synthase  37.14 
 
 
397 aa  232  9e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.414267  normal  0.0115455 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2628  citrate synthase  37.5 
 
 
387 aa  231  1e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53950  methylcitrate synthase  36.51 
 
 
375 aa  227  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.282102  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4723  methylcitrate synthase  36.51 
 
 
375 aa  227  3e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7568  citrate synthase 2  40.49 
 
 
362 aa  226  4e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.708852 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1729  Citrate (Si)-synthase  37.57 
 
 
373 aa  226  6e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.120294  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1071  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  37.8 
 
 
373 aa  226  6e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.66322  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1821  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  35.54 
 
 
374 aa  225  8e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1830  citrate synthase 2  41.27 
 
 
362 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.011311 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2156  citrate synthase 3  34.85 
 
 
373 aa  223  3e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3010  citrate synthase 3  34.32 
 
 
373 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2188  citrate synthase 3  34.32 
 
 
372 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.685723  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2125  citrate synthase 3  34.32 
 
 
372 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.306637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2348  citrate synthase 3  34.32 
 
 
372 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2450  citrate synthase 3  34.32 
 
 
373 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0697754  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0798  citrate synthase 3  36.74 
 
 
370 aa  223  4.9999999999999996e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.036744  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2315  citrate synthase 3  34.32 
 
 
373 aa  222  7e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0820  2-methylcitrate synthase  34.04 
 
 
372 aa  222  8e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0574  citrate synthase  38.71 
 
 
378 aa  222  8e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1176  2-methylcitrate synthase  34.04 
 
 
372 aa  222  8e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.831059  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2367  citrate synthase 3  34.05 
 
 
373 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2111  citrate synthase 3  34.05 
 
 
372 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0857  citrate (Si)-synthase  39.13 
 
 
390 aa  221  1.9999999999999999e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1776  methylcitrate synthase  35.73 
 
 
375 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.549839  hitchhiker  0.000461346 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1202  Citrate (Si)-synthase  32.8 
 
 
375 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000138488  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>