More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1005 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1005  Citrate (Si)-synthase  100 
 
 
368 aa  744    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0520  citrate (Si)-synthase  86.89 
 
 
368 aa  637    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.341938  normal  0.0162418 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0247  citrate synthase 2  80.27 
 
 
368 aa  591  1e-168  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.32184  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8787  citrate synthase 2  80.99 
 
 
378 aa  578  1e-164  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.901315 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0511  citrate synthase 2  75 
 
 
368 aa  573  1.0000000000000001e-162  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.043222  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1016  Citrate (Si)-synthase  76.37 
 
 
366 aa  563  1.0000000000000001e-159  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.525155  hitchhiker  0.00235766 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0830  Citrate (Si)-synthase  76.26 
 
 
374 aa  559  1e-158  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0834  Citrate (Si)-synthase  77.94 
 
 
377 aa  555  1e-157  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0423  citrate synthase 2  75.55 
 
 
368 aa  556  1e-157  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.523327 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0733  citrate synthase 2  72.85 
 
 
368 aa  550  1e-155  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1262  Citrate (Si)-synthase  72.53 
 
 
375 aa  546  1e-154  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0509  citrate synthase 2  74.24 
 
 
371 aa  535  1e-151  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10908  citrate synthase 2  71.12 
 
 
373 aa  537  1e-151  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5025  citrate synthase 2  72.42 
 
 
371 aa  536  1e-151  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.761314 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33820  citrate synthase 2  72.58 
 
 
389 aa  520  1e-146  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.655288  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0081  citrate synthase 2  74.86 
 
 
369 aa  518  1e-146  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7229  citrate synthase 2  75.91 
 
 
364 aa  521  1e-146  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4841  citrate synthase 2  73.54 
 
 
376 aa  514  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.169021 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4459  citrate synthase 2  73.26 
 
 
376 aa  513  1e-144  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1726  citrate synthase 2  72.5 
 
 
373 aa  512  1e-144  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4546  citrate synthase 2  73.26 
 
 
376 aa  513  1e-144  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.591553  normal  0.862054 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0115  citrate synthase 2  71.94 
 
 
368 aa  509  1e-143  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5814  Citrate (Si)-synthase  73.39 
 
 
361 aa  503  1e-141  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00482398 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0848  Citrate (Si)-synthase  64.17 
 
 
368 aa  482  1e-135  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4708  citrate synthase 2  65.18 
 
 
370 aa  441  1e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0881  citrate synthase 2  50.16 
 
 
351 aa  258  1e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.154658  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3748  Citrate (Si)-synthase  40.81 
 
 
388 aa  256  4e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1189  Citrate (Si)-synthase  37.99 
 
 
395 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2557  citrate synthase  39.57 
 
 
391 aa  226  6e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3561  Citrate (Si)-synthase  36.16 
 
 
387 aa  223  4.9999999999999996e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141515  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6150  Citrate (Si)-synthase  37.16 
 
 
391 aa  222  9e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.153659 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3093  Citrate (Si)-synthase  35.42 
 
 
378 aa  213  3.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.832749 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4948  citrate synthase 2  36.94 
 
 
364 aa  208  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.257238  normal  0.409706 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1830  citrate synthase 2  37.36 
 
 
362 aa  205  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.011311 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2027  citrate synthase 2  34.96 
 
 
362 aa  202  7e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2103  citrate synthase 2  36.31 
 
 
364 aa  202  9e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7568  citrate synthase 2  47.62 
 
 
362 aa  195  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.708852 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2423  Citrate (Si)-synthase  34.33 
 
 
377 aa  192  9e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1729  Citrate (Si)-synthase  33.33 
 
 
373 aa  189  7e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.120294  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4146  citrate (Si)-synthase  33.96 
 
 
375 aa  189  8e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2628  citrate synthase  33.59 
 
 
387 aa  187  2e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2401  2-methylcitrate synthase  32.79 
 
 
371 aa  184  3e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.612256  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0895  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  31.27 
 
 
430 aa  183  5.0000000000000004e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0663  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  33.06 
 
 
373 aa  181  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.280152  normal  0.110027 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2420  Citrate synthase  34.5 
 
