More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3748 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3748  Citrate (Si)-synthase  100 
 
 		 388 aa  754    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6150  Citrate (Si)-synthase  57.03 
 
 		 391 aa  432  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.153659 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3561  Citrate (Si)-synthase  58.67 
 
 		 387 aa  422  1e-117  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141515  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3093  Citrate (Si)-synthase  55.44 
 
 		 378 aa  415  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.832749 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1729  Citrate (Si)-synthase  52.82 
 
 		 373 aa  355  1e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.120294  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1189  Citrate (Si)-synthase  42.82 
 
 		 395 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0520  citrate (Si)-synthase  41.76 
 
 		 368 aa  254  3e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.341938  normal  0.0162418 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0834  Citrate (Si)-synthase  42.51 
 
 		 377 aa  253  6e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0511  citrate synthase 2  41.49 
 
 		 368 aa  252  7e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.043222  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0247  citrate synthase 2  42.12 
 
 		 368 aa  251  2e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.32184  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2557  citrate synthase  42.29 
 
 		 391 aa  250  3e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10908  citrate synthase 2  42.47 
 
 		 373 aa  249  5e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0830  Citrate (Si)-synthase  41.38 
 
 		 374 aa  249  9e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1005  Citrate (Si)-synthase  40.81 
 
 		 368 aa  245  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0733  citrate synthase 2  41.24 
 
 		 368 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0423  citrate synthase 2  41.49 
 
 		 368 aa  239  4e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.523327 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0848  Citrate (Si)-synthase  41.73 
 
 		 368 aa  240  4e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1262  Citrate (Si)-synthase  39.47 
 
 		 375 aa  238  1e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5025  citrate synthase 2  40.16 
 
 		 371 aa  238  1e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.761314 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5814  Citrate (Si)-synthase  42.97 
 
 		 361 aa  236  7e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00482398 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4146  citrate (Si)-synthase  40.05 
 
 		 375 aa  234  2.0000000000000002e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33820  citrate synthase 2  41.8 
 
 		 389 aa  233  3e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.655288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2103  citrate synthase 2  40.37 
 
 		 364 aa  233  6e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1252  Citrate (Si)-synthase  39.62 
 
 		 373 aa  232  6e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8787  citrate synthase 2  40.32 
 
 		 378 aa  231  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.901315 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0647  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  34.32 
 
 		 367 aa  230  3e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.029125  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1016  Citrate (Si)-synthase  40.91 
 
 		 366 aa  230  3e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.525155  hitchhiker  0.00235766 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0622  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  34.32 
 
 		 367 aa  230  3e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0115525  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0663  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  39.52 
 
 		 373 aa  229  7e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.280152  normal  0.110027 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0404  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  36.02 
 
 		 378 aa  229  8e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0723  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  40 
 
 		 382 aa  228  1e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.517524  normal  0.584309 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0509  citrate synthase 2  42.62 
 
 		 371 aa  227  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1467  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  36.17 
 
 		 385 aa  227  3e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0316751  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02341  citrate synthase  37.23 
 
 		 375 aa  227  3e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2713  citrate synthase  35.15 
 
 		 378 aa  226  4e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4089  citrate synthase  35.12 
 
 		 389 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0837  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  37.11 
 
 		 378 aa  226  7e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.531649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1528  citrate synthase  36.96 
 
 		 375 aa  225  1e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0349986  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2423  Citrate (Si)-synthase  39.4 
 
 		 377 aa  224  1e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1476  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  37.53 
 
 		 382 aa  224  2e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.644774  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0115  citrate synthase 2  39.95 
 
 		 368 aa  224  2e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2221  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  37.02 
 
 		 377 aa  223  3e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57744  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3036  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  37.8 
 
 		 382 aa  223  6e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1377  citrate synthase  35.16 
 
 		 386 aa  223  6e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1408  citrate synthase  35.16 
 
 		 386 aa  223  6e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2027  citrate synthase 2  40.37 
 
 		 362 aa  222  8e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1099  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  33.16 
 
 		 387 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2628  citrate synthase  37.33 
 
 		 387 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0279  citrate synthase  36.13 
 
 		 396 aa  221  1.9999999999999999e-56  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1572  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  34.93 
 
