More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1729 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1729  Citrate (Si)-synthase  100 
 
 		 373 aa  747    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.120294  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6150  Citrate (Si)-synthase  51.6 
 
 		 391 aa  367  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.153659 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3093  Citrate (Si)-synthase  51.06 
 
 		 378 aa  367  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.832749 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3561  Citrate (Si)-synthase  55.14 
 
 		 387 aa  358  9.999999999999999e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141515  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3748  Citrate (Si)-synthase  52.82 
 
 		 388 aa  355  8.999999999999999e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1189  Citrate (Si)-synthase  41.08 
 
 		 395 aa  264  2e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2557  citrate synthase  41.1 
 
 		 391 aa  251  2e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0306  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  35.87 
 
 		 397 aa  241  2e-62  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.772555 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0622  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  35.97 
 
 		 367 aa  241  2e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0115525  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0647  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  35.97 
 
 		 367 aa  241  2e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.029125  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1467  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  36.89 
 
 		 385 aa  239  6.999999999999999e-62  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0316751  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1726  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  34.76 
 
 		 380 aa  234  2.0000000000000002e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1522  citrate synthase  36.29 
 
 		 370 aa  229  4e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.640515  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0895  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  37.57 
 
 		 430 aa  226  4e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1252  Citrate (Si)-synthase  38.8 
 
 		 373 aa  224  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2423  Citrate (Si)-synthase  38.52 
 
 		 377 aa  223  4e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4146  citrate (Si)-synthase  37.63 
 
 		 375 aa  222  8e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2103  citrate synthase 2  38.15 
 
 		 364 aa  219  5e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2420  Citrate synthase  36.46 
 
 		 481 aa  219  5e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2221  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  36.56 
 
 		 377 aa  219  7e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57744  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1258  citrate synthase  33.33 
 
 		 373 aa  218  1e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1621  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  35.64 
 
 		 379 aa  218  1e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285346  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2539  Citrate (Si)-synthase  37.57 
 
 		 374 aa  218  1e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.64966  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1526  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  34.39 
 
 		 390 aa  218  2e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.682888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1476  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  37.1 
 
 		 382 aa  215  9e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.644774  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2027  citrate synthase 2  39.3 
 
 		 362 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0723  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  38.07 
 
 		 382 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.517524  normal  0.584309 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0663  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  37.7 
 
 		 373 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.280152  normal  0.110027 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1377  citrate synthase  34.78 
 
 		 386 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1408  citrate synthase  34.78 
 
 		 386 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7568  citrate synthase 2  38.54 
 
 		 362 aa  213  5.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.708852 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2234  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  34.73 
 
 		 409 aa  211  2e-53  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.709963 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4948  citrate synthase 2  39.14 
 
 		 364 aa  211  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.257238  normal  0.409706 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1099  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  33.79 
 
 		 387 aa  210  3e-53  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0781  citrate synthase  35.68 
 
 		 372 aa  209  4e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1752  citrate synthase  33.7 
 
 		 373 aa  209  8e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.206255  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0281  citrate synthase  33.52 
 
 		 378 aa  209  8e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.160338  normal  0.143922 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1786  citrate synthase  33.7 
 
 		 373 aa  209  8e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2031  citrate (Si)-synthase  34.59 
 
 		 473 aa  208  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602388  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4790  methylcitrate synthase  36.61 
 
 		 385 aa  207  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.427382  normal  0.159071 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2713  citrate synthase  33.61 
 
 		 378 aa  207  3e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2679  citrate synthase  34.79 
 
 		 372 aa  206  4e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0198833  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2319  methylcitrate synthase  35.09 
 
 		 386 aa  206  5e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.16364  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2105  citrate (Si)-synthase  35.79 
 
 		 397 aa  206  6e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.414267  normal  0.0115455 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0404  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  33.78 
 
 		 378 aa  204  2e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2401  2-methylcitrate synthase  34.85 
 
 		 371 aa  204  2e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.612256  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4089  citrate synthase  34.13 
 
 		 389 aa  203  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2276  citrate synthase  33.87 
 
 		 380 aa  203  3e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0563  citrate synthase  34.54 
 
 		 412 aa  203  4e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3036  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  37 
 