 
481 aa  181  2e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0154  citrate synthase  35.2 
 
 
374 aa  181  2e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.649155 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1252  Citrate (Si)-synthase  33.06 
 
 
373 aa  180  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1467  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  32.43 
 
 
385 aa  180  2.9999999999999997e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0316751  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0404  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  32.18 
 
 
378 aa  180  4e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2221  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  34.4 
 
 
377 aa  179  5.999999999999999e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57744  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3295  methylcitrate synthase  31.75 
 
 
378 aa  179  9e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.11596 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2713  citrate synthase  31.62 
 
 
378 aa  178  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3630  methylcitrate synthase  31.17 
 
 
375 aa  179  1e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0314  methylcitrate synthase  31.17 
 
 
375 aa  178  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3826  methylcitrate synthase  31.17 
 
 
375 aa  178  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1665  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  32.02 
 
 
374 aa  177  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2420  2-methylcitrate synthase  32.46 
 
 
375 aa  177  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0822163  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1420  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  30.69 
 
 
374 aa  177  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1035  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  36 
 
 
375 aa  177  2e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1377  citrate synthase  32.19 
 
 
386 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1198  methylcitrate synthase  30.69 
 
 
376 aa  177  3e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1408  citrate synthase  32.19 
 
 
386 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1202  Citrate (Si)-synthase  29.97 
 
 
375 aa  177  3e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000138488  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0072  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  32.71 
 
 
372 aa  177  4e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2276  citrate synthase  31.72 
 
 
380 aa  177  4e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2321  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  30.95 
 
 
384 aa  176  4e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0344  methylcitrate synthase  31.17 
 
 
375 aa  176  6e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4022  methylcitrate synthase  31.2 
 
 
375 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3946  methylcitrate synthase  31.2 
 
 
375 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2112  2-methylcitrate synthase  30.95 
 
 
374 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3645  methylcitrate synthase  31.2 
 
 
375 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4048  methylcitrate synthase  31.2 
 
 
375 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4141  methylcitrate synthase  31.2 
 
 
379 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1665  citrate synthase  32.28 
 
 
378 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0612  citrate synthase  34.68 
 
 
386 aa  174  1.9999999999999998e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.148892  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2539  Citrate (Si)-synthase  33.6 
 
 
374 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.64966  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4723  methylcitrate synthase  31.28 
 
 
375 aa  173  5e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0781  citrate synthase  31.83 
 
 
372 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53950  methylcitrate synthase  31.28 
 
 
375 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.282102  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1821  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  30.85 
 
 
374 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0857  citrate (Si)-synthase  36.09 
 
 
390 aa  172  7.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1858  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  30.93 
 
 
374 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2498  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  30.69 
 
 
374 aa  172  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0246552 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0723  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  32.81 
 
 
382 aa  171  2e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.517524  normal  0.584309 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1111  methylcitrate synthase  32.54 
 
 
379 aa  170  3e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.468935 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3036  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  32.01 
 
 
382 aa  170  4e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2288  2-methylcitrate synthase  30.83 
 
 
375 aa  170  5e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.037213  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0837  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  32.18 
 
 
378 aa  169  5e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.531649  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2679  citrate synthase  31.37 
 
 
372 aa  169  5e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0198833  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0647  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  32.97 
 
 
367 aa  169  6e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.029125  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0622  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  32.97 
 
 
367 aa  169  6e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0115525  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1310  methylcitrate synthase  31.73 
 
 
375 aa  169  7e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1580  citrate synthase  31.47 
 
 
383 aa  169  8e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01781  citrate synthase  32.71 
 
 
378 aa  168  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.176216  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03371  methylcitrate synthase  30.93 
 
 
373 aa  167  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1366  citrate synthase  32.3 
 
 
423 aa  167  2e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0730  citrate synthase  32.19 
 
 
398 aa  167  2e-40  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.554862  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0820  2-methylcitrate synthase  30.34 
 
 
372 aa  167  2e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1176  2-methylcitrate synthase  30.34 
 
 
372 aa  167  2e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.831059  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2821  putative 2-methylcitrate synthase  29.74 
 
 
374 aa  167  2.9999999999999998e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.702751  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>