 		 380 aa  220  3e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01781  citrate synthase  35.6 
 
 		 378 aa  218  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.176216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2319  methylcitrate synthase  36.78 
 
 		 386 aa  218  1e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.16364  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0100  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  36.6 
 
 		 377 aa  218  1e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01811  citrate synthase  34.47 
 
 		 381 aa  218  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0163  citrate synthase  34.21 
 
 		 381 aa  218  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.292022  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0895  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  35.98 
 
 		 430 aa  217  2.9999999999999998e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26921  citrate synthase  35.36 
 
 		 396 aa  216  4e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3065  citrate synthase  33.33 
 
 		 386 aa  216  4e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2672  citrate synthase  33.33 
 
 		 386 aa  216  4e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.530506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4841  citrate synthase 2  40.97 
 
 		 376 aa  216  5e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.169021 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0306  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  33.17 
 
 		 397 aa  216  5e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.772555 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4459  citrate synthase 2  40.97 
 
 		 376 aa  216  5e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4546  citrate synthase 2  40.97 
 
 		 376 aa  216  5e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.591553  normal  0.862054 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01791  citrate synthase  34.21 
 
 		 381 aa  216  5.9999999999999996e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1726  citrate synthase 2  40.94 
 
 		 373 aa  216  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1245  citrate synthase  32.8 
 
 		 374 aa  216  7e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2105  citrate (Si)-synthase  37.23 
 
 		 397 aa  216  8e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.414267  normal  0.0115455 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1202  Citrate (Si)-synthase  31.48 
 
 		 375 aa  215  9.999999999999999e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000138488  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7568  citrate synthase 2  40.32 
 
 		 362 aa  215  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.708852 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01901  citrate synthase  33.42 
 
 		 381 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2413  citrate synthase  35.08 
 
 		 397 aa  213  3.9999999999999995e-54  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4948  citrate synthase 2  39.63 
 
 		 364 aa  213  5.999999999999999e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.257238  normal  0.409706 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1665  citrate synthase  34.49 
 
 		 378 aa  212  9e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1526  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  34.99 
 
 		 390 aa  211  1e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.682888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1830  citrate synthase 2  40.11 
 
 		 362 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.011311 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1522  citrate synthase  33.07 
 
 		 370 aa  211  2e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.640515  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1580  citrate synthase  33.07 
 
 		 383 aa  211  2e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7229  citrate synthase 2  39.95 
 
 		 364 aa  210  3e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2081  methylcitrate synthase  35.83 
 
 		 404 aa  209  5e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.847456  normal  0.17968 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2420  Citrate synthase  35.92 
 
 		 481 aa  209  6e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4790  methylcitrate synthase  36.96 
 
 		 385 aa  209  8e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.427382  normal  0.159071 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11154  citrate synthase  36.55 
 
 		 393 aa  209  9e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1523  citrate synthase  36.86 
 
 		 379 aa  208  1e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000149405 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0081  citrate synthase 2  41.05 
 
 		 369 aa  208  1e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2539  Citrate (Si)-synthase  38.63 
 
 		 374 aa  208  1e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.64966  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4708  citrate synthase 2  39.2 
 
 		 370 aa  207  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1726  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  34.2 
 
 		 380 aa  207  2e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2647  methylcitrate synthase  37.6 
 
 		 394 aa  207  3e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0621  methylcitrate synthase  34.97 
 
 		 383 aa  206  8e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2142  methylcitrate synthase  34.05 
 
 		 390 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1869  methylcitrate synthase  34.05 
 
 		 390 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1737  methylcitrate synthase  34.05 
 
 		 390 aa  205  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0781  citrate synthase  35.01 
 
 		 372 aa  205  1e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0383  methylcitrate synthase  34.05 
 
 		 390 aa  205  1e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.679335  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0289  methylcitrate synthase  34.05 
 
 		 390 aa  205  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2276  citrate synthase  34.92 
 
 		 380 aa  204  1e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1523  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  36.9 
 
 		 379 aa  205  1e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.297697  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0878  methylcitrate synthase  34.05 
 
 		 390 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1165  methylcitrate synthase  34.05 
 
 		 390 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23220  methylcitrate synthase  34.28 
 
 		 387 aa  205  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>