 		 382 aa  203  4e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1692  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  33.77 
 
 		 409 aa  203  4e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.141022  normal  0.100865 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0398  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  32.53 
 
 		 377 aa  202  9.999999999999999e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0419831  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0713  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  35.16 
 
 		 404 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.756288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1572  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  33.42 
 
 		 380 aa  201  1.9999999999999998e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3273  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  34.73 
 
 		 389 aa  200  3e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2081  methylcitrate synthase  34.38 
 
 		 404 aa  200  3e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.847456  normal  0.17968 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1523  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  37.13 
 
 		 379 aa  200  3e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.297697  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3292  methylcitrate synthase  34.73 
 
 		 389 aa  200  3e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5388  methylcitrate synthase  34.13 
 
 		 390 aa  199  5e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0621  methylcitrate synthase  34.83 
 
 		 383 aa  199  5e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0715  citrate synthase  32.32 
 
 		 355 aa  199  5e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4841  methylcitrate synthase  34.13 
 
 		 390 aa  199  5e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.994856  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00287  2-methylcitrate synthase  34.73 
 
 		 389 aa  199  6e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00291  hypothetical protein  34.73 
 
 		 389 aa  199  6e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0398  methylcitrate synthase  34.73 
 
 		 389 aa  199  6e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2188  methylcitrate synthase  34.05 
 
 		 390 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0357  methylcitrate synthase  34.66 
 
 		 389 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0837  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  36.12 
 
 		 378 aa  198  1.0000000000000001e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.531649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0142  methylcitrate synthase  33.78 
 
 		 390 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.482229  normal  0.590891 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0350  citrate synthase  30.89 
 
 		 391 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2647  methylcitrate synthase  35.16 
 
 		 394 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0364  methylcitrate synthase  34.66 
 
 		 389 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1063  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  34.24 
 
 		 393 aa  197  3e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1586  methylcitrate synthase  34.6 
 
 		 385 aa  197  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000154256  normal  0.49975 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4451  methylcitrate synthase  35.86 
 
 		 384 aa  197  3e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.230042  normal  0.856917 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4756  methylcitrate synthase  33.78 
 
 		 390 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.394349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0289  methylcitrate synthase  33.51 
 
 		 390 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1869  methylcitrate synthase  33.51 
 
 		 390 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0383  methylcitrate synthase  33.51 
 
 		 390 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.679335  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0878  methylcitrate synthase  33.51 
 
 		 390 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1737  methylcitrate synthase  33.51 
 
 		 390 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1165  methylcitrate synthase  33.51 
 
 		 390 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2142  methylcitrate synthase  33.51 
 
 		 390 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5345  methylcitrate synthase  33.78 
 
 		 390 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.417928  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5516  methylcitrate synthase  33.78 
 
 		 390 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0272926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1347  methylcitrate synthase  36.99 
 
 		 389 aa  197  4.0000000000000005e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.26517  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2821  putative 2-methylcitrate synthase  33.88 
 
 		 374 aa  196  5.000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.702751  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23220  methylcitrate synthase  34.96 
 
 		 387 aa  196  5.000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0409  methylcitrate synthase  34.46 
 
 		 389 aa  196  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000027346 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0404  methylcitrate synthase  34.39 
 
 		 389 aa  196  6e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0403  methylcitrate synthase  34.46 
 
 		 389 aa  196  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0421  methylcitrate synthase  35.04 
 
 		 389 aa  195  9e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0258062 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4704  citrate synthase  32.97 
 
 		 382 aa  194  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0866  methylcitrate synthase  35.43 
 
 		 391 aa  194  2e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3029  methylcitrate synthase  33.86 
 
 		 385 aa  194  2e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1202  Citrate (Si)-synthase  30 
 
 		 375 aa  194  2e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000138488  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0401  methylcitrate synthase  34.48 
 
 		 389 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.600733  hitchhiker  0.00000000076827 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1809  methylcitrate synthase  33.86 
 
 		 384 aa  194  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.507238  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0463  methylcitrate synthase  34.48 
 
 		 389 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000165686  hitchhiker  0.000000131062 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1830  citrate synthase 2  38.11 
 
 		 362 aa  193  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.011311 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>